Филовириды
Филовириды | |
---|---|
вируса Эбола Структура и геном | |
Электронная микрофотография вируса Марбурга | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Сорт: | Монхивирицетес |
Заказ: | Мононегавирусы |
Семья: | Филовириды |
Роды | |
Filoviridae ( / ˌ f aɪ l oʊ ˈ v ɪr ɪ d iː / [ 1 ] ) — семейство одноцепочечных РНК-вирусов с отрицательным смыслом из отряда Mononegavirales . [ 2 ] Двумя широко известными членами этого семейства являются вирус Эбола и вирус Марбург . Оба вируса и некоторые из их менее известных родственников вызывают тяжелые заболевания у людей и приматов в виде вирусных геморрагических лихорадок . [ 3 ]
Все филовирусы классифицируются в США как избранные агенты . [ 4 ] Всемирной организацией здравоохранения как патогены группы риска 4 (требующие сдерживания, эквивалентного уровню биобезопасности 4 ), [ 5 ] Национальными институтами здравоохранения / Национальным институтом аллергии и инфекционных заболеваний как приоритетные патогены категории А, [ 6 ] и Центрами по контролю и профилактике заболеваний как агенты биотерроризма категории А , [ 7 ] и внесены в список биологических агентов экспортного контроля Австралийской группы . [ 8 ]
Использование термина
[ редактировать ]Семейство . Filoviridae — вирусологический таксон , определенный в 1982 году [ 3 ] и с поправками, внесенными в 1991 г., [ 9 ] 1998, [ 10 ] 2000, [ 11 ] 2005, [ 12 ] 2010 [ 13 ] и 2011. [ 14 ] В настоящее время семейство включает шесть вирусов родов Cuevavirus , Dianlovirus , Ebolavirus , Marburgvirus , Striavirus и Thamnovirus и включено в порядок Mononegavirales . [ 13 ] Члены семейства (т.е. реальные физические объекты) называются филовирусами или филовиридами. [ 13 ] Название Filoviridae происходит от латинского существительного filum (имеющего в виду нитевидную морфологию филовирионов) и таксономического суффикса -viridae (который обозначает семейство вирусов). [ 3 ]
Примечание
[ редактировать ]Согласно правилам наименования таксонов, установленным Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV) , название Filoviridae всегда должно быть написано с заглавной буквы , курсивом , никогда не сокращаться, и ему должно предшествовать слово «семейство». Названия его членов (филовирусов или филовиридов) пишутся строчными буквами, не выделяются курсивом и употребляются без артиклей . [ 13 ] [ 14 ]
Жизненный цикл
[ редактировать ]филовируса Жизненный цикл на клеточной поверхности начинается с прикрепления вириона к специфическим рецепторам , за которым следует слияние вируса оболочки вириона с клеточными мембранами и сопутствующее высвобождение нуклеокапсида в цитозоль . Вирусная -зависимая РНК-полимераза (RdRp или РНК-реплизаза) частично снимает оболочку нуклеокапсида и транскрибирует гены РНК с положительной цепью в мРНК , которые затем транслируются в структурные и неструктурные белки . Филовирус RdRps связывается с единственным промотором, расположенным на 3'-конце генома. Транскрипция либо заканчивается после гена, либо продолжается до следующего гена. Это означает, что гены, расположенные вблизи 3'-конца генома, транскрибируются в наибольшем количестве, тогда как гены, расположенные ближе к 5'-концу, транскрибируются с наименьшей вероятностью. Таким образом, порядок генов является простой, но эффективной формой регуляции транскрипции. Наиболее распространенным белком является нуклеопротеин , концентрация которого в клетке определяет, когда RdRp переключается с транскрипции гена на репликацию генома. Репликация приводит к образованию полноразмерных антигеномов с положительной цепью, которые, в свою очередь, транскрибируются в копии генома потомства вируса с отрицательной цепью. Вновь синтезированные структурные белки и геномы самособираются и накапливаются внутри клетки. клеточная мембрана . Вирионы отпочковываются от клетки, получая свои оболочки из клеточной мембраны, из которой они отпочковываются. Зрелые частицы потомства затем заражают другие клетки, чтобы повторить цикл. [ 12 ]
Критерии включения семьи
[ редактировать ]Вирус, соответствующий критериям принадлежности к отряду Mononegavirales, является членом семейства Filoviridae, если: [ 13 ] [ 14 ]
- он вызывает вирусную геморрагическую лихорадку у некоторых приматов.
- он заражает приматов , свиней и летучих мышей в природе.
- его необходимо адаптировать путем серийного пассажа, чтобы вызвать заболевание у грызунов.
- он реплицируется исключительно в цитоплазме клетки хозяина -
- имеет геном ≈19 кб. длиной
- он имеет геном РНК , который составляет ≈1,1% массы вириона.
- его геном имеет молекулярную массу ≈4,2 × 10 6
- его геном содержит один или несколько перекрывающихся генов
- его геном содержит семь генов в порядке 3'-UTR - NP - VP35 - VP40 - GP - VP30 - VP24 - L - 5'-UTR.
- его ген VP24 не гомологичен генам других мононегавирусов.
- его геном содержит сигналы инициации и терминации транскрипции , не обнаруженные в геномах других мононегавирусов.
- образует нуклеокапсиды с плавучей плотностью в CsCl ≈1,32 г/см. 3
- он образует нуклеокапсиды с центральным аксиальным каналом (шириной ≈10–15 нм), окруженным темным слоем (шириной ≈20 нм), и наружным спиральным слоем (шириной ≈50 нм) с поперечной исчерченностью (периодичность ≈5 нм)
- класса I он экспрессирует слитый гликопротеин , который сильно N- и O - гликозилирован и ацилирован в цитоплазматическом хвосте.
- он экспрессирует белок первичного матрикса , который не гликозилирован
- он образует вирионы, которые отпочковываются от плазматической мембраны
- он образует вирионы преимущественно нитевидной формы (U- и 6-образной формы) шириной ≈80 нм и длиной несколько сотен нм и длиной до 14 мкм.
- он образует вирионы, имеющие поверхностные выступы длиной ≈7 нм, расположенные на расстоянии ≈10 нм друг от друга.
- образует вирионы с молекулярной массой ≈3,82 × 10 8 ; S ; 20W не менее 1,40 и плавучая плотность в тартрате калия ≈1,14 г/см. 3
- образует вирионы, плохо нейтрализуемые in vivo.
Семейная организация
[ редактировать ]Название рода | Название вида | Название вируса (сокращение) |
---|---|---|
Куэвавирус | Куэвавирус Лловиу | Вирус Лловиу (LLOV) |
Дианловирус | Менгла-дианловирус | Вирус Менгла (MLAV) |
Эболавирус | Бомба эболавируса | Бомбейский вирус (BOMV) |
Эболавирус Бундибугио | Вирус Бундибугио (BDBV; ранее BEBOV) | |
Рестонский эболавирус | Вирус Рестон (RESTV; ранее REBOV) | |
Вирус Эбола из Судана | Суданский вирус (SUDV; ранее SEBOV) | |
Эболавирус Тайского леса | Вирус Тайского леса (TAFV; ранее CIEBOV) | |
Заирский эболавирус | Вирус Эбола (EBOV; ранее ZEBOV) | |
Марбургвирус | Марбург | Вирус Марбург (MARV) |
Вирус Ворона (RAVV) | ||
Стриавирус | Ксиланг стриовирус | Вирус Ксилонг (XILV) |
тамновирус | Тамновирус Хуанцзяо | Вирус Хуанцзяо (HUJV) |
Филогенетика
[ редактировать ]По оценкам, частота мутаций в этих геномах составляет от 0,46 × 10 −4 и 8,21 × 10 −4 нуклеотидные замены/сайт/год. [ 15 ] По оценкам, самым последним общим предком секвенированных вариантов филовируса был 1971 год (1960–1976) для вируса Эбола, 1970 год (1948–1987 годы) для вируса Рестон и 1969 год (1956–1976 годы) для вируса Судан, причем самый поздний общий предок среди четырех видов, включенных в анализ (вирус Эбола, вирус Тай Форест, вирус Судан и вирус Рестон), оценивается в 1000–2100 лет. [ 16 ] Самый последний общий предок видов Марбурга и Судана, по-видимому, появился за 700 и 850 лет до настоящего времени соответственно. Хотя мутационные часы определили время дивергенции существующих филовирусов примерно на 10 000 лет раньше настоящего, датирование ортологичных эндогенных элементов (палеовирусов) в геномах хомяков и полевок показало, что существующие роды филовиридов имели общего предка, по крайней мере такого же древнего, как и Миоцен (около 16–23 миллионов лет назад). [ 17 ]
