Ламинин, альфа 4

ЛАМА4
Идентификаторы
Псевдонимы	LAMA4 , CMD1JJ, LAMA3, LAMA4*-1, ламинин, альфа 4, субъединица ламинина альфа 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 600133 ; МГИ : 109321 ; Гомологен : 37604 ; Генные карты : LAMA4 ; ОМА : LAMA4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6q21 Start 112,107,931 bp End 112,254,939 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 10 (mouse) Band 10 B1|10 20.02 cM Start 38,841,511 bp End 38,986,184 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in tibial nerve left uterine tube epithelium of colon smooth muscle tissue parietal pleura body of uterus sural nerve muscle layer of sigmoid colon germinal epithelium saphenous vein Top expressed in external carotid artery internal carotid artery lumbar spinal ganglion sciatic nerve left lung lobe dermis tunica media of zone of aorta white adipose tissue atrium calvaria More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function signaling receptor binding extracellular matrix structural constituent protein binding Cellular component extracellular region basement membrane extracellular exosome extracellular matrix collagen-containing extracellular matrix Biological process regulation of cell adhesion cell adhesion extracellular matrix organization regulation of cell migration regulation of embryonic development negative regulation of cold-induced thermogenesis Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 3910 16775 Вместе ENSG00000112769 ENSMUSG00000019846 ЮниПрот Q16363 P97927 RefSeq (мРНК) НМ_001105206 НМ_001105207 НМ_001105208 НМ_001105209 НМ_002290 НМ_010681 RefSeq (белок) НП_001098676 НП_001098677 НП_001098678 НП_001098679 НП_002281 НП_034811 Местоположение (UCSC) Чр 6: 112,11 – 112,25 Мб Чр 10: 38,84 – 38,99 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица ламинина альфа-4 представляет собой белок , который у человека кодируется LAMA4 геном .

Функция

Ламинины , семейство гликопротеинов внеклеточного матрикса , являются основным неколлагеновым компонентом базальных мембран . Они участвуют в широком спектре биологических процессов, включая клеточную адгезию , дифференцировку, миграцию, передачу сигналов, рост нейритов и метастазирование .

Ламинины состоят из трех неидентичных цепей: ламинина альфа, бета и гамма (ранее A, B1 и B2 соответственно) и образуют крестообразную структуру, состоящую из трех коротких плеч, каждое из которых образовано отдельной цепью, и длинного плеча, состоящего из из всех 3 цепей. Каждая цепь ламинина представляет собой многодоменный белок, кодируемый отдельным геном. Описано несколько изоформ каждой цепи. альфа-, бета- и гамма-цепей Различные изомеры объединяются, образуя различные гетеротримерные изоформы ламинина, которые обозначаются арабскими цифрами в порядке их открытия, т.е. гетеротример альфа1бета1гамма1 представляет собой ламинин 1. Биологические функции различных цепей и молекул тримеров в значительной степени различаются. неизвестно, но было показано, что некоторые цепи различаются по распределению в тканях, предположительно отражая разнообразные функции in vivo .

Этот ген кодирует изоформу альфа-цепи ламинина, альфа-4. Доменная структура альфа-4 аналогична структуре домена альфа-3, оба из которых напоминают усеченные версии альфа-1 и альфа-2, в том, что примерно 1200 остатков на N-конце ( домены IV, V и VI) были утеряны. Ламинин, альфа 4, содержит С-концевой домен G, который отличает все альфа-цепи от бета- и гамма-цепей. Анализ РНК из тканей взрослого и плода выявил регуляцию экспрессии в процессе развития, однако точная функция ламинина альфа-4 неизвестна.

Ген

В литературе описано тканеспецифическое использование альтернативного полиА-сигнала. Также был отмечен альтернативный сплайсинг с участием первого интрона в 5'-UTR и ламинин-альфа-4-подобных изоформ, однако полноразмерная природа этих продуктов неизвестна.

Дальнейшее чтение

• Любимова Ю.Ю., Фудзита М., Хазензон Н.М., Любимов А.В., Блэк К.Л. (2006). «Изменения изоформ ламинина, связанные с инвазией опухоли головного мозга и ангиогенезом» . Границы бионауки . 11 (1): 81–8. дои : 10.2741/1781 . ПМК   3506377 . ПМИД   16146715 .
• Ииванайнен А., Сайнио К., Сариола Х., Трюггвасон К. (май 1995 г.). «Первичная структура и экспрессия новой альфа-4-цепи ламинина человека». Письма ФЭБС . 365 (2–3): 183–8. дои : 10.1016/0014-5793(95)00462-I . ПМИД   7781776 . S2CID   83904114 .
• Бергесон Р.Э., Шике М., Дойцманн Р., Экблом П., Энгель Дж., Кляйнман Х., Мартин Г.Р., Менегузи Г., Паулссон М., Санес Дж. (апрель 1994 г.). «Новая номенклатура ламининов». Матричная биология . 14 (3): 209–11. дои : 10.1016/0945-053X(94)90184-8 . ПМИД   7921537 .
• Райан М.К., Тизард Р., ВанДевантер Д.Р., Картер В.Г. (сентябрь 1994 г.). «Клонирование гена LamA3, кодирующего альфа-3-цепь адгезивного лиганда эпилигрина. Экспрессия при заживлении ран» . Журнал биологической химии . 269 ​​(36): 22779–87. дои : 10.1016/S0021-9258(17)31713-1 . ПМИД   8077230 .
• Ричардс А., Аль-Имара Л., Поуп FM (июнь 1996 г.). «Полная последовательность кДНК ламинина альфа 4 и ее связь с другими альфа-цепями ламинина человека» . Европейский журнал биохимии . 238 (3): 813–21. дои : 10.1111/j.1432-1033.1996.0813w.x . ПМИД   8706685 .
• Сяо С., Люкс М.Л., Ривз Р., Хадсон Т.Дж., Флетчер Дж.А. (март 1997 г.). «Активация HMGI (Y) путем перестройки хромосомы 6p21 в многолинейных мезенхимальных клетках гамартомы легких» . Американский журнал патологии . 150 (3): 901–10. ПМЦ   1857887 . ПМИД   9060828 .
• Дуркин М.Е., Лочел Ф., Маттей М.Г., Гилпин Б.Дж., Альбрехцен Р., Вевер У.М. (июль 1997 г.). «Тканеспецифическая экспрессия альфа5-цепи ламинина человека и картирование гена на хромосоме человека 20q13.2-13.3 и на дистальной хромосоме 2 мыши рядом с локусом рваной (Ra) мутации» . Письма ФЭБС . 411 (2–3): 296–300. дои : 10.1016/S0014-5793(97)00686-8 . ПМИД   9271224 . S2CID   45286880 .
• Ричардс А., Луккарини С., Поуп FM (август 1997 г.). «Структурная организация LAMA4, гена, кодирующего ламинин альфа4». Европейский журнал биохимии . 248 (1): 15–23. дои : 10.1111/j.1432-1033.1997.t01-1-00015.x . ПМИД   9310354 .
• Мровец Т., Мельчар С., Горский А. (1998). «Опосредованные ВИЧ-белком изменения во взаимодействии Т-клеток с белками внеклеточного матрикса и эндотелием». Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis . 45 (2–3): 255–9. ПМИД   9597096 .
• Тальтс Дж. Ф., Сасаки Т., Миосге Н., Геринг В., Манн К., Мейн Р., Тимпл Р. (ноябрь 2000 г.). «Структурный и функциональный анализ рекомбинантного G-домена цепи ламинина альфа4 и его протеолитический процессинг в тканях» . Журнал биологической химии . 275 (45): 35192–9. дои : 10.1074/jbc.M003261200 . ПМИД   10934193 .
• Флейшмайер Р., Курода К., Утани А., Дуглас Макдональд Э., Перлиш Дж.С., Арикава-Хирасава Е., Секигути К., Санзен Н., Тимпл Р., Ямада Ю. (декабрь 2000 г.). «Дифференциальная экспрессия альфа-цепей ламинина на стадиях пролиферации и дифференцировки в модели морфогенеза кожи». Матричная биология . 19 (7): 637–47. дои : 10.1016/S0945-053X(00)00092-5 . ПМИД   11102753 .
• МакАртур С.П., Ван И., Херут Д., Густафсон С. (июнь 2001 г.). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнной железы человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Архивы оральной биологии . 46 (6): 545–55. дои : 10.1016/S0003-9969(01)00014-0 . ПМИД   11311202 .
• Петаяниеми Н., Корхонен М., Кортесмаа Дж., Трюггвасон К., Секигути К., Фудзивара Х., Сорокин Л., Торнелл Л.Е., Вондиму З., Ассефа Д., Патарройо М., Виртанен И. (август 2002 г.). «Локализация альфа4-цепи ламинина в тканях развивающегося и взрослого человека» . Журнал гистохимии и цитохимии 50 (8): 1113–30. дои : 10.1177/002215540205000813 . ПМИД   12133914 .
• Гу Ю.К., Кортесмаа Дж., Трюггвасон К., Перссон Дж., Экблом П., Якобсен С.Е., Экблом М. (февраль 2003 г.). «Специфическое для изоформы ламинина стимулирование адгезии и миграции клеток-предшественников костного мозга человека» . Кровь . 101 (3): 877–85. дои : 10.1182/кровь-2002-03-0796 . ПМИД   12393739 .
• Хаяси Ю, Ким К.Х., Фудзивара Х., Симоно С., Ямашита М., Санзен Н., Футаки С., Секигути К. (декабрь 2002 г.). «Идентификация и рекомбинантное производство вариантов сплайсинга субъединицы альфа4 человека ламинина». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 299 (3): 498–504. дои : 10.1016/S0006-291X(02)02642-6 . ПМИД   12445830 .
• Гонсалес А.М., Гонсалес М., Херрон Г.С., Нагаварапу Ю., Хопкинсон С.Б., Цурута Д., Джонс Дж.К. (декабрь 2002 г.). «Сложные взаимодействия между субъединицей ламинина альфа-4 и интегринами регулируют поведение эндотелиальных клеток in vitro и ангиогенез in vivo» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (25): 16075–80. дои : 10.1073/pnas.252649399 . ПМК   138567 . ПМИД   12454288 .
• ДеХан К.С., Гонсалес М., Гонсалес А.М., Хопкинсон С.Б., Чандел Н.С., Брюнель Дж.К., Джонс Дж.К. (март 2004 г.). «Субъединица ламинина альфа4 регулирует выживаемость эндотелиальных клеток». Экспериментальные исследования клеток . 294 (1): 281–9. дои : 10.1016/j.yexcr.2003.11.006 . ПМИД   14980521 .