НЦИ-60
NCI -60 Панель линий раковых клеток представляет собой группу из 60 линий раковых клеток человека, используемых Национальным институтом рака (NCI) для скрининга соединений с целью выявления потенциальной противораковой активности. [1]
Цель
[ редактировать ]Процедура скрининга называется « Скрининг линий опухолевых клеток человека NCI-60 » и является одной из услуг по открытию и развитию (DTP) NCI Программы развивающей терапии . [2] [3] [4] Проведены курсы скрининга для каждой клеточной линии цитостатического и цитотоксического воздействия тестируемых веществ. [2]
Благодаря разнообразию клеточных линий можно сравнивать тестируемые соединения по характеру их действия, причем высокая корреляция потенциально соответствует схожим механизмам действия. [2] Автоматизированное сравнение с базой данных, содержащей более 88 000 чистых соединений и более 34 000 неочищенных экстрактов (по состоянию на 6 января 2017 г.). [update]) предоставляется инструментом COMPARE , который показывает список веществ, ранжированных по коэффициентам корреляции Пирсона для данного тестируемого вещества. [5]
Эта же панель используется в программе молекулярных мишеней для характеристики молекулярных мишеней. Измерения включают уровни белка, измерения РНК, статус мутации и активности ферментов . уровни [6]
Клеточные линии
[ редактировать ]На панели представлены клеточные линии, представляющие лейкемию , меланому , немелкоклеточный рак легких , а также рак головного мозга , яичников , молочной железы , толстой кишки , почек и простаты . [1] [2]
13 дополнительных клеточных линий оцениваются для использования в программе скрининга.среди них две линии, происходящие от до сих пор не представленной мелкоклеточной карциномы легкого . [1]
Все клеточные линии, кроме одной (по состоянию на 6 января 2017 г.) [update]) доступны другим лабораториям, включая дополнительные клеточные линии. [1]
Ошибочная идентификация и неправильная классификация
[ редактировать ]Примерно на рубеже тысячелетий было обнаружено, что несколько клеточных линий были ошибочно идентифицированы или неправильно классифицированы во время исследования или ранее: [7] [8] [9]
MDA-MB-435 , первоначально классифицированный как линия клеток рака молочной железы, был идентифицирован как линия клеток меланомы. [7] При дальнейшем исследовании оказалось, что текущий MDA-MB-435 получен от того же человека, что и клеточная линия M14 . [7] Изучение клонов показало, что путаница с M14 произошла очень рано в истории MDA-MB-435, еще до его включения в Программу развивающей терапии. [7]
NCI/ADR-RES , первоначально классифицированная как линия клеток рака молочной железы, была идентифицирована как линия клеток опухоли яичника. [8] NCI/ADR-RES, по-видимому, в какой-то момент был получен из клеточной линии OVCAR-8 . [8] Первоначально линия клеток называлась MCF-7/ADR-RES ; переименован вместе с изменением классификации. [8]
Было обнаружено, что две линии клеток рака головного мозга, SNB-19 и U251 , происходят от одного и того же человека. [9] Это делает вероятной путаницу.
61-я клеточная линия MDA-N произошла от неправильно классифицированной клеточной линии MDA-MB-435. Подтверждено, что [7] Таким образом, ее также неправильно классифицировали, поскольку на самом деле это линия клеток меланомы, но по состоянию на 6 января 2018 г. [update] официальный сайт по-прежнему указывает это как линию клеток рака молочной железы. [1] Эта линия сотовой связи недоступна с 6 января 2018 г. [update]. [1]
Международный комитет по аутентификации клеточных линий ведет список зараженных клеточных линий . [10] Он включает клеточные линии, о которых сообщалось выше, хотя обычно даты отчетности и статьи значительно позже первых дат, и статьи вызывают особую озабоченность в отношении соответствующей клеточной линии. [10] [7] [8] [9]
Продолжающееся использование неправильной классификации
[ редактировать ]По состоянию на 2014 год [update] В сотнях научных исследований MDA-MB-435 до сих пор используется в качестве модели рака молочной железы, даже после того, как в 2007 году он был официально объявлен клеточной линией меланомы, и даже в международных рецензируемых журналах с самым высоким рейтингом. [11] То же самое верно и для других ошибочно идентифицированных клеточных линий. [11]
Список клеточных линий NCI-60
[ редактировать ]| Клеточная линия | Классификация опухолей | (Потенциально) неверно идентифицирован | Исходная классификация | Недоступно | Время удвоения (часы) | Плотность прививки | Идентификатор и ссылка на целлозавра |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CCRF-CEM | Лейкемия | 26.7 | 40000 | CCRF-CEM (RRID:CVCL_0207) | |||
| ХЛ-60(ТБ) | Лейкемия | 28.6 | 40000 | HL-60(ТБ) (RRID:CVCL_A794) | |||
| К-562 | Лейкемия | 19.6 | 5000 | К-562 (RRID:CVCL_0004) | |||
| ЛОТ-4 | Лейкемия | 27.9 | 30000 | МОЛТ-4 (RRID:CVCL_0013) | |||
| РПМИ-8226 | Лейкемия | 33.5 | 20000 | RPMI-8226 (RRID:CVCL_0014) | |||
| СР-786 | Лейкемия | 28.7 | 20000 | SR (RRID:CVCL_1711) | |||
| А549 | Немелкоклеточное легкое | 22.9 | 7500 | А-549 (RRID:CVCL_0023) | |||
| ЕКВКС | Немелкоклеточное легкое | 43.6 | 20000 | EKVX (RRID:CVCL_1195) | |||
| ХОП-62 | Немелкоклеточное легкое | 39 | 10000 | HOP-62 (RRID:CVCL_1285) | |||
| ХОП-92 | Немелкоклеточное легкое | 79.5 | 20000 | HOP-92 (RRID:CVCL_1286) | |||
| НЦИ-H226 | Немелкоклеточное легкое | 61 | 20000 | НЦИ-H226 (RRID:CVCL_1544) | |||
| НЦИ-H23 | Немелкоклеточное легкое | 33.4 | 20000 | НЦИ-H23 (RRID:CVCL_1547) | |||
| НЦИ-H322M | Немелкоклеточное легкое | 35.3 | 20000 | НЦИ-H322M (RRID:CVCL_1557) | |||
| НЦИ-H460 | Немелкоклеточное легкое | 17.8 | 7500 | НЦИ-H460 (RRID:CVCL_0459) | |||
| НЦИ-H522 | Немелкоклеточное легкое | 38.2 | 20000 | NCI-H522 (RRID:CVCL_1567) | |||
| КОЛО 205 | Колон | 23.8 | 15000 | КОЛО 205 (RRID:CVCL_0218) | |||
| НСС-2998 | Колон | 31.5 | 15000 | HCC2998 (RRID:CVCL_1266) | |||
| HCT116 | Колон | 17.4 | 5000 | HCT 116 (RRID:CVCL_0291) | |||
| HCT-15 | Колон | 20.6 | 10000 | HCT 15 (RRID:CVCL_0292) | |||
| ХТ-29 | Колон | 19.5 | 5000 | HT-29 (RRID:CVCL_0320) | |||
| КМ12 | Колон | 23.7 | 15000 | КМ12 (RRID:CVCL_1331) | |||
| SW-620 | Колон | 20.4 | 10000 | SW620 (RRID:CVCL_0547) | |||
| СФ-268 | ЦНС | 33.1 | 15000 | SF268 (RRID:CVCL_1689) | |||
