ПТК7

ПТК7
Идентификаторы
Псевдонимы	PTK7 , CCK-4, CCK4, протеинтирозинкиназа 7 (неактивная)
Внешние идентификаторы	Опустить : 601890 ; МГИ : 1918711 ; Гомологен : 43672 ; Генные карты : PTK7 ; ОМА : ПТК7 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	43,161,719 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 17 (mouse)
End	46,940,430 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	stromal cell of endometrium; ; body of uterus; ; left ovary; ; right ovary; ; canal of the cervix; ; ectocervix; ; right uterine tube; ; left uterine tube; ; right testis; ; left testis;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; lip; ; molar; ; ventricular zone; ; epiblast; ; genital tubercle; ; embryo; ; dermis; ; embryo; ; left lung lobe;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein kinase activity; protein binding; ATP binding; coreceptor activity involved in Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; cell-cell junction; focal adhesion; plasma membrane; cell junction; integral component of plasma membrane;
Biological process	actin cytoskeleton reorganization; cellular response to retinoic acid; ventricular septum development; convergent extension; establishment of planar polarity; wound healing; Wnt signaling pathway; coronary vasculature development; planar cell polarity pathway involved in neural tube closure; protein phosphorylation; heart development; establishment of epithelial cell apical/basal polarity; cell adhesion; neural tube closure; axis elongation; cochlea morphogenesis; positive regulation of neuron projection development; canonical Wnt signaling pathway; lung-associated mesenchyme development; cell migration; signal transduction; positive regulation of canonical Wnt signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5754
	71461
	ENSG00000112655
	ENSMUSG00000023972
	Q13308
	Q8BKG3
showНМ_001270398 ; НМ_002821 ; НМ_152880 ; НМ_152881 ; НМ_152882 ;
	NM_152883
	НМ_175168
	НП_001257327 ; НП_002812 ; НП_690619 ; НП_690620 ; НП_690621
	НП_780377
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Тирозин-протеинкиназа-подобная 7, также известная как киназа 4 карциномы толстой кишки ( CCK4 ), представляет собой рецепторную тирозинкиназу , которая у людей кодируется PTK7 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Рецепторные протеинтирозинкиназы передают внеклеточные сигналы через клеточную мембрану. У подгруппы этих киназ отсутствует обнаруживаемая каталитическая тирозинкиназная активность, но они сохраняют роль в передаче сигнала. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой внутриклеточный домен с гомологией тирозинкиназы и может функционировать как молекула клеточной адгезии . Считается, что этот ген экспрессируется в карциномах толстой кишки, но не в нормальной толстой кишке, и поэтому может быть маркером или участвовать в прогрессировании опухоли. Для этого гена обнаружено четыре варианта транскрипта, кодирующие четыре различные изоформы. ^{[ 6 ]}

PTK7 служит контекстно-зависимым переключателем передачи сигналов для путей Wnt (особенно в функциях, связанных с полярностью плоских клеток , таких как конвергентное расширение и миграция клеток нервного гребня ) и, по-видимому, имеет сходные функции для путей плексина и Flt-1 . ^{[ 7 ]} Saha et al. установили, что PTK7 имеет высокий уровень экспрессии при раке толстой кишки. с использованием серийного анализа экспрессии генов ( LongSAGE ). ^{[ 8 ]} Компания Pfizer нацелена на PTK7 при раке, создавая конъюгат антитело-лекарство против рецептора PTK7.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000112655 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023972 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Мосси К., Джаллал Б., Алвес Ф., Сурес И., Пахарь Г.Д., Ульрих А. (ноябрь 1995 г.). «Киназа карциномы толстой кишки-4 определяет новый подкласс семейства рецепторных тирозинкиназ». Онкоген . 11 (10): 2179–84. ПМИД 7478540 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: протеинтирозинкиназа PTK7 PTK7 7» .
^ Перадзири Х, Толвински Н.С., Борчерс А (август 2012 г.). «Множество ролей PTK7: универсальный регулятор межклеточной связи». Архив биохимии и биофизики . 524 (1): 71–6. дои : 10.1016/j.abb.2011.12.019 . ПМИД 22230326 .
^ Саха, С. и др. (2002). «Использование транскриптома для аннотирования генома». Nat Biotechnol 20(5): 508-512.

Дальнейшее чтение

Ли С.Т., Странк К.М., Спритц Р.А. (декабрь 1993 г.). «Обзор мРНК протеинтирозинкиназы, экспрессируемых в нормальных меланоцитах человека». Онкоген . 8 (12): 3403–10. ПМИД 8247543 .
Пак С.К., Ли Х.С., Ли С.Т. (февраль 1996 г.). «Характеристика полноразмерной кДНК PTK7 человека, кодирующей рецепторную протеинтирозинкиназоподобную молекулу, тесно связанную с куриным KLG». Журнал биохимии . 119 (2): 235–9. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021228 . ПМИД 8882711 .
Банга СС, Озер ХЛ, Парк С.К., Ли С.Т. (1997). «Присвоение PTK7, кодирующего рецепторную протеинтирозинкиназоподобную молекулу, хромосоме человека 6p21.1 -> p12.2 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика . 76 (1–2): 43–4. дои : 10.1159/000134511 . ПМИД 9154124 .
Юнг Дж.В., Джи А.Р., Ли Дж., Ким У.Дж., Ли С.Т. (декабрь 2002 г.). «Организация гена PTK7 человека, кодирующего рецепторную протеинтирозинкиназоподобную молекулу, и альтернативный сплайсинг ее мРНК». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1579 (2–3): 153–63. дои : 10.1016/s0167-4781(02)00536-5 . ПМИД 12427550 .
Чжан Х., Ли XJ, Мартин Д.Б., Эберсолд Р. (июнь 2003 г.). «Идентификация и количественная оценка N-связанных гликопротеинов с использованием химии гидразидов, мечения стабильными изотопами и масс-спектрометрии». Природная биотехнология . 21 (6): 660–6. дои : 10.1038/nbt827 . ПМИД 12754519 . S2CID 581283 .
Кобус Ф.Дж., Флеминг К.Г. (февраль 2005 г.). «GxxxG-содержащий трансмембранный домен онкогена CCK4 не кодирует предпочтительные самодействия». Биохимия . 44 (5): 1464–70. дои : 10.1021/bi048076l . ПМИД 15683231 .
Като М, Като М (сентябрь 2007 г.). «Сравнительная интегратомика неканонических сигнальных молекул WNT или полярности плоских клеток: механизм транскрипции PTK7 при колоректальном раке и механизм SEMA6A в недифференцированных ES-клетках» . Международный журнал молекулярной медицины . 20 (3): 405–9. дои : 10.3892/ijmm.20.3.405 . ПМИД 17671748 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000112655 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023972 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7478540-5] Мосси К., Джаллал Б., Алвес Ф., Сурес И., Пахарь Г.Д., Ульрих А. (ноябрь 1995 г.). «Киназа карциномы толстой кишки-4 определяет новый подкласс семейства рецепторных тирозинкиназ». Онкоген . 11 (10): 2179–84. ПМИД 7478540 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: протеинтирозинкиназа PTK7 PTK7 7» .

[7] Перадзири Х, Толвински Н.С., Борчерс А (август 2012 г.). «Множество ролей PTK7: универсальный регулятор межклеточной связи». Архив биохимии и биофизики . 524 (1): 71–6. дои : 10.1016/j.abb.2011.12.019 . ПМИД 22230326 .

[8] Саха, С. и др. (2002). «Использование транскриптома для аннотирования генома». Nat Biotechnol 20(5): 508-512.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )