Jump to content

Чаба Пал

Чаба Пал
Пал в 2009 году
Рожденный ( 1975-03-27 ) 27 марта 1975 г. (49 лет)
Будапешт , Венгрия
Образование Университет Этвёша Лоранда (доктор философии)
Альма-матер Венгерская академия наук (доктор наук)
Занятие Биолог
Работодатель Биологический исследовательский центр
Награды
Веб-сайт http://group.szbk.u-szeged.hu/sysbiol/pal-csaba-lab-index.html

Чаба Пал (венгерский: Пал [ˈpaːl] Чаба [ˈt͡ʃɒbɒ]; родился 27 марта 1975 г.) [ 6 ] [ 7 ] — венгерский биолог из Центра биологических исследований (BRC). [ 8 ] в Сегеде, Венгрия . Его лаборатория является частью отдела синтетической и системной биологии BRC. [ 9 ] [ 10 ] Его исследования находятся на стыке эволюции , устойчивости к антибиотикам и генной инженерии. [ 11 ] [ 5 ] и опубликовал более 80 научных публикаций в этих областях. [ 12 ] [ 13 ]

Образование

[ редактировать ]

Чаба Пал получил степень магистра биологии в Университете Этвеша Лоранда в Будапеште в 1998 году. [ 7 ] [ 14 ] Четыре года спустя он получил степень доктора философии в Этвеша Лоранда Университете в Будапеште в 2002 году. [ 7 ] [ 14 ] В 2018 году получил степень доктора наук Венгерской академии наук . [ 7 ] Чаба Пал провел несколько лет за границей, получая стипендию. У него была возможность проводить исследования в Бате . [ 15 ] Оксфорд , Гейдельберг и Италия . [ 7 ] [ 14 ] До своего возвращения в Венгрию в 2008 году он работал приглашенным учёным в Университете Тренто . [ 7 ] [ 14 ] В 2023 году Чаба Пал стал членом-корреспондентом Венгерской академии наук .

Карьера и исследования

[ редактировать ]

Чаба Пал занимается фундаментальными и прикладными проблемами эволюции геномных сетей и устойчивости к антибиотикам . [ 11 ] Для достижения этих целей он разрабатывает методы в системной биологии , компьютерном метаболическом моделировании и геномной инженерии .

Эволюция генома

[ редактировать ]

В 2001 году Чаба Пал и его коллеги продемонстрировали, что высокоэкспрессированные гены у дрожжей развиваются медленно. [ 16 ] Позже они утверждали, что на скорость эволюции белка . преимущественно влияет уровень его экспрессии, а не функциональная значимость Это исследование способствовало парадигматическому сдвигу в области эволюции белков . [ 17 ] [ 18 ] Балаж Папп, Чаба Пал и Лоуренс Херст изучали молекулярные механизмы, лежащие в основе чувствительности к дозировке . [ 19 ] Они специально проверили то, что сейчас известно как гипотеза баланса доз. [ 20 ] Гипотеза предлагает синтез по, казалось бы, несвязанным проблемам, таким как эволюция доминирования , дупликация генов и коэволюция белкового комплекса субъединиц . В 2007 году Пал и его коллеги продемонстрировали, что антагонистическая коэволюция с паразитами оказывает большое влияние на эволюцию скорости бактериальных мутаций . [ 21 ] В этой статье показано, как биотические взаимодействия влияют на эволюцию скорости мутаций .

Совсем недавно лаборатория Пала исследовала последствия компенсаторной адаптации на эволюцию содержания генов . [ 22 ] Хорошо известно, что, хотя основные клеточные процессы обычно сохраняются в ходе эволюции , лежащие в их основе гены несколько различаются у родственных видов. Они продемонстрировали, что потеря генов инициирует адаптивные геномные изменения, которые быстро восстанавливают приспособленность , но этот процесс оказывает существенное плейотропное воздействие на клеточную физиологию и способность к эволюции при изменении окружающей среды . [ 22 ]

Эволюция сети

[ редактировать ]

Лаборатория Пала также внесла свой вклад в зарождающуюся область эволюционной системной биологии . [ 23 ] Их исследования были сосредоточены на понимании степени предсказуемости эволюции на молекулярном уровне. в масштабе генома Используя моделирование метаболических сетей в сочетании с экспериментальными инструментами, они изучили ключевые вопросы эволюции , такие как мутационная устойчивость , [ 24 ] горизонтальный перенос генов , [ 25 ] редукция генома , [ 26 ] эпистаз , [ 27 ] [ 28 ] беспорядочные ферментативные реакции , [ 29 ] и сложные адаптации. [ 30 ]

