Поверхностно-активный белок D

СФТПД
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1B08, 1M7L, 1PW9, 1PWB, 2GGU, 2GGX, 2ORJ, 2ORK, 2OS9, 2RIA, 2RIB, 2RIC, 2RID, 2RIE, 3DBZ, 3G81, 3G83, 3G84, 3IKN, 3IKP, 3IKQ, 3IKR, 4E52, 4M17, 4M18
Идентификаторы
Псевдонимы	SFTPD , COLEC7, PSP-D, SFTP4, SP-D, поверхностно-активный белок D
Внешние идентификаторы	Опустить : 178635 ; МГИ : 109515 ; Гомологен : 2272 ; GeneCards : SFTPD ; OMA : SFTPD — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 10 (human) Band 10q22.3 Start 79,937,467 bp End 79,982,614 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 14 (mouse) Band 14 B|14 22.36 cM Start 40,894,171 bp End 40,907,106 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in lower lobe of lung visceral pleura upper lobe of lung upper lobe of left lung right lung testicle germinal epithelium body of pancreas skin of leg left lobe of thyroid gland Top expressed in right lung right lung lobe left lung left lung lobe lacrimal gland trachea olfactory epithelium parotid gland uterus conjunctival fornix More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein binding carbohydrate binding identical protein binding lipopolysaccharide binding monosaccharide binding Cellular component cytoplasm collagen endoplasmic reticulum membrane clathrin-coated endocytic vesicle endocytic vesicle extracellular region lysosome extracellular space multivesicular body rough endoplasmic reticulum Biological process surfactant homeostasis positive regulation of phagocytosis immune system process receptor-mediated endocytosis respiratory gaseous exchange by respiratory system reactive oxygen species metabolic process regulation of cytokine production negative regulation of T cell proliferation macrophage chemotaxis defense response to bacterium regulation of immune response lung alveolus development innate immune response toll-like receptor signaling pathway induction of bacterial agglutination regulation of adhesion of symbiont to host epithelial cell developmental process Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 6441 20390 Вместе ENSG00000133661 ENSMUSG00000021795 ЮниПрот P35247 P50404 RefSeq (мРНК) НМ_003019 НМ_009160 RefSeq (белок) НП_003010 НП_033186 Местоположение (UCSC) Чр 10: 79,94 – 79,98 Мб Чр 14: 40,89 – 40,91 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок поверхностно-активного вещества D , также известный как SP-D , представляет собой белок поверхностно-активного вещества легких, часть коллагенового семейства лектинов, называемого коллекционином . У человека SP-D кодируется SFTPD. геном и является частью врожденной иммунной системы . Каждая субъединица SP-D состоит из N-концевого домена, коллагеновой области , зародышевой шейки и C-концевого лектинового домена. Три из этих субъединиц собираются в гомотример, который в дальнейшем собирается в тетрамерный комплекс.

Взаимодействия

Было показано, что сурфактантный белок D взаимодействует с DMBT1 . и гемагглютинин вируса гриппа А. Посттрансляционная модификация SP-D, т.е. S-нитрозилирование, переключает его функцию.

