Jump to content

Генетическая нагрузка

Генетическая нагрузка — это разница между приспособленностью среднего генотипа в популяции и приспособленностью некоторого эталонного генотипа, который может быть либо лучшим из присутствующих в популяции , либо теоретически оптимальным генотипом. Средняя особь, взятая из популяции с низкой генетической нагрузкой, обычно при выращивании в тех же условиях будет иметь больше выживающего потомства, чем средняя особь из популяции с высокой генетической нагрузкой. [1] [2] Генетическая нагрузка также может рассматриваться как снижение приспособленности на уровне популяции по сравнению с тем, что было бы у популяции, если бы все люди имели эталонный генотип с высокой приспособленностью. [3] Высокая генетическая нагрузка может поставить популяцию под угрозу исчезновения .

Рассмотрим n генотипов , у которых есть фитнес и частоты , соответственно. Игнорируя частотно-зависимый отбор , генетическая нагрузка может быть рассчитано как:

где Это либо некоторый теоретический оптимум, либо максимальная приспособленность, наблюдаемая в популяции. При расчете генетической нагрузки должны быть обнаружены хотя бы в одном экземпляре в популяции, и средняя приспособленность , рассчитанная как среднее значение всех приспособленностей, взвешенных по соответствующим частотам:

где генотип и имеет фитнес и частоту и соответственно.

Одна из проблем с расчетом генетической нагрузки заключается в том, что трудно оценить ни теоретически оптимальный генотип, ни максимально подходящий генотип, фактически присутствующий в популяции. [4] Это не проблема для математических моделей генетической нагрузки или для эмпирических исследований, сравнивающих относительное значение генетической нагрузки в одних условиях с генетической нагрузкой в ​​других.

Вредная мутация

[ редактировать ]

Вредная мутационная нагрузка является основным фактором, способствующим генетической нагрузке в целом. [5] Теорема Холдейна-Мюллера о балансе мутации и отбора гласит, что нагрузка зависит только от частоты вредных мутаций , а не от коэффициента отбора . [6] В частности, относительно идеального генотипа приспособленности 1 средняя приспособленность популяции равна где U — общая частота вредных мутаций, суммированная по многим независимым сайтам. Интуиция отсутствия зависимости от коэффициента отбора заключается в том, что, хотя мутация с более сильными эффектами наносит больший вред на поколение, ее вред ощущается в течение меньшего числа поколений.

Немного вредная мутация может не оставаться в балансе мутации и отбора, а вместо этого может зафиксироваться в результате генетического дрейфа , когда ее коэффициент отбора меньше единицы, разделенной на эффективный размер популяции . [7] В бесполых популяциях стохастическое накопление мутационной нагрузки называется храповиком Мюллера и происходит при отсутствии полезных мутаций, когда после утраты наиболее подходящего генотипа его невозможно восстановить путем генетической рекомбинации . Детерминированное накопление мутационной нагрузки происходит у бесполых особей, когда частота вредных мутаций превышает одну на репликацию. [8] Ожидается, что виды, размножающиеся половым путем, будут иметь меньшую генетическую нагрузку. [9] Это одна из гипотез эволюционного преимущества полового размножения . Очищению вредных мутаций в половых популяциях способствует синергетический эпистаз среди вредных мутаций. [10]

Высокая нагрузка может привести к небольшому размеру популяции , что, в свою очередь, увеличивает накопление мутационной нагрузки, что приводит к вымиранию из-за мутационного распада . [11] [12]

Накопление вредных мутаций у людей беспокоило многих генетиков, в том числе Германа Йозефа Мюллера . [13] Джеймс Ф. Кроу , [10] Alexey Kondrashov , [14] В. Д. Гамильтон , [15] и Майкл Линч . [16]

Полезная мутация

[ редактировать ]

В достаточно генетически загруженных популяциях новые полезные мутации создают более подходящие генотипы, чем те, которые ранее присутствовали в популяции. Когда нагрузка рассчитывается как разница между имеющимся наиболее приспособленным генотипом и средним, это создает замещающую нагрузку . Разница между теоретическим максимумом (который на самом деле может отсутствовать) и средним значением известна как «лаговая нагрузка». [17] Мотоо Кимуры Первоначальный аргумент в пользу нейтральной теории молекулярной эволюции заключался в том, что если бы большинство различий между видами были адаптивными, это превысило бы предел скорости адаптации, установленный замещающей нагрузкой. [18] Однако аргумент Кимуры путает нагрузку с задержкой с нагрузкой замещения, используя первую, хотя именно последняя фактически устанавливает максимальную скорость эволюции путем естественного отбора. [19]

