WDR5

WDR5
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2CNX, 2CO0, 2G99, 2G9A, 2GNQ, 2H13, 2H14, 2H68, 2H6K, 2H6N, 2H6Q, 2H9L, 2H9M, 2H9N, 2H9P, 2O9K, 3EG6, 3EMH, 3MXX, 3N0D, 3N0E, 3P4F, 3PSL, 3SMR, 3UR4, 3UVK, 3UVL, 3UVM, 3UVN, 3UVO, 4A7J, 4CY1, 4CY2, 4ERQ, 4ERY, 4ERZ, 4ES0, 4ESG, 4EWR, 4GM3, 4GM8, 4GM9, 4GMB, 4IA9, 4O45, 4QL1, 4Y7R, 5EAL, 5EAP, 5EAR, 4QQE, 5EAM
Идентификаторы
Псевдонимы	WDR5 , BIG-3, CFAP89, SWD3, белок 5, содержащий повтор WD, домен 5 повтора WD
Внешние идентификаторы	Опустить : 609012 ; МГИ : 2155884 ; Гомологен : 59931 ; GeneCards : WDR5 ; OMA : WDR5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 9 (human) Band 9q34.2 Start 134,135,365 bp End 134,159,968 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2|2 A3 Start 27,405,169 bp End 27,426,547 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in skin of arm left testis right testis sperm gastrocnemius muscle cerebellar hemisphere right hemisphere of cerebellum anterior pituitary secondary oocyte gonad Top expressed in secondary oocyte primary oocyte zygote primitive streak medullary collecting duct epiblast granulocyte renal corpuscle somite ventricular zone More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function histone methyltransferase activity (H3-K4 specific) histone acetyltransferase activity (H4-K8 specific) histone acetyltransferase activity (H4-K5 specific) methylated histone binding protein binding histone acetyltransferase activity (H4-K16 specific) histone-lysine N-methyltransferase activity histone binding Cellular component Set1C/COMPASS complex intracellular anatomical structure nucleoplasm MLL1 complex MLL3/4 complex histone acetyltransferase complex nucleus histone methyltransferase complex ciliary basal body Biological process skeletal system development regulation of transcription, DNA-templated transcription, DNA-templated histone H4-K5 acetylation histone H3-K4 methylation histone H3 acetylation histone H4-K16 acetylation neuron projection development histone H4-K8 acetylation cilium assembly post-translational protein modification regulation of megakaryocyte differentiation chromatin organization Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 11091 140858 Вместе ENSG00000196363 ENSMUSG00000026917 ЮниПрот P61964 P61965 RefSeq (мРНК) НМ_017588 НМ_052821 НМ_080848 RefSeq (белок) НП_060058 НП_438172 НП_543124 Местоположение (UCSC) Чр 9: 134,14 – 134,16 Мб Чр 2: 27,41 – 27,43 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок 5, содержащий повтор WD, представляет собой белок , который у человека кодируется WDR5 геном .

Этот ген кодирует члена семейства белков с повторами WD. Повторы WD представляют собой минимально консервативные области примерно из 40 аминокислот, обычно заключенные в скобки gly-his и trp-asp (GH-WD), что может способствовать образованию гетеротримерных или мультибелковых комплексов. Члены этого семейства участвуют во множестве клеточных процессов, включая развитие клеточного цикла, передачу сигнала, апоптоз и регуляцию генов. Этот белок содержит 7 повторов WD. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие один и тот же белок, были идентифицированы.

Взаимодействия

Было показано, что WDR5 взаимодействует с фактором C1 клетки-хозяина. и МЛЛ . Он также взаимодействует с длинной некодирующей РНК HOTTIP и с днРНК NeST . WDR5 является ключевым фактором, определяющим рекрутирование MYC в хроматин.

