EDF1

EDF1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1X57
Идентификаторы
Псевдонимы	EDF1 , EDF-1, MBF1, CFAP280, Фактор 1, связанный с дифференцировкой эндотелиальной дифференциации 1
Внешние идентификаторы	Омим : 605107 ; MGI : 1891227 ; Гомологен : 2809 ; GeneCards : EDF1 ; OMA : EDF1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	136,866,308 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	25,452,094 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	parotid gland; ; anterior pituitary; ; body of pancreas; ; right lobe of thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; mucosa of transverse colon; ; duodenum; ; right hemisphere of cerebellum; ; jejunal mucosa; ; body of stomach;
	Top expressed in
	Paneth cell; ; facial motor nucleus; ; motor neuron; ; fossa; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; condyle; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; duodenum; ; right kidney; ; left lobe of liver;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	methyltransferase activity; sequence-specific DNA binding; DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; transcription coactivator activity; calmodulin binding; histone acetyltransferase activity; protein binding; RNA binding; TFIID-class transcription factor complex binding;
Cellular component	cytoplasm; transcription factor TFIID complex; intracellular anatomical structure; nucleolus; extracellular exosome; nucleus; cytosol;
Biological process	cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; multicellular organism development; positive regulation of transcription, DNA-templated; regulation of lipid metabolic process; endothelial cell differentiation; positive regulation of DNA binding;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8721
	59022
	ENSG00000107223
	Ensmusg00000015092
	O60869
	Q9JMG1
	NM_153200 ; NM_001281297 ; NM_001281298 ; NM_001281299 ; NM_003792
	NM_021519
	NP_001268226 ; NP_001268227 ; NP_001268228 ; NP_003783 ; NP_694880
	NP_067494
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Для ядерного реактора EDF1 см. Атомную электростанцию Chinon

Связанный с эндотелиальной дифференцировкой фактор 1 является белком , который у людей кодируется EDF1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует белок, который может регулировать дифференцировку эндотелиальных клеток. Было постулировано, что белок функционирует как мостичная молекула, которая взаимосвязает регуляторные белки и базальный транскрипционный механизм, тем самым модулируя транскрипцию генов, участвующих в дифференцировке эндотелиальной дифференцировки. Также было обнаружено, что этот белок действует как транскрипционный коактиватор путем взаимосвязи общего фактора транскрипционного фактора TATA-связывающего белка (TBP) и ген-специфических активаторов. Для этого гена были обнаружены два альтернативных транскрипта, которые кодируют различные белки. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что EDF1 взаимодействует :

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000107223 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000015092 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Dragoni I, Mariotti M, Consalez GG, Soria MR, Maier JA (декабрь 1998 г.). «EDF-1, новый генный продукт, понижаемый в дифференцировке эндотелиальных клеток человека» . J Biol Chem . 273 (47): 31119–24. doi : 10.1074/jbc.273.47.31119 . PMID 9813014 .
^ Ballabio E, Mariotti M, De Benedictis L, Maier JA (апрель 2004 г.). «Двойная роль фактора-1, связанного с дифференцировкой, в цитозоле и ядре: модуляция протеинкиназой А» . Cell Mol Life Sci . 61 (9): 1069–74. doi : 10.1007/s00018-004-4016-0 . PMC 11146030 . PMID 15112053 . S2CID 861006 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: EDF1-эндотелиальная дифференцировка фактора 1» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Брендел С., Гелман Л., Ауверкс Дж (июнь 2002 г.). «Мультипротеиновый коэффициент 1 (MBF-1) является кофактором для ядерных рецепторов, которые регулируют липидный метаболизм» . Мол Эндокринол . 16 (6): 1367–77. doi : 10.1210/mend.16.6.0843 . PMID 12040021 .
^ Mariotti M, De Benedictis L, Avon E, Maier JA (август 2000 г.). «Взаимодействие между фактором-1, связанным с эндотелиальной дифференцировкой, и кальмодулином in vitro и in vivo» . Дж. Биол. Химический 275 (31): 24047–51. doi : 10.1074/jbc.m001928200 . PMID 10816571 .
^ Kabe Y, Goto M, Shima D, Imai T, Wada T, Morohashi Ki, Shirakawa M, Hirose S, Handa H (ноябрь 1999 г.). «Роль человеческого MBF1 как транскрипционного коактиватора» . Дж. Биол. Химический 274 (48): 34196–202. doi : 10.1074/jbc.274.48.34196 . PMID 10567391 .