В более поздних моделях быстрой адаптации «бегущей волны» появился термин, называемый «лидерством», который эквивалентен замещающей нагрузке, и обнаружено, что он является решающим фактором, определяющим скорость адаптивной эволюции. [20] [21]

Инбридинг

[ редактировать ]

Инбридинг увеличивает гомозиготность . В краткосрочной перспективе увеличение инбридинга увеличивает вероятность того, что потомство получит две копии рецессивных вредных аллелей, снижая приспособленность из-за инбридинговой депрессии . [22] У видов, которые обычно инбридируют, например, посредством самооплодотворения , часть рецессивных вредных аллелей может быть удалена . [23] [24]

Аналогичным образом, в небольшой популяции людей, практикующих эндогамию , вредные аллели могут либо подавить генофонд популяции, вызывая ее вымирание, либо, наоборот, сделать ее более приспособленной. [25]

Рекомбинация/сегрегация

[ редактировать ]

Комбинации аллелей, которые в ходе эволюции хорошо работали вместе, могут не работать при рекомбинации с другим набором совместно эволюционировавших аллелей, что приводит к аутбридинговой депрессии . Нагрузка сегрегации возникает при наличии сверхдоминирования , т.е. когда гетерозиготы более приспособлены, чем любая гомозигота. В таком случае гетерозиготный генотип разрушается в результате менделевской сегрегации , что приводит к образованию гомозиготного потомства. Следовательно, существует нагрузка сегрегации, поскольку не все люди имеют теоретически оптимальный генотип. Рекомбинационная нагрузка возникает из-за неблагоприятных комбинаций по нескольким локусам, которые возникают при благоприятного неравновесия по сцеплению. нарушении [26] Рекомбинационная нагрузка также может возникнуть в результате объединения вредных аллелей, подверженных синергическому эпистазу , т. е. повреждение которых в комбинации больше, чем прогнозируется при рассмотрении их по отдельности. [27]

Миграция

[ редактировать ]

Предполагается, что миграционная нагрузка возникает, когда неадаптированные чужеродные организмы попадают в новую среду. [28]

С одной стороны, полезные гены мигрантов могут повысить приспособленность местного населения. [29] С другой стороны, миграция может снизить приспособленность местных популяций за счет привнесения дезадаптивных аллелей. Предполагается, что это происходит, когда скорость миграции «намного превышает» коэффициент отбора. [29]

Миграционная нагрузка может возникать за счет снижения приспособленности местных организмов или за счет естественного отбора, навязанного вновь прибывшим, например, в результате их уничтожения местными хищниками. [30] [31] Большинство исследований нашли доказательства этой теории только в форме отбора против популяций иммигрантов, однако одно исследование также обнаружило доказательства увеличения мутационного бремени в популяциях реципиентов. [32]

