Гомолог 3 Alkb, альфа-кетоглутаратзависимая диоксигеназа

АЛКБХ3
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2IUW
Идентификаторы
Псевдонимы	ALKBH3 , ABH3, DEPC-1, DEPC1, PCA1, hABH3, гомолог alkB 3, альфа-кетоглутарат-зависимая диоксигеназа, гомолог alkB 3, альфа-кетоглутаратзависимая диоксигеназа, гомолог 3 alkB, альфа-кетоглутарат-зависимая диоксигеназа
Внешние идентификаторы	Опустить : 610603 ; МГИ : 1916363 ; Гомологен : 16393 ; Генные карты : ALKBH3 ; ОМА : ALKBH3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 11 (human) Band 11p11.2 Start 43,880,811 bp End 43,920,274 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2|2 E1 Start 93,810,895 bp End 93,841,152 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right uterine tube Achilles tendon muscle of thigh gonad gastrocnemius muscle stromal cell of endometrium islet of Langerhans body of pancreas skin of leg left ovary Top expressed in interventricular septum seminiferous tubule muscle of thigh gastrocnemius muscle soleus muscle medial head of gastrocnemius muscle triceps brachii muscle lumbar spinal ganglion skeletal muscle tissue vastus lateralis muscle More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function protein binding L-ascorbic acid binding dioxygenase activity metal ion binding DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity oxidoreductase activity ferrous iron binding mRNA N1-methyladenosine dioxygenase activity 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity cytosine C-5 DNA demethylase activity Cellular component nucleus mitochondrion nucleoplasm cytoplasm cytosol Biological process cell population proliferation cellular response to DNA damage stimulus DNA dealkylation involved in DNA repair oxidative single-stranded DNA demethylation oxidative single-stranded RNA demethylation DNA repair Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 221120 69113 Вместе ENSG00000166199 ENSMUSG00000040174 ЮниПрот Q96Q83 Q8K1E6 RefSeq (мРНК) НМ_139178 НМ_026944 RefSeq (белок) НП_631917 НП_081220 Местоположение (UCSC) Чр 11: 43,88 – 43,92 Мб Chr 2: 93,81 – 93,84 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гомолог 3 AlkB, альфа-кетоглутаратзависимая диоксигеназа, представляет собой белок , который у человека кодируется геном ALKBH3 .

Функция

Белок AlkB Escherichia coli защищает от цитотоксичности метилирующих агентов путем восстановления специфических повреждений ДНК, возникающих в одноцепочечной ДНК. ALKBH2 (MIM 610602) и ALKBH3 представляют собой гомологи AlkB E. coli, которые катализируют удаление 1-метиладенина и 3-метилцитозина (Duncan et al., 2002 [PubMed 12486230]).

Дальнейшее чтение

• Сундхейм О, Вогбё CB, Бьорос М, Соуза ММ, Талстад В, Аас П.А., Драблёс Ф, Крокан Х.Е., Тайнер Дж.А., Слупфауг Г (2006). «Структура ABH3 человека и ключевые остатки для окислительного деметилирования с целью обратить вспять повреждение ДНК/РНК» . ЭМБО Дж. 25 (14): 3389–97. дои : 10.1038/sj.emboj.7601219 . ПМЦ   1523172 . ПМИД   16858410 .
• Лю БК, Ву Ю.Д., Ли ПХ, Вэй Дж.С., Чжан Т., Лю Р.Л. (2007). «Антиген-1 рака простаты как потенциальный новый маркер рака простаты» . Азиат Дж. Андрол . 9 (6): 821–6. дои : 10.1111/j.1745-7262.2007.00279.x . ПМИД   17968469 .
• Монсен В.Т., Сундхейм О., Аас П.А., Вестбай М.П., ​​Соуза М.М., Слупфауг Г., Крокан Х.Э. (2010). «Дивергентные β-шпильки определяют двухцепочечное или одноцепочечное узнавание субстрата человеческих AlkB-гомологов 2 и 3» . Нуклеиновые кислоты Рез . 38 (19): 6447–55. дои : 10.1093/nar/gkq518 . ПМЦ   2965238 . ПМИД   20525795 .
• Чен Б, Лю Х, Сунь Х, Ян К.Г. (2010). «Механистическое понимание узнавания одноцепочечных и двухцепочечных субстратов ДНК с помощью ABH2 и ABH3». Мол Биосист . 6 (11): 2143–9. дои : 10.1039/c005148a . ПМИД   20714506 .
• Малки К., Ухер Р., Пайя-Кано Дж., Биндер Э., Ритчел М., Зобель А., Морс О., Хаузер Дж., Хенигсберг Н., Джерман Б., Суери Д., Плацентино А., Нг Май, Коэн-Вудс С., Слейтер Ф., Фармер. А, Эйчисон К.Дж., Крейг И.В., Льюис СМ, Макгаффин П., Шалквик LC (2011). «Сходящиеся данные о животных и людях свидетельствуют о роли гена PPM1A в реакции на антидепрессанты». Биол. Психиатрия . 69 (4): 360–5. doi : 10.1016/j.biopsych.2010.08.011 . ПМИД   20970119 . S2CID   41571515 .
• Тасаки М., Симада К., Кимура Х., Цудзикава К., Кониси Н. (2011). «ALKBH3, гомолог AlkB человека, способствует выживанию клеток при немелкоклеточном раке легких человека» . Бр. Дж. Рак . 104 (4): 700–6. дои : 10.1038/sj.bjc.6606012 . ПМК   3049579 . ПМИД   21285982 .
• Данго С., Мосаммапараст Н., Сова М.Э., Сюн Л.Дж., Ву Ф, Пак К., Рубин М., Гиги С., Харпер Дж.В., Ши Ю (2011). «Раскручивание ДНК хеликазой ASCC3 связано с ALKBH3-зависимым восстановлением алкилирования ДНК и пролиферацией раковых клеток» . Мол. Клетка . 44 (3): 373–84. doi : 10.1016/j.molcel.2011.08.039 . ПМЦ   3258846 . ПМИД   22055184 .
• Койке К., Уэда Ю., Хасэ Х., Китаэ К., Фусамаэ Ю., Масаи С., Инагаки Т., Сайго Ю., Хирасава С., Накадзима К., Осио И., Макино Ю., Кониси Н., Ямамото Х., Цудзикава К. (2012). «Противоопухолевый эффект нокдауна гомолога 3 AlkB в гормоннезависимых клетках рака простаты». Цели Curr по лечению рака . 12 (7): 847–56. дои : 10.2174/156800912802429283 . ПМИД   22515525 .
• Ямато И, Шо М, Симада К, Хотта К, Уэда Ю, Ясуда С, Сиги Н, Кониси Н, Цудзикава К, Накадзима Ю (2012). «PCA-1/ALKBH3 способствует развитию рака поджелудочной железы, поддерживая устойчивость к апоптозу и ангиогенез». Рак Рез . 72 (18): 4829–39. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-12-0328 . ПМИД   22826605 . S2CID   134935 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .