CST5

CST5
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
показывать Список кодов идентификаторов PDB
	1RN7, 1ROA
Идентификаторы
Псевдонимы	CST5 , цистатин D
Внешние идентификаторы	Омим : 123858 ; MGI : 1930004 ; Гомологен : 55615 ; GeneCards : CST5 ; OMA : CST5 - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	23,879,748 bp
показывать Местоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	149,252,213 bp
показывать РНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	parotid gland; ; right adrenal cortex; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; upper lobe of left lung; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; right lung; ; tonsil; ; body of pancreas; ; muscle tissue;
	Top expressed in
	parotid gland; ; lacrimal gland; ; submandibular gland; ; masseter muscle; ; lymph node; ; sexually immature organism; ; grey matter; ; prosencephalon; ; cerebrum; ; cerebral hemisphere;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Джин Онтология
Molecular function	peptidase inhibitor activity; protein binding; cysteine-type endopeptidase inhibitor activity; protease binding;
Cellular component	extracellular region; extracellular exosome; extracellular space;
Biological process	negative regulation of peptidase activity; negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity; negative regulation of endopeptidase activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1473
	58214
	ENSG00000170367
	Ensmusg00000033156
	P28325
	Q9JM84
	NM_001900
	NM_021405
	NP_001891
	NP_067380
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Цистатин-D -это белок , который у людей кодируется CST5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Суперсемейство цистатина охватывает белки, которые содержат множественные цистатин-подобные последовательности. Некоторые из членов являются активными ингибиторами протеазы цистеина, в то время как другие потеряли или, возможно, никогда не приобретали эту ингибирующую активность. В суперсемействе существует три ингибирующих семейства, включая цистатины типа 1 (Stefins), цистатины типа 2 и кининогены. Белки цистатина типа 2 представляют собой класс ингибиторов цистеиновой протеиназы, обнаруженных в различных жидкостях и выделениях человека. Локус цистатина на хромосоме 20 содержит большинство генов цистатина и псевдогенов типа 2. Этот ген расположен в локусе цистатина и кодирует белок, обнаруженный в слюне и слезах. Кодированный белок может играть защитную роль против протеиназ, присутствующих в полости рта. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000170367 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000033156 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Freije JP, Abrahamson M, Olafsson I, Velasco G, Grubb A, Lopez-Otin C (Dec 1991). «Структура и экспрессия гена, кодирующего цистатин D, нового ингибитора протеиназы цистеиназы человека» . J Biol Chem . 266 (30): 20538–43. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 54958-9 . PMID 1939105 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: CST5 Cystatin D" .

Внешние ссылки

Онлайн -база данных Merops : для пептидаз и их ингибиторов I25.005
человека Расположение генома CST5 и CST5 страница генов в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P28325 (Cystatin-D) в PDBE-KB .

Дальнейшее чтение

Браун WM, Dziegielewska KM (1997). «Друзья и отношения суперсемейства цистатина-Новые члены и их эволюция» . Белок Sci . 6 (1): 5–12. doi : 10.1002/pro.5560060102 . PMC 2143511 . PMID 9007972 .
Saitoh E, Isemura S, Sanada K, et al. (1989). «Суперсемейство цистатина. Свидетельство о том, что гены цистатина семейства II эволюционно связаны с генами цистатина Family III». Биол. Химический Хоппе-Сейлер . 369 Suppl: 191–7. PMID 3202964 .
Dickinson DP, Thiesse M, Dempsey LD, Millar SJ (1993). «Геномное клонирование, физическое картирование и экспрессия генов цистатина типа 2 человека». Критическое Преподобный Орал Биол. Медик 4 (3–4): 573–80. doi : 10.1177/104544411930040034401 . PMID 7690606 .
Дикинсон Д.П., Чжао Y, Тисс М., Сицилиано М.Дж. (1995). «Прямое картирование семи генов, кодирующих цистатины типа 2 человека на один сайт, расположенный по адресу 20P11.2». Геномика . 24 (1): 172–5. doi : 10.1006/geno.1994.1595 . PMID 7896273 .
Balbín M, Hall A, Grubb A, et al. (1994). «Структурная и функциональная характеристика двух аллельных вариантов цистатина D, разделяющего характерный спектр ингибирования против протеиназ цистеина млекопитающих» . Дж. Биол. Химический 269 (37): 23156–62. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 31633-2 . PMID 8083219 .
Thiesse M, Millar SJ, Dickinson DP (1994). «Семейство генов цистатина человека человека 2 типа состоит из восьми до девяти членов, причем по меньшей мере семь генов сгруппированы в одном локусе на человеческой хромосоме 20». ДНК -клеточная биол . 13 (2): 97–116. doi : 10.1089/dna.1994.13.97 . PMID 8179826 .
Freije JP, Balbín M, Abrahamson M, et al. (1993). «Цистатин человека D. Клонирование кДНК, характеристика ингибитора Escherichia Coli, и идентификация нативного белка в слюне» . Дж. Биол. Химический 268 (21): 15737–44. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 82317-1 . PMID 8340398 .
Freije JP, Pendás AM, Velasco G, et al. (1993). «Локализация гена цистатина D человека (CST5) в хромосоме 20p11.21 с помощью гибридизации in situ». Цитогенет. Клеточная генера . 62 (1): 29–31. doi : 10.1159/000133438 . PMID 8422752 .
Balbín M, Freije JP, Abrahamson M, et al. (1993). «Изменение последовательности в гене цистатина D человека, приводящего к полиморфизму аминокислоты (Cys/Arg) на уровне белка». Гул Генет . 90 (6): 668–9. doi : 10.1007/bf00202491 . PMID 8444475 . S2CID 23090315 .
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы человека 20» . Природа . 414 (6866): 865–71. Bibcode : 2001natur.414..865d . doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052 .
Dickinson DP, Thiesse M, Hicks MJ (2002). «Экспрессия генов цистатина 2 типа CST1-CST5 в тканях для взрослых людей и развивающейся подчиненых железе». ДНК -клеточная биол . 21 (1): 47–65. doi : 10.1089/10445490252810311 . PMID 11879580 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Alvarez-Fernandez M, Liang YH, Abrahamson M, Su XD (2005). «Кристаллическая структура цистатина D -цистатина D, ингибитор цистеин -пептидазы с ограниченным профилем ингибирования» (PDF) . Дж. Биол. Химический 280 (18): 18221–8. doi : 10.1074/jbc.m411914200 . PMID 15728581 . S2CID 12151927 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 20 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000170367 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000033156 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid1939105-5] Freije JP, Abrahamson M, Olafsson I, Velasco G, Grubb A, Lopez-Otin C (Dec 1991). «Структура и экспрессия гена, кодирующего цистатин D, нового ингибитора протеиназы цистеиназы человека» . J Biol Chem . 266 (30): 20538–43. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 54958-9 . PMID 1939105 .

[entrez-6] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: CST5 Cystatin D" .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]