Бревикан

БКАН
Идентификаторы
Псевдонимы	BCAN , BEHAB, CSPG7, Бревикан
Внешние идентификаторы	Опустить : 600347 ; МГИ : 1096385 ; Гомологен : 7244 ; GeneCards : BCAN ; OMA : BCAN — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	156,659,532 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	88,000,230 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; amygdala; ; anterior cingulate cortex; ; right frontal lobe; ; nucleus accumbens; ; caudate nucleus; ; putamen; ; ganglionic eminence; ; prefrontal cortex; ; Brodmann area 9;
	Top expressed in
	superior frontal gyrus; ; entorhinal cortex; ; primary visual cortex; ; perirhinal cortex; ; CA3 field; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; cerebellar cortex; ; central gray substance of midbrain; ; nucleus of stria terminalis; ; superior colliculus;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	hyaluronic acid binding; carbohydrate binding; extracellular matrix structural constituent;
Cellular component	membrane; extracellular region; lysosomal lumen; Golgi lumen; anchored component of membrane; extracellular matrix; glutamatergic synapse;
Biological process	skeletal system development; chondroitin sulfate biosynthetic process; extracellular matrix organization; central nervous system development; chondroitin sulfate catabolic process; dermatan sulfate biosynthetic process; hippocampus development; cell adhesion; synapse maturation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	63827
	12032
	ENSG00000132692
	ENSMUSG00000004892
	Q96GW7
	Q61361
	НМ_021948 ; НМ_198427
	НМ_001109758 ; НМ_007529
	НП_068767 ; НП_940819
	НП_001103228 ; НП_031555
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Коровый белок Бревикана — это белок , который у человека кодируется BCAN геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Бревикан является членом семейства белков лектиканов .

Бревикан локализуется на поверхности нейронов головного мозга . ^{[ 8 ]} В меланоцитарных клетках экспрессия гена BCAN может регулироваться с помощью MITF . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000132692 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004892 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гэри С.К., Зерилло К.А., Чанг В.Л., Го Джу, Грей Дж., Хокфилд С. (октябрь 2000 г.). «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и анализ экспрессии человеческого BEHAB/бревикана, специфичного для мозга протеогликана, регулируемого во время развития коры головного мозга и в глиоме» . Джин . 256 (1–2): 139–47. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00362-0 . ПМИД 11054543 .
^ Номото Х., Оохаси Т., Хиракава С., Уэки Ю., Оцуки Х., Ниномия Ю. (февраль 2002 г.). «Человеческие гены BRAL1 и BCAN, принадлежащие к суперсемейству link-модулей, тандемно расположены на хромосоме 1q21-23». Акта Медика Окаяма . 56 (1): 25–9. ПМИД 11873941 .
^ «Энтрез Джин: BCAN brevican» .
^ Фришкнехт Р., Зайденбехер К.И. (июль 2012 г.). «Бревикан: ключевой протеогликан в перисинаптическом внеклеточном матриксе мозга». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 44 (7): 1051–4. doi : 10.1016/j.biocel.2012.03.022 . ПМИД 22537913 .
^ Хук К.С., Шлегель Н.К., Айххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус С., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергштейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–76. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . ПМИД 19067971 .

