ARHGAP11B

ARHGAP11B
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGAP11B , B'-T, FAM7B1, Rho белок 11B, активирующий ГТФазу, GAP (1-8), ArhGAP11B и энцефализация человека
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 616310 ; GeneCards : ARHGAP11B ; OMA : ARHGAP11B — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	30,649,529 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; bone marrow; ; bone marrow cells; ; ganglionic eminence; ; stromal cell of endometrium; ; ventricular zone; ; gonad; ; lymph node; ; monocyte; ; appendix;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	GTPase activator activity;
Cellular component	cytosol;
Biological process	regulation of small GTPase mediated signal transduction; signal transduction; cerebral cortex development; positive regulation of GTPase activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	89839
	н/д
	ENSG00000274734 ; ENSG00000286139 ; ENSG00000285077
	н/д
	Q3KRB8
	н/д
	НМ_001039841
	н/д
	НП_001034930
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека

ARHGAP11B представляет собой специфический для человека ген, который амплифицирует базальные предшественники , контролирует пролиферацию нейронных предшественников и способствует складыванию неокортекса . Он способен вызывать сворачивание неокортекса у мышей. Это, вероятно, отражает роль ARHGAP11B в развитии и эволюционном расширении неокортекса человека. Этот вывод согласуется с открытием о том, что дупликация гена , создавшая ARHGAP11B, произошла в человеческой линии после расхождения с линией шимпанзе, но до расхождения с неандертальцами. ^[3]

Структура

ARHGAP11B кодирует 267 аминокислот. Усеченная копия ARHGAP11A , которая встречается во всем животном мире и кодирует белок, активирующий Rho GTPase ( домен RhoGAP ), ARHGAP11B включает большую часть домена GAP (до лизина-220), за которым следует новая С-концевая последовательность, которая не хватает 756 C-концевых аминокислот ARHGAP11A .

Активность

В отличие от полноразмерных ARHGAP11A и ARHGAP11A 1-250 , ARHGAP11B , как и ARHGAP11A1-220 , не проявлял активности RhoGAP в анализе трансфекции клеток на основе RhoA/Rho-киназы . Это указывает на то, что С-концевые 47 аминокислот ARHGAP11B (после лизина-220) составляют не только уникальную последовательность, возникающую в результате делеции со сдвигом рамки считывания, но также функционально отличаются от своих аналогов в ARHGAP11A . В этом анализе совместная экспрессия ARHGAP11B вместе с ARHGAP11A не ингибировала активность RhoGAP последнего. ^[3]

Функция

ARHGAP11B участвует в складывании неокортекса; однако его точная функция остается неизвестной. Несколько генов, участвующих в умственной отсталости, кодируют белки с доменами RhoGAP или другие белки сигнального пути Rho. ^[4] Сообщается, что ^[5] что он локализован в митохондриях , где связывается с транслокатором адениновых нуклеотидов . Он не влияет на обменную активность адениннуклеотидов транслокатора, но приводит к задержке открытия переходной поры митохондриальной проницаемости , что обеспечивает большую секвестрацию кальция. Кроме того, присутствие ARHGAP11B в митохондриях усиливает глутаминолиз , скорее всего, из-за способности митохондрий связывать кальций, тем самым активируя дегидрогеназы митохондриального матрикса в цикле лимонной кислоты , особенно комплекс оксоглутаратдегидрогеназы . ^{[ нужна ссылка ]}

Эволюция человека

Изменения в ARHGAP11B являются одним из нескольких ключевых генетических факторов недавней эволюции мозга и отличий современных людей от (других) обезьян и неандертальцев . ^[6] Исследование 2016 года предполагает, что одна мутация , « замена одного нуклеотида, лежит в основе специфических свойств ARHGAP11B, которые, вероятно, способствовали эволюционному расширению неокортекса человека». ^[7]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000286139, ENSG00000285077 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000274734, ENSG00000286139, ENSG00000285077 — Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б Флорио М., Альберт М., Таверна Э., Намба Т., Брандл Х., Левитус Э. и др. (март 2015 г.). «Человеческий ген ARHGAP11B способствует амплификации базальных предшественников и расширению неокортекса» . Наука . 347 (6229): 1465–1470. Бибкод : 2015Sci...347.1465F . дои : 10.1126/science.aaa1975 . ПМИД 25721503 . S2CID 34506325 .
^ Шустер С., Ривалан М., Штраус У., Стоеника Л., Тримбух Т., Радемахер Н. и др. (сентябрь 2015 г.). «NOMA-GAP/ARHGAP33 регулирует развитие синапсов и аутичное поведение у мышей» . Молекулярная психиатрия . 20 (9): 1120–1131. дои : 10.1038/mp.2015.42 . ПМИД 25869807 . S2CID 21934291 .
^ Намба Т., Дочи Дж., Пинсон А., Син Л., Калебич Н., Вильш-Бройнингер М. и др. (март 2020 г.). «Специфический для человека ARHGAP11B действует в митохондриях, увеличивая количество неокортикальных предшественников посредством глутаминолиза» . Нейрон . 105 (5): 867–881.e9. дои : 10.1016/j.neuron.2019.11.027 . ПМИД 31883789 .
^ « Находка «прорыва» показывает, что у современных людей растет больше клеток мозга, чем у неандертальцев» . Наука . Проверено 19 октября 2022 г.
^ Флорио М., Намба Т., Паабо С., Хиллер М., Хаттнер В.Б. (декабрь 2016 г.). «Единственная мутация сайта сплайсинга в специфичном для человека ARHGAP11B вызывает базальную амплификацию предшественника» . Достижения науки . 2 (12): e1601941. Бибкод : 2016SciA....2E1941F . дои : 10.1126/sciadv.1601941 . ПМК 5142801 . ПМИД 27957544 .

Дальнейшее чтение

Судмант П.Х., Кицман Дж.О., Антоначчи Ф., Алкан С., Малиг М., Цаленко А. и др. (октябрь 2010 г.). «Разнообразие вариаций числа копий человека и многокопийных генов» . Наука . 330 (6004): 641–646. Бибкод : 2010Sci...330..641S . дои : 10.1126/science.1197005 . ПМК 3020103 . ПМИД 21030649 .
Син Л., Кубик-Загородная А., Намба Т., Пинсон А., Флорио М., Прохазка Дж. и др. (июль 2021 г.). «Экспрессия специфичного для человека ARHGAP11B у мышей приводит к расширению неокортекса и повышению гибкости памяти» . Журнал ЭМБО . 40 (13): e107093. дои : 10.15252/embj.2020107093 . ПМК 8246068 . ПМИД 33938018 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000286139, ENSG00000285077 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000274734, ENSG00000286139, ENSG00000285077 — Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[Florio-3] Jump up to: ^а ^б Флорио М., Альберт М., Таверна Э., Намба Т., Брандл Х., Левитус Э. и др. (март 2015 г.). «Человеческий ген ARHGAP11B способствует амплификации базальных предшественников и расширению неокортекса» . Наука . 347 (6229): 1465–1470. Бибкод : 2015Sci...347.1465F . дои : 10.1126/science.aaa1975 . ПМИД 25721503 . S2CID 34506325 .

[4] Шустер С., Ривалан М., Штраус У., Стоеника Л., Тримбух Т., Радемахер Н. и др. (сентябрь 2015 г.). «NOMA-GAP/ARHGAP33 регулирует развитие синапсов и аутичное поведение у мышей» . Молекулярная психиатрия . 20 (9): 1120–1131. дои : 10.1038/mp.2015.42 . ПМИД 25869807 . S2CID 21934291 .

[5] Намба Т., Дочи Дж., Пинсон А., Син Л., Калебич Н., Вильш-Бройнингер М. и др. (март 2020 г.). «Специфический для человека ARHGAP11B действует в митохондриях, увеличивая количество неокортикальных предшественников посредством глутаминолиза» . Нейрон . 105 (5): 867–881.e9. дои : 10.1016/j.neuron.2019.11.027 . ПМИД 31883789 .

[6] « Находка «прорыва» показывает, что у современных людей растет больше клеток мозга, чем у неандертальцев» . Наука . Проверено 19 октября 2022 г.

[7] Флорио М., Намба Т., Паабо С., Хиллер М., Хаттнер В.Б. (декабрь 2016 г.). «Единственная мутация сайта сплайсинга в специфичном для человека ARHGAP11B вызывает базальную амплификацию предшественника» . Достижения науки . 2 (12): e1601941. Бибкод : 2016SciA....2E1941F . дои : 10.1126/sciadv.1601941 . ПМК 5142801 . ПМИД 27957544 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]