БРДТ

БРДТ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2RFJ, 4FLP, 4KCX
Идентификаторы
Псевдонимы	BRDT , BRD6, CT9, связанный с бромодоменом семенников, SPGF21
Внешние идентификаторы	Опустить : 602144 ; МГИ : 1891374 ; Гомологен : 21064 ; GeneCards : БРДТ ; ОМА : БРДТ - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	92,014,426 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	107,387,058 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; gonad; ; testicle; ; sperm; ; buccal mucosa cell; ; oocyte; ; paraflocculus of cerebellum; ; placenta; ; granulocyte;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; spermatocyte; ; seminiferous tubule; ; spermatid; ; primary oocyte; ; olfactory epithelium; ; lumbar spinal ganglion; ; Gonadal ridge; ; female urethra;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	transcription coactivator activity; histone binding; lysine-acetylated histone binding;
Cellular component	nucleus;
Biological process	male meiotic nuclear division; positive regulation of transcription involved in meiotic cell cycle; chromatin remodeling; mRNA processing; male meiosis I; cell differentiation; regulation of RNA splicing; meiosis; transcription, DNA-templated; spermatogenesis; RNA splicing; regulation of transcription, DNA-templated; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	676
	114642
	ENSG00000137948
	ENSMUSG00000029279
	Q58F21
	Q91Y44
showНМ_001242805 ; НМ_001242806 ; НМ_001242807 ; НМ_001242808 ; НМ_001242810 ;
	NM_001726; NM_207189
	НМ_001079873 ; НМ_054054
showНП_001229734 ; НП_001229735 ; НП_001229736 ; НП_001229737 ; НП_001229739 ;
	NP_001717; NP_997072
	НП_001073342 ; НП_473395
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бромодомен, специфичный для семенников, представляет собой белок , который у человека кодируется BRDT геном . Он является членом семейства белков бромодомена и экстратерминального мотива (BET) . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

BRDT похож на семейство белков RING3 . Он обладает двумя бромодоменовыми мотивами и последовательностью PEST (кластер остатков пролина, глутаминовой кислоты, серина и треонина), характерной для белков, подвергающихся быстрой внутриклеточной деградации. Бромодомен содержится в белках, регулирующих транскрипцию. Для этого гена обнаружено два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок. ^{[ 6 ]}

Использование трех различных моделей мышей (мыши с нокаутом по Brdt, мыши, экспрессирующие нефункциональный Brdt, и мыши, экспрессирующие мутированный Brdt, лишенный первого бромодомена) показало, что Brdt управляет программой мейотической и постмейотической экспрессии генов. Он также контролирует постмейотическую реорганизацию генома по всему геному, которая происходит после гиперацетилирования гистонов в удлиняющихся сперматидах. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Потенциал в качестве мишени мужских противозачаточных препаратов

Ингибиторы BET, такие как JQ1, блокируют область BRDT, ответственную за связывание хроматина, и вызывают обратимое снижение выработки спермы, качества спермы и размера семенников у мышей. ^{[ 8 ]} Механизм действия JQ1 можно объяснить, рассматривая функции Brdt как фактора экспрессии специфичных для семенников генов и постмейотической реорганизации хроматина. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Поскольку ингибиторы BET также ингибируют другие белки BET BRD2, BRD3 и BRD4, они, вероятно, будут оказывать на людей воздействие, выходящее за пределы временной мужской бесплодия.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000137948 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029279 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Джонс М.Х., Нумата М., Шимане М. (январь 1998 г.). «Идентификация и характеристика BRDT: ген, специфичный для семенников, родственный генам бромодомена RING3 и Drosophila fsh». Геномика . 45 (3): 529–34. дои : 10.1006/geno.1997.5000 . ПМИД 9367677 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Ген Энтрез: BRDT-бромодомен, специфичный для семенников» .
^ Jump up to: ^а ^б Гоше Дж, Буссуар Ф, Монтелье Э, Курте С, Бушу Т, Бертран С, Хери П, Жунье С, Депо А, Витте А.Л., Гвардиола П, Перне К, Дебернарди А, Лопес Ф, Холота Х, Имберт Дж, Вольгемут DJ , Жерар М., Руссо С., Хохбин С. (2012). «Брдомомен-зависимое программирование мужского генома на определенных стадиях по Брдту» . ЭМБО Дж. 31 (19): 3809–20. дои : 10.1038/emboj.2012.233 . ПМЦ 3463845 . ПМИД 22922464 .
^ «Мужские противозачаточные таблетки в разработке?» . 16 августа 2012 года . Проверено 17 августа 2012 г.

Внешние ссылки

человека Расположение генома BRDT и страница сведений о гене BRDT в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Чжэн Ю, Юань В, Чжоу Цз и др. (2005). «Молекулярное клонирование и экспрессия нового альтернативного варианта сплайсинга гена BRDT». Межд. Дж. Мол. Мед . 15 (2): 315–21. дои : 10.3892/ijmm.15.2.315 . ПМИД 15647849 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Пивот-Пажо С., Карон С., Говин Дж. и др. (2003). «Зависимая от ацетилирования реорганизация хроматина с помощью BRDT, семенников-специфичного белка, содержащего бромодомен» . Мол. Клетка. Биол . 23 (15): 5354–65. дои : 10.1128/MCB.23.15.5354-5365.2003 . ПМК 165724 . ПМИД 12861021 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Сканлан М.Дж., Алторки Н.К., Гуре А.О. и др. (2000). «Экспрессия антигенов рака яичка при раке легких: определение гена, специфичного для бромодомена яичка (BRDT), как нового гена CT, CT9». Рак Летт . 150 (2): 155–64. дои : 10.1016/S0304-3835(99)00385-7 . ПМИД 10704737 .
Дхаллуин С., Карлсон Дж.Э., Цзэн Л. и др. (1999). «Структура и лиганд бромодомена гистонацетилтрансферазы». Природа . 399 (6735): 491–6. Бибкод : 1999Natur.399..491D . дои : 10.1038/20974 . ПМИД 10365964 . S2CID 1210925 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000137948 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029279 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9367677-5] Джонс М.Х., Нумата М., Шимане М. (январь 1998 г.). «Идентификация и характеристика BRDT: ген, специфичный для семенников, родственный генам бромодомена RING3 и Drosophila fsh». Геномика . 45 (3): 529–34. дои : 10.1006/geno.1997.5000 . ПМИД 9367677 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «Ген Энтрез: BRDT-бромодомен, специфичный для семенников» .

[pmid22922464-7] Jump up to: ^а ^б Гоше Дж, Буссуар Ф, Монтелье Э, Курте С, Бушу Т, Бертран С, Хери П, Жунье С, Депо А, Витте А.Л., Гвардиола П, Перне К, Дебернарди А, Лопес Ф, Холота Х, Имберт Дж, Вольгемут DJ , Жерар М., Руссо С., Хохбин С. (2012). «Брдомомен-зависимое программирование мужского генома на определенных стадиях по Брдту» . ЭМБО Дж. 31 (19): 3809–20. дои : 10.1038/emboj.2012.233 . ПМЦ 3463845 . ПМИД 22922464 .

[8] «Мужские противозачаточные таблетки в разработке?» . 16 августа 2012 года . Проверено 17 августа 2012 г.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]