Дальнейшее чтение

Ху Б., Конг Л.Л., Мэтьюз Р.Т., Виапьяно М.С. (сентябрь 2008 г.). «Протеогликан бревикан связывается с фибронектином после протеолитического расщепления и способствует подвижности клеток глиомы» . Журнал биологической химии . 283 (36): 24848–59. дои : 10.1074/jbc.M801433200 . ПМЦ 3259830 . ПМИД 18611854 .
Зайденбехер К.И., Рихтер К., Раух Ю., Фесслер Р., Гарнер К.С., Гундельфингер Э.Д. (ноябрь 1995 г.). «Бревикан, протеогликан хондроитинсульфата мозга крысы, встречается в виде секретируемых изоформ, закрепленных на клеточной поверхности гликозилфосфатидилинозитолом» . Журнал биологической химии . 270 (45): 27206–12. дои : 10.1074/jbc.270.45.27206 . ПМИД 7592978 .
Аспберг А., Миура Р., Бурдулус С., Шимонака М., Хайнегард Д., Шахнер М., Руослахти Е., Ямагути Ю. (сентябрь 1997 г.). «Домены лектина C-типа лектиканов, семейства агрегирующих протеогликанов хондроитинсульфата, связывают тенасцин-R посредством белок-белковых взаимодействий, независимых от углеводной части» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (19): 10116–21. Бибкод : 1997PNAS...9410116A . дои : 10.1073/pnas.94.19.10116 . ПМК 23322 . ПМИД 9294172 .
Накамура Х., Фуджи Ю., Иноки И., Сугимото К., Танзава К., Мацуки Х., Миура Р., Ямагути Ю., Окада Ю. (декабрь 2000 г.). «Бревикан разлагается матриксными металлопротеиназами и аггреканазой-1 (ADAMTS4) в разных местах» . Журнал биологической химии . 275 (49): 38885–90. дои : 10.1074/jbc.M003875200 . ПМИД 10986281 .
Олин А.И., Мергелин М., Сасаки Т., Тимпл Р., Хайнегорд Д., Аспберг А. (январь 2001 г.). «Протеогликаны аггрекан и версикан образуют сети с фибулином-2 посредством связывания их лектинового домена» . Журнал биологической химии . 276 (2): 1253–61. дои : 10.1074/jbc.M006783200 . ПМИД 11038354 .
Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Браш Дж., Чен Дж., Чоу Б., Чуй С., Кроули С., Каррелл Б., Деуэл Б., Дауд П., Итон Д., Фостер Дж., Гримальди С., Гу Q , Хасс П.Е., Хелденс С., Хуанг А., Ким Х.С., Климовски Л., Джин Ю., Джонсон С., Ли Дж., Льюис Л., Ляо Д., Марк М., Робби Э., Санчес С., Шенфельд Дж., Сешагири С., Симмонс Л., Сингх Дж., Смит В., Стинсон Дж., Вагтс А., Вандлен Р., Ватанабе С., Вианд Д., Вудс К., Се М.Х., Янсура Д., Йи С., Ю Г., Юань Дж., Чжан М., Чжан З., Годдард А., Вуд В.И., Годовский П., Грей А. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики» . Геномные исследования . 13 (10): 2265–70. дои : 10.1101/гр.1293003 . ПМЦ 403697 . ПМИД 12975309 .
Сюй XM, Чен Ю, Чен Дж, Ян С, Гао Ф, Андерхилл CB, Кресвелл К, Чжан Л (сентябрь 2003 г.). «Пептид с тремя мотивами, связывающими гиалуронан, ингибирует рост опухоли и индуцирует апоптоз». Исследования рака . 63 (18): 5685–90. ПМИД 14522884 .
Бекку Ю., Су В.Д., Хиракава С., Фесслер Р., Оцука А., Кан Дж.С., Сандерс Дж., Мураками Т., Ниномия Ю., Оохаси Т. (сентябрь 2003 г.). «Молекулярное клонирование Bral2, нового белка, специфичного для мозга, и иммуногистохимическая колокализация с бревиканом в перинейрональных сетях». Молекулярная и клеточная нейронауки . 24 (1): 148–59. дои : 10.1016/S1044-7431(03)00133-7 . ПМИД 14550776 . S2CID 25762224 .
Дун Ю, Хань Х, Сюэ Ю, Дун Б, Го Х, Ху Г, Чжу С, Лу Ю (февраль 2004 г.). «Секретируемая мРНК бревикана экспрессируется в гипофизе взрослых крыс». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 314 (3): 745–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2003.12.151 . ПМИД 14741698 .
Виапьяно М.С., Би В.Л., Пипмайер Дж., Хокфилд С., Мэтьюз Р.Т. (август 2005 г.). «Новые опухолеспецифические изоформы BEHAB/бревикан, выявленные в злокачественных глиомах человека» . Исследования рака . 65 (15): 6726–33. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-0585 . ПМИД 16061654 .
Накада М., Миямори Х., Кита Д., Такахаси Т., Ямасита Дж., Сато Х., Миура Р., Ямагути Ю., Окада Ю. (сентябрь 2005 г.). «Человеческие глиобластомы сверхэкспрессируют ADAMTS-5, который разрушает бревикан». Акта Нейропатологика . 110 (3): 239–46. дои : 10.1007/ s00401-005-1032-6 ПМИД 16133547 . S2CID 25744956 .
Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х.Ю. , Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Внешние ссылки

человека Расположение генома BCAN и страница сведений о гене BCAN в браузере генома UCSC .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000132692 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004892 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11054543-5] Гэри С.К., Зерилло К.А., Чанг В.Л., Го Джу, Грей Дж., Хокфилд С. (октябрь 2000 г.). «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и анализ экспрессии человеческого BEHAB/бревикана, специфичного для мозга протеогликана, регулируемого во время развития коры головного мозга и в глиоме» . Джин . 256 (1–2): 139–47. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00362-0 . ПМИД 11054543 .

[pmid11873941-6] Номото Х., Оохаси Т., Хиракава С., Уэки Ю., Оцуки Х., Ниномия Ю. (февраль 2002 г.). «Человеческие гены BRAL1 и BCAN, принадлежащие к суперсемейству link-модулей, тандемно расположены на хромосоме 1q21-23». Акта Медика Окаяма . 56 (1): 25–9. ПМИД 11873941 .

[entrez-7] «Энтрез Джин: BCAN brevican» .

[pmid22537913-8] Фришкнехт Р., Зайденбехер К.И. (июль 2012 г.). «Бревикан: ключевой протеогликан в перисинаптическом внеклеточном матриксе мозга». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 44 (7): 1051–4. doi : 10.1016/j.biocel.2012.03.022 . ПМИД 22537913 .

[pmid19067971-9] Хук К.С., Шлегель Н.К., Айххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус С., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергштейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые цели MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии микрочипов ДНК» . Исследование пигментных клеток и меланомы . 21 (6): 665–76. дои : 10.1111/j.1755-148X.2008.00505.x . ПМИД 19067971 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]