Табби протеин
Табби протеин | |||
---|---|---|---|
![]() Тубусный белок, экспрессируемый в мозге мыши | |||
Идентификаторы | |||
Символ | Ванна | ||
Пфам | PF01167 | ||
ИнтерПро | IPR000007 | ||
PROSITE | PDOC00923 | ||
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1c8z / СКОПе / СУПФАМ | ||
Суперсемейство OPM | 104 | ||
белок OPM | 1i7e | ||
|
Белок TUBBY кодируется TUB геном . Это вышележащей клетки, сигнальный белок общий для многоклеточных эукариот . Первый ген Tubby был идентифицирован у мышей , а белки, гомологичные Tubby, известны как «tubby-подобные белки» (TULP). Они имеют общую и характерную третичную структуру , состоящую из бета-цилиндра, упакованного вокруг альфа-спирали в центральной поре. Ген получил свое название из-за своей роли в обмене веществ; У мышей с мутированным геном Tubby развивается ожирение с отсроченным началом , нейросенсорная потеря слуха и дегенерация сетчатки . [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]
Структура
[ редактировать ]Белки Tubby классифицируются как α+β белки и имеют 12- бета-нитевой ствол, окружающий центральную альфа-спираль. Белки Tubby могут связывать небольшую клеточную сигнальную молекулу фосфатидилинозитол , которая обычно локализуется на клеточной мембране . Структурная складка, аналогичная Tubby-подобным белкам, была идентифицирована в Scramblase . семействе белков [ 4 ]
Функция
[ редактировать ]Белки Tubby участвуют в качестве факторов транскрипции. [ 5 ] и как потенциальные сигнальные факторы, связанные с активностью G-белка . [ 6 ] Они связаны с нейронов дифференцировкой и развитием , а у млекопитающих участвуют в трех болезненных процессах при мутациях : ожирении , дегенерации сетчатки и потере слуха . [ 5 ] Известно, что у мышей мутации в белках тубби влияют на продолжительность жизни и жира . накопление [ 7 ] а также углеводный обмен . [ 8 ] Домены Tubby связываются с цитоплазматической стороной клеточных мембран посредством связывания различных фосфоинозитидов. [ 9 ]
Белки человека, содержащие этот домен
[ редактировать ]ВАННА ; ТУЛЬП1 ; ТУЛП2 ; ТУЛП3 ; ТУЛП4 ;
Внешние ссылки
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Нобен-Траут, К.; Наггерт, Дж. К.; Норт, Массачусетс; Нишина, ПМ (1996). «Ген-кандидат на мутацию мышиной тубби». Природа . 380 (6574): 534–538. Бибкод : 1996Natur.380..534N . дои : 10.1038/380534a0 . ПМИД 8606774 . S2CID 4272027 .
- ^ Клейн, П.В.; Фан, В.; Ковац, С.Г.; Ли, Джей-Джей; Пулидо, Дж.К.; Ву, Ю.; Беркемейер, ЛР; Мисуми, диджей; Холмгрен, Л.; Шарла, О.; Вульф, Э.А.; Тайбер, О.; Броуди, Т.; Шу, П.; Хокинс, Ф.; Кеннеди, Б.; Бальдини, Л.; Эбелинг, К.; Альперин, Г.Д.; Дидс, Дж.; Лейки, Северная Дакота; Калпеппер, Дж.; Чен, Х.; Глюксманн-Куис, Массачусетс; Карлсон, Джорджия; Дуйк, генеральный менеджер; Мур, К.Дж. (1996). «Идентификация и характеристика гена ожирения у мышей Tubby: члена нового семейства генов» . Клетка . 85 (2): 281–290. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81104-6 . ПМИД 8612280 . S2CID 15670925 .
- ^ Олемиллер, К.К.; Хьюз, Р.М.; Мосингер-Огилви, Дж; Спек, доктор медицинских наук; Грософ, Д.Х.; Сильверман, М.С. (1995). «Дегенерация улитки и сетчатки у пухлой мыши». НейроОтчёт . 6 (6): 845–9. дои : 10.1097/00001756-199504190-00005 . ПМИД 7612867 . S2CID 8311280 .
- ^ Бейтман А., Финн Р.Д., Симс П.Дж., Видмер Т., Бигерт А., Сёдинг Дж. (январь 2009 г.). «Фосфолипидные скрамблазы и Табби-подобные белки принадлежат к новому суперсемейству мембраносвязанных факторов транскрипции» . Биоинформатика . 25 (2): 159–62. doi : 10.1093/биоинформатика/btn595 . ПМК 2639001 . ПМИД 19010806 .
- ^ Jump up to: а б Боггон, Ти Джей; Шан, штат Вашингтон; Сантагата, С; Майерс, Южная Каролина; Шапиро, Л. (1999). «Использование тубби-белков как факторов транскрипции с помощью структурного функционального анализа». Наука . 286 (5447): 2119–25. дои : 10.1126/science.286.5447.2119 . ПМИД 10591637 .
- ^ Кэрролл, К; Гомес, К; Шапиро, Л. (2004). «Табби-белки: сюжет усложняется». Nat Rev Mol Cell Biol . 5 (1): 55–63. дои : 10.1038/nrm1278 . ПМИД 14708010 . S2CID 7065010 .
- ^ Мухопадхьяй, А; Депланке, Б; Уолхаут, Эй Джей; Тиссенбаум, ХА (2005). «C. elegans tubby регулирует продолжительность жизни и накопление жира с помощью двух независимых механизмов» . Клеточные метаб . 2 (1): 35–42. дои : 10.1016/j.cmet.2005.06.004 . ПМИД 16054097 .
- ^ Ван, Ю; Себерн, К; Бектель, Л; Ли, BY; Саткевич, JP; Нишина, ПМ; Наггерт, Дж. К. (2006). «Нарушение углеводного обмена у мышей, гомозиготных по мутации Tubby» . Физиологическая Геномика . 27 (2): 131–40. doi : 10.1152/физиологгеномика.00239.2005 . ПМИД 16849632 .
- ^ Чо, В. и Стахелин, Р.В. (июнь 2005 г.). «Мембранно-белковые взаимодействия в клеточной передаче сигналов и мембранном транспорте». Ежегодный обзор биофизики и биомолекулярной структуры . 34 : 119–151. doi : 10.1146/annurev.biophys.33.110502.133337 . ПМИД 15869386 .