Белок 1, связывающий элемент далеко выше по течению

ФУБП1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1J4W, 2KXH, 4LIJ
Идентификаторы
Псевдонимы	FUBP1 , FBP, FUBP, hDH V, белок 1, связывающий элемент далеко выше
Внешние идентификаторы	Опустить : 603444 ; МГИ : 1196294 ; Гомологен : 48253 ; Генные карты : FUBP1 ; ОМА : FUBP1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	77,979,110 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	151,942,463 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; Achilles tendon; ; left ovary; ; right uterine tube; ; right ovary; ; body of uterus; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; canal of the cervix;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; tail of embryo; ; ventricular zone; ; maxillary prominence; ; mandibular prominence; ; epiblast; ; somite; ; abdominal wall; ; ganglionic eminence; ; Rostral migratory stream;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; nucleic acid binding; single-stranded DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; RNA binding;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm;
Biological process	positive regulation of gene expression; regulation of transcription, DNA-templated; transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8880
	51886
	ENSG00000162613
	ENSMUSG00000028034
	Q96AE4
	Q91WJ8
	НМ_001303433 ; НМ_003902 ; НМ_001376055 ; НМ_001376056 ; НМ_001376057
showНМ_057172 ; НМ_001355366 ; НМ_001355367 ; НМ_001355368 ; НМ_001355369 ;
	NM_001355370; NM_001355371; NM_001355372; NM_001355373; NM_001355374
	НП_001290362 ; НП_003893 ; НП_001362984 ; НП_001362985 ; НП_001362986
showНП_476513 ; НП_001342295 ; НП_001342296 ; НП_001342297 ; НП_001342298 ;
	NP_001342299; NP_001342300; NP_001342301; NP_001342302; NP_001342303
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1, связывающий элемент далеко выше, представляет собой белок , который у человека кодируется FUBP1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген кодирует белок, связывающий оцДНК, который активирует дальний элемент (FUSE) c-myc и стимулирует экспрессию c-myc в недифференцированных клетках. Регуляция FUSE с помощью FUBP происходит посредством одноцепочечного связывания FUBP с некодирующей цепью. Было показано, что этот белок функционирует как АТФ-зависимая ДНК-хеликаза. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что белок 1, связывающий элементы далеко выше по ходу процесса, взаимодействует с MAPK14. ^{[ 7 ]} и СМН1 . ^{[ 8 ]}

Клиническое значение

Делеция гена FUBP1 является частью 1p/19q коделеционной мутации , наблюдаемой при олигодендроглиоме , форме первичной опухоли головного мозга . ^{[ 9 ]} Ген CIC также теряется при коделеционной мутации 1p/19q.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162613 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028034 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Дункан Р., Базар Л., Микелотти Г., Томонага Т., Крутч Х., Авиган М., Левенс Д. (апрель 1994 г.). «Сиквенс-специфичный одноцепочечный связывающий белок активирует расположенный выше по течению элемент c-myc и определяет новый ДНК-связывающий мотив» . Генс Дев . 8 (4): 465–80. дои : 10.1101/gad.8.4.465 . ПМИД 8125259 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 1, связывающий далеко расположенный выше элемент (FUSE) FUBP1» .
^ Ким, Мин Юнг; Пак Бум Джун; Кан Ён-Сон; Ким Хён Джун; Пак Джэ Хён; Кан Чон У; Ли Сан Вон; Хан Чон Мин; Ли Хан-Ун; Ким Сон Хун (июль 2003 г.). «Понижение уровня FUSE-связывающего белка и c-myc с помощью кофактора тРНК-синтетазы p38 необходимо для дифференцировки клеток легких». Нат. Жене . 34 (3). США: 330–6. дои : 10.1038/ng1182 . ISSN 1061-4036 . ПМИД 12819782 . S2CID 41006480 .
^ Уильямс, BY; Гамильтон СЛ; Саркар Х.К. (март 2000 г.). «Белок выживающего двигательного нейрона взаимодействует с белком, связывающим трансактиватор FUSE, из мозга плода человека». ФЭБС Летт . 470 (2). НИДЕРЛАНДЫ: 207–10. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01320-X . ISSN 0014-5793 . ПМИД 10734235 . S2CID 28330997 .
^ Веллер, Майкл (8 декабря 2020 г.). «Руководство ЕАНО по диагностике и лечению диффузных глиом взрослого возраста» . Обзоры природы. Клиническая онкология . 18 (3): 170–186. дои : 10.1038/s41571-020-00447-z . ПМЦ 7904519 . ПМИД 33293629 .