Кладограмма Filoviridae выглядит следующим образом: [ 18 ] [ 19 ]
Филовириды |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Палеовирусология
[ редактировать ]Филовирусы имеют историю, насчитывающую несколько десятков миллионов лет. Эндогенные вирусные элементы (EVE), которые, по-видимому, происходят от филовирусоподобных вирусов, были идентифицированы в геномах летучих мышей , грызунов , землероек , тенреков , долгопятов и сумчатых . [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] Хотя большинство филовирусоподобных EVE, по-видимому, являются псевдогенами , эволюционный анализ показывает, что ортологи, выделенные из нескольких видов летучих мышей рода Myotis, сохранились путем отбора. [ 23 ]
Вакцина
[ редактировать ]В настоящее время существует очень ограниченное количество вакцин против известного филовируса. [ 24 ] Эффективная вакцина против EBOV, разработанная в Канаде, [ 25 ] был одобрен к использованию в 2019 году в США и Европе. [ 26 ] [ 27 ] Аналогичным образом предпринимаются усилия по разработке вакцины против вируса Марбург. [ 28 ]
Проблемы мутаций и потенциал пандемии
[ редактировать ]Высказывалось серьезное беспокойство по поводу того, что очень небольшая генетическая мутация филовируса, такого как EBOV, может привести к изменению системы передачи с прямой передачи через жидкости организма на передачу воздушно-капельным путем, как это было замечено у вируса Рестона (еще одного представителя рода Ebolavirus) между инфицированными вирусами. макаки. Подобное изменение в нынешних циркулирующих штаммах EBOV может значительно увеличить уровень инфекций и заболеваний, вызванных EBOV. Однако нет никаких данных о том, что какой-либо штамм Эболы когда-либо совершал этот переход у людей. [ 29 ]
Национальный центр анализа и противодействия биозащите Министерства внутренней безопасности рассматривает риск появления в будущем мутировавшего штамма вируса Эбола с возможностью аэрозольной передачи как серьезную угрозу национальной безопасности и сотрудничает с Центрами по контролю и профилактике заболеваний (CDC). ) разработать методы обнаружения аэрозолей EBOV. [ 30 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Филовирусиды» . Словарь Merriam-Webster.com . Проверено 28 июля 2018 г.
- ^ Кун, Дж. Х.; Амарасингхе, ГК; Баслер, CF; Бавария, С; Букреев А; Чандран, К; Крозье, я; Дольник, О; Дай, Дж. М.; Форменти, ПБХ; Гриффитс, А; Хьюсон, Р; Кобингер, врач общей практики ; Лерой, EM; Мюльбергер, Э; Нетесов С.В.; Паласиос, Дж; Палий, Б; Павенска, Ю.Т.; Смитер, С.Дж.; Такада, А; Таунер, Дж. С.; Валь, В; Отчет ICTV, Консорциум (июнь 2019 г.). «Профиль таксономии вируса ICTV: Filoviridae» . Журнал общей вирусологии . 100 (6): 911–912. дои : 10.1099/jgv.0.001252 . ПМК 7011696 . ПМИД 31021739 .
- ^ Перейти обратно: а б с Кили М.П., Боуэн Э.Т., Эдди Г.А., Исааксон М., Джонсон К.М., Маккормик Дж.Б., Мерфи Ф.А., Паттин С.Р., Питерс Д., Прозески О.В., Регнери Р.Л., Симпсон Д.И., Сленчка В., Сюро П., ван дер Гроен Дж., Уэбб Пенсильвания, Вульф Х (1982). «Filoviridae: таксономический дом для вирусов Марбурга и Эболы?» . Интервирусология . 18 (1–2): 24–32. дои : 10.1159/000149300 . ПМИД 7118520 .