  1. ^ Уитлок, Майкл С.; Бурге, Дени (2000). «Факторы, влияющие на генетическую нагрузку у дрозофилы : синергетический эпистаз и корреляции между компонентами приспособленности» (PDF) . Эволюция . 54 (5): 1654–1660. doi : 10.1554/0014-3820(2000)054[1654:FATGLI]2.0.CO;2 . ПМИД   11108592 . S2CID   44511613 .
  2. ^ Крист, Кэтрин Карви; Фаррар, Дональд Р. (1983). «Генетическая нагрузка и распространение на большие расстояния в платиннейронах Asplenium ». Канадский журнал ботаники . 61 (6): 1809–1814. дои : 10.1139/b83-190 .
  3. ^ Дж. Ф. Кроу (1958). «Некоторые возможности измерения интенсивности отбора у человека». Биология человека . 30 (1): 1–13. ПМИД   13513111 .
  4. ^ Агравал, Анил Ф.; Уитлок, Майкл К. (2012). «Мутационная нагрузка: приспособленность особей в популяциях, где много вредных аллелей». Ежегодный обзор экологии, эволюции и систематики . 43 (1): 115–135. doi : 10.1146/annurev-ecolsys-110411-160257 .
  5. ^ Клековски, Эдвард Дж. (1988). «Генетическая нагрузка и ее причины у долгоживущих растений». Деревья . 2 (4): 195–203. дои : 10.1007/BF00202374 . S2CID   24058154 .
  6. ^ Бюргер, Рейнхард (1998). «Математические свойства моделей мутационного отбора». Генетика . 102/103: 279–298. дои : 10.1023/а:1017043111100 . S2CID   22885529 .
  7. ^ Ланде, Рассел (октябрь 1994 г.). «Риск вымирания популяции из-за фиксации новых вредных мутаций». Эволюция . 48 (5): 1460–1469. дои : 10.2307/2410240 . JSTOR   2410240 . ПМИД   28568413 .
  8. ^ Кондрашов А.С. (1988). «Вредные мутации и эволюция полового размножения». Природа . 336 (6198): 435–440. Бибкод : 1988Natur.336..435K . дои : 10.1038/336435a0 . ПМИД   3057385 . S2CID   4233528 .
  9. ^ Брак, Тара Н. (2009). Мутация, бесполое размножение и генетическая нагрузка: исследование в трех частях (кандидатская диссертация). Университет Канзаса.
  10. ^ Перейти обратно: а б Кроу, Джеймс Ф. (5 августа 1997 г.). «Высокий уровень спонтанных мутаций: риск для здоровья?» . Труды Национальной академии наук . 94 (16): 8380–8386. Бибкод : 1997PNAS...94.8380C . дои : 10.1073/pnas.94.16.8380 . ISSN   0027-8424 . ПМК   33757 . ПМИД   9237985 .
  11. ^ Линч, Майкл; Конери, Джон; Бургер, Рейнхард (декабрь 1995 г.). «Мутационные кризисы в сексуальных популяциях». Эволюция . 49 (6): 1067–1080. дои : 10.2307/2410432 . JSTOR   2410432 . ПМИД   28568521 .
  12. ^ Линч, Майкл; Конери, Джон; Бургер, Рейнхард (1 января 1995 г.). «Накопление мутаций и вымирание малых популяций». Американский натуралист . 146 (4): 489–518. дои : 10.1086/285812 . JSTOR   2462976 . S2CID   14762497 .
  13. ^ Мюллер, HJ (1 июня 1950 г.). «Наш груз мутаций» . Американский журнал генетики человека . 2 (2): 111–176. ISSN   0002-9297 . ПМК   1716299 . ПМИД   14771033 .
  14. ^ Кондрашов, Алексей С. (21 августа 1995 г.). «Загрязнение генома очень незначительными вредными мутациями: почему мы не умерли 100 раз?» . Журнал теоретической биологии . 175 (4): 583–594. Бибкод : 1995JThBi.175..583K . дои : 10.1006/jtbi.1995.0167 . ПМИД   7475094 .
  15. ^ Гамильтон, У.Д. Узкие дороги Джин-Лэнда, том. 2: Эволюция пола . стр. 449–463.
  16. ^ Линч, М. (7 марта 2016 г.). «Мутация и человеческая исключительность: наша будущая генетическая нагрузка» . Генетика . 202 (3): 869–875. дои : 10.1534/genetics.115.180471 . ПМЦ   4788123 . ПМИД   26953265 .
  17. ^ Смит, Дж. Мейнард (1 января 1976 г.). «Что определяет скорость эволюции?». Американский натуралист . 110 (973): 331–338. дои : 10.1086/283071 . JSTOR   2459757 . S2CID   85575105 .
  18. ^ Кимура, Мотоо (1968). «Скорость эволюции на молекулярном уровне» (PDF) . Природа . 217 (5129): 624–626. Бибкод : 1968Natur.217..624K . дои : 10.1038/217624a0 . ПМИД   5637732 . S2CID   4161261 .
  19. ^ Юэнс, Уоррен Дж. (2003). Математическая популяционная генетика (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 78 . ISBN  978-0387201917 .
  20. ^ Десаи, ММ; Фишер, DS (4 мая 2007 г.). «Баланс отбора полезных мутаций и влияние сцепления на положительный отбор» . Генетика . 176 (3): 1759–1798. doi : 10.1534/genetics.106.067678 . ЧВК   1931526 . ПМИД   17483432 .
  21. ^ Бертрам, Дж; Гомес, К; Мазель, Дж. (февраль 2017 г.). «Прогнозирование закономерностей долгосрочной адаптации и вымирания с помощью популяционной генетики». Эволюция . 71 (2): 204–214. arXiv : 1605.08717 . дои : 10.1111/evo.13116 . ПМИД   27868195 . S2CID   4705439 .
