Лактатдегидрогеназа b

ЛДХБ
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1I0Z, 1T2F
Идентификаторы
Псевдонимы	LDHB , HEL-S-281, LDH-B, LDH-H, LDHBD, TRG-5, лактатдегидрогеназа B
Внешние идентификаторы	ОПУСТИТЬ : 150100 ; МГИ : 96763 ; Гомологен : 55647 ; GeneCards : LDHB ; ОМА : LDHB — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 12 (human) Band 12p12.1 Start 21,635,342 bp End 21,757,857 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 6 (mouse) Band 6 G2|6 74.17 cM Start 142,435,975 bp End 142,453,683 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in renal medulla right ventricle external globus pallidus endothelial cell lateral nuclear group of thalamus myocardium of left ventricle Pars compacta pars reticulata kidney tubule middle temporal gyrus Top expressed in primary oocyte secondary oocyte zygote right kidney right ventricle primary visual cortex superior frontal gyrus vestibular membrane of cochlear duct anterior horn of spinal cord proximal tubule More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor oxidoreductase activity lactate dehydrogenase activity protein binding kinase binding NAD binding catalytic activity L-lactate dehydrogenase activity identical protein binding Cellular component extracellular exosome membrane raft membrane myelin sheath mitochondrion cytoplasm cytosol Biological process NAD metabolic process lactate metabolic process carboxylic acid metabolic process pyruvate metabolic process carbohydrate metabolic process Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 3945 16832 Вместе ENSG00000111716 ENSMUSG00000030246 ЮниПрот P07195 P16125 RefSeq (мРНК) НМ_001174097 НМ_002300 НМ_001315537 НМ_008492 НМ_001302765 НМ_001316322 RefSeq (белок) НП_001167568 НП_001302466 НП_002291 НП_001289694 НП_001303251 НП_032518 Местоположение (UCSC) Чр 12: 21,64 – 21,76 Мб Chr 6: 142,44 – 142,45 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Лактатдегидрогеназа B — это белок , который у человека кодируется геном LDHB .

Функция

Этот ген кодирует субъединицу B фермента лактатдегидрогеназы, который катализирует взаимное превращение пирувата и лактата с сопутствующим взаимопревращением НАДН и НАД+ в процессе постгликолиза. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскрипта. Недавние исследования показали, что расширенная на С-конце изоформа образуется с использованием альтернативного кодона терминации трансляции внутри рамки посредством механизма считывания стоп-кодона и что эта изоформа локализуется в пероксисомах. Мутации в этом гене связаны с дефицитом лактатдегидрогеназы B. Псевдогены были идентифицированы на хромосомах X, 5 и 13.

Дальнейшее чтение

• Филиберт Р.А., Нельсон Дж.Дж., Сандху Х.К., Кроу Р.Р., Кориелл У.Х. (2003). «Связь экзонного полиморфизма ЛДГА с измененной дыхательной реакцией у пробандов с высоким риском панического расстройства». Являюсь. Дж. Мед. Жене. Б Нейропсихиатр. Жене . 117Б (1): 11–7. дои : 10.1002/ajmg.b.10015 . ПМИД   12555229 . S2CID   25994539 .
• Маццотта С., Герранти Р., Гоццетти А., Букалосси А., Боккиа М., Саммассимо С., Петралия С., Огели Г.И., Лаурия Ф (2006). «Повышение уровня изоферментов лактатдегидрогеназы в сыворотке крови при Ph-отрицательных хронических миелопролиферативных заболеваниях: метаболическая адаптация?». Гематология . 11 (4): 239–44. дои : 10.1080/10245330600774835 . ПМИД   17178662 . S2CID   36110689 .
• де Хаас Т., Хасселт Н., Трост Д., Карон Х., Попович М., Задравец-Залетел Л., Грайковска В., Перек М., Остерхельд М.С., Эллисон Д., Баас Ф., Верстег Р., Кул М. (2008). «Молекулярная стратификация риска пациентов с медуллобластомой на основе иммуногистохимического анализа экспрессии MYC, LDHB и CCNB1» . Клин. Рак Рез . 14 (13): 4154–60. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-07-4159 . ПМИД   18593994 .
• Уайт М.П., ​​Кемпа Л.Г., Макалистер В.Х., Чжан Ф., Мумм С., Венкерт Д. (2010). «Повышение уровня изоферментов лактатдегидрогеназы в сыворотке крови и аспартаттрансаминазы отличает болезнь Альберса-Шенберга (остеопетроз с дефицитом 7-го хлоридного канала) среди склерозирующих заболеваний костей» . Дж. Боун Майнер. Рез . 25 (11): 2515–26. дои : 10.1002/jbmr.130 . ПМИД   20499337 . S2CID   22022750 .
• Эгбертс Ф., Момквист А., Эгбертс Дж.Х., Келер К.К., Хаушильд А. (2010). «Сыворотка S100B и ЛДГ бесполезны для прогнозирования состояния сторожевого узла у пациентов с меланомой». Противораковые рез . 30 (5): 1799–805. ПМИД   20592382 .
• Хендриксон С.Л., Лаутенбергер Дж.А., Чинн Л.В., Маласки М., Сезгин Э., Кингсли Л.А., Годерт Дж.Дж., Кирк Г.Д., Гомпертс Э.Д., Бухбиндер С.П., Тройер Дж.Л., О'Брайен С.Дж. (2010). «Генетические варианты кодируемых в ядре митохондриальных генов влияют на прогрессирование СПИДа» . ПЛОС ОДИН . 5 (9): e12862. Бибкод : 2010PLoSO...512862H . дои : 10.1371/journal.pone.0012862 . ПМЦ   2943476 . ПМИД   20877624 .
• Свидерек К., Панет П. (2011). «Различия и сходства в связывании пирувата и L-лактата в активном центре изоформ M4 и H4 лактатдегидрогеназы человека». Арх. Биохим. Биофиз . 505 (1): 33–41. дои : 10.1016/j.abb.2010.10.010 . ПМИД   20951115 .
• Чжа Икс, Ван Ф, Ван И, Хэ С, Цзин Ю, Ву Икс, Чжан Х (2011). «Лактатдегидрогеназа B имеет решающее значение для гиперактивного mTOR-опосредованного онкогенеза» . Рак Рез . 71 (1): 13–8. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-10-1668 . ПМИД   21199794 .
• Ким Дж.Х., Ким Э.Л., Ли Ю.К., Пак С.Б., Ким Б.В., Ван Х.Дж., Юн Ч., Ли С.Дж., Юн Джи (2011). «Снижение экспрессии лактатдегидрогеназы B усиливает опосредованную клаудином 1 инвазивность клеток гепатомы через митохондриальные дефекты». Эксп. Сотовый Res . 317 (8): 1108–18. дои : 10.1016/j.yexcr.2011.02.011 . ПМИД   21356207 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .