Лектин бобовых

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1apn, 1avb, 1ax0, 1ax1, 1ax2, 1axy, 1axz, 1azd, 1bjq, 1bqp, 1bxh, 1bzw, 1ces, 1ciw, 1cjp, 1cn1, 1con, 1cq9, 1cr7, 1cvn, 1dbn, 1dgl, 1dhk, 1dq0, 1dq1, 1dq2, 1dq4, 1dq5, 1dq6, 1dzq, 1enq, 1enr, 1ens, 1f9k, 1fat, 1fay, 1fny, 1fnz, 1fx5, 1fyu, 1g7y, 1g8w, 1g9f, 1gic, 1gkb, 1gnz, 1gsl, 1gz9, 1gzc, 1h9p, 1h9w, 1hkd, 1hql, 1hqw, 1i3h, 1ioa, 1jbc, 1jn2, 1joj, 1jui, 1jw6, 1jxn, 1jyc, 1jyi, 1lec, 1led, 1lem, 1len, 1les, 1lgb, 1lgc, 1loa, 1lob, 1loc, 1lod, 1loe, 1lof, 1log, 1lte, 1lu1, 1lu2, 1lul, 1mvq, 1n3o, 1n3p, 1n3q, 1n47, 1nls, 1nxd, 1ofs, 1ona, 1q8o, 1q8p, 1q8q, 1q8s, 1q8v, 1qdc, 1qdo, 1qf3, 1qgl, 1qmo, 1qnw, 1qny, 1qoo, 1qos, 1qot, 1rin, 1rir, 1rit, 1s1a, 1sbd, 1sbe, 1sbf, 1scr, 1scs, 1sfy, 1tei, 1ukg, 1uzy, 1uzz, 1v00, 1v6i, 1v6j, 1v6k, 1v6l, 1v6m, 1v6n, 1v6o, 1val, 1vam, 1viw, 1vln, 1wbf, 1wbl, 1wuv, 2a7a, 2ar6, 2arb, 2are, 2arx, 2auy, 2b7y, 2bqp, 2cna, 2ctv, 2cwm, 2cy6, 2cyf, 2d3p, 2d3r, 2d3s, 2d7f, 2dh1, 2dtw, 2dty, 2du0, 2du1, 2dv9, 2dva, 2dvb, 2dvd, 2dvf, 2dvg, 2e51, 2e53, 2e7q, 2e7t, 2ef6, 2eig, 2enr, 2fmd, 2g4i, 2gdf, 2gme, 2gmm, 2gmp, 2gn3, 2gn7, 2gnb, 2gnd, 2gnm, 2gnt, 2jdz, 2je7, 2je9, 2jec, 2lal, 2ltn, 2ovu, 2ow4, 2p2k, 2p34, 2p37, 2pel, 2phf, 2phr, 2pht, 2phu, 2phw, 2phx, 2sba, 2tep, 2uu8, 2zbj, 2zmk, 2zml, 2zmn, 3cna, 3d4k, 3enr, 5cna

Домен лектина бобовых (или домен лектина L-типа)
Домен лектина бобовых (или домен лектина L-типа)
	Структура сайта связывания моносахаридов лектина чечевицы.
Идентификаторы
Символ	Lectin_legB
Пфам	PF00139
Пфам Клан	CL0004
ИнтерПро	ИПР001220
PROSITE	PDOC00278
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1лем / СКОПе / СУПФАМ
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1apn, 1avb, 1ax0, 1ax1, 1ax2, 1axy, 1axz, 1azd, 1bjq, 1bqp, 1bxh, 1bzw, 1ces, 1ciw, 1cjp, 1cn1, 1con, 1cq9, 1cr7, 1cvn, 1dbn, 1dgl, 1dhk, 1dq0, 1dq1, 1dq2, 1dq4, 1dq5, 1dq6, 1dzq, 1enq, 1enr, 1ens, 1f9k, 1fat, 1fay, 1fny, 1fnz, 1fx5, 1fyu, 1g7y, 1g8w, 1g9f, 1gic, 1gkb, 1gnz, 1gsl, 1gz9, 1gzc, 1h9p, 1h9w, 1hkd, 1hql, 1hqw, 1i3h, 1ioa, 1jbc, 1jn2, 1joj, 1jui, 1jw6, 1jxn, 1jyc, 1jyi, 1lec, 1led, 1lem, 1len, 1les, 1lgb, 1lgc, 1loa, 1lob, 1loc, 1lod, 1loe, 1lof, 1log, 1lte, 1lu1, 1lu2, 1lul, 1mvq, 1n3o, 1n3p, 1n3q, 1n47, 1nls, 1nxd, 1ofs, 1ona, 1q8o, 1q8p, 1q8q, 1q8s, 1q8v, 1qdc, 1qdo, 1qf3, 1qgl, 1qmo, 1qnw, 1qny, 1qoo, 1qos, 1qot, 1rin, 1rir, 1rit, 1s1a, 1sbd, 1sbe, 1sbf, 1scr, 1scs, 1sfy, 1tei, 1ukg, 1uzy, 1uzz, 1v00, 1v6i, 1v6j, 1v6k, 1v6l, 1v6m, 1v6n, 1v6o, 1val, 1vam, 1viw, 1vln, 1wbf, 1wbl, 1wuv, 2a7a, 2ar6, 2arb, 2are, 2arx, 2auy, 2b7y, 2bqp, 2cna, 2ctv, 2cwm, 2cy6, 2cyf, 2d3p, 2d3r, 2d3s, 2d7f, 2dh1, 2dtw, 2dty, 2du0, 2du1, 2dv9, 2dva, 2dvb, 2dvd, 2dvf, 2dvg, 2e51, 2e53, 2e7q, 2e7t, 2ef6, 2eig, 2enr, 2fmd, 2g4i, 2gdf, 2gme, 2gmm, 2gmp, 2gn3, 2gn7, 2gnb, 2gnd, 2gnm, 2gnt, 2jdz, 2je7, 2je9, 2jec, 2lal, 2ltn, 2ovu, 2ow4, 2p2k, 2p34, 2p37, 2pel, 2phf, 2phr, 2pht, 2phu, 2phw, 2phx, 2sba, 2tep, 2uu8, 2zbj, 2zmk, 2zml, 2zmn, 3cna, 3d4k, 3enr, 5cna

Лектины бобовых (или лектины L-типа) представляют собой семейство сахаросвязывающих белков или лектинов, содержащихся в семенах и, в меньших количествах, в корнях, стеблях, листьях и коре растений семейства Fabaceae . ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Точная функция лектинов бобовых in vivo неизвестна, но они, вероятно, участвуют в защите растений от хищников. Родственные белки также были обнаружены в других семействах растений и животных. Их десятилетиями использовали в качестве модельной системы для изучения белково-углеводных взаимодействий, поскольку они демонстрируют широкий спектр специфичностей связывания, их легко получить, очистить и охарактеризовать структуру. ^{[ 3 ]} Хорошо изученные члены этого семейства белков включают фитогемагглютинин , агглютинины сои и конканавалин А.

Связывание сахара лектинами бобовых

Лектины бобовых используют гениальную структуру для связывания определенных сахаров. Эта структура состоит из консервативного сайта связывания моносахарида, в котором четыре консервативных остатка из четырех отдельных областей белка придают аффинность (см. Рисунок), вариабельной петли, которая придает моносахариду специфичность и ряд субсайтов вокруг сайта связывания моносахарида, которые содержат дополнительные остатки сахара или гидрофобные группы. ^{[ 3 ]}

Четвертичная структура

Лектины бобовых интересны и с точки зрения структуры белка. Несмотря на консервативную структуру субъединицы лектина бобовых, они могут принимать широкий спектр четвертичных структур. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Причину такой замечательной изменчивости, вероятно, следует искать во взаимодействии с многовалентными лигандами. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Лорис Р., Кассет Ф., Букерт Дж. и др. (декабрь 1994 г.). «Сайт связывания моносахаридов лектина чечевицы: исследование рентгеновского и молекулярного моделирования». Гликокондж. Дж . 11 (6): 507–17. дои : 10.1007/bf00731301 . ПМИД 7696853 . S2CID 20037257 .
^ Шэрон Н., Лис Х. (ноябрь 1990 г.). «Лектины бобовых — большое семейство гомологичных белков» . ФАСЕБ Дж . 4 (14): 3198–208. дои : 10.1096/fasebj.4.14.2227211 . ПМИД 2227211 . S2CID 23310019 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Лорис Р., Хамелрик Т., Букерт Дж., Винс Л. (март 1998 г.). «Структура лектина бобовых». Биохим. Биофиз. Акта . 1383 (1): 9–36. дои : 10.1016/S0167-4838(97)00182-9 . ПМИД 9546043 .
^ Манодж Н., Сугуна К. (октябрь 2001 г.). «Признак четвертичной структуры в последовательностях лектинов бобовых» . Белок англ . 14 (10): 735–45. дои : 10.1093/протеин/14.10.735 . ПМИД 11739891 .
^ Браузер PDBe для сборок лектинов бобовых.
^ Хамелрик Т.В., Мур Дж.Г., Криспилс М.Дж., Лорис Р., Винс Л. (июнь 2000 г.). «Роль слабых белок-белковых взаимодействий в связывании многовалентных лектинов с углеводами: кристаллическая структура сшитого FRIL». Дж. Мол. Биол . 299 (4): 875–83. дои : 10.1006/jmbi.2000.3785 . ПМИД 10843844 .

[pmid7696853-1] Лорис Р., Кассет Ф., Букерт Дж. и др. (декабрь 1994 г.). «Сайт связывания моносахаридов лектина чечевицы: исследование рентгеновского и молекулярного моделирования». Гликокондж. Дж . 11 (6): 507–17. дои : 10.1007/bf00731301 . ПМИД 7696853 . S2CID 20037257 .

[pmid2227211-2] Шэрон Н., Лис Х. (ноябрь 1990 г.). «Лектины бобовых — большое семейство гомологичных белков» . ФАСЕБ Дж . 4 (14): 3198–208. дои : 10.1096/fasebj.4.14.2227211 . ПМИД 2227211 . S2CID 23310019 .

[pmid9546043-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с Лорис Р., Хамелрик Т., Букерт Дж., Винс Л. (март 1998 г.). «Структура лектина бобовых». Биохим. Биофиз. Акта . 1383 (1): 9–36. дои : 10.1016/S0167-4838(97)00182-9 . ПМИД 9546043 .

[pmid11739891-4] Манодж Н., Сугуна К. (октябрь 2001 г.). «Признак четвертичной структуры в последовательностях лектинов бобовых» . Белок англ . 14 (10): 735–45. дои : 10.1093/протеин/14.10.735 . ПМИД 11739891 .

[5] Браузер PDBe для сборок лектинов бобовых.

[FRIL-6] Хамелрик Т.В., Мур Дж.Г., Криспилс М.Дж., Лорис Р., Винс Л. (июнь 2000 г.). «Роль слабых белок-белковых взаимодействий в связывании многовалентных лектинов с углеводами: кристаллическая структура сшитого FRIL». Дж. Мол. Биол . 299 (4): 875–83. дои : 10.1006/jmbi.2000.3785 . ПМИД 10843844 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]