Домен GHKL
| Гистидинкиназа, ДНК-гираза B и HSP90-подобная АТФаза | |||
|---|---|---|---|
 Структура N-концевого домена шаперона дрожжевого Hsp90. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | HATPase_c | ||
| Пфам | PF02518 | ||
| ИнтерПро | ИПР003594 | ||
| УМНЫЙ | HATPase_c | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1ei1 / SCOPe / СУПФАМ | ||
| CDD | cd00075 | ||
| |||
Домен GHKL ( G yrase , H sp90 , Histidine Kinase ) представляет собой , Mut L эволюционно консервативный белковый домен . [ 2 ] Это АТФазный домен, обнаруженный в нескольких АТФ-связывающих белках, таких как гистидинкиназа, ДНК-гираза B, топоизомеразы, [ 3 ] белок теплового шока HSP90, [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] фитохромоподобные АТФазы и белки восстановления несоответствия ДНК.
Более подробную информацию об этом белке можно найти в разделе «Белок месяца: ДНК-топоизомераза». [ 7 ]
Структура
[ редактировать ]Складка этого домена состоит из двух слоев альфа/бета, которые содержат 8-нитевой смешанный бета-лист. [ 2 ]
Подсемейства
[ редактировать ]- Белок теплового шока Hsp90, N-концевой
- Сенсорная гистидинкиназа NatK, С-концевой домен
Члены
[ редактировать ]- БЦКДК
- ХСП90АА1 , ХСП90АБ1 , ХСП90Б1
- MLH1 , MLH3 , MORC1 , MORC2 , MORC3 , MORC4
- ПДК1 , ПДК2 , ПДК3 , ПДК4
- ПМС1 , ПМС2 , ПМС2Л1 , ПМС2Л11 , ПМС2Л3 , ПМС4Л
- ТОП2А , ТОП2Б
- ЛОВУШКА1 , ЛОВУШКА
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Продрому С., Роу С.М., Пайпер П.В., Перл Л.Х. (июнь 1997 г.). «Молекулярный зажим в кристаллической структуре N-концевого домена шаперона дрожжей Hsp90». Нат. Структура. Биол . 4 (6): 477–82. дои : 10.1038/nsb0697-477 . ПМИД 9187656 . S2CID 38764610 .
- ^ Jump up to: а б Дутта Р., Иноуе М. (январь 2000 г.). «GHKL, новое суперсемейство АТФаз/киназ». Тенденции биохимии. Наука . 25 (1): 24–8. дои : 10.1016/S0968-0004(99)01503-0 . ПМИД 10637609 .
- ^ Беллон С., Парсонс Дж.Д., Вэй Ю., Хаякава К., Свенсон Л.Л., Чарифсон П.С., Липпке Дж.А., Алдапе Р., Гросс CH (май 2004 г.). «Кристаллические структуры субъединицы ParE топоизомеразы IV Escherichia coli (24 и 43 килодальтон): одиночный остаток определяет различия в активности новобиоцина против топоизомеразы IV и ДНК-гиразы» . Антимикроб. Агенты Чематер . 48 (5): 1856–64. дои : 10.1128/AAC.48.5.1856-1864.2004 . ПМК 400558 . ПМИД 15105144 .
- ^ Иммормино Р.М., Доллинс Д.Э., Шаффер П.Л., Солдано К.Л., Уокер М.А., Гевирт Д.Т. (октябрь 2004 г.). «Вызванный лигандом конформационный сдвиг в N-концевом домене GRP94, шаперона Hsp90» . Ж. Биол. Хим . 279 (44): 46162–71. дои : 10.1074/jbc.M405253200 . ПМИД 15292259 .
- ^ Роу С.М., Али М.М., Мейер П., Воан С.К., Панарету Б., Пайпер П.В., Продрому С., Перл Л.Х. (январь 2004 г.). «Механизм регуляции Hsp90 с помощью специфичного для протеинкиназы кошаперона p50 (cdc37)» . Клетка . 116 (1): 87–98. дои : 10.1016/S0092-8674(03)01027-4 . ПМИД 14718169 . S2CID 797232 .
- ^ Райт Л, Баррил Икс, Даймок Б, Шеридан Л, Сургенор А, Бесвик М, Дрисдейл М, Коллиер А, Мэсси А, Дэвис Н, Финк А, Фромонт С, Ахерн В, Боксалл К, Шарп С, Уоркман П, Хаббард Р.Э. (июнь 2004 г.). «Взаимосвязь структура-активность при связывании пуринового ингибитора с изоформами HSP90» . хим. Биол . 11 (6): 775–85. doi : 10.1016/j.chembiol.2004.03.033 . ПМИД 15217611 .
- ^ Макдауэлл Дж (2006). «ДНК-топоизомераза» . Белок месяца . ИнтерПро.
 | Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |