Дэвид С. Уишарт
Дэвид Вишарт | |
---|---|
Рожденный | 7 декабря 1961 г. Эдмонтон, Альберта , Канада | года ) ( 62
Альма-матер | Университет Альберты Йельский университет |
Занятие | Профессор |
Известный | |
Награды |
|
Научная карьера | |
Поля | |
Учреждения | Университет Альберты |
Веб-сайт | www |
Дэвид С. Вишарт FRSC (родился 7 декабря 1961 г.) — канадский исследователь и заслуженный профессор факультета биологических наук и факультета вычислительной техники Университета Альберты . Уишарт также имеет перекрестные назначения на факультете фармации и фармацевтических наук и на кафедре лабораторной медицины и патологии факультета медицины и стоматологии . Кроме того, Уишарт работает по совместительству в области метаболомики в Тихоокеанской северо-западной национальной лаборатории в Ричленде, штат Вашингтон. Уишарт хорошо известен своим новаторским вкладом в области ЯМР-спектроскопии белков , биоинформатики , хемоинформатики и метаболомики . [1] [2] [3] В 2011 году Уишарт основал Инновационный центр метаболомики (TMIC). [4] это национальная лаборатория метаболомики Канады.
Уишарт — успешный серийный предприниматель . С 1995 года он запустил 8 успешных стартапов биотехнологических компаний, включая Chenomx, [5] Персональная аналитика здоровья OMx [6] и Molecular You Corp. [7] За свою карьеру он опубликовал более 500 публикаций и более 100 000 цитирований. [8] он неизменно входит в число 100 лучших ученых мира в любой дисциплине. [9] [10] и входит в число 200 лучших ученых-биологов мира. [11]
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Уишарт родился и вырос в Эдмонтоне, Альберта , Канада, у него есть брат Ян (врач) и сестра Сэнди. Его мать, Патрисия, работала натуралистом и писателем; его отец Уильям был биологом дикой природы в правительстве Альберты. Уишарт идентифицирует себя как Метис . У него есть предки кри и ассинибойны по отцовской линии, а также шотландские предки по материнской линии. В юности Уишарт научился охотиться, ловить рыбу и ловить ловушки у своего отца, который также управлял собственной ловушкой . Этот ранний опыт знакомства с миром природы вдохновил Уишарта на интенсивный интерес к естествознанию. [ нужна ссылка ]
Уишарт получил степень бакалавра наук. (с отличием, первая степень) по физике Университета Альберты в 1983 году и степень магистра философии. (1986) и доктор философии . степени (1991) по молекулярной биофизике Йельского университета . Уишарт защитил докторскую диссертацию. под руководством Фредерика М. Ричардса и его постдокторские исследования (1991–1995) под руководством Брайана Д. Сайкса. [12]
Академическая карьера
[ редактировать ]Уишарт начал свою академическую карьеру в качестве доцента в 1995 году на факультете фармации и фармацевтических наук Университета Альберты, где «Бристоль Майерс Сквибб» возглавлял кафедру биотехнологии в течение 10 лет . В 2002 году он получил звание доцента , а в 2003 году — профессора, поступив на кафедру вычислительной техники и биологических наук факультета естественных наук Университета Альберты. В связи с его растущим участием в клинической химии, Уишарт был назначен адъюнкт-профессором кафедры лабораторной медицины и патологии в 2012 году. В знак признания его выдающегося вклада и стипендий в преподавании, исследованиях и работе в Университете Альберты Уишарт был назначен Почетный профессор университета в 2018 году. [13] С 2004 по 2016 год Уишарт также работал старшим научным сотрудником и директором по нанобиологии в Национальном исследовательском совете Канады при Национальном институте нанотехнологий , расположенном в кампусе Университета Альберты.
Исследовать
[ редактировать ]Научные интересы Уишарта охватывают ряд разнообразных областей, включая структурную биологию , вычислительную биологию ядерного магнитного резонанса , биоинформатику, нанобиологию, метаболомику, спектроскопию (ЯМР) и масс-спектрометрию . Общей темой его исследовательской карьеры была разработка методов, технологических ядер, протоколов, ресурсов данных или компьютерных программ, которые делают науку проще, быстрее, дешевле или легче. Эта работа привела к ряду важных открытий, которые фундаментально изменили области биомолекулярного ЯМР, метаболомики и вычислительной биологии. [1] [2] [3]
Биомолекулярный ЯМР
[ редактировать ]Уишарт начал свою исследовательскую карьеру в области ЯМР белков в начале 1990-х годов, сосредоточившись на использовании ЯМР-спектроскопии для характеристики структуры белков и денатурации белков . В то время структурный анализ белков с помощью ЯМР требовал сотен часов ручного анализа данных и составления таблиц. Стремясь ускорить этот процесс, Уишарт обнаружил интересную тенденцию в отношении того, как сдвиги аминокислотных химические остатков ЯМР систематически изменяются в зависимости от их вторичной структуры . Он приступил к разработке метода, называемого индексом химического сдвига , также известного как CSI, который использовал набор простых правил и простых таблиц химического сдвига, что позволило ученым напрямую использовать назначения химических сдвигов белков для быстрого определения типа и местоположения вторичных белковых белков. структуры в белках за считанные секунды. [14] [15] Впоследствии Уишарт показал, как химические сдвиги ЯМР можно использовать для простого и быстрого измерения гибкости белка с помощью индекса случайного клубка или RCI . [16] [17] Позже он показал, как можно использовать химические сдвиги для определения углов скручивания основной цепи белка с помощью программы под названием PREDITOR . [18] Уишарт также определил, как химические сдвиги можно использовать для измерения площади поверхности, доступной для остатков. [19] и идентифицировать элементы супервторичной структуры. [19] [20] Чтобы еще больше расширить эту работу, Уишарт разработал инновационные методы определения трехмерной структуры белков, используя метод, называемый химическим сдвигом, с помощью таких программ, как GeNMR, CS23D и E-Thrifty. [21] [22] [23] Чтобы помочь сравнить и оценить существующие структуры ЯМР белков, Уишарт также разработал методы точного прогнозирования химических сдвигов белков по трехмерным координатам с помощью таких программ, как ShiftX и ShiftX2. [24] [25] В то же время он также разработал методы повторной ссылки на неправильно присвоенные химические сдвиги белков с помощью таких программ, как SHIFTCOR и PANAV . [26] Эти программы использовались для создания баз данных ЯМР белков, таких как RefDB, которые содержат тысячи повторных ссылок на химические сдвиги. [27] Статьи Уишарта, описывающие эти методы ЯМР, цитировались более 15 000 раз и в настоящее время считаются [ кем? ] быть основополагающими методами для большей части современного ЯМР белков.
Метаболомика
[ редактировать ]В начале 2000-х годов Уишарт переключил свое внимание с рассмотрения больших молекул, таких как белки, на изучение малых молекул (метаболитов). В 2001 году он разработал, а затем запатентовал методы на основе ЯМР (что привело к созданию дочерней компании Chenomx). [5] ), что позволило быстро идентифицировать и количественно определить метаболиты с помощью ЯМР в биожидкостях. [28] В 2005 году он задумал проект «Метаболом человека» (HMP). [29] – метаболомный эквивалент проекта «Геном человека» . Уишарту удалось привлечь более 10 миллионов долларов финансирования от Genome Canada и запустить межинституциональную общеканадскую программу по систематическому выявлению всех метаболитов , лекарств и ксенобиотиков человека в клинически важных биожидкостях . Цель HMP — предоставить научному сообществу легкодоступные справочные данные о метаболитах человека, тем самым сделав анализ метаболомических данных более полным и намного более простым. По состоянию на 2022 год [update], HMP все еще продолжается и привел к идентификации > 240 000 метаболитов человека, > 6 000 лекарств и метаболитов лекарств, > 70 000 пищевых компонентов и > 3 000 токсинов и загрязняющих веществ. [30] [31] [32] Эта информация, а также множество инструментов, облегчающих идентификацию и интерпретацию метаболитов, были заархивированы в нескольких общедоступных базах данных, созданных лабораторией Уишарт. К ним относятся База данных метаболомов человека (HMDB) , которая содержит данные о метаболитах человека и их структурах, а также описания, спектры ЯМР и спектры МС. [33] Еще один ресурс, разработанный в рамках проекта, — DrugBank . [31] база данных всех известных, одобренных лекарств и их целевых молекул. Другие базы данных, разработанные лабораторией Wishart, включают FooDB , [32] база данных пищевых компонентов и пищевых добавок; и Т3ДБ , [34] база данных о токсичных соединениях и загрязнителях, а также об их токсикологическом воздействии. Ресурсы метаболомной базы данных HMP широко используются: более 60 миллионов просмотров страниц в год, а статьи, связанные с HMP, цитировались более 30 000 раз за последние 10 лет. [ нужна ссылка ]
В 2011 году Уишарт основал Инновационный центр метаболомики (TMIC) и был его первым директором (2011–2019). TMIC широко известна как национальная лаборатория метаболомики Канады. Лаборатория Уишарта в составе TMIC располагает современным оборудованием для ЖХ-МС , ГХ-МС и ЯМР стоимостью более 8 миллионов долларов. Его лаборатория регулярно обрабатывает более 20 000 образцов каждый год. Используя этот широкий спектр оборудования, Уишарт помог разработать ряд методов количественной метаболомики для ЯМР. [35] [36] и жидкостная хроматография, масс-спектрометрия. [37] [38] Используя эти методы, Уишарт и его команда провели комплексный количественный анализ метаболома человеческой сыворотки. [39] моча, [40] слюна, [41] спинномозговая жидкость [42] и фекалии. [43]
Вычислительная биология и открытая наука
[ редактировать ]Уишарт отмечен [ кем? ] за то, что сделал все ресурсы своей лаборатории данными, компьютерные программы, алгоритмы и методы общедоступными. Эта инициатива открытой науки/открытого доступа была направлена на предоставление инструментов и методов, которые сделают биомолекулярный ЯМР, метаболомику, структурную биологию и ряд связанных с ними методов более доступными для всех ученых. На данный момент эта инициатива привела к тому, что лаборатория Уишарта разработала и выпустила более 100 общедоступных веб-серверов и веб-баз данных. [44] в том числе НП-МРД [45] и CFM-ID. [46] Чтобы продолжить свои усилия в области открытой науки, Уишарт стал соучредителем нескольких образовательных программ по биоинформатике, таких как Канадские семинары по биоинформатике , и активно участвовал в других международных инициативах по стандартизации и открытому исходному коду, чтобы сделать ресурсы вычислительной биологии более широко доступными.
Личная жизнь
[ редактировать ]Уишарт женат на Дебби Уолдман, писателе и редакторе-фрилансере из Ютики, Нью-Йорк . У него двое детей: Элизабет, эпидемиолог; и Ной, инженер-строитель. Все они живут и работают в Эдмонтоне, Альберта. [ нужна ссылка ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Уишарт, доктор Дэвид – Фонд ASTech» . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ Jump up to: а б «Дэвид Уишарт — Directory@UAlberta» . apps.ualberta.ca . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ Jump up to: а б «Почетные стипендии Общества метаболомики» . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ "Люди" . Инновационный центр метаболомики . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ Jump up to: а б «Chenomx Inc | Открытие и измерение метаболитов» . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ «ДругБанк | О ДругБанке» . www.drugbank.com . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ «Наша команда – Молекулярный ты» . молекулярный you.com . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ «Дэвид Уишарт» . ученый.google.com . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ Иоаннидис, Джон П.А.; Баас, Йерун; Клаванс, Ричард; Бояк, Кевин В. (12 августа 2019 г.). «Стандартизированная база данных авторов показателей цитирования, аннотированная для научной области» . ПЛОС Биология . 17 (8): e3000384. дои : 10.1371/journal.pbio.3000384 . ISSN 1545-7885 . ПМК 6699798 . ПМИД 31404057 .
