HIST1H3C

HIST1H3C
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 3WKJ, 3B95, 2C1J, 3AYW, 3WA9, 3U4S, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3U31, 2UXN, 3AZK, 2C1N, 5C11, 3QO2, 3X1V, 5C13, 4A0J, 4U68, 5AV8, 4LLB, 3U5O, 1O9S, 4FT2, 4HON, 3W99, 3ZVY, 4Z0R, 5AVC, 1CT6, 1Q3L, 3O37, 3W97, 3SOW, 3KMT, 4YM6, 4A7J, 3UEE, 2KWK, 4F4U, 3UEF, 3UIG, 4BD3, 3AZL, 4QBR, 4F56, 3AFA, 4LKA, 5CPK, 5FFV, 3V43, 5CH1, 3U5P, 3AZI, 3U5N, 3AZH, 3UIK, 4QBQ, 1U35, 4UY4, 2OT7, 5AV9, 2B2W, 3U3D, 3AZF, 3W98, 4I51, 4X3K, 4FWF, 2B2T, 2B2V, 4A0N, 2KWJ, 3WAA, 3QJ6, 5DAH, 3AZG, 3AZE, 3X1T, 3RIY, 2L75, 3A1B, 2VPG, 4QBS, 3O35, 5CPJ, 3ZG6, 4YM5, 3AZJ, 2RI7, 3AZN, 3AVR, 5CPI, 2LBM, 3W96, 3O34, 2M0O, 4L7X, 5CH2, 5AV6, 3AZM, 4UP0, 3X1S, 2OX0, 3UII, 3SOU, 4N4H, 4TN7, 1CS9, 3X1U, 4LXL, 2B2U, 2OQ6, 3RIG, 5C3I, 4YHP, 5B24, 5D6Y, 4YHZ, 4Z2M, 5HJD, 5HJC, 5HJB, 5B2I, 5HYN, 5FB0, 5FB1, 5IQL, 5B2J, 5JIN
Идентификаторы
Псевдонимы	HIST1H3C , H3.1, H3/c, H3FC, кластер гистонов 1, H3c, кластер гистонов 1, член семейства H3 c, H3C3
Внешние идентификаторы	Опустить : 602812 ; МГИ : 2448355 ; Гомологен : 134495 ; Генные карты : HIST1H3C ; OMA : HIST1H3C — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p22.2 Start 26,045,411 bp End 26,045,821 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 3 (mouse) Band 3|3 F2.1 Start 96,154,001 bp End 96,155,825 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in stomach colon lung kidney heart vagina ovary testicle Top expressed in genital tubercle secondary oocyte primary oocyte embryo zygote embryo morula tail of embryo bone marrow epiblast More reference expression data BioGPS n/a
showГенная онтология Molecular function DNA binding histone binding protein binding protein heterodimerization activity cadherin binding nucleosomal DNA binding Cellular component membrane nucleoplasm chromosome extracellular region nuclear chromosome extracellular exosome nucleosome nucleus protein-containing complex Biological process telomere organization epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation protein heterotetramerization blood coagulation DNA replication-dependent chromatin assembly rDNA heterochromatin assembly negative regulation of gene expression, epigenetic chromatin organization regulation of gene silencing by miRNA nucleosome assembly interleukin-7-mediated signaling pathway regulation of megakaryocyte differentiation regulation of hematopoietic stem cell differentiation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 8352 15077 Вместе ENSG00000278272 ENSMUSG00000093769 ЮниПрот P68431 P84228 RefSeq (мРНК) НМ_003531 НМ_178216 RefSeq (белок) НП_066298 НП_003520 НП_003525 НП_003527 showНП_473386 НП_835734 НП_783584 НП_835510 НП_835587 NP_038576 NP_835511 NP_835512 Местоположение (UCSC) Чр 6: 26.05 – 26.05 Мб Chr 3: 96,15 – 96,16 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Гистон H3.1 — это белок , который у человека кодируется HIST1H3C геном .

