Ламинин, альфа 5

ЛАМА5
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2Y38
Идентификаторы
Псевдонимы	LAMA5 , ламинин, альфа 5, субъединица ламинина альфа 5
Внешние идентификаторы	Опустить : 601033 ; МГИ : 105382 ; Гомологен : 4060 ; Генные карты : LAMA5 ; ОМА : LAMA5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 20 (human) Band 20q13.33 Start 62,307,955 bp End 62,367,312 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2 H4|2 102.7 cM Start 179,818,166 bp End 179,867,652 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right uterine tube right hemisphere of cerebellum right lung right coronary artery popliteal artery tibial arteries muscle layer of sigmoid colon gastric mucosa upper lobe of left lung skin of abdomen Top expressed in gastrula decidua ascending aorta medullary collecting duct left lung lobe epiblast blastocyst molar aortic valve islet of Langerhans More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function structural molecule activity integrin binding signaling receptor binding extracellular matrix structural constituent Cellular component extracellular matrix laminin-5 complex extracellular region basement membrane laminin-10 complex laminin-11 complex extracellular exosome nucleus extracellular space synaptic cleft neuromuscular junction collagen-containing extracellular matrix Biological process hair follicle development cell differentiation regulation of embryonic development regulation of cell migration cell recognition embryo development lung development muscle organ development extracellular matrix organization morphogenesis of a polarized epithelium odontogenesis of dentin-containing tooth focal adhesion assembly branching involved in ureteric bud morphogenesis regulation of cell adhesion cell adhesion regulation of cell population proliferation cytoskeleton organization angiogenesis neural crest cell migration animal organ morphogenesis integrin-mediated signaling pathway endothelial cell differentiation substrate adhesion-dependent cell spreading morphogenesis of embryonic epithelium cell population proliferation cell migration branching morphogenesis of an epithelial tube branching involved in salivary gland morphogenesis cilium assembly protein localization to plasma membrane cytokine-mediated signaling pathway tissue development cell-cell adhesion Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 3911 16776 Вместе ENSG00000130702 ENSMUSG00000015647 ЮниПрот О15230 Q61001 RefSeq (мРНК) НМ_005560 НМ_001081171 RefSeq (белок) НП_005551 НП_001074640 Местоположение (UCSC) Чр 20: 62,31 – 62,37 Мб Chr 2: 179,82 – 179,87 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица ламинина альфа-5 представляет собой белок , который у человека кодируется LAMA5 геном .

Функция

Компоненты внеклеточного матрикса оказывают множество эффектов на ткани по всему организму. В частности, ламинины, семейство гетеротримерных внеклеточных гликопротеинов, влияют на развитие и целостность тканей в таких различных органах, как почки, легкие, кожа и нервная система. Считается, что ламинины опосредуют прикрепление, миграцию и организацию клеток в ткани во время эмбрионального развития путем взаимодействия с другими компонентами внеклеточного матрикса. Ламинины функционируют как гетеротримерные комплексы альфа-, бета- и гамма-цепей, причем каждый тип цепи представляет отдельное подсемейство белков. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к альфа-подсемейству цепей ламинина и является основным компонентом базальных мембран. Для этого гена обнаружено два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы, но полноразмерная природа одного из них не установлена.

Взаимодействия

Было показано, что ламинин, альфа 5, взаимодействует с BCAM .

