SYCP3

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

XLR/SYCP3/FAM9 домен
XLR/SYCP3/FAM9 домен
Идентификаторы
Символ	Кор1
Pfam	PF04803
InterPro	IPR006888
Кат -	4CPC
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

SYCP3
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	4CPC
Идентификаторы
Псевдонимы	SYCP3 , COR1, SCP3, SPGF4, RPRGL4, СИНАПОНЕМАЛЬНЫЙ КОМПЛЕКС Белок 3
Внешние идентификаторы	Омим : 604759 ; MGI : 109542 ; Гомологен : 7964 ; GeneCards : SYCP3 ; OMA : SYCP3 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	101,739,472 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	88,309,098 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right testis; ; left testis; ; secondary oocyte; ; gonad; ; sperm; ; testicle; ; buccal mucosa cell; ; stromal cell of endometrium; ; mucosa of transverse colon; ; Achilles tendon;
	Top expressed in
	seminiferous tubule; ; spermatocyte; ; spermatid; ; ascending aorta; ; zygote; ; aortic valve; ; epithelium of small intestine; ; Gonadal ridge; ; brown adipose tissue; ; secondary oocyte;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	DNA binding;
Cellular component	nucleus; chromosome; synaptonemal complex; lateral element; chromosome, centromeric region;
Biological process	cell cycle; male meiosis I; cell division; meiosis; spermatogenesis; spermatid development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	50511
	20962
	ENSG00000139351
	EMSMUSM000000200559
	Q8izu3
	P70281
	NM_001177948 ; NM_001177949 ; NM_153694
	NM_011517
	NP_001171419 ; NP_001171420 ; NP_710161
	NP_035647
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Синаптотемемный комплекс белок 3 - это белок , который у людей кодируется SYCP3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Это компонент синаптотемального комплекса, между гомологичными хромосомами во время профазы мейоза образованного . ^{[ 8 ]}

Семья генов

SYCP3 также известен как COR1. Он содержит консервативный домен с катушкой, который также встречается в семействе белков FAM9 ( FAM9A , FAM9B ), обнаруженных на хромосоме X человека. ^{[ 5 ]}

Несколько белков, подобных SYCP3, обнаружены на половых хромосомах мышей. Они назначаются имена, начинающиеся с SLX или хитрого в зависимости от хромосомы, с которой они связаны. SLX/SLXL1 и хитрость являются неофункциональными, которые оказывают противоположное влияние на экспрессию генов и эпигенетические модификации, и каждый ген снижает жизнеспособность и подвижность (посредством связывания Spindlin ) сперматозоидов, содержащих другую половую хромосому, наклоняя соотношение полов к своей собственной пользе. ^{[ 9 ]} Со временем они дублируются, чтобы сбалансировать эффекты друг друга. ^{[ 10 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000139351 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000020059 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Martinez-Garay I, Jablonka S, Sutajova M, Steuernagel P, Gal A, Kutsche K (сентябрь 2002 г.). «Новое семейство генов (FAM9) с низкой копией повторений в XP22.3, экспрессируемое исключительно в яичке: последствия для рекомбинаций в этом регионе». Геномика . 80 (3): 259–67. doi : 10.1006/geno.2002.6834 . PMID 12213195 .
^ Mallon AM, Platzer M, Bate R, Gloeckner G, Botcherby MR, Nordsiek G, et al. (Июнь 2000 г.). «Сравнительный анализ последовательности генома в области BPA/STR у мышей и человека» . Исследование генома . 10 (6): 758–75. doi : 10.1101/gr.10.6.758 . PMC 310879 . PMID 10854409 .
^ «Ген Entrez: Sycp3 синаптотемальный комплекс белок 3» .
^ Syrjänen JL, Pellegrini L, Davies или (июнь 2014 г.). «Молекулярная модель роли SYCP3 в организации мейотической хромосом» . элиф . 3 doi : 10.7554/elife.02963 . PMC 4102245 . PMID 24950965 .
^ Cocquet J, Ellis PJ, Mahadevaiah SK, Affara NA, Vaiman D, Burgoyne PS (сентябрь 2012 г.). «Генетическая основа для постмейотического X против Y -хромосомы внутригеномный конфликт у мыши» . PLOS Genetics . 8 (9): E1002900. doi : 10.1371/journal.pgen.1002900 . PMC 3441658 . PMID 23028340 .
^ Крюгер А.Н., Брогли М.А., Хуизинге Дж.Л., Кидд Дж. М., Де Руайд Д.Г., Ху Й.К., Мюллер Дж. Л. (октябрь 2019). «Нефункциональное семейство ампликонических генов, связанных с x, необходимо для мужской фертильности и равного соотношения полов у мышей» . Текущая биология . 29 (21): 3699–3706.e5. doi : 10.1016/j.cub.2019.08.057 . PMC 7012382 . PMID 31630956 .

Дальнейшее чтение

Юань Л., Лю Дж.Г., Чжао Дж., Брунделл Е., Данехольт Б., Хоог С (январь 2000 г.). «Мышиный ген SCP3 необходим для сборки синаптотемама, синапсиса хромосомы и мужской фертильности» . Молекулярная клетка . 5 (1): 73–83. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80404-9 . PMID 10678170 .
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T, et al. (Октябрь 2001 г.). «Панель взаимодействия белка-белка с использованием кДНК с полной длиной мыши» . Исследование генома . 11 (10): 1758–65. doi : 10.1101/gr.180101 . PMC 311163 . PMID 11591653 .
Lee J, Iwai T, Yokota T, Yamashita M (июль 2003 г.). «Временно и пространственно селективная потеря белка REC8 из мейотических хромосом во время мейоза млекопитающих». Журнал сотовой науки . 116 (Pt 13): 2781–90. doi : 10.1242/jcs.00495 . PMID 12759374 . S2CID 11040339 .
Miyamoto T, Hasuike S, Yogev L, Maduro MR, Ishikawa M, Westphal H, Lamb DJ (ноябрь 2003 г.). «Азооспермия у пациентов, гетерозиготных для мутации в SYCP3». Лансет . 362 (9397): 1714–9. doi : 10.1016/s0140-6736 (03) 14845-3 . PMID 14643120 . S2CID 44513816 .
Бур П., Джаль М., Лок М.Т., Рой Д.Г., Гилтэй Дж., Хохстенбах Р., Слиже Перенос (2004). «Кинтитика или майоз у азооспермических мужчин: суставочный гистологический и цитологический подход». Цитогенное и Gename Research . 105 (1): 36–46. doi : 10 1159/0000078007 . HDL : 1874/11543 . PMID 15218256 . S2CID 26325415 .
Stouffs K, Lissens W, Tournaye H, Van Steirteghem A, Liebaers I (октябрь 2005 г.). «Мутации SYCP3 редки у пациентов с азооспермией». Плодородие и бесплодия . 84 (4): 1019–20. doi : 10.1016/j.fertnstert.2005.04.033 . PMID 16213863 .
Aarabi M, Modarressi MH, Soltanghoraee H, Behjati R, Amirjannati N, Akhondi MM (август 2006 г.). «Экспрессия яичка синаптонемального комплекса белка 3 (SYCP3), грабит -рибонуклеиновая кислота у 110 пациентов с необрушительной азооспермией» . Плодородие и бесплодия . 86 (2): 325–31. doi : 10.1016/j.fertnstert.2005.12.070 . PMID 16824523 .
Sapkota G, Knockaert M, Alarcón C, Montalvo E, Brivanlou AH, Massagué J (декабрь 2006 г.). «Дефосфорилирование областей линкеров SMAD1 и SMAD2/3 с помощью малых С-концевых доменных фосфатаз имеет различные результаты для морфогенетического белка кости и трансформирующих путей фактора роста-бета-бета» . Журнал биологической химии . 281 (52): 40412–9. doi : 10.1074/jbc.m610172200 . PMID 17085434 .
Martínez J, Bonache S, Carvajal A, Bassas L, Larriba S (октябрь 2007 г.). «Мутации SYCP3 редки у бесплодных испанских мужчин с мейотическим арестом» . Плодородие и бесплодия . 88 (4): 988–9. doi : 10.1016/j.fertnstert.2006.11.163 . PMID 17434513 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : Q8izu3 (белок синаптотемама человека 3) в PDBE-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : P70281 (белок 3-синаптонемального комплекса мыши) в PDBE-KB .

Эта статья о гене о хромосоме человека 12 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000139351 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000020059 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid12213195-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Martinez-Garay I, Jablonka S, Sutajova M, Steuernagel P, Gal A, Kutsche K (сентябрь 2002 г.). «Новое семейство генов (FAM9) с низкой копией повторений в XP22.3, экспрессируемое исключительно в яичке: последствия для рекомбинаций в этом регионе». Геномика . 80 (3): 259–67. doi : 10.1006/geno.2002.6834 . PMID 12213195 .

[pmid10854409-6] Mallon AM, Platzer M, Bate R, Gloeckner G, Botcherby MR, Nordsiek G, et al. (Июнь 2000 г.). «Сравнительный анализ последовательности генома в области BPA/STR у мышей и человека» . Исследование генома . 10 (6): 758–75. doi : 10.1101/gr.10.6.758 . PMC 310879 . PMID 10854409 .

[entrez-7] «Ген Entrez: Sycp3 синаптотемальный комплекс белок 3» .

[pmid24950965-8] Syrjänen JL, Pellegrini L, Davies или (июнь 2014 г.). «Молекулярная модель роли SYCP3 в организации мейотической хромосом» . элиф . 3 doi : 10.7554/elife.02963 . PMC 4102245 . PMID 24950965 .

[9] Cocquet J, Ellis PJ, Mahadevaiah SK, Affara NA, Vaiman D, Burgoyne PS (сентябрь 2012 г.). «Генетическая основа для постмейотического X против Y -хромосомы внутригеномный конфликт у мыши» . PLOS Genetics . 8 (9): E1002900. doi : 10.1371/journal.pgen.1002900 . PMC 3441658 . PMID 23028340 .

[10] Крюгер А.Н., Брогли М.А., Хуизинге Дж.Л., Кидд Дж. М., Де Руайд Д.Г., Ху Й.К., Мюллер Дж. Л. (октябрь 2019). «Нефункциональное семейство ампликонических генов, связанных с x, необходимо для мужской фертильности и равного соотношения полов у мышей» . Текущая биология . 29 (21): 3699–3706.e5. doi : 10.1016/j.cub.2019.08.057 . PMC 7012382 . PMID 31630956 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]