- ^ Баас, Йерун; Бояк, Кевин; Иоаннидис, Джон П.А. (19 октября 2021 г.). «Обновление данных за август 2021 г. для «Обновленных общенаучных баз данных авторов стандартизированных показателей цитирования» » . 3 . Эльзевир Б.В. дои : 10.17632/btchxktzyw.3 . Проверено 17 декабря 2022 г.
{{cite journal}}
: Для цитирования журнала требуется|journal=
( помощь ) - ^ «Высоко цитируемые исследователи» . publons.com . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ «Брайан Сайкс | Биохимия» . www.ualberta.ca . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ «Заслуженный профессор Университета Альберты | Канцелярия проректора и вице-президента (академического)» . www.ualberta.ca . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ Уишарт, Д.С.; Сайкс, Б.Д.; Ричардс, FM (18 февраля 1992 г.). «Индекс химического сдвига: быстрый и простой метод определения вторичной структуры белка с помощью ЯМР-спектроскопии» . Биохимия . 31 (6): 1647–1651. дои : 10.1021/bi00121a010 . ISSN 0006-2960 . ПМИД 1737021 .
- ^ Уишарт, Дэвид С.; Сайкс, Брайан Д. (март 1994 г.). «Индекс химического сдвига 13C: простой метод идентификации вторичной структуры белка с использованием данных о химическом сдвиге 13C» . Журнал биомолекулярного ЯМР . 4 (2): 171–180. дои : 10.1007/BF00175245 . ISSN 0925-2738 . ПМИД 8019132 . S2CID 42323147 .
- ^ Бержанский, Марк В.; Уишарт, Дэвид С. (1 ноября 2005 г.). «Простой метод прогнозирования гибкости белка с использованием вторичных химических сдвигов» . Журнал Американского химического общества . 127 (43): 14970–14971. дои : 10.1021/ja054842f . ISSN 0002-7863 . ПМИД 16248604 .
- ^ Бержанский, Марк В.; Уишарт, Дэвид С. (январь 2008 г.). «Применение индекса случайной катушки для изучения гибкости белков» . Журнал биомолекулярного ЯМР . 40 (1): 31–48. дои : 10.1007/s10858-007-9208-0 . ISSN 0925-2738 . ПМИД 17985196 . S2CID 40798448 .
- ^ Бержанский, М.В.; Нил, С.; Уишарт, DS (1 июля 2006 г.). «PREDITOR: веб-сервер для прогнозирования ограничений угла скручивания белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Веб-сервер): W63–W69. дои : 10.1093/нар/gkl341 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 1538894 . ПМИД 16845087 .
- ^ Jump up to: а б Хафса, Нур Э.; Уишарт, Дэвид С. (ноябрь 2014 г.). «CSI 2.0: значительно улучшенная версия индекса химического сдвига» . Журнал биомолекулярного ЯМР . 60 (2–3): 131–146. дои : 10.1007/s10858-014-9863-x . ISSN 0925-2738 . ПМИД 25273503 . S2CID 24871947 .
- ^ Хафса, Нур Э.; Арндт, Дэвид; Уишарт, Дэвид С. (1 июля 2015 г.). «CSI 3.0: веб-сервер для идентификации вторичной и супервторичной структуры белков с использованием химических сдвигов ЯМР» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (П1): Ж370–Ж377. дои : 10.1093/нар/gkv494 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 4489240 . ПМИД 25979265 .
- ^ Бержанский, М.; Тан, П.; Лян, Дж.; Круз, Дж.А.; Чжоу, Дж.; Чжоу, Ю.; Бассетт, Э.; МакДонелл, К.; Лу, П.; Лин, Г.; Уишарт, DS (1 июля 2009 г.). «GeNMR: веб-сервер для быстрого определения структуры белка на основе ЯМР» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (Веб-сервер): W670–W677. дои : 10.1093/нар/gkp280 . ISSN 0305-1048 . ПМК 2703936 . ПМИД 19406927 .
