Лейцил-тРНК-синтетаза

ЛАРС1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2WFD
Идентификаторы
Псевдонимы	LARS1 , лейцил-тРНК-синтетаза, ILFS1, HSPC192, LARS, лейцил-тРНК-синтетаза 1, LRS, LEUS, LFIS, PIG44, hr025Cl, LEURS, RNTLS
Внешние идентификаторы	Опустить : 151350 ; МГИ : 1913808 ; Гомологен : 7083 ; Генные карты : LARS1 ; ОМА : LARS1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	146,182,696 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	42,395,259 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Brodmann area 23; ; endothelial cell; ; ventricular zone; ; middle temporal gyrus; ; body of pancreas; ; right uterine tube; ; ganglionic eminence; ; primary visual cortex; ; cartilage tissue; ; islet of Langerhans;
	Top expressed in
	medullary collecting duct; ; basilar part of occipital bone; ; lacrimal gland; ; yolk sac; ; primitive streak; ; renal corpuscle; ; calvaria; ; seminal vesicula; ; ureter; ; salivary gland;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	aminoacyl-tRNA ligase activity; nucleotide binding; leucine-tRNA ligase activity; ligase activity; protein binding; ATP binding; aminoacyl-tRNA editing activity; valine-tRNA ligase activity; GTPase activator activity; glutamine-tRNA ligase activity;
Cellular component	cytosol; nuclear body; cytoplasm; lysosome; endoplasmic reticulum; endomembrane system; aminoacyl-tRNA synthetase multienzyme complex;
Biological process	tRNA aminoacylation for protein translation; protein biosynthesis; leucyl-tRNA aminoacylation; valyl-tRNA aminoacylation; protein targeting to lysosome; regulation of cell size; negative regulation of autophagy; cellular response to amino acid starvation; positive regulation of GTPase activity; cellular response to amino acid stimulus; cellular response to leucine; positive regulation of TORC1 signaling; cellular response to leucine starvation; glutaminyl-tRNA aminoacylation; aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51520
	107045
	ENSG00000133706
	ENSMUSG00000024493
	Q9P2J5
	Q8BMJ2
	НМ_020117 ; НМ_001317964 ; НМ_001317965 ; НМ_016460
	НМ_134137
	НП_001304893 ; НП_001304894 ; НП_057544 ; НП_064502
	НП_598898
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Лейцил-тРНК-синтетаза цитоплазматическая — фермент , который у человека кодируется LARS геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует цитозольную лейцин-тРНК-синтетазу, члена аминоацил-тРНК-синтетазы класса I. семейства Кодируемый фермент катализирует АТФ -зависимое связывание L-лейцина с тРНК(Leu). Он обнаруживается в цитоплазме как часть мультисинтетазного комплекса и взаимодействует с аргинил-тРНК-синтетазой через С-концевой домен. Были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскрипта этого гена; однако их полноразмерная природа неизвестна. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что лейцил-тРНК-синтетаза взаимодействует с EEF1G . ^{[ 7 ]}

Ингибиторы

См. также

Лейцин-тРНК-лигаза

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000133706 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024493 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Джайлз Р.Э., Симидзу Н., Раддл Ф.Х. (сентябрь 1980 г.). «Присвоение генетического локуса человека хромосоме 5, который корректирует термочувствительное поражение, связанное со снижением активности лейцил-тРНК-синтетазы в клетках китайского хомячка ts025Cl». Генетика соматических клеток . 6 (5): 667–687. дои : 10.1007/BF01538645 . ПМИД 6933703 . S2CID 11128003 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: лейцил-тРНК-синтетаза LARS» .
^ Сан Ли Дж., Гю Пак С., Пак Х., Соль В., Ли С., Ким С. (февраль 2002 г.). «Сеть взаимодействия аминоацил-тРНК-синтетаз человека и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 291 (1): 158–164. дои : 10.1006/bbrc.2002.6398 . ПМИД 11829477 .
^ Маркинсон Б., Ганнум М., Винтер Т., Райцерз А., Рок Ф., Гупта А.К. (январь 2018 г.). «Изучение преимуществ борного механизма действия и физико-химических свойств таваборола при лечении онихомикоза». Журнал Американской ортопедической медицинской ассоциации . 108 (1): 12–19. дои : 10.7547/16-154 . ПМИД 29547036 .

Дальнейшее чтение

Норкум МТ (август 1991 г.). «Структурный анализ высокомолекулярного комплекса аминоацил-тРНК-синтетазы. Влияние нейтральных солей и детергентов» . Журнал биологической химии . 266 (23): 15398–15405. дои : 10.1016/S0021-9258(18)98629-1 . ПМИД 1651330 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–174. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–156. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Кевийон С., Робинсон Дж. К., Бертонно Э., Сиатека М., Миранд М. (январь 1999 г.). «Макромолекулярная сборка аминоацил-тРНК-синтетаз: идентификация белок-белковых взаимодействий и характеристика основного белка». Журнал молекулярной биологии . 285 (1): 183–195. дои : 10.1006/jmbi.1998.2316 . ПМИД 9878398 .
Ро С.Б., Ким М.Дж., Ли Дж.С., Сол В., Мотеги Х., Ким С., Шиба К. (апрель 1999 г.). «Генетическое исследование белок-белковых взаимодействий в мульти-тРНК-синтетазном комплексе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (8): 4488–4493. Бибкод : 1999PNAS...96.4488R . дои : 10.1073/pnas.96.8.4488 . ЧВК 16359 . ПМИД 10200289 .
Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К.И., Хиросава М., Охара О (февраль 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XVI. Полные последовательности 150 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 7 (1): 65–73. дои : 10.1093/dnares/7.1.65 . ПМИД 10718198 .
Кан Дж., Ким Т., Ко Ю.Г., Ро С.Б., Пак С.Г., Ким М.Дж. и др. (октябрь 2000 г.). «Белок теплового шока 90 опосредует белок-белковые взаимодействия между аминоацил-тРНК-синтетазами человека» . Журнал биологической химии . 275 (41): 31682–31688. дои : 10.1074/jbc.M909965199 . ПМИД 10913161 .
Чжан QH, Е М, Ву XY, Ren SX, Чжао М, Чжао CJ и др. (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых клетках/клетках-предшественниках» . Геномные исследования . 10 (10): 1546–1560. дои : 10.1101/гр.140200 . ПМК 310934 . ПМИД 11042152 .
Сан Ли Дж., Гю Пак С., Пак Х., Соль В., Ли С., Ким С. (февраль 2002 г.). «Сеть взаимодействия аминоацил-тРНК-синтетаз человека и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 291 (1): 158–164. дои : 10.1006/bbrc.2002.6398 . ПМИД 11829477 .
Лин С., Яо Ю.Н., Чжэн Ю.Г., Вэй Х., Ван Л., Ву С.Ф., Ван Э.Д. (октябрь 2005 г.). «С-концевой присоединенный домен цитозольной лейцил-тРНК-синтетазы человека незаменим при ее взаимодействии с аргинил-тРНК-синтетазой в комплексе мульти-тРНК-синтетазы» . Журнал биологической химии . 280 (41): 34755–34763. дои : 10.1074/jbc.M413511200 . ПМИД 16055448 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Й., Ота Т., Нишикава Т., Ямашита Р. и др. (январь 2006 г.). «Диверсификация модуляции транскрипции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .
Маесо Э., Руэда А., Хименес С., Дель Хойо П., Мартин Р., Кабельо А. и др. (май 2007 г.). «Новая мутация в гене тРНК Leu (UUR) митохондриальной ДНК, связанная с поздней миопатией глаза». Нервно-мышечные расстройства . 17 (5): 415–418. дои : 10.1016/j.nmd.2007.01.015 . ПМИД 17363246 . S2CID 26750219 .
Лю С.В., Келли С.О. (апрель 2007 г.). «Один остаток в лейцил-тРНК-синтетазе, влияющий на специфичность аминокислот и аминоацилирование тРНК» . Биохимия . 46 (15): 4466–4472. дои : 10.1021/bi0618215 . ПМК 2518062 . ПМИД 17378584 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000133706 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024493 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid6933703-5] Джайлз Р.Э., Симидзу Н., Раддл Ф.Х. (сентябрь 1980 г.). «Присвоение генетического локуса человека хромосоме 5, который корректирует термочувствительное поражение, связанное со снижением активности лейцил-тРНК-синтетазы в клетках китайского хомячка ts025Cl». Генетика соматических клеток . 6 (5): 667–687. дои : 10.1007/BF01538645 . ПМИД 6933703 . S2CID 11128003 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: лейцил-тРНК-синтетаза LARS» .

[pmid11829477-7] Сан Ли Дж., Гю Пак С., Пак Х., Соль В., Ли С., Ким С. (февраль 2002 г.). «Сеть взаимодействия аминоацил-тРНК-синтетаз человека и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 291 (1): 158–164. дои : 10.1006/bbrc.2002.6398 . ПМИД 11829477 .

[8] Маркинсон Б., Ганнум М., Винтер Т., Райцерз А., Рок Ф., Гупта А.К. (январь 2018 г.). «Изучение преимуществ борного механизма действия и физико-химических свойств таваборола при лечении онихомикоза». Журнал Американской ортопедической медицинской ассоциации . 108 (1): 12–19. дои : 10.7547/16-154 . ПМИД 29547036 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]