Хризеобактерия
Хризеобактерия | |
---|---|
![]() | |
Бактерии Chryseobacterium oleae DSM25575, выращенные на твердой среде LB | |
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Бактероидота |
Сорт: | Флавобактерии |
Заказ: | Флавобактерии |
Семья: | Уикселловые |
Род: | Хризеобактерия Вандамм и др . 1994 г. |
Разновидность | |
Посмотреть текст | |
Синонимы [ 1 ] | |
|
Хризеобактерии — род грамотрицательных бактерий . Виды Chryseobacterium представляют собой хемоорганотрофные палочковидные грамотрицательные бактерии. Хризеобактерии образуют типичные колонии желто-оранжевого цвета за счет пигмента типа флексирубина. Род включает более 100 описанных видов из различных сред обитания, включая источники пресной воды, почву, морских рыб и человека-хозяина. [ 2 ]
История
[ редактировать ]Род Chryseobacterium был первоначально создан в 1994 году Vandamme et al . [ 3 ] для шести бактериальных таксонов, которые в то время были отнесены к роду Flavobacterium : F. balustinum , F. indologenes , F. gleum , F. meningosepticum , F. indoltheticum и F. scophthalmum . был создан дополнительный род Elizabethkingia В 2005 году для двух видов рода Chryseobacterium ; а именно, C. meningosepticum и C. miricola. [ 4 ] стандарты и рекомендации по описанию новых таксонов семейства Flavobacteriaceae . опубликовали В 2002 году Bernardet et al. [ 5 ] К 2006 году род Chryseobacterium расширился до 10 видов, к 2014 году — более 60 видов. [ 6 ] и на данный момент их более 100.
Экология
[ редактировать ]Виды Chryseobacterium . были извлечены из почв, корней растений, цветов, разлагающегося растительного материала и кленового сока. Некоторые штаммы Chryseobacterium , ассоциированные с растениями , способны ингибировать фитопатогенные грибы. Виды Chryseobacterium . были также извлечены из пресноводных ручьев, озер, их отложений, систем водяного охлаждения, питьевой воды, молочнокислых напитков, заводов по розливу пива, ила биореакторов, загрязненной почвы, морских отложений и вечной мерзлоты . [ 6 ] Виды Chryseobacterium . связаны со многими животными - они обнаружены в средней кишке комаров, в кишках тараканов, фекалиях многоножек и пингвиньем гуано, гомогенатах кишечника пресноводных копепод, птичьих перьях, коровьем молоке, сыром мясе и курице. Виды Chryseobacterium . были выделены из слизи внешне здоровых рыб, однако иногда их рассматривают как организмы, вызывающие порчу. [ 6 ] три новых холодоустойчивых вида Chryseobacterium : C. oranimense , C. haifense и C. bovis . В сыром молоке в Израиле были обнаружены [ 7 ]
Патогенез
[ редактировать ]Наиболее патогенная Flavobacterium spp., Chryseobacterium meningosepticum , вызывавшая многочисленные инфекции, была переклассифицирована в род Elizabethkingia . [ 4 ] Chryseobacterium indologenes, хотя и широко распространена в природе, в основном встречается в почве и воде, является редким патогеном для человека. Однако в редких случаях это может вызвать серьезные инфекции, особенно среди людей с ослабленным иммунитетом. [ 8 ] В большинстве случаев инфекции являются внутрибольничными и часто связаны с иммуносупрессией или постоянными катетерами. Сообщалось, что он является возбудителем бактериемии , перитонита , пневмонии , эмпиемы , пиелонефрита , цистита , менингита и инфекций, связанных с центральным венозным катетером. Число зарегистрированных случаев заражения C. indologenes растет. Большинство зарегистрированных случаев заражения поступило из Тайваня и лишь около 10% произошло за пределами Азии. Несколько сообщений поступило из Австралии, Индии, Европы и США. [ 8 ] C. indologenes также патогенен для мягкого клеща, тогда как другие виды Chryseobacterium spp. были выделены у больных черепах, лягушек и рыб, в частности C. scophthalmum, C. joostei, C. piscicola, C. chaponense, C. viscerum и C. oncorhynchi, C. aahli, C. hominis, C. shigense , а также C. indologenes , вызывающий заболевания человека. [ 6 ]
