Бакуловирусный белок 3, содержащий повтор IAP

БИРЦ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2UVL, 3EB5, 3EB6, 3M0A, 3M0D
Идентификаторы
Псевдонимы	BIRC3 , AIP1, API2, CIAP2, HAIP1, HIAP1, MALT2, MIHC, RNF49, c-IAP2, бакуловирусный повтор IAP, содержащий 3, IAP-1
Внешние идентификаторы	Опустить : 601721 ; МГИ : 1197007 ; Гомологен : 899 ; Генные карты : BIRC3 ; OMA : BIRC3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	102,339,403 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	7,873,187 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	appendix; ; epithelium of nasopharynx; ; cartilage tissue; ; lymph node; ; spleen; ; gallbladder; ; granulocyte; ; mucosa of sigmoid colon; ; palpebral conjunctiva; ; tonsil;
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; zygote; ; primary oocyte; ; mesenteric lymph nodes; ; granulocyte; ; spleen; ; prostate; ; egg cell; ; lobe of prostate; ; thymus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process; protein binding; ubiquitin-protein transferase activity; transferase activity; ubiquitin protein ligase activity;
Cellular component	cytoplasm; nucleoplasm; membrane raft; nucleus; cytosol; protein-containing complex;
Biological process	regulation of apoptotic process; regulation of nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway; regulation of innate immune response; regulation of toll-like receptor signaling pathway; negative regulation of necroptotic process; inhibition of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; regulation of cysteine-type endopeptidase activity; regulation of RIG-I signaling pathway; regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; negative regulation of apoptotic process; tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; mitotic spindle assembly; cell surface receptor signaling pathway; NIK/NF-kappaB signaling; spermatogenesis; regulation of inflammatory response; positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; positive regulation of protein ubiquitination; apoptotic process; protein ubiquitination; protein deubiquitination; regulation of necroptotic process; protein heterooligomerization; MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway; TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway; negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	330
	11796
	ENSG00000023445
	ЭНСМУСГ00000032000
	Q13489
	О08863
	НМ_001165 ; НМ_182962
	НМ_007464
	НП_001156 ; НП_892007
	НП_031490
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бакуловирусный белок3, содержащий повтор IAP (также известный как cIAP2 ), представляет собой белок , который у человека кодируется BIRC3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

cIAP2 является членом семейства ингибиторов апоптоза , которые ингибируют апоптоз , препятствуя активации каспаз . Кодируемый белок ингибирует апоптоз, вызванный депривацией сыворотки, но не влияет на апоптоз, возникающий в результате воздействия менадиона , мощного индуктора свободных радикалов . Белок cIAP2 содержит три домена BIR : домен UBA , домен CARD и домен RING Finger . варианты транскрипта, кодирующие одну и ту же изоформу . Были идентифицированы ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что бакуловирусный белок 3, содержащий повторы IAP, взаимодействует с:

КАСП9 , ^{[ 8 ]}
РИПК1 , ^{[ 9 ]}
ТРАФ1 , ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}
ТРАФ2 , ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} и
УБЭ2Д2 . ^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000023445 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000032000 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Листон П., Рой Н., Тамай К., Лефевр С., Бэрд С., Чертон-Хорват Г., Фарахани Р., Маклин М., Икеда Дж.Э., Маккензи А., Корнелюк Р.Г. (февраль 1996 г.). «Подавление апоптоза в клетках млекопитающих с помощью NAIP и родственного семейства генов IAP». Природа . 379 (6563): 349–53. Бибкод : 1996Natur.379..349L . дои : 10.1038/379349a0 . ПМИД 8552191 . S2CID 4305853 .
^ Роте М., Пан М.Г., Хензель В.Дж., Эйрес Т.М., Гёддел Д.В. (февраль 1996 г.). «Сигнальный комплекс TNFR2-TRAF содержит два новых белка, родственных бакуловирусным ингибиторам белков апоптоза» . Клетка . 83 (7): 1243–52. дои : 10.1016/0092-8674(95)90149-3 . PMID 8548810 . S2CID 10694839 .
^ «Ген Энтрез: BIRC3, содержащий бакуловирусный повтор IAP 3» .
^ Деверо К.Л., Рой Н., Стеннике Х.Р., Ван Арсдейл Т., Чжоу К., Сринивасула С.М., Алнемри Э.С., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (1998). «IAP блокируют апоптотические события, индуцированные каспазой-8 и цитохромом с, путем прямого ингибирования отдельных каспаз» . ЭМБО Дж . 17 (8): 2215–23. дои : 10.1093/emboj/17.8.2215 . ПМК 1170566 . ПМИД 9545235 .
^ Бертран М.Дж., Милутинович С., Диксон К.М., Хо В.К., Будро А., Дюркин Дж., Гиллард Дж.В., Жакит Дж.Б., Моррис С.Дж., Баркер П.А. (2008). «cIAP1 и cIAP2 способствуют выживанию раковых клеток, действуя как лигазы E3, которые способствуют убиквитинированию RIP1» . Мол. Клетка . 30 (6): 689–700. doi : 10.1016/j.molcel.2008.05.014 . ПМИД 18570872 .
^ Jump up to: ^а ^б Рой Н., Деверо К.Л., Такахаши Р., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (1997). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами специфических каспаз» . ЭМБО Дж . 16 (23): 6914–25. дои : 10.1093/emboj/16.23.6914 . ПМК 1170295 . ПМИД 9384571 .
^ Jump up to: ^а ^б Ли Икс, Ян Ю, Эшвелл Дж.Д. (2002). «TNF-RII и c-IAP1 опосредуют убиквитинирование и деградацию TRAF2» . Природа . 416 (6878): 345–7. Бибкод : 2002Natur.416..345L . дои : 10.1038/416345a . ПМИД 11907583 . S2CID 4325926 .
^ Урен А.Г., Пакуш М., Хокинс С.Дж., Пульс К.Л., Во Д.Л. (1996). «Клонирование и экспрессия гомологов белка, ингибирующего апоптоз, которые действуют, ингибируя апоптоз и / или связывая факторы, связанные с рецептором фактора некроза опухоли» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (10): 4974–8. Бибкод : 1996PNAS...93.4974U . дои : 10.1073/pnas.93.10.4974 . ПМК 39390 . ПМИД 8643514 .
^ Ёнеда Т, Имаидзуми К, Маэда М, Юи Д, Манабе Т, Катаяма Т, Сато Н, Гоми Ф, Морихара Т, Мори Ю, Миёси К, Хитоми Дж, Угава С, Ямада С, Окабэ М, Тохьяма М (2000) . «Регуляторные механизмы TRAF2-опосредованной передачи сигнала с помощью Bcl10, белка, ассоциированного с лимфомой MALT» . Ж. Биол. Химия 275 (15): 11114–20. дои : 10.1074/jbc.275.15.11114 . ПМИД 10753917 . S2CID 41164520 .
^ Мейс П.Д., Линке К., Фелтэм Р., Шумахер Ф.Р., Смит К.А., Во Д.Л., Силке Дж., Дэй CL (2008). «Структуры домена cIAP2 RING обнаруживают конформационные изменения, связанные с рекрутированием убиквитин-конъюгирующего фермента (E2)» . Ж. Биол. Хим . 283 (46): 31633–40. дои : 10.1074/jbc.M804753200 . ПМИД 18784070 . S2CID 13619386 .

Дальнейшее чтение

Бертони Ф., Кавалли Ф., Коттер Ф.Е., Зукка Э. (2003). «Генетические изменения, лежащие в основе патогенеза MALT-лимфомы». Гематол. Дж . 3 (1): 10–3. дои : 10.1038/sj.thj.6200146 . ПМИД 11960389 .
Урен А.Г., Пакуш М., Хокинс С.Дж. и др. (1996). «Клонирование и экспрессия гомологов белка, ингибирующего апоптоз, которые действуют, ингибируя апоптоз и / или связывая факторы, связанные с рецептором фактора некроза опухоли» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (10): 4974–8. Бибкод : 1996PNAS...93.4974U . дои : 10.1073/pnas.93.10.4974 . ПМК 39390 . ПМИД 8643514 .
Райчан-Сепарович Э., Листон П., Лефевр С., Корнелюк Р.Г. (1997). «Отнесение генов человеческого ингибитора белка апоптоза (IAP) xiap, hiap-1 и hiap-2 к хромосомам Xq25 и 11q22-q23 методом флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика . 37 (3): 404–6. дои : 10.1006/geno.1996.0579 . ПМИД 8938457 .
Рой Н., Деверо К.Л., Такахаши Р. и др. (1998). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами специфических каспаз» . ЭМБО Дж . 16 (23): 6914–25. дои : 10.1093/emboj/16.23.6914 . ПМК 1170295 . ПМИД 9384571 .
Деверо К.Л., Рой Н., Стеннике Х.Р. и др. (1998). «IAP блокируют апоптотические события, индуцированные каспазой-8 и цитохромом с, путем прямого ингибирования отдельных каспаз» . ЭМБО Дж . 17 (8): 2215–23. дои : 10.1093/emboj/17.8.2215 . ПМК 1170566 . ПМИД 9545235 .
Янг С.С., Листон П., Сюань Дж.И. и др. (1999). «Геномная организация и физическая карта ингибиторов апоптоза человека: HIAP1 и HIAP2». Мамм. Геном . 10 (1): 44–8. дои : 10.1007/s003359900940 . ПМИД 9892732 . S2CID 7052915 .
Хорревоец А.Дж., Фонтейн Р.Д., ван Зонневельд А.Дж. и др. (1999). «Гены сосудистого эндотелия, которые реагируют на фактор некроза опухоли-альфа in vitro, экспрессируются в атеросклеротических поражениях, включая ингибитор белка-1 апоптоза, станнин и два новых гена». Кровь . 93 (10): 3418–31. дои : 10.1182/blood.V93.10.3418.410k23_3418_3431 . ПМИД 10233894 .
Сузуки Х., Мотеги М., Акаги Т. и др. (1999). «API1-MALT1-MLT участвует в лимфоме лимфоидной ткани, ассоциированной со слизистой оболочкой, с t(11;18)(q21;q21)». Кровь . 94 (9): 3270–1. дои : 10.1182/blood.V94.9.3270 . ПМИД 10610122 .
Хуанг Х., Жоазейро Калифорния, Бонфоко Э. и др. (2000). «Ингибитор апоптоза, cIAP2, действует как убиквитин-белковая лигаза и способствует моноубиквитинированию in vitro каспаз 3 и 7» . Ж. Биол. Хим . 275 (35): 26661–4. дои : 10.1074/jbc.C000199200 . ПМИД 10862606 .
Верхаген А.М., Экерт П.Г., Пакуш М. и др. (2000). «Идентификация DIABLO, белка млекопитающих, который способствует апоптозу путем связывания и противодействия белкам IAP» . Клетка . 102 (1): 43–53. дои : 10.1016/S0092-8674(00)00009-X . ПМИД 10929712 . S2CID 3192775 .
Баенс М., Стейлс А., Дирламм Дж. и др. (2001). «Структура гена MLT и молекулярная характеристика геномных точек разрыва в t (11; 18) (q21; q21) B-клеточных лимфом маргинальной зоны типа MALT». Гены Хромосомы Рак . 29 (4): 281–91. doi : 10.1002/1098-2264(2000)9999:9999<::AID-GCC1036>3.0.CO;2-I . ПМИД 11066071 . S2CID 25986338 .
Вернебург Б.Г., Зуг С.Дж., Данг Т.Т. и др. (2001). «Молекулярная характеристика сигнальных промежуточных продуктов CD40» . Ж. Биол. Хим . 276 (46): 43334–42. дои : 10.1074/jbc.M104994200 . ПМИД 11562359 . S2CID 25436077 .
Сузуки Ю., Имаи Ю., Накаяма Х. и др. (2001). «Сериновая протеаза HtrA2 высвобождается из митохондрий и взаимодействует с XIAP, вызывая гибель клеток» . Мол. Клетка . 8 (3): 613–21. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00341-0 . ПМИД 11583623 .
Ли Икс, Ян Ю, Эшвелл Дж.Д. (2002). «TNF-RII и c-IAP1 опосредуют убиквитинирование и деградацию TRAF2» . Природа . 416 (6878): 345–7. Бибкод : 2002Natur.416..345L . дои : 10.1038/416345a . ПМИД 11907583 . S2CID 4325926 .
Гордон Г.Дж., Аппасани К., Парселлс Дж.П. и др. (2002). «Ингибитор белка-1 апоптоза способствует выживанию опухолевых клеток при мезотелиоме» . Канцерогенез . 23 (6): 1017–24. дои : 10.1093/carcin/23.6.1017 . ПМИД 12082024 .
Шариф М.К., Нури М.А., Зукос Ю. (2002). «Снижение экспрессии белков-ингибиторов апоптоза в Т-клетках у пациентов с рассеянным склерозом после терапии бета-интерфероном». Дж. Нейроиммунол . 129 (1–2): 224–31. дои : 10.1016/S0165-5728(02)00185-6 . ПМИД 12161039 . S2CID 25809358 .
Экедаль Дж., Джозеф Б., Григорьев М.Ю. и др. (2002). «Экспрессия ингибиторов белков апоптоза в клетках мелко- и немелкоклеточной карциномы легких». Эксп. Сотовый Res . 279 (2): 277–90. дои : 10.1006/excr.2002.5608 . ПМИД 12243753 .

Внешние ссылки

человека BIRC3 Расположение генома и страница сведений о гене BIRC3 в браузере генома UCSC .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q13489 (белок 3, содержащий бакуловирусный IAP) на PDBe-KB .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000023445 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000032000 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8552191-5] Листон П., Рой Н., Тамай К., Лефевр С., Бэрд С., Чертон-Хорват Г., Фарахани Р., Маклин М., Икеда Дж.Э., Маккензи А., Корнелюк Р.Г. (февраль 1996 г.). «Подавление апоптоза в клетках млекопитающих с помощью NAIP и родственного семейства генов IAP». Природа . 379 (6563): 349–53. Бибкод : 1996Natur.379..349L . дои : 10.1038/379349a0 . ПМИД 8552191 . S2CID 4305853 .

[pmid8548810-6] Роте М., Пан М.Г., Хензель В.Дж., Эйрес Т.М., Гёддел Д.В. (февраль 1996 г.). «Сигнальный комплекс TNFR2-TRAF содержит два новых белка, родственных бакуловирусным ингибиторам белков апоптоза» . Клетка . 83 (7): 1243–52. дои : 10.1016/0092-8674(95)90149-3 . PMID 8548810 . S2CID 10694839 .

[7] «Ген Энтрез: BIRC3, содержащий бакуловирусный повтор IAP 3» .

[pmid9545235-8] Деверо К.Л., Рой Н., Стеннике Х.Р., Ван Арсдейл Т., Чжоу К., Сринивасула С.М., Алнемри Э.С., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (1998). «IAP блокируют апоптотические события, индуцированные каспазой-8 и цитохромом с, путем прямого ингибирования отдельных каспаз» . ЭМБО Дж . 17 (8): 2215–23. дои : 10.1093/emboj/17.8.2215 . ПМК 1170566 . ПМИД 9545235 .

[pmid18570872-9] Бертран М.Дж., Милутинович С., Диксон К.М., Хо В.К., Будро А., Дюркин Дж., Гиллард Дж.В., Жакит Дж.Б., Моррис С.Дж., Баркер П.А. (2008). «cIAP1 и cIAP2 способствуют выживанию раковых клеток, действуя как лигазы E3, которые способствуют убиквитинированию RIP1» . Мол. Клетка . 30 (6): 689–700. doi : 10.1016/j.molcel.2008.05.014 . ПМИД 18570872 .

[pmid9384571-10] Jump up to: ^а ^б Рой Н., Деверо К.Л., Такахаши Р., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (1997). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами специфических каспаз» . ЭМБО Дж . 16 (23): 6914–25. дои : 10.1093/emboj/16.23.6914 . ПМК 1170295 . ПМИД 9384571 .

[pmid11907583-11] Jump up to: ^а ^б Ли Икс, Ян Ю, Эшвелл Дж.Д. (2002). «TNF-RII и c-IAP1 опосредуют убиквитинирование и деградацию TRAF2» . Природа . 416 (6878): 345–7. Бибкод : 2002Natur.416..345L . дои : 10.1038/416345a . ПМИД 11907583 . S2CID 4325926 .

[pmid8643514-12] Урен А.Г., Пакуш М., Хокинс С.Дж., Пульс К.Л., Во Д.Л. (1996). «Клонирование и экспрессия гомологов белка, ингибирующего апоптоз, которые действуют, ингибируя апоптоз и / или связывая факторы, связанные с рецептором фактора некроза опухоли» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (10): 4974–8. Бибкод : 1996PNAS...93.4974U . дои : 10.1073/pnas.93.10.4974 . ПМК 39390 . ПМИД 8643514 .

[pmid10753917-13] Ёнеда Т, Имаидзуми К, Маэда М, Юи Д, Манабе Т, Катаяма Т, Сато Н, Гоми Ф, Морихара Т, Мори Ю, Миёси К, Хитоми Дж, Угава С, Ямада С, Окабэ М, Тохьяма М (2000) . «Регуляторные механизмы TRAF2-опосредованной передачи сигнала с помощью Bcl10, белка, ассоциированного с лимфомой MALT» . Ж. Биол. Химия 275 (15): 11114–20. дои : 10.1074/jbc.275.15.11114 . ПМИД 10753917 . S2CID 41164520 .

[pmid18784070-14] Мейс П.Д., Линке К., Фелтэм Р., Шумахер Ф.Р., Смит К.А., Во Д.Л., Силке Дж., Дэй CL (2008). «Структуры домена cIAP2 RING обнаруживают конформационные изменения, связанные с рекрутированием убиквитин-конъюгирующего фермента (E2)» . Ж. Биол. Хим . 283 (46): 31633–40. дои : 10.1074/jbc.M804753200 . ПМИД 18784070 . S2CID 13619386 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]