| СФ-295 | ЦНС | 29.5 | 10000 | SF295 (RRID:CVCL_1690) | |||
| СФ-539 | ЦНС | 35.4 | 15000 | SF539 (RRID:CVCL_1691) | |||
| СНБ-19 | ЦНС | да | ЦНС | 34.6 | 15000 | СНБ-19 (RRID:CVCL_0535) | |
| СНБ-75 | ЦНС | 62.8 | 20000 | СНБ-75 (RRID:CVCL_1706) | |||
| U251 | ЦНС | да | ЦНС | 23.8 | 7500 | U-251MG (RRID:CVCL_0021) | |
| ЛОКС ИМВИ | Меланома | 20.5 | 7500 | LOX-IMVI (RRID:CVCL_1381) | |||
| МАЛЬМЕ-3М | Меланома | 46.2 | 20000 | Мальме-3М (RRID:CVCL_1438) | |||
| М14 | Меланома | 26.3 | 15000 | M14 (RRID:CVCL_1395) | |||
| МДА-МБ-435 | Меланома | да | Грудь | 25.8 | 15000 | MDA-MB-435 (RRID:CVCL_0417) | |
| СК-МЭЛ-2 | Меланома | 45.5 | 20000 | СК-МЕЛ-2 (RRID:CVCL_0069) | |||
| СК-МЭЛ-28 | Меланома | 35.1 | 10000 | SK-MEL-28 (RRID:CVCL_0526) | |||
| СК-МЭЛ-5 | Меланома | 25.2 | 10000 | СК-МЕЛ-5 (RRID:CVCL_0527) | |||
| УАКК-257 | Меланома | 38.5 | 20000 | UACC-257 (RRID:CVCL_1779) | |||
| УАКК-62 | Меланома | 31.3 | 10000 | UACC-62 (RRID:CVCL_1780) | |||
| ИГРЫ-1 | яичник | 31 | 10000 | ИГРОВ-1 (RRID:CVCL_1304) | |||
| ОВКАР-3 | яичник | 34.7 | 10000 | ОВКАР-3 (RRID:CVCL_0465) | |||
| ОВКАР-4 | яичник | 41.4 | 15000 | ОВКАР-4 (RRID:CVCL_1627) | |||
| ОВКАР-5 | яичник | 48.8 | 20000 | ОВКАР-5 (RRID:CVCL_1628) | |||
| ОВКАР-8 | яичник | 26.1 | 10000 | ОВКАР-8 (RRID:CVCL_1629) | |||
| NCI/ADR-RES (первоначально MCF-7/ADR-RES) | яичник | да | Грудь | 34 | 15000 | НЦИ-АДР-РЕС (RRID:CVCL_1452) | |
| SK-OV-3 | яичник | 48.7 | 20000 | СК-ОВ-3 (RRID:CVCL_0532) | |||
| 786-О | Реналь | 22.4 | 10000 | 786-О (RRID:CVCL_1051) | |||
| А498 | Реналь | 66.8 | 25000 | А-498 (RRID:CVCL_1056) | |||
| АЧН | Реналь | 27.5 | 10000 | ACHN (RRID:CVCL_1067) | |||
| ЦАКИ-1 | Реналь | 39 | 10000 | Каки-1 (RRID:CVCL_0234) | |||
| РХФ 393 | Реналь | 62.9 | 15000 | RXF 393L (RRID:CVCL_1673) | |||
| SN12C | Реналь | 29.5 | 15000 | SN12C (RRID:CVCL_1705) | |||
| ТК-10 | Реналь | 51.3 | 15000 | ТК-10 (RRID:CVCL_1773) | |||
| ДРУЗЬЯ-31 | Реналь | 41.7 | 15000 | УО-31 (RRID:CVCL_1911) | |||
| ПК-3 | Простата | 27.1 | 7500 | ПК-3 (RRID:CVCL_0035) | |||
| ДУ-145 | Простата | 32.3 | 10000 | DU145 (RRID:CVCL_0105) | |||
| MCF7 | Грудь | 25.4 | 10000 | MCF-7 (RRID:CVCL_0031) | |||
| МДА-МБ-231 | Грудь | 41.9 | 20000 | MDA-MB-231 (RRID:CVCL_0062) | |||
| МДА-МБ-468 | Грудь | 62 | 2000 | MDA-MB-468 (RRID:CVCL_0419) | |||
| ХС 578Т | Грудь | 53.8 | 20000 | Hs 578T (RRID:CVCL_0332) | |||
| МДА-Н | Меланома | да | Грудь | недоступен | 22.5 | 15000 | МДА-Н (RRID:CVCL_1910) |
| БТ-549 | Грудь | 53.9 | 20000 | BT-549 (RRID:CVCL_1092) | |||
| Т-47Д | Грудь | 45.5 | 20000 | Т-47Д (RRID:CVCL_0553) |
Список дополнительных клеточных линий
[ редактировать ]| Клеточная линия | Классификация опухолей | Разновидность | Плотность прививки | Идентификатор и ссылка на целлозавра |
|---|---|---|---|---|
| ЛХФЛ 529 | Немелкоклеточное легкое | человек | 10000 | LXFL 529L (RRID:CVCL_D085) |
| ДМС 114 | Мелкоклеточное легкое | человек | 20000 | ДМС 114 (RRID:CVCL_1174) |
| ШП-77 | Мелкоклеточное легкое | человек | 40000 | ШП-77 (RRID:CVCL_1693) |
| ДЛД-1 | Колон | человек | 50000 | DLD-1 (RRID:CVCL_0248) |
| КМ20Л2 | Колон | человек | 10000 | KM20L2 (RRID:CVCL_D889) |