- ^ Уишарт, Д.С.; Арндт, Д.; Бержанский, М.; Тан, П.; Чжоу, Дж.; Лин, Г. (19 мая 2008 г.). «CS23D: веб-сервер для быстрого создания структуры белка с использованием химических сдвигов ЯМР и данных о последовательностях» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (Веб-сервер): W496–W502. дои : 10.1093/нар/gkn305 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 2447725 . ПМИД 18515350 .
- ^ Хафса, Нур Э.; Бержанский, Марк В.; Арндт, Дэвид; Уишарт, Дэвид С. (январь 2018 г.). «Быстрое и надежное определение структуры белка с помощью химического сдвига» . Журнал биомолекулярного ЯМР . 70 (1): 33–51. дои : 10.1007/s10858-017-0154-1 . ISSN 0925-2738 . ПМИД 29196969 . S2CID 3495790 .
- ^ Нил, Стивен (2003). «Быстрый и точный расчет химических сдвигов белков 1H, 13C и 15N» . Журнал биомолекулярного ЯМР . 26 (3): 215–240. дои : 10.1023/A:1023812930288 . ПМИД 12766419 . S2CID 29425090 .
- ^ Хан, Бомсу; Лю, Ифэн; Гинзингер, Саймон В.; Уишарт, Дэвид С. (май 2011 г.). «SHIFTX2: значительно улучшено предсказание химического сдвига белка» . Журнал биомолекулярного ЯМР . 50 (1): 43–57. дои : 10.1007/s10858-011-9478-4 . ISSN 0925-2738 . ПМК 3085061 . ПМИД 21448735 .
- ^ Ван, Боуэй; Ван, Юнджун; Уишарт, Дэвид С. (июнь 2010 г.). «Вероятностный подход к проверке присвоения химического сдвига белков ЯМР» . Журнал биомолекулярного ЯМР . 47 (2): 85–99. дои : 10.1007/s10858-010-9407-y . ISSN 0925-2738 . ПМИД 20446018 . S2CID 22564072 .
- ^ Чжан, Хайян; Нил, Стивен; Уишарт, Дэвид С. (2003). «RefDB: База данных единообразно упоминаемых химических сдвигов белков» . Журнал биомолекулярного ЯМР . 25 (3): 173–195. дои : 10.1023/А:1022836027055 . ПМИД 12652131 . S2CID 12786364 .
- ^ «Сводка патентов правительства Канады» .
- ^ Уишарт, Дэвид С. (июнь 2007 г.). «Протеомика и проект метаболома человека» . Экспертное обозрение по протеомике . 4 (3): 333–335. дои : 10.1586/14789450.4.3.333 . ISSN 1478-9450 . ПМИД 17552914 . S2CID 9501798 .
- ^ Уишарт, Дэвид С; Го, Анчи; Олер, Эпонина; Ван, Фэй; Анджум, Афия; Питерс, Харрисон; Дизон, Рейнард; Сайида, Зинат; Тянь, Сыян; Ли, Брайан Л; Бержанский, Марк (07 января 2022 г.). «HMDB 5.0: База данных метаболомов человека на 2022 год» . Исследования нуклеиновых кислот . 50 (Д1): Д622–Д631. дои : 10.1093/nar/gkab1062 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 8728138 . ПМИД 34986597 .
- ^ Jump up to: а б Закон, Вивиан; Нокс, Крейг; Джумбу, Янник; Джуисон, Тим; Го, Ань Чи; Лю, Ифэн; Мациевский, Адам; Арндт, Дэвид; Уилсон, Майкл; Невё, Ванесса; Тан, Александра (январь 2014 г.). «DrugBank 4.0: проливает новый свет на метаболизм лекарств» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Д1): Д1091–Д1097. дои : 10.1093/нар/gkt1068 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 3965102 . ПМИД 24203711 .
