Среднеквадратичное смещение
Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( январь 2017 г. ) |
В статистической механике среднеквадратичное смещение ( MSD , также среднеквадратичное смещение , среднеквадратичное смещение или среднеквадратичное колебание ) является мерой отклонения положения частицы по отношению к исходному положению с течением времени. Это наиболее распространенная мера пространственной протяженности случайного движения, и ее можно рассматривать как измерение части системы, «исследованной» случайным блуждающим человеком . В области биофизики и экологической инженерии среднеквадратичное смещение измеряется с течением времени, чтобы определить, распространяется ли частица медленно из-за диффузии или вносит свой вклад и адвективная сила. [1] Другая актуальная концепция, диаметр, связанный с дисперсией (VRD, который в два раза превышает квадратный корень из MSD), также используется при изучении явлений транспортировки и смешивания в области экологической инженерии . [2] Это заметно проявляется в факторе Дебая-Валлера (описывающем колебания внутри твердого состояния) и в уравнении Ланжевена (описывающем диффузию броуновской частицы ).
МСД в то время определяется как среднее значение по ансамблю :
где N — количество усредняемых частиц, вектор является исходной позицией -я частица и вектор это позиция -я частица в момент времени t . [3]
Вывод СКО для броуновской частицы в 1D
[ редактировать ]Функция плотности вероятности (PDF) для частицы в одном измерении находится путем решения одномерного уравнения диффузии . (Это уравнение утверждает, что плотность вероятности положения со временем рассеивается — это метод, который Эйнштейн использовал для описания броуновской частицы. Другой метод описания движения броуновской частицы был описан Ланжевеном, ныне известным по своему тезке как метод Ланжевена. уравнение .)
учитывая начальное состояние ; где - положение частицы в определенный момент времени, - начальное положение меченой частицы, а - константа диффузии в единицах СИ (косвенная мера скорости частицы). Черта в аргументе мгновенной вероятности относится к условной вероятности. Уравнение диффузии гласит, что скорость, при которой вероятность обнаружения частицы на зависит от позиции.
Дифференциальное уравнение, приведенное выше, принимает форму одномерного уравнения теплопроводности . Одномерный PDF-файл ниже представляет собой функцию Грина уравнения теплопроводности (также известную как ядро тепла в математике):
Это означает, что вероятность найти частицу в является гауссовским, а ширина гауссова зависит от времени. Точнее, полная ширина на половине максимума (FWHM) (технически/педантично, на самом деле это полная длительность на половине максимума, поскольку независимой переменной является время) масштабируется следующим образом:
Используя PDF, можно получить среднее значение заданной функции, , во время :
где среднее значение берется по всему пространству (или любой применимой переменной).
Среднеквадратичное смещение определяется как
расширение среднего значения ансамбля
для ясности опустим явное обозначение зависимости от времени. Чтобы найти MSD, можно пойти одним из двух путей: можно явно вычислить и , затем подставьте результат обратно в определение MSD; или можно найти функцию, генерирующую момент , чрезвычайно полезную и общую функцию при работе с плотностями вероятности. Создающая момент функция описывает момент PDF. Первый момент PDF смещения, показанный выше, представляет собой просто среднее значение: . Второй момент задается как .
Тогда для нахождения моментообразующей функции удобно ввести характеристическую функцию:
можно разложить экспоненту в приведенном выше уравнении, чтобы получить
Беря натуральный логарифм характеристической функции, получается новая функция, кумулянтная производящая функция ,
где это кумулянт . Первые два кумулянта связаны с первыми двумя моментами: , с помощью и где второй кумулянт — это так называемая дисперсия, . Учитывая эти определения, можно исследовать моменты броуновской частицы PDF:
заполнив квадрат и зная общую площадь под гауссовским квадратом, получим
Берем натуральный логарифм и сравниваем степени к производящей функции кумулянта, первый кумулянт равен
как и ожидалось, а именно, что среднее положение является гауссовским центром. Второй кумулянт
коэффициент 2 получается из факториала в знаменателе кумулянтной производящей функции. Отсюда вычисляется второй момент:
Подключая результаты для первого и второго моментов назад, можно найти MSD,
Вывод для n измерений
[ редактировать ]Для броуновской частицы в многомерном евклидовом пространстве ее положение представлено вектором , где декартовы координаты независимы статистически .
Функция распределения вероятностей n -переменных представляет собой произведение фундаментальных решений по каждой переменной; то есть,
Среднеквадратичное смещение определяется как
Поскольку все координаты независимы, то и их отклонение от исходного положения также независимо. Поэтому,
Для каждой координаты, следуя тому же выводу, что и в одномерном сценарии выше, можно получить MSD в этом измерении как . Следовательно, окончательный результат среднеквадратического смещения в n -мерном броуновском движении:
Определение MSD для временных лагов
[ редактировать ]При измерениях отслеживания одиночных частиц (SPT) смещения могут определяться для разных временных интервалов между положениями (также называемых временными задержками или временем задержки). SPT дает траекторию , представляющий частицу, подвергающуюся двумерной диффузии.