См. также

• легочный сурфактант

Дальнейшее чтение

• Аточина-Вассерман Э.Н., Бирс М.Ф., Кадире Х., Томер Ю., Инч А., Скотт П. и др. (декабрь 2007 г.). «Селективное ингибирование индуцибельной активности NO-синтазы in vivo обращает вспять воспалительные нарушения у мышей с дефицитом поверхностно-активного белка D» . Журнал иммунологии . 179 (12): 8090–7. дои : 10.4049/jimmunol.179.12.8090 . ПМК   4009628 . ПМИД   18056350 .
• Го С.Дж., Аточина-Вассерман Е.Н., Абрамова Е., Фоли Дж.П., Заман А., Крауч Е. и др. (ноябрь 2008 г.). «S-нитрозилирование поверхностно-активного белка-D контролирует воспалительную функцию» . ПЛОС Биология . 6 (11): е266. дои : 10.1371/journal.pbio.0060266 . ПМК   2581630 . ПМИД   19007302 .
• Хансен С., Холмсков У. (август 1998 г.). «Структурные аспекты коллектинов и рецепторы для коллектинов». Иммунобиология . 199 (2): 165–89. дои : 10.1016/s0171-2985(98)80025-9 . ПМИД   9777404 .
• Лу Дж., Уиллис AC, Рид К.Б. (июнь 1992 г.). «Очистка, характеристика и клонирование кДНК поверхностно-активного белка D легких человека» . Биохимический журнал . 284. 284 (Часть 3) (3): 795–802. дои : 10.1042/bj2840795 . ПМЦ   1132609 . ПМИД   1339284 .
• Перссон А.В., Гиббонс Б.Дж., Шумейкер Дж.Д., Моксли М.А., Лонгмор У.Дж. (декабрь 1992 г.). «Основным гликолипидом, распознаваемым SP-D в поверхностно-активном веществе, является фосфатидилинозитол». Биохимия . 31 (48): 12183–9. дои : 10.1021/bi00163a030 . ПМИД   1457414 .
• Огасавара Ю., Куроки Ю., Акино Т. (октябрь 1992 г.). «Легочный сурфактантный белок D специфически связывается с фосфатидилинозитолом» . Журнал биологической химии . 267 (29): 21244–9. дои : 10.1016/S0021-9258(19)36824-3 . ПМИД   1400434 .
• Раст К., Гроссо Л., Чжан В., Чанг Д., Перссон А., Лонгмор В. и др. (октябрь 1991 г.). «Человеческий поверхностно-активный белок D: SP-D содержит домен распознавания углеводов лектина C-типа». Архив биохимии и биофизики . 290 (1): 116–26. дои : 10.1016/0003-9861(91)90597-C . ПМИД   1898081 .
• Куроки Ю, Ширатори М, Огасавара Ю, Цузуки А, Акино Т (ноябрь 1991 г.). «Характеристика белка легочного сурфактанта D: его совместная очистка с липидами». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Липиды и липидный обмен . 1086 (2): 185–90. дои : 10.1016/0005-2760(91)90006-4 . ПМИД   1932100 .
• Крауч Э., Перссон А., Чанг Д., Хойзер Дж. (июнь 1994 г.). «Молекулярная структура белка легочного сурфактанта D (SP-D)» . Журнал биологической химии . 269 ​​(25): 17311–9. дои : 10.1016/S0021-9258(17)32556-5 . ПМИД   8006040 .
• Шеффер Э., Гийу Ф., Часть D, Закин М.М. (ноябрь 1993 г.). «Другая комбинация факторов транскрипции модулирует экспрессию промотора трансферрина человека в печени и клетках Сертоли» . Журнал биологической химии . 268 (31): 23399–408. дои : 10.1016/S0021-9258(19)49476-3 . PMID   8226864 .
• Кёлбле К., Лу Дж., Моул С.Е., Калуз С., Рид К.Б. (август 1993 г.). «Отнесение гена белка D сурфактанта легких человека (SFTP4) к 10q22-q23, близкому к кластеру генов белка A сурфактанта». Геномика . 17 (2): 294–8. дои : 10.1006/geno.1993.1324 . ПМИД   8406480 .
• Крауч Э., Перссон А., Чанг Д. (январь 1993 г.). «Накопление сурфактантного белка D при легочном альвеолярном протеинозе человека» . Американский журнал патологии . 142 (1): 241–8. ПМЦ   1886847 . ПМИД   8424457 .
• Крауч, Э.; Руст, К.; Вейл, Р.; Донис-Келлер, Х .; Гроссо, Л. (февраль 1993 г.). «Геномная организация человеческого поверхностно-активного белка D (SP-D). SP-D кодируется на хромосоме 10q22.2-23.1» . Журнал биологической химии . 268 (4): 2976–2983. дои : 10.1016/S0021-9258(18)53869-2 . ПМИД   8428971 .
• Раст К., Бингл Л., Мариенчек В., Перссон А., Крауч Э.К. (февраль 1996 г.). «Характеристика промотора человеческого поверхностно-активного белка D: транскрипционная регуляция экспрессии гена SP-D глюкокортикоидами». Американский журнал респираторной клеточной и молекулярной биологии . 14 (2): 121–30. дои : 10.1165/ajrcmb.14.2.8630261 . ПМИД   8630261 .
• Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД   8889548 .
• Холмсков У., Лоусон П., Тейснер Б., Торное И., Уиллис А.С., Морган С. и др. (май 1997 г.). «Выделение и характеристика нового члена суперсемейства рецепторов-поглотителей, гликопротеина-340 (gp-340), как молекулы, связывающей белок-D поверхностно-активного вещества легких» . Журнал биологической химии . 272 (21): 13743–9. дои : 10.1074/jbc.272.21.13743 . ПМИД   9153228 .
• Ботас С., Пулен Ф., Акияма Дж., Браун С., Аллен Л., Гёрке Дж. и др. (сентябрь 1998 г.). «Измененный гомеостаз сурфактанта и морфология альвеолярных клеток типа II у мышей, лишенных сурфактантного белка D» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 95 (20): 11869–74. Бибкод : 1998PNAS...9511869B . дои : 10.1073/pnas.95.20.11869 . ПМК   21732 . ПМИД   9751757 .
• Хоканссон К., Лим Н.К., Хоппе Х.Дж., Рид К.Б. (март 1999 г.). «Кристаллическая структура тримерной альфа-спирали и трех лектиновых доменов поверхностно-активного белка D легких человека» . Структура . 7 (3): 255–64. дои : 10.1016/S0969-2126(99)80036-7 . ПМИД   10368295 .
• Холмсков Ю., Молленхауэр Дж., Мэдсен Дж., Витвед Л., Гронлунд Дж., Торное И. и др. (сентябрь 1999 г.). «Клонирование gp-340, предполагаемого опсонинового рецептора поверхностно-активного белка D легких» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (19): 10794–9. Бибкод : 1999PNAS...9610794H . дои : 10.1073/pnas.96.19.10794 . ЧВК   17962 . ПМИД   10485905 .
• Лаузен М., Линч Н., Шлоссер А., Торное И., Саекмосе С.Г., Тейснер Б. и др. (ноябрь 1999 г.). «Связанный с микрофибриллами белок 4 присутствует в смывах легких и связывается с коллагеновой областью поверхностно-активного белка D легких» . Журнал биологической химии . 274 (45): 32234–40. дои : 10.1074/jbc.274.45.32234 . ПМИД   10542261 .
• Мэдсен Дж., Клим А., Торное И., Скьодт К., Кох С., Холмсков У. (июнь 2000 г.). «Локализация белка D сурфактанта легких на поверхностях слизистых оболочек в тканях человека» . Журнал иммунологии . 164 (11): 5866–70. дои : 10.4049/jimmunol.164.11.5866 . ПМИД   10820266 .
• Чжан Л., Икегами М., Крауч Э.К., Корфхаген Т.Р., Уитсетт Дж.А. (июнь 2001 г.). «Активность легочного сурфактантного белка-D (SP-D) in vivo зависит от олигомерной структуры» . Журнал биологической химии . 276 (22): 19214–9. дои : 10.1074/jbc.M010191200 . ПМИД   11278637 .

Внешние ссылки

• Сурфактант + белок + D в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)