| СНБ-78 | ЦНС | человек | 20000 | СНБ-78 (RRID:CVCL_B321) |
| ХФ 498 | ЦНС | человек | 20000 | XF 498 (RRID:CVCL_8928) |
| РПМИ-7951 | Меланома | человек | 20000 | RPMI-7951 (RRID:CVCL_1666) |
| М19-МЕЛ | Меланома | человек | 10000 | M19-MEL (RRID:CVCL_B415) |
| RXF-631 | Реналь | человек | 10000 | RXF 631L (RRID:CVCL_A780) |
| СН12К1 | Реналь | человек | 10000 | SN12K1 (RRID:CVCL_D106) |
| P388 | Лейкемия | мышь | 50000 | P388 (RRID:CVCL_7222) |
| P388/ДОПОГ | Лейкемия | мышь | 50000 | P388/ДОПОГ (RRID:CVCL_IZ75) |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г час «Клеточные линии на экране in vitro» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 года . Проверено 6 января 2018 г.
- ^ Jump up to: а б с д «Скрининг линий опухолевых клеток человека NCI-60» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 26 августа 2015 года . Проверено 6 января 2018 г.
- ^ «Службы открытия и развития» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 26 августа 2015 года . Проверено 6 января 2018 г.
- ^ «Добро пожаловать в программу развивающей терапии» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . Проверено 6 января 2018 г.
- ^ «СРАВНИТЕЛЬНЫЙ анализ» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 11 августа 2015 года . Проверено 6 января 2018 г.
- ^ «Молекулярные мишени» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака. 12 мая 2015 года . Проверено 7 января 2018 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж «MDA-MB-435 и его производное MDA-N представляют собой линии клеток меланомы, а не линии клеток рака молочной железы» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 года . Проверено 6 января 2018 г.
- ^ Jump up to: а б с д и «Клеточная линия NCI/ADR-RES представляет собой линию клеток опухоли яичника, а не линию груди» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 года . Проверено 6 января 2018 г.
- ^ Jump up to: а б с «Клеточные линии ЦНС SNB-19 и U251 происходят от одного и того же человека» . Программа развивающей терапии . Национальный институт рака . 8 мая 2015 года . Проверено 6 января 2018 г.
- ^ Jump up to: а б База данных перекрестно загрязненных или ошибочно идентифицированных клеточных линий (PDF) , 8.0, Международный комитет по аутентификации клеточных линий (ICLAC), 1 декабря 2016 г. , получено 6 января 2018 г.
- ^ Jump up to: а б Прасад, Видудала СУДС; Гопалан, Рампрасад О.Г. (2 июня 2015 г.). «Продолжение использования MDA-MB-435, линии клеток меланомы, в качестве модели рака молочной железы человека, даже в 2014 году» . НПЖ Рак молочной железы . 1 : 15002–. дои : 10.1038/npjbcancer.2015.2 . ПМК 5515196 . ПМИД 28721362 .
- ^ Jump up to: а б «Результат поиска целлозавра: 61 совпадение по запросу «Панель линий раковых клеток NCI60» » . Целлозавр . Швейцарский институт биоинформатики . Проверено 7 января 2018 г. Ссылка включает в себя список связанных страниц в результатах поиска.
- ^ «Целлозавр - ресурс знаний о клеточных линиях» . Целлозавр . Швейцарский институт биоинформатики . Проверено 17 января 2018 г. Справочник включает страницы, найденные путем поиска по соответствующим именам строк ячеек, указанным в Списке дополнительных строк ячеек .