RANBP1

RANBP1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1K5D, 1K5G
Идентификаторы
Псевдонимы	RANBP1 , HTF9A, RAN -связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	Омим : 601180 ; MGI : 96269 ; Гомологен : 21600 ; GeneCards : RANBP1 ; OMA : RANBP1 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	20,127,355 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	18,066,596 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; ventricular zone; ; left testis; ; right testis; ; mucosa of transverse colon; ; prefrontal cortex; ; cerebellar hemisphere; ; anterior cingulate cortex; ; right hemisphere of cerebellum; ; left uterine tube;
	Top expressed in
	yolk sac; ; epiblast; ; embryo; ; tail of embryo; ; embryo; ; genital tubercle; ; ventricular zone; ; neural tube; ; mesencephalon; ; ganglionic eminence;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	GTPase activator activity; GDP-dissociation inhibitor activity; protein binding; cadherin binding;
Cellular component	cytoplasm; nuclear envelope; nucleus; centrosome; cytosol; nuclear pore;
Biological process	positive regulation of GTPase activity; intracellular transport; viral process; signal transduction; ubiquitin-dependent protein catabolic process; regulation of catalytic activity; protein import into nucleus; spindle organization; positive regulation of mitotic centrosome separation; RNA export from nucleus; G1/S transition of mitotic cell cycle;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5902
	19385
	ENSG0000000099901
	Ensmusg00000005732
	P43487
	P34022
	NM_001278639 ; NM_001278640 ; NM_001278641 ; NM_002882
	NM_011239
	NP_001265568 ; NP_001265569 ; NP_001265570 ; NP_002873
	NP_035369
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

RAN-специфический связывающий белок 1 является ферментом , который у людей кодируется RANBP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

REN /TC4 -связывающий белок, RANBP1, специфически взаимодействует с GTP -заряженным RAN. RANBP1 кодирует 23-километровый белок, который связывается с RAN, комплексным с GTP, но не ВВП . RANBP1 не активирует активность GTPase RAN, но заметно увеличивает гидролиз GTP с помощью активирующих RangTPase белка ( Rangap1 ). RANBP1 КДНК кодирует белок 201-аминокислот, который на 92% похож на гомолог мыши. Как в клетках млекопитающих, так и в дрожжах RANBP1 действует как негативный регулятор RCC1 , ингибируя RCC1-стимулированную гулино-нуклеотидным высвобождением из RAN. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RANBP1 взаимодействует с XPO1 , ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} KPNB1 ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} и побежал . ^{[ 9 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000099901 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000005732 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Хаяси Н., Йокояма Н., Секи Т., Азума Ю., Оба Т., Нишимото Т (август 1995 г.). «RANBP1, RAS-подобное ядерное связывание G-белка с RAN/TC4, ингибирует RCC1 через RAN/TC4». MOL GEN GENET . 247 (6): 661–9. doi : 10.1007/bf00290397 . PMID 7616957 . S2CID 24266692 .
^ Kehlenbach RH, Dickmanns A, Kehlenbach A, Guan T, Gerace L (июль 1999 г.). «Роль RANBP1 в высвобождении CRM1 из комплекса ядерных пор в терминальной стадии ядерного экспорта» . J Cell Biol . 145 (4): 645–57. doi : 10.1083/jcb.145.4.645 . PMC 2133185 . PMID 10330396 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: RANBP1 RAN -связывающий белок 1» .
^ Сингх, BB; Патель HH; Roepman R; Шик D; Феррейра Па (декабрь 1999 г.). «Домен кластера цинковых пальцев RANBP2-это конкретный участок стыковки для коэффициента ядерного экспорта, экспортина-1» . Дж. Биол. Химический 274 (52): 37370–8. doi : 10.1074/jbc.274.52.37370 . HDL : 2066/120791 . ISSN 0021-9258 . PMID 10601307 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Plafker, K; Макара IG (май 2000). «Облегченный нуклеоцитоплазматический шатттлинг белка, связывающего RAN RANBP1» . Мол Клетка. Биол . 20 (10): 3510–21. doi : 10.1128/mcb.20.10.3510-3521.2000 . ISSN 0270-7306 . PMC 85643 . PMID 10779340 .
^ Yaseen, NR; Blobel G (сентябрь 1999). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение импорта ядер на нуклеопорин NUP358» . Дж. Биол. Химический 274 (37): 26493–502. doi : 10.1074/jbc.274.37.26493 . ISSN 0021-9258 . PMID 10473610 .
^ Рен, м; Вильямарин А; Ши а; Coutavas E; Мур MS; Locurcio m; Кларк V; Оппенгейм JD; D'Eustachio P; Раш М.Г. (апрель 1995 г.). «Отдельные домены GTPase GTPase взаимодействуют с различными факторами для регуляции импорта ядерного белка и обработки РНК» . Мол Клетка. Биол . 15 (4): 2117–24. doi : 10.1128/mcb.15.4.2117 . ISSN 0270-7306 . PMC 230439 . PMID 7891706 .
^ Стеггерда, См; Paschal BM (июль 2000 г.). «Белок MARMALIN MOG1 является фактором высвобождения нуклеотидов гуанина для RAN» . Дж. Биол. Химический 275 (30): 23175–80. doi : 10.1074/jbc.c000252200 . ISSN 0021-9258 . PMID 10811801 .

