Биобанк CARTaGENE
 | Эта статья содержит контент, написанный как реклама . ( Ноябрь 2023 г. ) |
CARTaGENE — это популяционная когорта , основанная на продолжающемся и долгосрочном исследовании здоровья 40 000 мужчин и женщин в Квебеке . Он является региональным членом Канадского партнерства за здоровье завтрашнего дня (CanPath). [1] Основной задачей проекта является выявление генетических и экологических причин распространенных хронических заболеваний, поражающих население Квебека, а также разработка инициатив в области персонализированной медицины и государственной политики, ориентированных на группы высокого риска для населения. [2]
CARTaGENE находится под научным руководством Себастьяна Жакмона, Екатерины Критику и Филиппа Броэ из Университетского медицинского центра детской больницы Сент-Жюстин . Базируется в Монреале, Квебек, Канада. CARTaGENE работает на базе университетского медицинского центра детской больницы Сент-Жюстин и получает финансирование от Genome Canada , Канадского фонда инноваций , Génome Québec. [3] и Канадское партнерство против рака (CPAC) с 2007 года, среди других источников. [2] Программа была первоначально основана профессорами Клодом Лабержем и Бартой Кнопперс и развивалась в два этапа набора участников под руководством профессора Филипа Авадаллы в качестве научного директора группы с 2009 по 2015 год, который в настоящее время является национальным научным директором Канадского партнерства. для здоровья завтрашнего дня (CanPath). [4] [5]
Дизайн
[ редактировать ]Группа CARTaGENE была создана для набора мужчин и женщин в возрасте 40–69 лет из Квебека, представляющих возрастную группу, наиболее подверженную риску развития хронических заболеваний, включая сердечно-сосудистые заболевания , нарушения обмена веществ, такие как сахарный диабет и рак , среди других. [2]
В период с августа 2009 г. по октябрь 2010 г. на первом этапе набора (Фаза А) было зарегистрировано 20 007 участников. [5] а в период с декабря 2012 г. по февраль 2015 г. новая волна набора персонала (Фаза B) привлекла еще 20 000 участников. [2] Участники были выбраны случайным образом и отслеживались на основе их файлов в государственных административных базах данных здравоохранения ( RAMQ -Régie de l'Assurance Maladie du Québec). [5] Участники также были выбраны так, чтобы они представляли 1% мегаполисов Квебека , в частности Монреаля , Квебек-Сити , Шербрука и Сагенея . [5] Из-за административных связей между RAMQ и CHU Sainte-Justine за участниками можно пассивно следить в течение следующих 50 лет. [5] Информационные пакеты о проекте сначала были отправлены по почте, а с потенциальными участниками связались по телефону, чтобы записаться и запланировать посещение одного из центров клинической оценки. [5] CARTaGENE является частью общеканадской группы , собирающей образцы по всей стране, чьи методы были применены при разработке пяти когорт в рамках Канадского проекта «Партнерство для завтрашнего дня» (CPTP). [4] [5]
Молекулярное профилирование
[ редактировать ]Были собраны подробные клинические биохимические данные и общий анализ крови для каждого из участников. [5] Подробные липидные профили , Hba1c , плотность костной ткани и креатинин. [5] также были собраны. Сбор крови был разработан таким образом, чтобы ДНК и РНК для будущего использования. можно было извлечь [5] позволяющий проводить анализ экспрессии генов на уровне популяции и генотипирование . [5] Условия хранения также оптимизированы с точки зрения протеомики и липидомики . [5] В проекте CARTaGENE есть программа Systems Genomics для выявления критических событий, связанных с рядом эндофенотипов, связанных с сердечно-сосудистой системой . [2] Он разрабатывает интегративные технологии и подходы для выявления однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), связанных с эндофенотипами. [6]
Типичные исследования
[ редактировать ]Типичные исследования включают популяционные продольные исследования . Исследователи могут попытаться оценить вклад определенного образа жизни, экологических и генетических факторов и выбранного эндофенотипа . Использование эндофенотипов позволяет получить более реалистичный набор данных о взаимодействиях генов и окружающей среды, влияющих на определенные эндофенотипы. [5]
Разработка
[ редактировать ]Под руководством профессора Барты Кнопперс (Университет Макгилла) и профессора Клода Лабержа ( Университет Лаваля ) было проведено первоначальное пилотное исследование, в котором приняли участие 223 участника, ответивших на анкету, основанную на P3G DataSHaPER. [7] модель. Шкалы, используемые в анкетах, были разработаны и проверены более чем 30 экспертами из различных областей и широко используются. [5] К ним относятся анкета о здоровье пациента, [8] шкала общей тревоги, [9] Содержание работы [10] и Международный вопросник по физической активности (IPAQ).