Сообщалось, что некоторые виды Chryseobacterium обладают необычными свойствами переваривания матрикса, способными разрушать самые сложные коллагеновые матриксы, такие как перья или экзоскелеты. вероятно, опосредуются действием специфических хитиназ и коллагеназоподобных Эти свойства , металлопротеаз . Было показано, что некоторые виды, такие как Chryseobacterium nematophagum, способны заражать, убивать и в конечном итоге уничтожать все ткани нематод, включая обычно очень нерастворимый кутикулярный экзоскелет. [ 9 ] Активность хитиназы, желатиназы и коллагеназы металлопротеаз связана со скользящей подвижностью Chryseobacterium , осуществляемой через системы секреции типа IX. Действительно, некоторые из этих ферментов обладают сигналами секреции С-концевого типа IX. [ 10 ] Сами хризобактерии не имеют ни коллагеновых, ни хитиновых белков и структур. Виды Chryseobacterium принадлежат к типу Bacteriodetes , представители которого все чаще описываются как имеющие необычно связанную подвижность и секреторную систему. [ 9 ] [ 10 ]
обнаружены ботулинические нейротоксиноподобные В геноме Chryseobacterium piperi str. (BoNT-подобные) токсины. CTM, и они представляют собой сильно различающуюся группу BoNT-подобных токсинов. Один из предсказанных BoNT-подобных токсинов C.piperi вызывал некротическую гибель клеток почек человека, но не расщеплял общие SNARE-субстраты BoNT. [ 11 ]
Устойчивость к антибиотикам
[ редактировать ]Виды Chryseobacterium. по своей природе устойчивы к широкому спектру антибиотиков , включая тетрациклины , эритромицин , линезолид , полимиксины , аминогликозиды , хлорамфеникол и многие бета-лактамы , а также обладают промежуточной чувствительностью к ванкомицину и клиндамицину и различаются по своей чувствительности к триметоприму-сульфаметоксазолу . [ 6 ]
Разновидность
[ редактировать ]Виды включают: [ 1 ]
- Chryseobacterium aahli Loch и Faisal 2014 г.
- Chryseobacterium angstadtii Kirk et al . 2013 год
- Chryseobacterium antarcticum (Yi et al ., 2005) Kämpfer et al . 2009 год
- Chryseobacterium anthropi Kämpfer et al . 2009 год
- « Chryseobacteriumbioticum » Дахал и др . 2021 год
- Chryseobacterium aquaticum Kim et al . 2008 год
- Chryseobacterium aquifrigidense Park и др . 2008 год
- Chryseobacterium arachidiradicis Kämpfer et al . 2015 год
- Chryseobacterium arachidis Kämpfer et al . 2014 год
- Chryseobacterium arthrosphaerae Kämpfer et al . 2010 год
- Chryseobacterium artocarpi Venil et al . 2014 год
- Chryseobacterium aurantiacum Luo et al . 2018 год
- Chryseobacterium aureum Lee и др . 2019 год
- Chryseobacterium balustinum (Harrison 1929) Vandamme et al . 1994 г.
- Chryseobacterium bernardetii Holmes et al . 2013 год
- Chryseobacterium binzhouense Meng et al . 2020 год
- Chryseobacterium bovis Ханцис-Захаров и др . 2008 год
- Chryseobacterium buanense (Joung et al ., 2010) García-López et al . 2020 год
- Chryseobacterium caeni Quan et al . 2007 год
- Chryseobacterium camelliae Kook et al . 2014 год
- Chryseobacterium candidae Indu et al . 2020 год
- Chryseobacterium carnipullorum Charimba et al . 2013 год
- Chryseobacterium carnis Holmes et al . 2013 год
- Chryseobacterium chaponense Kämpfer et al . 2011 год
- « Chryseobacterium chengduensis » Wen et al . 2016 год
- « Chryseobacterium cheonjiense » Chaudhary et al . 2021 год
- « Chryseobacterium chungangensis » Huq 2018 г.