Предполагая, что траектория отдельной частицы, измеренная в моменты времени , где любое фиксированное число, то существуют нетривиальные перемещения вперед ( , случаи, когда не учитываются), которые соответствуют временным интервалам (или временным задержкам) . Следовательно, существует много различных смещений для малых временных задержек и очень мало для больших временных задержек. можно определить как среднюю величину с течением времени: [4] [5]
Аналогично для непрерывных временных рядов:
Понятно, что выбирая большие и может улучшить статистические показатели. Этот метод позволяет нам оценить поведение целых ансамблей, просто измеряя одну траекторию, но обратите внимание, что он действителен только для систем с эргодичностью , таких как классическое броуновское движение (BM), дробное броуновское движение (fBM) и случайные системы с непрерывным временем. прогулка (CTRW) с ограниченным распределением времени ожидания, в этих случаях (определено выше), здесь обозначает среднее значение ансамбля. Однако для неэргодических систем, таких как CTRW с неограниченным временем ожидания, время ожидания в какой-то момент может стремиться к бесконечности, в этом случае сильно зависит от , и больше не равны друг другу, чтобы получить лучшую асимптотику, введите среднее среднее значение времени:
Здесь обозначает усреднение по N ансамблям.
Кроме того, из MSD можно легко вывести автокорреляционную функцию:
- , где – это так называемая автокорреляционная функция положения частиц.
МСД в экспериментах
[ редактировать ]Экспериментальные методы определения MSD включают рассеяние нейтронов и фотонную корреляционную спектроскопию .
между MSD и временем t позволяет графическими методами определить константу диффузии D. Линейная зависимость Это особенно полезно для приблизительных расчетов диффузии в экологических системах. В некоторых моделях атмосферной дисперсии взаимосвязь между MSD и временем t не является линейной. Вместо этого при изучении явления дисперсии обычно используется ряд степенных законов, эмпирически представляющих изменение квадратного корня из MSD в зависимости от расстояния по ветру. [6]
См. также
[ редактировать ]- Среднеквадратичное отклонение положений атомов : среднее значение берется по группе частиц за один раз, где MSD берется для одной частицы за определенный интервал времени.
- Среднеквадратическая ошибка
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Тарантино, Надин; Тиневез, Жан-Ив; Кроуэлл, Элизабет Фэрис; Буассон, Бертран; Энрикес, Рикардо; Мхланга, Муса; Агу, Фабрис; Исраэль, Ален; Лаплантин, Эммануэль (20 января 2014 г.). «ФНО и ИЛ-1 предъявляют различные требования к убиквитину для индукции супрамолекулярных структур NEMO-IKK» . J Клеточная Биол . 204 (2): 231–245. дои : 10.1083/jcb.201307172 . ISSN 0021-9525 . ПМЦ 3897181 . ПМИД 24446482 .
- ^ Б., Фишер, Хьюго (1 января 1979 г.). Смешение во внутренних и прибрежных водах . Академическая пресса. ISBN 9780080511771 . OCLC 983391285 .
{{cite book}}
: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Френкель, Даан и Смит, Беренд. Понимание молекулярного моделирования: от алгоритмов к приложениям . Академическое издательство, 196 (2-е изд.), с. 97.
- ^ Мишале, Ксавье (20 октября 2010 г.). «Анализ среднеквадратичного смещения одночастичных траекторий с ошибкой локализации: броуновское движение в изотропной среде» . Физический обзор E . 82 (4): 041914. Бибкод : 2010PhRvE..82d1914M . дои : 10.1103/PhysRevE.82.041914 . ПМК 3055791 . ПМИД 21230320 .
- ^ Цянь, Х.; Шитц, член парламента; Элсон, Эл. (1 октября 1991 г.). «Отслеживание одиночных частиц. Анализ диффузии и течения в двумерных системах» . Биофизический журнал . 60 (4): 910–921. Бибкод : 1991BpJ....60..910Q . дои : 10.1016/S0006-3495(91)82125-7 . ISSN 0006-3495 . ПМК 1260142 . ПМИД 1742458 .
- ^ Дэвидсон, Джорджия (1 августа 1990 г.). «Модифицированное степенное представление коэффициентов дисперсии Паскиля-Гиффорда». Журнал Ассоциации управления воздухом и отходами . 40 (8): 1146–1147. дои : 10.1080/10473289.1990.10466761 . ISSN 1047-3289 .