Начиная с 2009 года под руководством профессора Филипа Авадаллы по всей провинции было создано в общей сложности 12 оценочных центров для клинического и физического обследования. [5] После первоначального телефонного контакта участникам было предложено прийти на место проведения оценки и подписать форму согласия. [5] Им было предложено заполнить анкету о демографии и образе жизни, которую заполняли самостоятельно, а также анкету о состоянии здоровья, заполняемую интервьюером. [5] вопросник . генеалогический Также был включен [11] для завершения онлайн. Были проведены неинвазивные измерения, которые включали базовые измерения, такие как вес, рост и артериальное давление . [5] Кровь, слюна и моча были собраны и сохранены в Biobanque Génome Québec и дочернем университетском больничном центре в Шикутими (Biobanque GQ-CAURC). [12] ) для дальнейшего использования. [5] Также включены опросы о питании. [2] а также заполняются анкеты с информацией о месте жительства, профессиональной историей и частотой приема пищи. [2] По состоянию на февраль 2015 года в программу CARTaGENE было привлечено в общей сложности более 40 000 участников, а данные доступны через портал канадской программы «Партнерство для завтрашнего дня». [13]
Этика и управление
[ редактировать ]CARTaGENE соблюдает местные, национальные и международные законы и этические нормы. [2] К ним относятся Канадская Хартия прав и свобод , Хартия прав и свобод человека , Гражданский кодекс Квебека , Хельсинкская декларация Всемирной медицинской ассоциации (пересмотренная в 2008 г.), Всеобщая декларация о геноме человека и правах человека (1997 г. ). ) и Всеобщая декларация по биоэтике и правам человека: ЮНЕСКО (2005 г.), [14] среди других. CARTaGENE также соответствует рекомендациям «Министерского плана действий в области исследовательской этики и научной честности» MSSS ( 1998 г.), [15] «Руководство по разработке стандартов управления банками данных» MSSS (2004 г.) [16] и «Политика исследований с участием людей» [17] (2004) и др. [2]
Правовой мониторинг
[ редактировать ]CARTaGENE контролируется Советом по исследовательской этике Центра здоровья Университета Сент-Жюстин. [2] Он также находится под контролем Комиссии по доступу к информации (CAI). [18] ). Эта организация разрешает передачу информации из RAMQ в колл-центр, который связывается с участниками, и вся личная информация, хранящаяся в CARTaGENE, подлежит наблюдению со стороны CAI. [2]
Доступ
[ редактировать ]История болезни участников хранится в централизованной государственной базе данных (RAMQ), что позволяет исследователям отслеживать этих людей на протяжении всего исследования и отслеживать все медицинские события, назначения лекарств и смерти. [2] Личная информация, связывающая медицинские записи с идентификацией пациента, подвергается деидентификации и кодируется CARTaGENE, но обрабатывается и управляется RAMQ, обеспечивая конфиденциальность пациента . [2]
Исследователи могут запросить доступ к данным CARTaGENE через портал канадского проекта «Партнерство завтрашнего дня». [13] Исследователи должны подать заявку и пройти оценку независимого комитета по доступу к пробам и данным (SDAC). [2] Набор данных доступен исследователям в промышленности и академических учреждениях. Заявки с подробным описанием проектных предложений подлежат рассмотрению независимым комитетом — Комитетом по доступу к пробам и данным (SDAC). [2] Научное руководство CARTaGENE вместе с SDAC определяет, необходимо ли возвращать данные или результаты в проект. Подача заявок на доступ к набору данных осуществляется непосредственно в режиме онлайн. [2]
Набор и переаттестация
[ редактировать ]В ближайшие годы повторные оценки состояния здоровья будут проводиться регулярно с использованием онлайн-анкет. [5] За пациентами можно следить в течение 50 лет, если они подключены к государственным административным базам данных здравоохранения. [5]
Гармонизация
[ редактировать ]CARTaGENE был спроектирован таким образом, что его инфраструктура, включая сбор образцов, измерения биологических переменных и процедуры хранения, может быть гармонизирована с другими международными крупномасштабными когортами через платформу Public Population Project in Genomics (P3G). [19] В настоящее время проводятся общенациональные усилия по сбору образцов у участников по всей Канаде, при этом CaG представляет одну из пяти групп в рамках Канадского партнерства для завтрашнего дня (CPTP). [4] CPTP привлекла более 300 000 участников для создания банка данных о здравоохранении в Канаде. [20]
Мнение и СМИ
[ редактировать ]Общественность в целом положительно отнеслась к созданию проекта CARTaGENE, а в независимом исследовании сообщалось о консультациях, проведенных с представителями общественности. [21] Основные опасения касались защиты медицинских записей и конфиденциальности, уважения индивидуальной прозрачности, права донора на обратную связь и управления. [21]
Печатные СМИ
[ редактировать ]Местные и национальные СМИ сообщили о CARTaGENE.
- La Presse /The Canadian Press, Лия Левеск (15 января 2013 г.) «Тревожное» количество жителей Квебека страдают хроническими заболеваниями без их ведома» [22]
- Le Soleil , Жан Франсуа Клише (15 января 2013 г.) «Картахенский проект: каждый второй житель Квебека заболевает, не зная об этом» [23]
- Закон / The Canadian Press, Лия Левеск (январь 2013 г.) «Жители Квебека, не зная об этом, страдают хроническими заболеваниями» [22]
- La Tribune/La Presse Canadienne, Лия Левеск (14 января 2013 г.) «Жители Квебека, сами того не подозревая, страдают хроническими заболеваниями» [24]
- Ле Девуар , Полин Гравель (15 января 2013 г.) «Картахена начинает приносить плоды» [25]
- The Gazette , Чарли Фидельман (15 января 2013 г.). Генетическое исследование CARTaGene в Квебеке показывает, что «огромная часть» населения не знает о хронических заболеваниях. [26]
- Гражданин Оттавы , Чарли Фидельман (15 января 2013 г.). Генетическое исследование CARTaGene в Квебеке показывает, что «огромная часть» населения не знает о хронических заболеваниях. [26]
- Ле Девуар, Полин Гравель (18 января 2013 г.) «Генетические данные. Биобанк Картахены находится в строгой безопасности» [27]
Телевидение
[ редактировать ]- Radio-Canada TV, Кэтрин Ковакс (14 января 2013 г.) «Картахена ищет волонтеров» [28]
- CBC News Montreal Late, Нэнси Вудс (14 января 2013 г.) Montreal Late 12:28 [29]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Канадский проект «Партнерство завтрашнего дня»» .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п «Картаген» . cartagene.qc.ca . Архивировано из оригинала 2 апреля 2013 года . Проверено 3 апреля 2013 г.
- ^ «Исследования Квебека - Геном и ДНК человека | Геном Квебека» .
- ^ Перейти обратно: а б с «Канадский проект «Партнерство завтрашнего дня»» .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в Авадалла, Филип; Катрин Буало; Ив Пайетт; Юсеф Идагур; Жан-Филипп Гуле; Барта Кнопперс; Павел Хамет; Клод Лаберж (15 октября 2012 г.). «Когортный профиль исследования CARTaGENE: популяционный биобанк Квебека для общественного здравоохранения и персонализированной геномики» . Международный журнал эпидемиологии . 42 (5): 1285–99. дои : 10.1093/ije/dys160 . ПМИД 23071140 .
- ^ Идагдур, Юсеф; Авадалла, Филип (октябрь 2012 г.). «Использование вариаций экспрессии генов для выявления взаимодействий генов и окружающей среды при заболеваниях» . Границы генетики . 3 :6. дои : 10.3389/fgene.2012.00228 . ПМЦ 3668192 . ПМИД 23755064 .
- ^ «Войти в RStudio» . Архивировано из оригинала 9 октября 2014 г. Проверено 2 апреля 2013 г.