- ^ Jump up to: а б Скальберт, Огюстен; Андрес-Лакуэва, Кристина; Арита, Масанори; Крун, Пол; Манах, Клодин; Урпи-Сарда, Мирейя; Уишарт, Дэвид (11 мая 2011 г.). «Базы данных по пищевым фитохимическим веществам и их влиянию на здоровье» . Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 59 (9): 4331–4348. дои : 10.1021/jf200591d . ISSN 0021-8561 . ПМИД 21438636 .
- ^ Уишарт, Дэвид С; Го, Анчи; Олер, Эпонина; Ван, Фэй; Анджум, Афия; Питерс, Харрисон; Дизон, Рейнард; Сайида, Зинат; Тянь, Сыян; Ли, Брайан Л; Бержанский, Марк (07 января 2022 г.). «HMDB 5.0: База данных метаболомов человека на 2022 год» . Исследования нуклеиновых кислот . 50 (Д1): Д622–Д631. дои : 10.1093/nar/gkab1062 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 8728138 . ПМИД 34986597 .
- ^ Уишарт, Дэвид; Арндт, Дэвид; Пон, Эллисон; Саджед, Танвир; Го, Ань Чи; Джумбу, Янник; Нокс, Крейг; Уилсон, Майкл; Лян, Юнцзе; Грант, Джейсон; Лю, Ифэн (28 января 2015 г.). «T3DB: база данных токсичных экспозомов» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (Д1): Д928–Д934. дои : 10.1093/nar/gku1004 . ISSN 1362-4962 . ПМЦ 4383875 . ПМИД 25378312 .
- ^ Липферт, Матиас; Раут, Манодж Кумар; Бержанский, Марк; Уишарт, Дэвид С. (2019), Гауда, Г. А. Нагана; Рафтери, Дэниел (ред.), «Автоматизированные инструменты для анализа спектров 1D-ЯМР и 2D-ЯМР» , «Метаболомика на основе ЯМР» , «Методы молекулярной биологии», том. 2037, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Springer New York, стр. 429–449, doi : 10.1007/978-1-4939-9690-2_24 , ISBN. 978-1-4939-9689-6 , PMID 31463859 , S2CID 201665386 , получено 8 апреля 2022 г.
- ^ Раванбахш, Сиамак; Лю, Филип; Бьёрдал, Трент К.; Мандал, Рупасри; Грант, Джейсон Р.; Уилсон, Майкл; Эйснер, Роман; Синельников Игорь; Ху, Сяоюй; Лучинат, Клаудио; Грейнер, Рассел (27 мая 2015 г.). Монлеон, Дэниел (ред.). «Точное, полностью автоматизированное спектральное профилирование ЯМР для метаболомики» . ПЛОС ОДИН . 10 (5): e0124219. arXiv : 1409.1456 . Бибкод : 2015PLoSO..1024219R . дои : 10.1371/journal.pone.0124219 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 4446368 . ПМИД 26017271 .
- ^ Чжэн, Цзямин; Чжан, Лунь; Джонсон, Мэтью; Мандал, Рупасри; Уишарт, Дэвид С. (04 августа 2020 г.). «Комплексный целевой метаболомный анализ мочи» . Аналитическая химия . 92 (15): 10627–10634. дои : 10.1021/acs.analchem.0c01682 . ISSN 0003-2700 . ПМИД 32634308 . S2CID 220405141 .
- ^ Чжэн, Цзямин; Мандал, Рупасри; Уишарт, Дэвид С. (декабрь 2018 г.). «Чувствительный высокопроизводительный метод ЖХ-МС/МС для измерения катехоламинов в сыворотке малого объема» . Аналитика Химика Акта . 1037 : 159–167. Бибкод : 2018AcAC.1037..159Z . дои : 10.1016/j.aca.2018.01.021 . ПМИД 30292290 . S2CID 52931501 .
- ^ Психогиос, Николаос; Хау, Дэвид Д.; Пэн, Цзюнь; Го, Ань Чи; Мандал, Рупасри; Буатра, Сухайла; Синельников Игорь; Кришнамурти, Раманарайан; Эйснер, Роман; Гаутам, Биджая; Янг, Нельсон (16 февраля 2011 г.). Флауэр, Даррен (ред.). «Метаболом сыворотки человека» . ПЛОС ОДИН . 6 (2): e16957. Бибкод : 2011PLoSO...616957P . дои : 10.1371/journal.pone.0016957 . ISSN 1932-6203 . ПМК 3040193 . ПМИД 21359215 .
- ^ Буатра, Сухайла; Азиат, Фарид; Мандал, Рупасри; Го, Ань Чи; Уилсон, Майкл Р.; Нокс, Крейг; Бьорндаль, Трент Дж.; Кришнамурти, Раманарайан; Салим, Фозия; Лю, Филип; Дам, Зерихун Т. (4 сентября 2013 г.). Дзея, Пятрас (ред.). «Метаболом мочи человека» . ПЛОС ОДИН . 8 (9): e73076. Бибкод : 2013PLoSO...873076B . дои : 10.1371/journal.pone.0073076 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 3762851 . ПМИД 24023812 .
- ^ Мир, Зерихун Т.; Азиат, Фарид; Мандал, Рупасри; Кришнамурти, Рам; Буатра, Сухайла; Борзуи, Сима; Го, Ань Чи; Саджид, Танвир; Дэн, Лу; Лин, Хонг; Лю, Филип (декабрь 2015 г.). «Метаболом слюны человека» . Метаболомика . 11 (6): 1864–1883. дои : 10.1007/s11306-015-0840-5 . ISSN 1573-3882 . S2CID 18794642 .
- ^ Мандал, Рупасри; Го, Ань Чи; Чаудхари, Крути К; Лю, Филип; Яллоу, Файзат С; Донг, Эдисон; Азиат, Фарид; Уишарт, Дэвид С. (2012). «Мультиплатформенная характеристика метаболома спинномозговой жидкости человека: комплексное и количественное обновление» . Геномная медицина . 4 (4): 38. дои : 10,1186/gm337 . ISSN 1756-994Х . ПМК 3446266 . ПМИД 22546835 .
- ^ Кару, Наама; Дэн, Лу; Слае, Мордехай; Го, Ань Чи; Саджед, Танвир; Хюинь, Хиен; Вино, Эйтан; Уишарт, Дэвид С. (ноябрь 2018 г.). «Обзор метаболомики фекалий человека: методы, приложения и база данных метаболомов фекалий человека» . Аналитика Химика Акта . 1030 : 1–24. Бибкод : 2018AcAC.1030....1K . дои : 10.1016/j.aca.2018.05.031 . ПМИД 30032758 . S2CID 51710218 .
- ^ «Веб-серверы — исследовательская группа Wishart» . www.wishartlab.com . Проверено 8 апреля 2022 г.
- ^ Уишарт, Дэвид С; Сайида, Зинат; Будински, Закари; Го, Анчи; Ли, Брайан Л; Бержанский, Марк; Раут, Манодж; Питерс, Харрисон; Дизон, Рейнард; Ма, Роберт; Торрес-Кальсада, Клаудия (07 января 2022 г.). «NP-MRD: База данных магнитного резонанса натуральных продуктов» . Исследования нуклеиновых кислот . 50 (Д1): Д665–Д677. дои : 10.1093/nar/gkab1052 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 8728158 . ПМИД 34791429 .
- ^ Ван, Фэй; Лийганд, Яанус; Тянь, Сыян; Арндт, Дэвид; Грейнер, Рассел; Уишарт, Дэвид С. (31 августа 2021 г.). «CFM-ID 4.0: более точный спектральный прогноз ESI-MS/MS и идентификация соединений» . Аналитическая химия . 93 (34): 11692–11700. дои : 10.1021/acs.analchem.1c01465 . ISSN 0003-2700 . ПМК 9064193 . ПМИД 34403256 . S2CID 237197237 .