  22. ^ Саккери, Эй-Джей; Ллойд, HD; Хельяр, С.Дж.; Брейкфилд, премьер-министр (2005). «Инбридинг раскрывает фундаментальные различия в генетической нагрузке, влияющей на мужскую и женскую фертильность бабочки» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 272 (1558): 39–46. дои : 10.1098/rspb.2004.2903 . ПМК   1634945 . ПМИД   15875568 .
  23. ^ Байерс, Д.Л.; Уоллер, DM (1999). «Очищают ли популяции растений свой генетический груз? Влияние размера популяции и истории спаривания на депрессию инбридинга». Ежегодный обзор экологии и систематики . 30 (1): 479–513. doi : 10.1146/annurev.ecolsys.30.1.479 .
  24. ^ Барретт, Швейцария; Чарльзворт, Д. (1991). «Влияние изменения уровня инбридинга на генетическую нагрузку». Природа . 352 (6335): 522–524. Бибкод : 1991Natur.352..522B . дои : 10.1038/352522a0 . ПМИД   1865906 . S2CID   4240051 .
  25. ^ Пала, М.; Заппала, З.; Маронгиу, М. (2017). «Популяция и индивидуальные различия в регулировании на Сардинии» . Природная генетика . 49 (5): 700–707. дои : 10.1038/ng.3840 . ПМК   5411016 . ПМИД   28394350 . S2CID   4240051 .
  26. ^ Хааг, ЧР; Розе, Д. (2007). «Генетическая нагрузка у половых и бесполых диплоидов: сегрегация, доминирование и генетический дрейф» . Генетика . 176 (3): 1663–1678. doi : 10.1534/genetics.107.073080 . ЧВК   1931546 . ПМИД   17483409 .
  27. ^ Кинг, Дж. (1966). «Компонент взаимодействия генов генетической нагрузки» . Генетика . 53 (3): 403–413. дои : 10.1093/генетика/53.3.403 . ПМК   1211027 . ПМИД   5919323 .
  28. ^ Больник, Дэниел И. (2007). «Естественный отбор в популяциях, подверженных миграционной нагрузке». Эволюция . 61 (9): 2229–2243. дои : 10.1111/j.1558-5646.2007.00179.x . ПМИД   17767592 . S2CID   25685919 .
  29. ^ Перейти обратно: а б Ху, Синь-Шэн; Ли, Байлянь (2003). «О миграционной нагрузке семян и пыльцы в местном населении» . Наследственность . 90 (2): 162–168. дои : 10.1038/sj.hdy.6800212 . ПМИД   12634823 . «Поток генов может гомогенизировать генетическое расхождение среди популяций. С одной стороны, эффекты генетического дрейфа в небольших местных популяциях могут быть эффективно уменьшены, когда среднее число мигрантов больше одного (Райт, 1969), полезные гены иммигрантов могут смещать местные популяций к более высокому пику приспособленности (Barton and Whitlock, 1997). С другой стороны, поток генов между популяциями, адаптированными к разным средам, может вызвать дезадаптацию в популяции-реципиенте, что приведет к миграционной нагрузке и снижению уровня приспособленности популяции. намного превышает коэффициент отбора, мигрантные аллели могут даже вытеснять локально адаптивные аллели (Райт, 1969)».
  30. ^ Bolnick 2007 : «Второе последствие баланса миграции и отбора известно как «миграционная нагрузка» (Гарсия-Рамос и Киркпатрик 1997). Это потеря средней приспособленности популяции в результате иммиграции локально неадаптированных аллелей. Миграционная нагрузка аналогична «мутационной нагрузке», которая возникает, когда мутация приводит к появлению новых аллелей, которые, как ожидается, в среднем будут менее пригодными, чем существующие аллели, хотя и миграция, и мутация могут импортировать новые локально полезные аллели, которые способствуют адаптации (Kawecki 2000). ), иммигранты из других сред часто могут нести аллели, которые менее приспособлены к местной среде обитания. Следовательно, миграция не только ограничивает дивергенцию среди популяций, но и смещает популяции-реципиенты с их локальных адаптивных пиков. Для менделевских признаков это влечет за собой снижение частоты. локально предпочтительных аллелей, которые в противном случае были бы на уровне фиксации или близки к ней, тогда как количественные признаки могут быть смещены от среднего значения, благоприятствуемого отбором».
  31. ^ Bolnick 2007 : «Учитывая такую ​​историю жизни, ожидается, что гомогенизирующие эффекты миграции будут наиболее очевидными в начале поколения, после чего естественный отбор со стороны визуальных хищников, по-видимому, уничтожит многих иммигрантов».
  32. ^ Bolnick 2007 : На сегодняшний день поддержка миграционной нагрузки обычно ограничивается исследованиями отдельных популяций, в которых отбор действует против иммигрантов (King 1992; Sandoval 1994a; Hendry et al. 2002; Moore and Hendry 2005).
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: f5ffbec93bd753da49db9de8ade0b1a6__1717794720
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/f5/a6/f5ffbec93bd753da49db9de8ade0b1a6.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Genetic load - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)