Гистоны — основные ядерные белки , отвечающие за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот . Две молекулы каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4) образуют октамер , вокруг которого примерно 146 пар оснований ДНК обернуты повторяющимися единицами, называемыми нуклеосомами. Линкерный гистон H1 взаимодействует с линкерной ДНК между нуклеосомами и участвует в уплотнении хроматина в структуры более высокого порядка.

Этот ген не имеет интрона и кодирует члена семейства гистонов H3 . В транскриптах этого гена отсутствуют полиА-хвосты, вместо этого они содержат палиндромный терминирующий элемент. Этот ген обнаружен в большом кластере генов гистонов на хромосоме 6 .

Дальнейшее чтение

• Альбиг В., Денеке Д. (1998). «Кластер генов гистонов человека в локусе D6S105». Генетика человека . 101 (3): 284–94. дои : 10.1007/s004390050630 . ПМИД   9439656 . S2CID   38539096 .
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация встроенного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (5): 2535–44. дои : 10.1128/mcb.18.5.2535 . ПМК   110633 . ПМИД   9566873 .
• Мунаката Т., Адачи Н., Ёкояма Н. и др. (2000). «Человеческий гомолог дрожжевого фактора анти-молчания обладает шаперонной активностью гистонов» . Гены в клетки . 5 (3): 221–33. дои : 10.1046/j.1365-2443.2000.00319.x . ПМИД   10759893 . S2CID   20198031 .
• Сюй JY, Сунь ZW, Ли X и др. (2000). «Митотическое фосфорилирование гистона H3 регулируется киназой Ipl1/aurora и фосфатазой Glc7/PP1 у почкующихся дрожжей и нематод» . Клетка . 102 (3): 279–91. дои : 10.1016/S0092-8674(00)00034-9 . ПМИД   10975519 . S2CID   16057773 .
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP/P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с основными гистонами» . Вирусология . 277 (2): 278–95. дои : 10.1006/виро.2000.0593 . ПМИД   11080476 .
• Лахнер М., О'Кэрролл Д., Ри С. и др. (2001). «Метилирование гистона H3 лизина 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа . 410 (6824): 116–20. Бибкод : 2001Natur.410..116L . дои : 10.1038/35065132 . ПМИД   11242053 . S2CID   4331863 .
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Усиление активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина» . Вирусология . 289 (2): 312–26. дои : 10.1006/виро.2001.1129 . ПМИД   11689053 .
• Ян Л., Ся Л., Ву Д.И. и др. (2002). «Молекулярное клонирование ESET, новой метилтрансферазы, специфичной для гистона H3, которая взаимодействует с фактором транскрипции ERG». Онкоген . 21 (1): 148–52. дои : 10.1038/sj.onc.1204998 . ПМИД   11791185 . S2CID   10912876 .
• Нильсен П.Р., Нитлиспах Д., Мотт Х.Р. и др. (2002). «Структура хромодомена HP1, связанного с гистоном H3, метилированным по лизину 9». Природа . 416 (6876): 103–7. Бибкод : 2002Natur.416..103N . дои : 10.1038/nature722 . ПМИД   11882902 . S2CID   4423019 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Умехара Т., Хорикоши М. (2003). «Фактор инициации транскрипции IID-интерактивный гистоновый шаперон CIA-II, участвующий в сперматогенезе млекопитающих» . Журнал биологической химии . 278 (37): 35660–7. дои : 10.1074/jbc.M303549200 . ПМИД   12842904 .
• Лусич М., Марчелло А., Серезето А., Джакка М. (2004). «Регуляция экспрессии гена ВИЧ-1 путем ацетилирования гистонов и рекрутирования факторов на промоторе LTR» . Журнал ЭМБО . 22 (24): 6550–61. дои : 10.1093/emboj/cdg631 . ПМК   291826 . ПМИД   14657027 .
• Блэк Б.Е., Фольц Д.Р., Чакраварти С. и др. (2004). «Структурные детерминанты генерации центромерного хроматина». Природа . 430 (6999): 578–82. Бибкод : 2004Natur.430..578B . дои : 10.1038/nature02766 . ПМИД   15282608 . S2CID   4392941 .