Дальнейшее чтение

• Утани А., Номидзу М., Ямада Ю. (январь 1997 г.). «Фибулин-2 связывается с короткими плечами ламинина-5 и ламинина-1 посредством консервативных аминокислотных последовательностей» . Журнал биологической химии . 272 (5): 2814–20. дои : 10.1074/jbc.272.5.2814 . ПМИД   9006922 .
• Руссель П., Кин Д.Р., Руджеро Ф., Шамплио М.Ф., Рест М., Бургесон Р.Э. (август 1997 г.). «Ламинин 5 связывает домен NC-1 коллагена типа VII» . Журнал клеточной биологии . 138 (3): 719–28. дои : 10.1083/jcb.138.3.719 . ПМК   2141627 . ПМИД   9245798 .
• Тайгер К.Ф., Шамплио М.Ф., Педроса-Домеллоф Ф., Торнелл Л.Е., Экблом П., Гуллберг Д. (ноябрь 1997 г.). «Наличие цепи ламинина альфа5 и отсутствие цепи ламинина альфа1 во время развития мышц человека и при мышечных дистрофиях» . Журнал биологической химии . 272 (45): 28590–5. дои : 10.1074/jbc.272.45.28590 . ПМИД   9353324 .
• Мровец Т., Мельчар С., Горский А. (1998). «Опосредованные ВИЧ-белком изменения во взаимодействии Т-клеток с белками внеклеточного матрикса и эндотелием». Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis . 45 (2–3): 255–9. ПМИД   9597096 .
• Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (февраль 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (1): 31–9. дои : 10.1093/dnares/5.1.31 . ПМИД   9628581 .
• Симидзу Х., Хосокава Х., Ниномия Х., Майнер Дж.Х., Масаки Т. (апрель 1999 г.). «Адгезия культивируемых эндотелиальных клеток аорты крупного рогатого скота к ламинину-1, опосредованная дистрогликаном» . Журнал биологической химии . 274 (17): 11995–2000. дои : 10.1074/jbc.274.17.11995 . hdl : 2433/180895 . ПМИД   10207021 .
• Сон Ю.Дж., Скрэнтон Т.В., Сандерленд У.Дж., Пэк С.Дж., Майнер Дж.Х., Санес Дж.Р., Карлсон СС (январь 2000 г.). «Белок синаптических пузырьков SV2 образует комплекс с альфа5-содержащим ламинином на поверхности нервного окончания» . Журнал биологической химии . 275 (1): 451–60. дои : 10.1074/jbc.275.1.451 . ПМИД   10617638 .
• Келер Д., Крузе М., Штекер В., Стерчи Э.Э. (январь 2000 г.). «Гетерологически сверхэкспрессированный, аффинно очищенный меприн альфа человека функционально активен и расщепляет компоненты базальной мембраны in vitro» . Письма ФЭБС . 465 (1): 2–7. дои : 10.1016/S0014-5793(99)01712-3 . ПМИД   10620696 . S2CID   22895580 .
• Киккава И., Санзен Н., Фудзивара Х., Зонненберг А., Секигути К. (март 2000 г.). «Специфичность связывания ламинина-10/11 с интегрином: ламинин-10/11 распознается интегринами альфа-3-бета-1, альфа-6-бета-1 и альфа-6-бета-4». Журнал клеточной науки . 113 (Часть 5) (5): 869–7 дои : 10.1242/jcs.113.5.869 . ПМИД   10671376 .
• Шамплио М.Ф., Виртанен И., Тайгер К.Ф., Корхонен М., Бургесон Р., Гуллберг Д. (сентябрь 2000 г.). «Посттрансляционные модификации и ассоциации бета-/гамма-цепей цепей ламинина альфа1 и альфа5 человека: очистка ламинина-3 из плаценты». Экспериментальные исследования клеток . 259 (2): 326–35. дои : 10.1006/excr.2000.4980 . ПМИД   10964500 .
• Либби Р.Т., Шамплио М.Ф., Клодепьер Т., Сюй Ю., Гиббонс Э.П., Кох М., Бергесон Р.Э., Хантер Д.Д., Бранкен У.Дж. (сентябрь 2000 г.). «Экспрессия ламинина у взрослых и развивающихся сетчаток: свидетельства существования двух новых ламининов ЦНС» . Журнал неврологии . 20 (17): 6517–28. doi : 10.1523/JNEUROSCI.20-17-06517.2000 . ПМЦ   2924637 . ПМИД   10964957 .
• Пирс Р.А., Гриффин Г.Л., Майнер Дж.Х., старший менеджер (декабрь 2000 г.). «Схемы экспрессии ламинина альфа1 и альфа5 в легких человека во время развития». Американский журнал респираторной клеточной и молекулярной биологии . 23 (6): 742–7. дои : 10.1165/ajrcmb.23.6.4202 . ПМИД   11104726 .
• Парсонс С.Ф., Ли Дж., Спринг Ф.А., Уиллиг Т.Н., Питерс Л.Л., Гимм Дж.А., Таннер М.Дж., Мохандас Н., Ансти DJ, Чейсис Дж.А. (январь 2001 г.). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают человеческий ламинин, содержащий цепь альфа5, с высоким сродством» . Кровь . 97 (1): 312–20. дои : 10.1182/blood.V97.1.312 . ПМИД   11133776 . S2CID   10715366 .
• Сагизаде М, Браун Д.Д., Кастельон Р., Чва М., Хуанг Г.Х., Любимова Дж.Ю., Розенберг С., Спирин К.С., Столитенко Р.Б., Адачи В., Киношита С., Мерфи Г., Виндзор Л.Дж., Кенни М.К., Любимов А.В. (февраль 2001 г.). «Сверхэкспрессия матриксной металлопротеиназы-10 и матриксной металлопротеиназы-3 в роговице человека с диабетом: возможный механизм изменений базальной мембраны и интегрина» . Американский журнал патологии . 158 (2): 723–34. дои : 10.1016/S0002-9440(10)64015-1 . ПМК   1850323 . ПМИД   11159210 .
• МакАртур С.П., Ван И., Херут Д., Густафсон С. (июнь 2001 г.). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнной железы человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Архивы оральной биологии . 46 (6): 545–55. дои : 10.1016/S0003-9969(01)00014-0 . ПМИД   11311202 .
• Ганю-Паласиос Л., Аллегра М., Спирито Ф., Поммере О., Ромеро С., Ортонн Дж.П., Менегузци Г. (май 2001 г.). «Короткое плечо цепи ламинина гамма2 играет ключевую роль во включении ламинина 5 во внеклеточный матрикс и в клеточной адгезии» . Журнал клеточной биологии . 153 (4): 835–50. дои : 10.1083/jcb.153.4.835 . ПМК   2192378 . ПМИД   11352943 .
• Нагасе Т., Кикуно Р., Охара О (август 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XXI. Полные последовательности 60 новых клонов кДНК головного мозга, кодирующих крупные белки» . Исследование ДНК . 8 (4): 179–87. дои : 10.1093/dnares/8.4.179 . ПМИД   11572484 .
• Дой М., Тайболл Дж., Кортесмаа Дж., Янссон К., Ииванейнен А., Парвардех М., Тимпл Р., Хедин У., Сведенборг Дж., Трюггвасон К. (апрель 2002 г.). «Рекомбинантный человеческий ламинин-10 (альфа5бета1гамма1). Производство, очистка и способствующая миграции активность на сосудистых эндотелиальных клетках» . Журнал биологической химии . 277 (15): 12741–8. дои : 10.1074/jbc.M111228200 . ПМИД   11821406 .