- ^ Служба инспекции здоровья животных и растений США (APHIS) и Центры США по контролю и профилактике заболеваний (CDC). «Национальный реестр избранных агентов (NSAR)» . Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Министерство здравоохранения и социальных служб США. «Биобезопасность в микробиологических и биомедицинских лабораториях (BMBL), 5-е издание» . Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Национальные институты здравоохранения США (NIH), Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний США (NIAID). «Биозащита — приоритетные патогены категорий A, B и C NIAID» . Архивировано из оригинала 22 октября 2011 г. Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Центры США по контролю и профилактике заболеваний (CDC). «Агенты биотерроризма/болезни» . Архивировано из оригинала 22 июля 2014 года . Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Группа Австралии. «Перечень биологических агентов для экспортного контроля» . Архивировано из оригинала 6 августа 2011 г. Проверено 16 октября 2011 г.
- ^ Маккормик, Дж. Б. (1991). «Семейство Filoviridae». Во Франки, РИБ; Фоке, СМ; Кнудсон, Д.Л.; и др. (ред.). Классификация и номенклатура вирусов – пятый доклад Международного комитета по таксономии вирусов. Дополнение к архиву вирусологии . Том. 2. Вена, Австрия: Шпрингер. стр. 247–49. ISBN 0-387-82286-0 .
- ^ Ярлинг, ПБ; Кили, член парламента; Кленк, Х.-Д.; Питерс, CJ; Санчес, А.; Свейнпол, Р. (1995). «Семейство Filoviridae». В Мерфи, ФА; Фоке, СМ; Бишоп, DHL; Габриал, ЮАР; Джарвис, AW; Мартелли, врач общей практики; Мэйо, Массачусетс; Саммерс, доктор медицины (ред.). Таксономия вирусов — шестой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Дополнение к архиву вирусологии . Том. 10. Вена, Австрия: Шпрингер. стр. 289–92. ISBN 3-211-82594-0 .
- ^ Нетесов С.В.; Фельдманн, Х.; Ярлинг, ПБ; Кленк, HD; Санчес, А. (2000). «Семейство Filoviridae». Ин ван Регенмортель, MHV; Фоке, СМ; Бишоп, DHL; Карстенс, Э.Б.; Эстес, МК; Лимон, СМ; Манилофф Дж.; Мэйо, Массачусетс; МакГеоч, диджей; Прингл, Чехия; Викнер, Р.Б. (ред.). Таксономия вирусов — Седьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Academic Press. стр. 539–48. ISBN 0-12-370200-3 .
- ^ Перейти обратно: а б Фельдманн, Х.; Гейсберт, ТВ; Ярлинг, ПБ; Кленк, Х.-Д.; Нетесов С.В.; Питерс, CJ; Санчес, А.; Свейнпол, Р.; Волчков, В.Е. (2005). «Семейство Filoviridae». Ин Фоке, CM; Мэйо, Массачусетс; Манилофф Дж.; Дессельбергер, У.; Болл, Лос-Анджелес (ред.). Таксономия вирусов — Восьмой доклад Международного комитета по таксономии вирусов . Сан-Диего, США: Elsevier/Academic Press. стр. 645–653. ISBN 0-12-370200-3 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Кун Дж.Х., Беккер С., Эбихара Х., Гейсберт Т.В., Джонсон К.М., Каваока Ю., Липкин В.И., Негредо А.И., Нетесов С.В., Никол С.Т., Паласиос Г., Петерс К.Дж., Тенорио А., Волчков В.Е., Ярлинг П.Б. (2010). «Предложение по пересмотренной таксономии семейства Filoviridae: Классификация, названия таксонов и вирусов, а также вирусные сокращения» . Архив вирусологии . 155 (12): 2083–2103. дои : 10.1007/s00705-010-0814-x . ПМК 3074192 . ПМИД 21046175 .
