Диэтил пирокарбонат

Диэтил пирокарбонат
Имена
	Предпочтительное имя IUPAC Диэтилдикарбонат
	Другие имена Диэтилпирокарбонат ; Диэтилосидиформный ; Этоксирообразный ангидрид ; Пирокарбоновая кислота диэтиловая эфир ; DEPC ;
Идентификаторы
Номер CAS	1609-47-8 ;
3D model ( JSmol )	Интерактивное изображение ;
Чеби	Чеби: 59051 ;
Химический	CHEML55517 ;
Chemspider	2943 ;
Echa Infocard	100.015.039
ЕС номер	216-542-8 ;
Кегг	C11592 ;
Сетка	Диэтилпирокарбонат
PubChem CID	3051 ;
НЕКОТОРЫЙ	LMR3LZG146 ;
Comptox Dashboard ( EPA )	DTXSID2051764 ;
	показывать Дюймы
	показывать Улыбается
Характеристики
Химическая формула	C 6 H 10 O 5
Молярная масса	162.141 g·mol −1
Появление	Чистая, бесцветная жидкость
Плотность	1,101 г/мл при 25 ° C ; 1,121 г/мл при 20 ° C
Точка кипения	93 до 94 ° C (с 199 до 201 ° F; 366 до 367 K) при 24 гПа
Опасности
	Безопасность и гигиена труда (OHS/OSH):
Основные опасности	Вредный
	GHS Маркировка :
Пиктограммы
Сигнальное слово	Предупреждение
Заявления об опасности	H302 , H315 , H319 , H332 , H335
МЕРЫ ОФИНАЯ заявления	P261 , P264 , P270 , P271 , P280 , P301+P312 , P302+P352 , P304+P312 , P304+P340 , P305+P351+P338 , P312 , P321 P313, P333, P313, P332 , , P330 , P332+P313 , P337+P313 , P333, P333, P313, P313, P33, P332, P33, P332, P331 , P330 , P330, стр. P233 , P405 , P501
точка возгорания	69 ° C (156 ° F; 342 K) закрытая чашка
	Смертельная доза или концентрация (LD, LC):
Ld 50 ( средняя доза )	Oral - крыса - 850 мг/кг
Связанные соединения
Связанные соединения	Тотальный ; Диметилдикарбонат
	За исключением случаев, когда отмечены, данные приведены для материалов в их стандартном состоянии (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа). Проверьте ( что есть ?) Infobox ссылки

Диэтилпирокарбонат ( DEPC ), также называемый диэтилдикарбонатом ( название IUPAC ), используется в лаборатории для инактивации РНКазы ферментов в воде и на лабораторной посуде. Это делает это путем ковалентной модификации остатков гистидина (наиболее сильно), лизина , цистеина и тирозина . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Вода, обработанная DEPC (и, следовательно, без РНКазы), используется при обработке РНК в лаборатории для снижения риска деградации РНК с помощью РНК.

Вода обычно обрабатывается DEPC 0,1% об./Об. В течение не менее 2 часов при 37 ° C, а затем автоклавируется (не менее 15 минут), чтобы инактивировать следы DEPC. Инактивация DEPC таким образом дает CO ₂ и этанол . Более высокие концентрации DEPC способны дезактивировать большие количества РНКазы, но оставшиеся следы или побочные продукты могут ингибировать дальнейшие биохимические реакции, такие как транскрипция in vitro. Кроме того, химическая модификация РНК, такую как карбоксиметилирование, возможна, когда присутствуют следы DEPC или ее побочные продукты, что приводит к нарушению восстановления интактной РНК даже после обмена буфером (после осаждения).

DEPC нестабилен в воде и подвержен гидролизу к углекисению и этанолу, особенно в присутствии нуклеофила . По этой причине DEPC не может использоваться с буферами TRIS или Hepes . Напротив, его можно использовать с фосфатно-буферным физиологическим раствором или шваброй . ^{[ 3 ]} Удобное правило состоит в том, что ферменты или химические вещества, которые имеют активные -O: -n: или -s: не могут быть обработаны DEPC, чтобы стать без РНКазы, поскольку DEPC реагирует с этими видами. Кроме того, продукты деградации DEPC могут ингибировать транскрипцию in vitro.

DEPC Дериватизация гистидинов также используется для изучения важности гистидиловых остатков в ферментах. Модификация гистидина с помощью DEPC приводит к карбетоксилированным производным в азоте N-омега-2 кольца имидазола . Модификация DEPC гистидинов может быть изменена путем обработки 0,5 М гидроксиламином при нейтральном рН.

DEPC также можно использовать для исследования структуры двухцепочечной ДНК. ^{[ Цитация необходима ]}

Смотрите также

Декабрь

Ссылки

^ Чиргвин, Джон М; и др. (1979). «Выделение биологически активной рибонуклеиновой кислоты из источников в рибонуклеазе». Биохимия . 18 (24): 5294–5299. doi : 10.1021/bi00591a005 . PMID 518835 .
^ Волк, Барри; Леснау, Джудит А.; Рейхманн, Манфред Э. (1970). «Механизм необратимой инактивации бычьей панкреатической рибонуклеазы диэтилпирокарбонатом. Общая реакция диэтилпирокарбоната с белками» . Европейский журнал биохимии . 13 (3): 519–25. doi : 10.1111/j.1432-1033.1970.tb00955.x . PMID 5444158 .
^ «FAQ о DEPC» . Сигма-Альдрич . Получено 12 августа 2012 года .

Внешние ссылки

[1] Чиргвин, Джон М; и др. (1979). «Выделение биологически активной рибонуклеиновой кислоты из источников в рибонуклеазе». Биохимия . 18 (24): 5294–5299. doi : 10.1021/bi00591a005 . PMID 518835 .

[2] Волк, Барри; Леснау, Джудит А.; Рейхманн, Манфред Э. (1970). «Механизм необратимой инактивации бычьей панкреатической рибонуклеазы диэтилпирокарбонатом. Общая реакция диэтилпирокарбоната с белками» . Европейский журнал биохимии . 13 (3): 519–25. doi : 10.1111/j.1432-1033.1970.tb00955.x . PMID 5444158 .

[sigma-3] «FAQ о DEPC» . Сигма-Альдрич . Получено 12 августа 2012 года .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]