Дальнейшее чтение

Li FQ, Ueda H, Hirose S (1994). «Медиаторы активации транскрипции гена Fushi Tarazu с помощью BMFTZ-F1» . Мол Клетка. Биол . 14 (5): 3013–21. doi : 10.1128/mcb.14.5.3013 . PMC 358669 . PMID 8164657 .
Ozaki J, Takemaru Ki, Ikegami T, Mishima M, Ueda H, Hirose S, Kabe Y, Handa H, Shirakawa M (1999). «Идентификация основного домена и вторичная структура транскрипционного коактиватора MBF1» . Гены клетки . 4 (7): 415–24. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00267.x . PMID 10469174 . S2CID 17825943 .
Mariotti M, De Benedictis L, Avon E, Maier JA (2000). «Взаимодействие между фактором-1, связанным с эндотелиальной дифференцировкой, и кальмодулином in vitro и in vivo» . Дж. Биол. Химический 275 (31): 24047–51. doi : 10.1074/jbc.m001928200 . PMID 10816571 .
Брендель С., Гелман Л., Ауверкс Дж. (2003). «Мультипротеиновый коэффициент 1 (MBF-1) является кофактором для ядерных рецепторов, которые регулируют липидный метаболизм» . Мол Эндокринол . 16 (6): 1367–77. doi : 10.1210/mend.16.6.0843 . PMID 12040021 .
Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А., Босак С., Прочтенность Р, Поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid DE, FP Roth, Vidal M (2005). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
Болонье Ф., Питарке-Марти М., Ло Цицерон В., Мантовани Р., Майер Дж. (2006). «Характеристика минимального промотора человека EDF-1: участие NFY и SP1 в регуляции базальной транскрипции». Ген . 374 : 87–95. doi : 10.1016/j.gene.2006.01.030 . PMID 16567061 .

Эта статья о гене на хромосоме человека 9 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000107223 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000015092 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9813014-5] Dragoni I, Mariotti M, Consalez GG, Soria MR, Maier JA (декабрь 1998 г.). «EDF-1, новый генный продукт, понижаемый в дифференцировке эндотелиальных клеток человека» . J Biol Chem . 273 (47): 31119–24. doi : 10.1074/jbc.273.47.31119 . PMID 9813014 .

[pmid15112053-6] Ballabio E, Mariotti M, De Benedictis L, Maier JA (апрель 2004 г.). «Двойная роль фактора-1, связанного с дифференцировкой, в цитозоле и ядре: модуляция протеинкиназой А» . Cell Mol Life Sci . 61 (9): 1069–74. doi : 10.1007/s00018-004-4016-0 . PMC 11146030 . PMID 15112053 . S2CID 861006 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: EDF1-эндотелиальная дифференцировка фактора 1» .

[pmid12040021-8] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Брендел С., Гелман Л., Ауверкс Дж (июнь 2002 г.). «Мультипротеиновый коэффициент 1 (MBF-1) является кофактором для ядерных рецепторов, которые регулируют липидный метаболизм» . Мол Эндокринол . 16 (6): 1367–77. doi : 10.1210/mend.16.6.0843 . PMID 12040021 .

[pmid10816571-9] Mariotti M, De Benedictis L, Avon E, Maier JA (август 2000 г.). «Взаимодействие между фактором-1, связанным с эндотелиальной дифференцировкой, и кальмодулином in vitro и in vivo» . Дж. Биол. Химический 275 (31): 24047–51. doi : 10.1074/jbc.m001928200 . PMID 10816571 .

[pmid10567391-10] Kabe Y, Goto M, Shima D, Imai T, Wada T, Morohashi Ki, Shirakawa M, Hirose S, Handa H (ноябрь 1999 г.). «Роль человеческого MBF1 как транскрипционного коактиватора» . Дж. Биол. Химический 274 (48): 34196–202. doi : 10.1074/jbc.274.48.34196 . PMID 10567391 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]