Дальнейшее чтение

Уильямс БАЙ, Гамильтон С.Л., Саркар Х.К. (2000). «Белок выживающего двигательного нейрона взаимодействует с белком, связывающим трансактиватор FUSE, из мозга плода человека». ФЭБС Летт . 470 (2): 207–10. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01320-X . ПМИД 10734235 . S2CID 28330997 .
Лю Дж., Хэ Л., Коллинз И. и др. (2000). «Взаимодействующий с FBP репрессор нацелен на TFIIH, чтобы ингибировать активированную транскрипцию» . Мол. Клетка . 5 (2): 331–41. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80428-1 . ПМИД 10882074 .
Марковцов В., Николич Дж.М., Гольдман Дж.А. и др. (2000). «Кооперативная сборка комплекса hnRNP, индуцированная тканеспецифичным гомологом белка, связывающего полипиримидиновый тракт» . Мол. Клетка. Биол . 20 (20): 7463–79. дои : 10.1128/MCB.20.20.7463-7479.2000 . ПМК 86300 . ПМИД 11003644 .
Он Л., Вебер А., Левенс Д. (2000). «Детерминанты ядерного нацеливания белка, связывающего далеко расположенный выше элемент, транскрипционного фактора c-myc» . Нуклеиновые кислоты Рез . 28 (22): 4558–65. дои : 10.1093/нар/28.22.4558 . ПМЦ 113884 . ПМИД 11071946 .
Виндигни А, Очем А, Триоло Г, Фаласки А (2001). «Идентификация ДНК-хеликазы V человека с белком, связывающим элементы, находящимся далеко выше» . Нуклеиновые кислоты Рез . 29 (5): 1061–7. дои : 10.1093/нар/29.5.1061 . ПМК 29729 . ПМИД 11222755 .
Лю Дж., Акуличев С., Вебер А. и др. (2001). «Дефектное взаимодействие активаторов и репрессоров с TFIH при пигментной ксеродерме» . Клетка . 104 (3): 353–63. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00223-9 . ПМИД 11239393 .
Брэддок Д.Т., Луис Дж.М., Бабер Дж.Л. и др. (2002). «Структура и динамика доменов KH из FBP, связанных с одноцепочечной ДНК» . Природа . 415 (6875): 1051–6. Бибкод : 2002Natur.415.1051B . дои : 10.1038/4151051a . ПМИД 11875576 . S2CID 4401103 .
Раппсилбер Дж., Райдер У., Ламонд А.И., Манн М. (2002). «Крупномасштабный протеомный анализ сплайсосомы человека» . Геном Рез . 12 (8): 1231–45. дои : 10.1101/гр.473902 . ЧВК 186633 . ПМИД 12176931 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ким М.Дж., Пак Б.Дж., Кан Ю.С. и др. (2003). «Понижение уровня FUSE-связывающего белка и c-myc с помощью кофактора тРНК-синтетазы p38 необходимо для дифференцировки клеток легких». Нат. Жене . 34 (3): 330–6. дои : 10.1038/ng1182 . ПМИД 12819782 . S2CID 41006480 .
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С. и др. (2005). «Описание характеристик транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Нат. Биотехнология . 22 (6): 707–16. дои : 10.1038/nbt971 . ПМИД 15146197 . S2CID 27764390 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Кузин Ф., Лю Дж., Сэнфорд С. и др. (2004). «Динамическая реакция вышележащей ДНК на торсионный стресс, вызванный транскрипцией» . Нат. Структура. Мол. Биол . 11 (11): 1092–100. дои : 10.1038/nsmb848 . ПМИД 15502847 . S2CID 28956216 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Нат. Биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Стельзл Ю., Ворм Ю., Лаловски М. и др. (2005). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома» . Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 .
Депутат Фауч, Врабель А.М., Джонсон Д.Х. (2006). «Идентификация миоцилин-ассоциированных белков в трабекулярной сети человека». Эксп. Глазное разрешение . 82 (6): 1046–52. дои : 10.1016/j.exer.2005.09.016 . ПМИД 16289162 .
Лю Дж., Кузин Ф., Не З. и др. (2006). «Система FUSE/FBP/FIR/TFIIH представляет собой молекулярную машину, программирующую импульс экспрессии c-myc» . ЭМБО Дж . 25 (10): 2119–30. дои : 10.1038/sj.emboj.7601101 . ПМК 1462968 . ПМИД 16628215 .
Ко Х.С., Ким С.В., Шрирам С.Р. и др. (2006). «Идентификация белка-1, связывающего элементы, расположенного далеко выше, как подлинного субстрата Паркина» . Ж. Биол. Хим . 281 (24): 16193–6. дои : 10.1074/jbc.C600041200 . ПМИД 16672220 .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162613 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028034 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8125259-5] Дункан Р., Базар Л., Микелотти Г., Томонага Т., Крутч Х., Авиган М., Левенс Д. (апрель 1994 г.). «Сиквенс-специфичный одноцепочечный связывающий белок активирует расположенный выше по течению элемент c-myc и определяет новый ДНК-связывающий мотив» . Генс Дев . 8 (4): 465–80. дои : 10.1101/gad.8.4.465 . ПМИД 8125259 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: белок 1, связывающий далеко расположенный выше элемент (FUSE) FUBP1» .

[pmid12819782-7] Ким, Мин Юнг; Пак Бум Джун; Кан Ён-Сон; Ким Хён Джун; Пак Джэ Хён; Кан Чон У; Ли Сан Вон; Хан Чон Мин; Ли Хан-Ун; Ким Сон Хун (июль 2003 г.). «Понижение уровня FUSE-связывающего белка и c-myc с помощью кофактора тРНК-синтетазы p38 необходимо для дифференцировки клеток легких». Нат. Жене . 34 (3). США: 330–6. дои : 10.1038/ng1182 . ISSN 1061-4036 . ПМИД 12819782 . S2CID 41006480 .

[pmid10734235-8] Уильямс, BY; Гамильтон СЛ; Саркар Х.К. (март 2000 г.). «Белок выживающего двигательного нейрона взаимодействует с белком, связывающим трансактиватор FUSE, из мозга плода человека». ФЭБС Летт . 470 (2). НИДЕРЛАНДЫ: 207–10. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01320-X . ISSN 0014-5793 . ПМИД 10734235 . S2CID 28330997 .

[9] Веллер, Майкл (8 декабря 2020 г.). «Руководство ЕАНО по диагностике и лечению диффузных глиом взрослого возраста» . Обзоры природы. Клиническая онкология . 18 (3): 170–186. дои : 10.1038/s41571-020-00447-z . ПМЦ 7904519 . ПМИД 33293629 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]