- Chryseobacterium contaminans Kämpfer et al . 2014 год
- Chryseobacterium cucumeris Jeong et al . 2017 год
- Chryseobacterium culicis Kämpfer et al . 2010 год
- Chryseobacterium daecheongense Kim et al . 2005 г.
- Chryseobacterium daeguense Yoon et al . 2007 год
- Chryseobacterium defluvii Kämpfer et al . 2003 г.
- Chryseobacterium echinoideorum Lin et al . 2015 год
- Chryseobacterium elymi Cho et al . 2011 год
- Chryseobacterium endphyticum Lin et al . 2017 год
- Chryseobacterium flavum Zhou et al . 2007 год
- Chryseobacterium formosense Young et al . 2005 г.
- « Chryseobacterium formosus » Актер и др . 2015 год
- Chryseobacterium frigidisoli Bajerski et al . 2013 год
- Chryseobacterium frigidum Kim et al . 2016 год
- Chryseobacterium Gallinarum Kämpfer et al . 2014 год
- Chryseobacterium gambrini Herzog et al . 2008 год
- Chryseobacterium geocarposphaerae Kämpfer et al . 2014 год
- Chryseobacterium ginsengisoli Nguyen et al . 2013 год
- « Chryseobacterium ginsengiterrae » Noh et al . 2017 год
- Chryseobacterium ginsengiterrae Hahnke et al . 2017 год
- Chryseobacterium ginsenosidimutans Im et al . 2011 год
- Chryseobacterium glaciei Pal et al . 2018 год
- Chryseobacterium gleum (Holmes et al ., 1984) Vandamme et al . 1994 г.
- Chryseobacterium gregarium Behrendt et al . 2008 год
- Chryseobacterium gwangjuense Park et al . 2013 год
- Chryseobacterium hagamense Cho et al . 2011 год
- Chryseobacterium haifense Ханцис-Захаров и Халперн 2007 г.
- Chryseobacterium halperniae Hahnke et al . 2017 год
- Chryseobacterium hispalense Montero-Calasanz et al . 2013 год
- Chryseobacterium hispanicum Gallego et al . 2006 г.
- Chryseobacterium hominis Vaneechoutte et al . 2007 год
- Chryseobacterium humi Pires et al . 2010 год
- Chryseobacteriumungaricum Szoboszlay et al . 2008 год
- Chryseobacterium indologenes (Yabuuchi et al ., 1983) Vandamme et al . 1994 г.
- Chryseobacterium indoltheticum (Campbell and Williams 1951) Vandamme et al . 1994 г.
- Chryseobacterium jejuense Weon et al . 2008 год
- Chryseobacterium jeonii (Yi et al ., 2005) Kämpfer et al . 2009 год
- Chryseobacterium joostei Hugo et al . 2003 г.
- Chryseobacterium koreense (Ким и др ., 2004) Kämpfer et al . 2009 год
- Chryseobacterium kwangjuense Sang et al . 2013 год
- Chryseobacterium Lactis Holmes и др . 2013 год
- Chryseobacterium lacus Zhang et al . 2020 год
- Chryseobacterium lathyri Cho et al . 2011 год
- Chryseobacterium limogenitum Kämpfer et al . 2015 год
- Chryseobacterium Lineare Zhao et al . 2017 год
- Chryseobacterium luteum Behrendt et al . 2007 год
- « Chryseobacterium manosquense » Boxberger et al . 2020 год
- Chryseobacterium marinus (Lee et al . 2007) Kämpfer et al . 2009 год
- « Кандидат Chryseobacterium Massiliense » корриг. Греуб и др . 2004 г.
- Chryseobacterium molle Herzog et al . 2008 год
- Chryseobacterium montanum Guo et al . 2016 год
- « Хризеобактерии муковисцидоза » Тетц и Тетц 2018
- Chryseobacterium mulctrae Yoon et al . 2019 год
- Chryseobacterium nakagawai Holmes et al . 2013 год
- « Chryseobacterium Nematophagum » Пейдж и др . 2019 год
- Chryseobacterium nepalense Чаудхари и Ким, 2017 г.
- Chryseobacterium oleae Montero-Calasanz et al . 2014 год
- Chryseobacterium oncorhynchi Zamora et al . 2012 год
- Chryseobacterium oranimense Ханцис-Захаров и др . 2008 год
- Chryseobacterium pallidum Herzog et al . 2008 год
- Chryseobacterium palustre Pires et al . 2010 год
- « Chryseobacterium panacis » Singh et al . 2016 год
- Chryseobacterium pennipullorum Oosthuizen et al . 2019 год
- « Chryseobacterium phocaeense » Абу Абдаллах и др . 2019 год
- Chryseobacterium phosphatilyticum Jeong et al . 2019 год
- Chryseobacterium Piperi Strahan et al . 2011 год
- Chryseobacterium piscicola Ilardi et al . 2009 год
- Chryseobacterium piscium de Beer и др . 2006 г.
- Chryseobacterium Polytrichastri Chen et al . 2015 год
- Chryseobacterium populi Bortniak et al . 2019 год
- Chryseobacterium profundimaris Xu et al . 2015 год
- « Chryseobacterium proteolyticum » Ямагучи и Йоко, 2000 г.
- Chryseobacterium psychrotolerans (Ge et al . 2015) Hahnke et al . 2017 год
- Chryseobacterium reticulitermitis Zhao et al . 2017 год
- Chryseobacterium rhizoplanae Kämpfer et al . 2015 год
- Chryseobacterium rhizosphaerae Cho et al . 2011 год
- Chryseobacterium rigui Park et al . 2013 год
- Chryseobacterium salipaludis Divyasree et al . 2018 год
- Chryseobacterium salivictor Ким и Ю 2020
- Chryseobacterium scophthalmum (Mudarris et al . 1994) Vandamme et al . 1994 г.
- Chryseobacterium sediminis Kämpfer et al . 2015 год
- « Chryseobacterium senegalense » Lo et al . 2016 год
- Chryseobacterium shandongense Yang et al . 2015 год
- Chryseobacterium shigense Shimomura et al . 2005 г.
- « Chryseobacterium siluri » Oh et al . 2020 год
- Chryseobacterium solani Du et al . 2015 год
- Chryseobacterium Soldanellicola Park et al . 2006 г.
- Chryseobacterium soli Weon et al . 2008 год
- Chryseobacterium solincola Benmalek et al . 2010 год
- Chryseobacterium taeanense Park et al . 2006 г.
- Chryseobacterium taichungense Shen et al . 2005 г.
- Chryseobacterium taihuense Wu et al . 2013 год
- Chryseobacterium taiwanense Tai et al . 2006 г.
- Chryseobacterium takakiae Zhao et al . 2015 год
- Chryseobacterium taklimakanense (Peng et al . 2009) Holmes et al . 2013 год
- Chryseobacterium tenax (O'Sullivan et al ., 2006) Hahnke et al . 2017 год
- « Кандидат Chryseobacterium timonense » корриг. Дранкур и др . 2004 г.
- « Chryseobacterium timonianum » Абу Абдаллах и др . 2017 год
- Chryseobacterium treverense Yassin et al . 2010 год
- Chryseobacterium tructae Zamora et al . 2013 год
- Chryseobacterium ureilyticum Herzog et al . 2008 год
- Хризеобактерия коровья Lee et al . 2020 год
- Chryseobacterium vietnamense Ли и Чжу 2012 г.
- Chryseobacterium viscerum Zamora et al . 2012 год
- Chryseobacterium vrystaatense de Beer et al . 2005 г.
- Chryseobacterium wanjuense Weon et al . 2006 г.
- Chryseobacterium xinjiangense Zhao et al . 2011 год
- Штамм Chryseobacterium (Feng et al . 2014) от Hahnke et al . 2017 год
- « Chryseobacterium yeoncheonense » Hoang et al . 2013 год
- Chryseobacterium yonginense Йонг и Джо, 2011 г.
- Chryseobacterium zeae Kämpfer et al . 2014 год
- « Chryseobacterium zhengzhouense » Wang et al . 2016 год
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Эузеби Ж.П., Парте AC. « Хризеобактерия » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 29 июня 2021 г.
- ^ Мату А, Лум Нде А, Остхейзен Л, Хитцерот А, Баденхорст М, Дуба Л, Гидага М, Клинк Дж, Крик И.М., Лекома П.Дж., Нел Л., Дос Рамос С.М., Россоу Дж., Саломан Н., Сегоне Н., Серобе С., Тияни Т., Хьюго С.Дж., Ньюман Дж.Д. (январь 2019 г.). «Штаммы типа хризобактерий» . Объявления о ресурсах по микробиологии . 8 (1): e01518–18. дои : 10.1128/MRA.01518-18 . ПМК 6318376 . ПМИД 30637405 .
- ^ Вандам П., Бернарде Дж. Ф., Сегерс П., Керстерс К., Холмс Б. (01.10.1994). «ПРИМЕЧАНИЯ: Новые перспективы в классификации флавобактерий: описание Chryseobacterium gen. nov., Bergeyella gen. nov. и Empedobacter nom. rev» . Международный журнал систематической бактериологии . 44 (4): 827–831. дои : 10.1099/00207713-44-4-827 . ISSN 0020-7713 .
- ^ Jump up to: а б Ким К.К., Ким МК, Лим Дж.Х., Пак ХИ, Ли С.Т. (май 2005 г.). «Перенос Chryseobacterium meningosepticum и Chryseobacterium miricola в Elizabethkingia gen. nov. как Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. и Elizabethkingia miricola comb. nov.» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 55 (Часть 3): 1287–93. дои : 10.1099/ijs.0.63541-0 . ПМИД 15879269 .
- ^ Бернарде Дж. Ф., Накагава Ю., Холмс Б. и др. (Подкомитет по таксономии флавобактерий и цитофагоподобных бактерий Международного комитета по систематике прокариотов) (май 2002 г.). «Предложены минимальные стандарты описания новых таксонов семейства Flavobacteriaceae и уточненное описание семейства» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 52 (Часть 3): 1049–70. дои : 10.1099/00207713-52-3-1049 . ПМИД 12054224 .
- ^ Jump up to: а б с д и Лох Т.П., Фейсал М. (май 2015 г.). «Новые флавобактериальные инфекции у рыб: обзор» . Журнал перспективных исследований . 6 (3): 283–300. дои : 10.1016/j.jare.2014.10.009 . ПМЦ 4522593 . ПМИД 26257926 .
- ^ Ханцис-Захаров Е, Шакед Т, Сендерович Ю, Халперн М (ноябрь 2008 г.). «Chryseobacterium oranimense sp. nov., психротолерантная, протеолитическая и липолитическая бактерия, выделенная из сырого коровьего молока» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (Часть 11): 2635–9. дои : 10.1099/ijs.0.65819-0 . ПМИД 18984706 .
- «Новые бактерии обнаружены в сыром молоке» . ЭврекАлерт! (Пресс-релиз). 16 ноября 2008 г.
- ^ Jump up to: а б Мукерджи Р., Какарала Р., Смит С.Дж., Куш Х.Г. (апрель 2016 г.). «Chryseobacterium indologenes: новая инфекция в США» . Отчеты о случаях BMJ . 2016 : bcr2016214486. дои : 10.1136/bcr-2016-214486 . ПМЦ 4840731 . ПМИД 27053540 .
- ^ Jump up to: а б Пейдж АП, Робертс М., Феликс М.А., Пикард Д., Пейдж А, Вейр В. (февраль 2019 г.). «Золотая палочка смерти Chryseobacterium nematophagum представляет собой новый патоген, переваривающий матрикс нематод» . БМК Биология . 17 (1): 10. дои : 10.1186/s12915-019-0632-x . ПМК 6394051 . ПМИД 30813925 .
- ^ Jump up to: а б Макбрайд MJ, Чжу Ю (январь 2013 г.). «Гены скользящей подвижности и системы секреции Por широко распространены среди представителей типа bacteroidetes» . Журнал бактериологии . 195 (2): 270–8. дои : 10.1128/JB.01962-12 . ПМЦ 3553832 . ПМИД 23123910 .
- ^ Мэнсфилд М.Дж., Докси AC (июнь 2018 г.). «Геномный взгляд на эволюцию и экологию ботулинических нейротоксинов» . Патогены и болезни . 76 (4). doi : 10.1093/femspd/fty040 . ПМИД 29684130 .