- ^ Спитцер Р.Л., Кроенке К., Уильямс Дж.Б. (1999). «Подтверждение и полезность версии PRIME-MD для самостоятельного отчета: исследование первичной медико-санитарной помощи PHQ. Оценка психических расстройств на уровне первичной медико-санитарной помощи. Анкета о состоянии здоровья пациента». ДЖАМА . 282 (18): 1737–44. дои : 10.1001/jama.282.18.1737 . ПМИД 10568646 .
- ^ Спитцер, Роберт Л.; Кронке, Курт; Уильямс, Джанет Б.В.; Лёве, Бернд (2006). «Краткий метод оценки генерализованного тревожного расстройства». Архив внутренней медицины . 166 (10): 1092–7. дои : 10.1001/archinte.166.10.1092 . ISSN 0003-9926 . ПМИД 16717171 .
- ^ Карасек Р.; и др. (1998). «Опросник по содержанию работы (JCQ): инструмент для международной сравнительной оценки психосоциальных характеристик работы». Журнал психологии профессионального здоровья . 3 (4): 322–355. дои : 10.1037/1076-8998.3.4.322 . ПМИД 9805280 .
- ^ «QRS-БАЛЬСАК» . www.quebecgenpop.ca . Архивировано из оригинала 3 марта 2016 г. Проверено 12 августа 2019 г.
- ^ «GénomeQuébec | Биобанк GQ-CAURC» . Архивировано из оригинала 14 августа 2013 г. Проверено 3 апреля 2013 г.
- ^ Перейти обратно: а б «Портал CanPath» . Проверено 21 апреля 2024 г.
- ^ «Всеобщая декларация по биоэтике и правам человека» (PDF) . ЮНЕСКО . 2006.
- ^ «Министерский план действий по исследовательской этике и научной честности» . Ethics.msss.gouv.qc.ca . мссс. 1998.
- ^ «Руководство по стандартам управления банком данных» (PDF) . msss.gouv.qc.ca. МССС.
- ^ «Этика исследований с участием людей» (PDF) . Межведомственная консультативная группа по исследовательской этике (на французском языке). Архивировано из оригинала (PDF) 20 ноября 2013 г. Проверено 3 апреля 2013 г.
- ^ «Квебекская комиссия по доступу к информации |» .
- ^ Фортин С., Патмасири С., Гринтух Р. и Дешен М. «Механизмы доступа» к биобанкам: тонкая грань между содействием и препятствием сотрудничеству. Геномика общественного здравоохранения 14, 104–114, doi:10.1159/000309852 (2011).
- ^ Боругян, МЮ; Робсон, П.; Фортье, И.; Паркер, Л.; Маклафлин, Дж.; Кнопперс, Б.М.; Бедард, К.; Галлахер, Р.П.; Синклер, С.; Ферретти, В.; Уилан, Х.; Хоскин, Д.; Поттер, доктор юридических наук (2010). «Проект Канадского партнерства завтрашнего дня: создание общеканадской исследовательской платформы по профилактике заболеваний» . Журнал Канадской медицинской ассоциации . 182 (11): 1197–1201. дои : 10.1503/cmaj.091540 . ПМК 2917932 . ПМИД 20421354 .
- ^ Перейти обратно: а б Годар Б., Маршалл Ж. и Лаберж К. Участие сообщества в генетических исследованиях: результаты первых общественных консультаций по квебекскому проекту CARTaGENE. Community Genetics 10, 147-158, doi:10.1159/000101756 (2007).
- ^ Перейти обратно: а б «LaPresse.ca | Новости и информация в Квебеке и по всему миру» . Ла Пресс (на французском языке) . Проверено 26 августа 2019 г.
- ^ «LaPresse.ca | Новости и информация в Квебеке и по всему миру» . Ла Пресс (на французском языке) . Проверено 12 августа 2019 г.
- ^ Левеск, Л. (2013). «Жители Квебека, сами того не подозревая, страдают хроническими заболеваниями» (на французском языке). Трибуна.
- ^ «Le Devoir | Новости, текущие события, политика, культура и хроники» . www.ledevoir.com (на французском языке) . Проверено 12 августа 2019 г.
- ^ Перейти обратно: а б Фидельман, К. (The Montreal Gazette, 2013).
- ^ Гравий, П. в Le Devoir (2013).
- ^ Radio-Canada.ca, Т. (Радио-Канада, 2013).
- ^ «Новости CBC: Поздняя ночь в Монреале» . 2013. Архивировано из оригинала 28 июня 2013 г.