Дальнейшее чтение

Smirnova FR, Smirnova E, et. (1995). PO) ( Embo j 14 (4): 705–1 doi : 10.1002/j.1460-2075.1995 . PMC 398135 . PMID 7882974 .
Рен М., Вильямарин А., Ши А. и др. (1995). «Отдельные домены GTPase GTPase взаимодействуют с различными факторами для регуляции импорта ядерного белка и обработки РНК» . Мол Клетка. Биол . 15 (4): 2117–24. doi : 10.1128/mcb.15.4.2117 . PMC 230439 . PMID 7891706 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Coutavas E, Ren M, Oppenheim JD, et al. (1994). «Характеристика белков, которые взаимодействуют с регуляторным белком клеточного цикла RAN/TC4». Природа . 366 (6455): 585–7. Bibcode : 1993natur.366..585c . doi : 10.1038/366585A0 . PMID 8255297 . S2CID 4302198 .
Золотухин А.С., Фелбер Б.К. (1997). «Мутации в сигнале экспорта ядерного экспорта человека RAN-связывающего белка RANBP1 блокируют оборотную посттранскрипционную регуляцию вируса иммунодефицита человека типа 1 вируса иммунодефицита» . Дж. Биол. Химический 272 (17): 11356–60. doi : 10.1074/jbc.272.17.11356 . PMID 9111043 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Plafker K, Macara IG (2000). «Облегченный нуклеоцитоплазматический шатттлинг белка, связывающего RAN RANBP1» . Мол Клетка. Биол . 20 (10): 3510–21. doi : 10.1128/mcb.20.10.3510-3521.2000 . PMC 85643 . PMID 10779340 .
Steggerda SM, Paschal BM (2000). «Белок MARMALIN MOG1 является фактором высвобождения нуклеотидов гуанина для RAN» . Дж. Биол. Химический 275 (30): 23175–80. doi : 10.1074/jbc.c000252200 . PMID 10811801 .
Maynard TM, Haskell GT, Bhasin N, et al. (2002). «RANBP1, кандидат кандидата синдрома/синдрома дигёржа, экспрессируется на местах мезенхимальной/эпителиальной индукции» . Мех Девчонка 111 (1–2): 177–80. doi : 10.1016/s0925-4773 (01) 00616-5 . PMID 11804793 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Di Fiore B, Ciciarello M, Mangiacasale R, et al. (2004). «Млекопитающее RANBP1 регулирует сплоченность центросом во время митоза» . J. Cell Sci . 116 (Pt 16): 3399–411. doi : 10.1242/jcs.00624 . PMID 12840069 .
Seewald MJ, Kraemer A, Farkasovsky M, et al. (2003). «Биохимическая характеристика системы RAN-RANBP1-Rangap: являются ли белки RANBP и кислый хвост с помощью Rangap, необходимых для реакции GTPase RAN-Rangap?» Полем Мол Клетка. Биол . 23 (22): 8124–36. doi : 10.1128/mcb.23.22.8124-8136.2003 . PMC 262373 . PMID 14585972 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Bohlson SS, Zhang M, Ortiz CE, Tenner AJ (2005). «CD93 взаимодействует с доменом PDZ, содержащим адаптерный белок GIPC: последствия модуляции фагоцитоза». J. Leukoc. Биол . 77 (1): 80–9. doi : 10.1189/jlb.0504305 . PMID 15459234 . S2CID 3219168 .
Коллинз JE, Wright CL, Edwards CA, et al. (2005). «Подход, основанный на аннотациях генома к клонированию человека Orfeome» . Геном биол . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Bruneel A, Labas V, Mailloux A, et al. (2006). «Протеомика эндотелиальных клеток пупочной вены человека применяется к индуцированному этопозидом апоптоза». Протеомика . 5 (15): 3876–84. doi : 10.1002/pmic.200401239 . PMID 16130169 . S2CID 26007149 .
Такеда Е., Хида М., Катахира Дж., Йонда Ю (2006). «Фосфорилирование Rangap1 стабилизирует его взаимодействие с RAN и RANBP1» . Клеточная структура Функт . 30 (2): 69–80. doi : 10.1247/csf.30.69 . PMID 16428860 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F, et al. (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка-белка-белка с помощью масс-спектрометрии» . Мол Система Биол . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000099901 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000005732 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid7616957-5] Хаяси Н., Йокояма Н., Секи Т., Азума Ю., Оба Т., Нишимото Т (август 1995 г.). «RANBP1, RAS-подобное ядерное связывание G-белка с RAN/TC4, ингибирует RCC1 через RAN/TC4». MOL GEN GENET . 247 (6): 661–9. doi : 10.1007/bf00290397 . PMID 7616957 . S2CID 24266692 .

