Лектин C-типа
| Домен лектина C-типа | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Лектин_С | ||
| Пфам | PF00059 | ||
| ИнтерПро | ИПР001304 | ||
| УМНЫЙ | КЛЕКТ | ||
| PROSITE | PS50041 | ||
| СКОП2 | 2 мсб / СКОПе / СУПФАМ | ||
| CDD | cd00037 | ||
| |||
Лектин C-типа ( CLEC ) представляет собой тип белка , связывающего углеводы, известного как лектин . [3] Обозначение C-типа обусловлено их потребностью в кальции для связывания. [4] Белки, содержащие домены лектина C-типа, обладают разнообразным спектром функций, включая межклеточную адгезию, иммунный ответ на патогены и апоптоз . [5] [6]
Классификация
[ редактировать ]Дрикамер и др. классифицировали лектины C-типа на 7 подгрупп (от I до VII) в зависимости от порядка расположения различных белковых доменов в каждом белке. [7] Эта классификация была впоследствии обновлена в 2002 году, в результате чего было создано семь дополнительных групп (с VIII по XIV). [8] Совсем недавно были добавлены еще три подгруппы (с XV по XVII). [3]
| Группа | Имя | Связанные домены |
|---|---|---|
| я | мусорить | EGF , Sushi Домены , Ig и Link |
| II | Асиалогликопротеин и рецепторы DC | Никто |
| III | Коллекционирование | Никто |
| IV | Селектины | Суши и EGF домены |
| V | NK - клеточные рецепторы | Никто |
| МЫ | Эндоцитарные рецепторы мульти-CTLD | Домены FnII и рицина |
| VII | Рег группа | Никто |
| VIII | Хондролектин , Лайилин | Никто |
| IX | Тетранектин | Никто |
| Х | Полицистин | Домены WSC, REJ, PKD |
| XI | Аттрактин ( ATRN ) | PSI, EGF Домены и CUB |
| XII | Главный основной белок эозинофилов (EMBP) | Никто |
| XIII | ДГКР2 | Никто |
| XIV | Тромбомодулин , CD93 , CD248 , CLEC14A | EGF- домены [9] |
| XV | бимлек | Никто |
| XVI | SEC | SCP и EGF Домены |
| XVII | CBCP/ Frem1 /QBRICK | Повторы CSPG и CalX-бета домены |
CLEC включают в себя:
- CLEC1A , CLEC1B
- CLEC2A , CLEC2B , CD69 (CLEC2C), CLEC2D , CLEC2L
- CLEC3A , CLEC3B
- CLEC4A , CLEC4C , CLEC4D , CLEC4E , CLEC4F , CLEC4G , ASGR1 (CLEC4H1), ASGR2 (CLEC4H2), FCER2 (CLEC4J), CD207 (CLEC4K), CD209 (CLEC4L), CLEC4M
- CLEC5A
- CLEC6A
- CLEC7A
- ОЛР1 (CLEC8A)
- CLEC9A
- CLEC10A
- CLEC11A
- CLEC12A , CLEC12B
- CD302 (CLEC13A), LY75 (CLEC13B), PLA2R1 (CLEC13C), MRC1 (CLEC13D), MRC2 (CLEC13E)
- CLEC14A
- CLEC16A
- CLEC17A
«Лектиноподобные рецепторы NK-клеток» представляют собой очень тесно связанную группу: [10]
- КЛРА1
- КЛРБ1 (CLEC5B)
- КЛРК1 , КЛРК2 , КЛРК3 , КЛРК4
- КЛРД1
- КЛРФ1 (CLEC5C)
- КЛРГ1 (CLEC15A), КЛРГ2 (CLEC15B)
- КЛРК1
Дополнительные белки, содержащие этот домен, включают:
- АРУ1 ; АТРНЛ1
- БКАН
- CD248 ; CD72 ; CD93 ; ЧОДЛ ; КЛ-К1-Я ; CL-K1-Ib ; CL-K1-Ic ; CLECSF5 ; КОЛЕК10 ; КОЛЕК11 ; КОЛЕК12 ; CSPG3
- ФЦЕР2 ; ФРЕМ1 ; HBXBP ;
- ЛАЙН ; ЛОК348174 ; ЛОК728276
- МАФА ; МБЛ2 ; МГК34761 ; МИКЛ ; MRC1L1
- ОЛР1
- ПАП ; ПКД1 ; ПКД1Л2 ; ПЛА2Р1 ; ПРГ2 ; ПРГ3
- РЕГ1А ; РЕГ1Б ; РЕГ3А ; РЕГ3Г ; РЕГ4
- СЕЛЕ ; ПРОДАВАТЬ ; СЭЛП ; СФТПА1 ; СФТПА2 ; СФТПА2Б ; СФТПД ; СРКЛ
- THBD
- ВКАН
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Уокер-младший, Нагар Б., Янг Н.М., Хирама Т., Рини Дж.М. (апрель 2004 г.). «Рентгеновская кристаллическая структура галактозоспецифического лектина C-типа, обладающего новой декамерной четвертичной структурой». Биохимия . 43 (13): 3783–92. дои : 10.1021/bi035871a . ПМИД 15049685 .
- ^ Махла Р.С., Редди MC, Прасад Д.В., Кумар Х (сентябрь 2013 г.). «Подслащивающие PAMP: роль PAMP в комплексе с сахаром во врожденном иммунитете и биологии вакцин» . Границы в иммунологии . 4 : 248. дои : 10.3389/fimmu.2013.00248 . ПМЦ 3759294 . ПМИД 24032031 .
- ^ Jump up to: а б Зеленский А.Н., Гриди Дж.Э. (декабрь 2005 г.). «Суперсемейство лектиноподобных доменов C-типа». ФЕБС Дж . 272 (24): 6179–217. дои : 10.1111/j.1742-4658.2005.05031.x . ПМИД 16336259 . S2CID 7084402 .
- ^ C-тип + лектин Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
- ^ Дрикамер К. (октябрь 1999 г.). «Лектиноподобные домены C-типа». Курс. Мнение. Структура. Биол . 9 (5): 585–90. дои : 10.1016/S0959-440X(99)00009-3 . ПМИД 10508765 .
- ^ Камби А., Фигдор С (май 2009 г.). «Некроз: лектины C-типа ощущают смерть клеток» . Курс. Биол . 19 (9): R375–8. Бибкод : 2009CBio...19.R375C . дои : 10.1016/j.cub.2009.03.032 . ПМИД 19439262 . S2CID 17409821 .
- ^ Дрикамер К. (1993). «Эволюция Ca(2+)-зависимых лектинов животных» . Прог. Нуклеиновая кислота Рез. Мол. Биол . Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии. 45 : 207–32. дои : 10.1016/S0079-6603(08)60870-3 . ISBN 978-0-12-540045-9 . ПМИД 8341801 .
- ^ Дрикамер К., Фадден А.Дж. (2002). «Геномный анализ лектинов С-типа». Биохим. Соц. Симп . 69 (69): 59–72. дои : 10.1042/bss0690059 . ПМИД 12655774 .
- ^ Хан, Калифорния; МакМюррей, Дж.Л.; Мохаммед, Ф.; Бикнелл, Р. (2019). «Белки группы 14 доменов лектина C-типа в сосудистой биологии, раке и воспалении» . Журнал ФЭБС . 286 (17): 3299–3332. дои : 10.1111/февраль 14985 . ПМЦ 6852297 . ПМИД 31287944 .
- ^ NK+клетки+лектиноподобные+рецепторы Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Functional Glycomics Gateway , результат сотрудничества Консорциума функциональной гликомики и Nature Publishing Group.