- ^ Перейти обратно: а б с Кун, Дж. Х.; Беккер, С.; Эбихара, Х.; Гейсберт, ТВ; Ярлинг, ПБ; Каваока, Ю.; Нетесов С.В.; Никол, СТ; Питерс, CJ; Волчков, В.Е.; Ксязек, Т.Г. (2011). «Семейство Filoviridae». В Кинге, Эндрю MQ; Адамс, Майкл Дж.; Карстенс, Эрик Б.; и др. (ред.). Таксономия вирусов — Девятый отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Лондон, Великобритания: Elsevier/Academic Press. стр. 665 –671. ISBN 978-0-12-384684-6 .
- ^ Кэрролл С.А., Таунер Дж.С., Сили Т.К., Макмаллан Л.К., Христова М.Л., Берт Ф.Дж., Свейнпол Р., Роллин П.Е., Никол С.Т. (март 2013 г.). «Молекулярная эволюция вирусов семейства Filoviridae на основе 97 полногеномных последовательностей» . Дж. Вирол . 87 (5): 2608–16. дои : 10.1128/JVI.03118-12 . ПМК 3571414 . ПМИД 23255795 .
- ^ Ли Ю. Х., Чен СП (2014). «Эволюционная история вируса Эбола» (PDF) . Эпидемиол. Заразить . 142 (6): 1138–1145. дои : 10.1017/S0950268813002215 . ПМЦ 9151191 . ПМИД 24040779 . S2CID 9873900 .
- ^ Тейлор, диджей; Баллинджер, MJ; Жан, Джей-Джей; Ханзли, Ле; Брунн, Дж. А. (2014). «Доказательства того, что эболавирусы и куэвавирусы расходятся с марбургвирусами, начиная с миоцена» . ПерДж . 2 : е556. дои : 10.7717/peerj.556 . ПМЦ 4157239 . ПМИД 25237605 .
- ^ Мелани М. Хирвегер, Мишель К. Кох, Мелани Рупп, Пит Мэйс, Николас Ди Паола, Реми Брюггманн, Йенс Х. Кун, Хайке Шмидт-Постхаус и Торстен Зойберлих (22 ноября 2021 г.). «Новые филовирусы, хантавирусы и рабдовирусы пресноводных рыб, Швейцария, 2017» . Новые инфекционные заболевания . 27 (12): 3082–3091. дои : 10.3201/eid2712.210491 . ПМЦ 8632185 . ПМИД 34808081 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ , Фуцян Чжан, Чанчунь Ту (07 августа 2023 г.). «Обнаружение и характеристика нового филовируса летучих мышей (вирус Дэхун, DEHV) у фруктовых летучих мышей» . bioRxiv : 10.1101 Бяо Хэ, Тинсонг Ху, Сяоминь Ян /2023.08. 07.552227 .
{{cite journal}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Тейлор DJ, Лич Р.В., Брюэнн Дж. (2010). «Филовирусы древние и интегрированы в геномы млекопитающих» . Эволюционная биология BMC . 10 (1): 193. Бибкод : 2010BMCEE..10..193T . дои : 10.1186/1471-2148-10-193 . ПМК 2906475 . ПМИД 20569424 .
- ^ Белый В.А., Левин А.Дж., Скалка А.М. (2010). Бухмайер (ред.). «Неожиданное наследование: множественная интеграция древних последовательностей борнавируса и Эболавируса/Марбургвируса в геномах позвоночных» . ПЛОС Патогены . 6 (7): e1001030. дои : 10.1371/journal.ppat.1001030 . ПМК 2912400 . ПМИД 20686665 .
- ^ Кацуракис А., Гиффорд Р.Дж. (2010). «Эндогенные вирусные элементы в геномах животных» . ПЛОС Генетика . 6 (11): e1001191. дои : 10.1371/journal.pgen.1001191 . ПМЦ 2987831 . ПМИД 21124940 .
- ^ Тейлор DJ, Диттмар К., Баллинджер М.Дж., Брюэнн Дж.А. (2011). «Эволюционное поддержание филовирусоподобных генов в геномах летучих мышей» . Эволюционная биология BMC . 11 (336): 336. Бибкод : 2011BMCEE..11..336T . дои : 10.1186/1471-2148-11-336 . ПМЦ 3229293 . ПМИД 22093762 .
- ^ Петерс CJ, LeDuc JW (февраль 1999 г.). «Введение в Эболу: вирус и болезнь» . Журнал инфекционных болезней . 179 (Приложение 1): ix–xvi. дои : 10.1086/514322 . JSTOR 30117592 . ПМИД 9988154 .
- ^ Пламмер, Фрэнсис А.; Джонс, Стивен М. (30 октября 2017 г.). «История канадской вакцины против Эболы» . CMAJ: Журнал Канадской медицинской ассоциации . 189 (43): Е1326–Е1327. дои : 10.1503/cmaj.170704 . ISSN 0820-3946 . ПМЦ 5662448 . ПМИД 29084758 .
- ^ Исследования, Центр оценки биологических препаратов (27 января 2020 г.). «ЭРВЕБО» . FDA .
- ^ ЧАРСКА-ТОРЛИ, Дагмара (16 октября 2019 г.). «Эрвебо» . Европейское агентство по лекарственным средствам . Проверено 3 мая 2020 г.
- ^ Кешвара, Рохан; Хаген, Кэти Р.; Абреу-Мота, Тьяго; Папанери, Эми Б.; Лю, Дэвид; Вирблих, Кристоф; Джонсон, Рид Ф.; Шнелл, Матиас Дж. (05 марта 2019 г.). «Рекомбинантный вирус бешенства, экспрессирующий гликопротеин вируса Марбург, зависит от опосредованной антителами клеточной цитотоксичности для защиты от заболевания, вызванного вирусом Марбург, на мышиной модели» . Журнал вирусологии . 93 (6). дои : 10.1128/JVI.01865-18 . ISSN 0022-538X . ПМК 6401435 . ПМИД 30567978 .
- ^ Келланд, Кейт (19 сентября 2014 г.). «Ученые считают риск заражения мутантной вирусом Эбола, передающимся по воздуху, маловероятным» . Рейтер . Проверено 10 октября 2014 г.
- ^ «Основная статья: Новая технология делает возможным обнаружение вируса Эбола, передающегося по воздуху» . Департамент внутренней безопасности . 20 апреля 2021 г. Проверено 13 декабря 2021 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Кленк, Ханс-Дитер (1999). Вирусы Марбург и Эбола. Актуальные темы микробиологии и иммунологии . Том. 235. Берлин, Германия: Springer-Verlag. ISBN 978-3-540-64729-4 .
- Кленк, Ганс Дитер; Фельдманн, Хайнц (2004). Вирусы Эбола и Марбург — молекулярная и клеточная биология . Уаймондхэм, Норфолк, Великобритания: Horizon Bioscience. ISBN 978-0-9545232-3-7 .
- Кун, Йенс Х. (2008). Филовирусы — сборник 40-летних эпидемиологических, клинических и лабораторных исследований. Дополнение к архиву вирусологии . Том. 20. Вена, Австрия: Шпрингер. ISBN 978-3-211-20670-6 .
- Рябчикова Елена Ивановна; Прайс, Барбара Б. (2004). Вирусы Эбола и Марбург — взгляд на инфекцию с помощью электронной микроскопии . Колумбус, Огайо, США: Battelle Press. ISBN 978-1-57477-131-2 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- ICTV Report: Filoviridae
- « Филовирусиды » . Браузер таксономии NCBI . 11266.
- « ФИЛОВИР » . Научные ресурсы для исследования филовирусов. Архивировано из оригинала 30 июля 2020 г. Проверено 8 августа 2014 г.
- Теоретические доказательства того, что штамм вируса Эбола Заир может быть селен-зависимым: фактор патогенеза и вирусных вспышек? Тейлор 1995 г.
- Может ли селенит быть абсолютным ингибитором Эболы и других вирусных инфекций? Липински, 2015 г. Архивировано 19 ноября 2020 г. в Wayback Machine.
- Многие жители Западной Африки могут иметь иммунитет к вирусу Эбола New York Times