[pmid10330396-6] Kehlenbach RH, Dickmanns A, Kehlenbach A, Guan T, Gerace L (июль 1999 г.). «Роль RANBP1 в высвобождении CRM1 из комплекса ядерных пор в терминальной стадии ядерного экспорта» . J Cell Biol . 145 (4): 645–57. doi : 10.1083/jcb.145.4.645 . PMC 2133185 . PMID 10330396 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: RANBP1 RAN -связывающий белок 1» .

[pmid10601307-8] Сингх, BB; Патель HH; Roepman R; Шик D; Феррейра Па (декабрь 1999 г.). «Домен кластера цинковых пальцев RANBP2-это конкретный участок стыковки для коэффициента ядерного экспорта, экспортина-1» . Дж. Биол. Химический 274 (52): 37370–8. doi : 10.1074/jbc.274.52.37370 . HDL : 2066/120791 . ISSN 0021-9258 . PMID 10601307 .

[pmid10779340-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Plafker, K; Макара IG (май 2000). «Облегченный нуклеоцитоплазматический шатттлинг белка, связывающего RAN RANBP1» . Мол Клетка. Биол . 20 (10): 3510–21. doi : 10.1128/mcb.20.10.3510-3521.2000 . ISSN 0270-7306 . PMC 85643 . PMID 10779340 .

[pmid10473610-10] Yaseen, NR; Blobel G (сентябрь 1999). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение импорта ядер на нуклеопорин NUP358» . Дж. Биол. Химический 274 (37): 26493–502. doi : 10.1074/jbc.274.37.26493 . ISSN 0021-9258 . PMID 10473610 .

[pmid7891706-11] Рен, м; Вильямарин А; Ши а; Coutavas E; Мур MS; Locurcio m; Кларк V; Оппенгейм JD; D'Eustachio P; Раш М.Г. (апрель 1995 г.). «Отдельные домены GTPase GTPase взаимодействуют с различными факторами для регуляции импорта ядерного белка и обработки РНК» . Мол Клетка. Биол . 15 (4): 2117–24. doi : 10.1128/mcb.15.4.2117 . ISSN 0270-7306 . PMC 230439 . PMID 7891706 .

[pmid10811801-12] Стеггерда, См; Paschal BM (июль 2000 г.). «Белок MARMALIN MOG1 является фактором высвобождения нуклеотидов гуанина для RAN» . Дж. Биол. Химический 275 (30): 23175–80. doi : 10.1074/jbc.c000252200 . ISSN 0021-9258 . PMID 10811801 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]