Дальнейшее чтение

• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Высоцка Дж., Майерс, член парламента, Лаэрти К.Д. и др. (2003). «Деацетилаза человека Sin3 и связанная с тритораксом гистоновая метилтрансфераза Set1/Ash2 H3-K4 избирательно связаны вместе фактором клеточной пролиферации HCF-1» . Генс Дев . 17 (7): 896–911. дои : 10.1101/gad.252103 . ЧВК   196026 . ПМИД   12670868 .
• Гори Ф, Демай МБ (2004). «BIG-3, новый повторяющийся белок WD-40, экспрессируется в развивающейся ростовой пластинке и ускоряет дифференцировку хондроцитов in vitro» . Эндокринология . 145 (3): 1050–4. дои : 10.1210/en.2003-1314 . ПМИД   14657013 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Ёкояма А., Ван З., Высоцка Дж. и др. (2004). «Протоонкопротеин лейкемии MLL образует SET1-подобный комплекс гистон-метилтрансферазы с менином для регуляции экспрессии гена Hox» . Мол. Клетка. Биол . 24 (13): 5639–49. дои : 10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004 . ПМЦ   480881 . ПМИД   15199122 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Люнг А.К. и др. (2005). «Динамика ядрышкового протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Бибкод : 2005Natur.433...77A . дои : 10.1038/nature03207 . ПМИД   15635413 . S2CID   4344740 .
• Высоцка Дж., Свигут Т., Милн Т.А. и др. (2005). «WDR5 связывается с гистоном H3, метилированным по K4, и необходим для метилирования H3 K4 и развития позвоночных» . Клетка . 121 (6): 859–72. дои : 10.1016/j.cell.2005.03.036 . ПМИД   15960974 . S2CID   17521631 .
• Доу Ю., Милн Т.А., Тэкетт А.Дж. и др. (2005). «Физическая ассоциация и координационная функция метилтрансферазы H3 K4 MLL1 и ацетилтрансферазы H4 K16 MOF» . Клетка . 121 (6): 873–85. дои : 10.1016/j.cell.2005.04.031 . ПМИД   15960975 . S2CID   14717470 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Гори Ф., Фридман Л., Демэй М.Б. (2006). «Wdr5, новый белок-повтор WD, регулирует дифференцировку остеобластов и хондроцитов in vivo». Журнал скелетно-мышечных и нейрональных взаимодействий . 5 (4): 338–9. ПМИД   16340128 .
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД   16713569 . S2CID   13709685 .
• Рутенбург А.Дж., Ван В., Грейбош Д.М. и др. (2006). «Распознавание и презентация гистона H3 модулем WDR5 комплекса MLL1» . Нат. Структура. Мол. Биол . 13 (8): 704–12. дои : 10.1038/nsmb1119 . ПМЦ   4698793 . ПМИД   16829959 .
• Кутюр Дж.Ф., Коллазо Э., Тривел Р.К. (2006). «Молекулярное распознавание гистона H3 белком WD40 WDR5». Нат. Структура. Мол. Биол . 13 (8): 698–703. дои : 10.1038/nsmb1116 . ПМИД   16829960 . S2CID   26165068 .
• Доу Ю., Милн Т.А., Рутенбург А.Дж. и др. (2006). «Регуляция активности метилтрансферазы MLL1 H3K4 с помощью ее основных компонентов». Нат. Структура. Мол. Биол . 13 (8): 713–9. дои : 10.1038/nsmb1128 . ПМИД   16878130 . S2CID   12849159 .
• Шуец А., Аллали-Хассани А., Мартин Ф. и др. (2006). «Структурная основа молекулярного распознавания и презентации гистона H3 с помощью WDR5» . ЭМБО Дж . 25 (18): 4245–52. дои : 10.1038/sj.emboj.7601316 . ПМК   1570438 . ПМИД   16946699 .
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Мол. Сист. Биол . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ   1847948 . ПМИД   17353931 .
• Брайан А.Ф., Ван Дж., Ховард Г.К. и др. (2020). «WDR5 является консервативным регулятором экспрессии генов синтеза белка» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (6): 2924–2941. дои : 10.1093/nar/gkaa051 . ПМК   7102967 . ПМИД   31996893 .