Устойчивость к антибиотикам

[ редактировать ]

Лаборатория Чабы Пала в настоящее время изучает проблему устойчивости к антибиотикам . Объединив лабораторную эволюцию , секвенирование генома и функциональный анализ , они составили карту эволюционных компромиссов между антибиотиками . Они обнаружили, что мутации множественной лекарственной устойчивости у бактерий одновременно повышают чувствительность ко многим другим, не связанным с ними лекарствам (побочная чувствительность), и исследовали лежащие в их основе молекулярные механизмы. [ 31 ]

Геномная инженерия

[ редактировать ]

Наконец, лаборатория Пала является сторонником развивающейся области эволюционной геномной инженерии . [ 32 ] [ 33 ] Геномная инженерия позволяет модифицировать определенные участки генома направленным и комбинаторным образом, а также позволяет изучать основные эволюционные проблемы, в которых естественные генетические вариации ограничены или предвзяты. Однако существующие инструменты были оптимизированы для нескольких штаммов лабораторных моделей , что приводит к накоплению многочисленных нежелательных, нецелевых модификаций и требует обширной модификации генома хозяина перед крупномасштабным редактированием. Лаборатория Pal представила простое универсальное решение. [ 34 ] [ 35 ] Этот метод уникален, поскольку позволяет систематически сравнивать мутационные эффекты и эпистаз среди широкого спектра видов бактерий.

Награды и почести

[ редактировать ]

Чаба Пал получил несколько отечественных и международных наград, в том числе Премию Игнаца Либена (2009 г.), [ 36 ] [ циклическая ссылка ] [ 37 ] Премия «Таланты Сент-Дьёрдьи» (2014), [ 1 ] и премия Бояи (2015). [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] [ 41 ] В 2016 году Чаба Пал стал членом Academia Europaea . [ 2 ] В 2017 году он был выбран членом EMBO ( Европейской организации молекулярной биологии ). [ 3 ] [ 4 ] а в 2018 году стал членом FEMS. ( Федерация европейских микробиологических обществ ) [ 5 ] В 2021 году Чаба получил академическую премию. [ 42 ] а в 2023 году он был избран членом-корреспондентом Венгерской академии наук. [ 43 ] [ 44 ]

  1. ^ Перейти обратно: а б «Премия талантов Сент-Дьёрдьи» . www.nobel-szeged.hu . Архивировано из оригинала 29 января 2020 года . Проверено 29 января 2020 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б «Академия Европы: П%Ц 3%А 1 л Чаба» . www.ae-info.org . Проверено 28 января 2020 г.
  3. ^ Перейти обратно: а б Юкич, Игорь. «EMBO приветствует 65 новых членов» . ЭМБО . Архивировано из оригинала 19 июня 2017 года . Проверено 16 июня 2017 г.
  4. ^ Перейти обратно: а б «Найдите людей в сообществах EMBO» . People.embo.org . Проверено 28 января 2020 г.
  5. ^ Перейти обратно: а б с «Эксперт FEMS: доктор Чаба Пал» . ФЕМС . Проверено 29 января 2020 г.
  6. ^ "BRC Чаба ПАЛ, доктор наук" . www.brc.hu. Проверено 29 января 2020 г. [ постоянная мертвая ссылка ]
  7. ^ Перейти обратно: а б с д и ж "BRC Csaba PAL CV" (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 29 января . Получено 29 января.
  8. ^ «БРЦ» . www.brc.hu. ​Проверено 28 января 2020 г.
  9. ^ «Отдел синтетической и системной биологии BRC» . www.brc.hu. ​Архивировано из оригинала 28 января 2020 года . Проверено 29 января 2020 г.
  10. ^ «Лаборатория Чаба Пала» . group.szbk.u-szeged.hu . Проверено 28 января 2020 г.
  11. ^ Перейти обратно: а б «Новых членов встречают в Гейдельберге» . ЭМБО . 19 декабря 2018 года . Проверено 19 декабря 2018 г.
  12. ^ «Библиотека венгерских научных трудов» . m2.mtmt.hu. Проверено 31 января 2020 г.
  13. ^ «Чаба Пал — цитаты из Google Scholar» . ученый.google.hu . Проверено 31 января 2020 г.
  14. ^ Перейти обратно: а б с д «Академия Европы: резюме» . www.ae-info.org . Проверено 29 января 2020 г.
  15. ^ «Студенты и постдокторанты прошлого и настоящего» . люди.bath.ac.uk. ​Проверено 28 января 2020 г.
  16. ^ Херст, Лоуренс Д.; Папп, Балаж; Пал, Чаба (июнь 2001 г.). «Высоко экспрессированные гены у дрожжей развиваются медленно» . Генетика . 158 (2): 927–931. дои : 10.1093/генетика/158.2.927 . ПМЦ   1461684 . ПМИД   11430355 .
  17. ^ Чжан, Цзяньчжи; Ян, Цзянь-Ронг (2015). «Детерминанты скорости эволюции белковой последовательности» . Обзоры природы Генетика . 16 (7): 409–420. дои : 10.1038/nrg3950 . ПМК   4523088 . ПМИД   26055156 .
  18. ^ Кунин, Е.В. (2011). «Существуют ли законы эволюции генома?» . PLOS Вычислительная биология . 7 (8): e1002173. arXiv : 1108.3589 . Бибкод : 2011PLSCB...7E2173K . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002173 . ПМК   3161903 . ПМИД   21901087 .
  19. ^ Папп, Балаж; Пал, Чаба; Херст, Лоуренс Д. (июль 2003 г.). «Чувствительность к дозировке и эволюция семейств генов дрожжей» . Природа . 424 (6945): 194–197. Бибкод : 2003Natur.424..194P . дои : 10.1038/nature01771 . ISSN   1476-4687 . ПМИД   12853957 . S2CID   4382441 . Проверено 10 июля 2003 г.
  20. ^ Бирчлер, Дж. А.; Вейтия, РА (20 августа 2012 г.). «Гипотеза генного баланса: взаимосвязь вопросов чувствительности к дозировке в биологических дисциплинах» . Труды Национальной академии наук . 109 (37): 14746–14753. дои : 10.1073/pnas.1207726109 . ISSN   0027-8424 . ПМЦ   3443177 . ПМИД   22908297 .
  21. ^ Пал, Чаба; Масиа, Мария Д.; Оливер, Антонио; Шахар, Ира; Баклинг, Ангус (декабрь 2007 г.). «Коэволюция с вирусами стимулирует эволюцию скорости мутаций бактерий» . Природа . 450 (7172): 1079–1081. Бибкод : 2007Natur.450.1079P . дои : 10.1038/nature06350 . ISSN   1476-4687 . ПМИД   18059461 . S2CID   4373536 . Проверено 2 декабря 2007 г.
  22. ^ Перейти обратно: а б Шамеч, Бела; Боросс, Габор; Калапис, Дороттья; Ковач, Карой; Фекете, Грегори; Фаркас, Золтан; Лазар, Виктория; Хртян, Моника; Кеммерен, Патрик; Грут Керкамп, Мэриан Дж.А.; Руткай, Эдит; Холстеге, Фрэнк КП; Папп, Балаж; Пал, Чаба (2014). «Геномный ландшафт компенсаторной эволюции» . PLoS Биология . 12 (8): e1001935. дои : 10.1371/journal.pbio.1001935 . ПМК   4144845 . ПМИД   25157590 .
  23. ^ Папп, Балаж; Нотебарт, Ричард А.; Пал, Чаба (сентябрь 2011 г.). «Системно-биологические подходы к прогнозированию геномной эволюции» . Обзоры природы Генетика . 12 (9): 591–602. дои : 10.1038/nrg3033 . ISSN   1471-0064 . ПМИД   21808261 . S2CID   13965868 . Проверено 2 августа 2011 г.
  24. ^ Папп, Балаж; Пал, Чаба; Херст, Лоуренс Д. (июнь 2004 г.). «Метаболический сетевой анализ причин и эволюции незаменимости ферментов у дрожжей» . Природа . 429 (6992): 661–664. Бибкод : 2004Natur.429..661P . дои : 10.1038/nature02636 . ISSN   1476-4687 . ПМИД   15190353 . S2CID   492849 . Проверено 10 июня 2004 г.
  25. ^ Пал, Чаба; Папп, Балаж; Лерчер, Мартин Дж. (декабрь 2005 г.). «Адаптивная эволюция бактериальных метаболических сетей путем горизонтального переноса генов» . Природная генетика . 37 (12): 1372–1375. дои : 10.1038/ng1686 . ISSN   1546-1718 . ПМИД   16311593 . S2CID   14611750 . Проверено 20 ноября 2005 г.
  26. ^ Пал, Чаба; Папп, Балаж; Лерчер, Мартин Дж.; Чермели, Питер; Оливер, Стивен Г.; Херст, Лоуренс Д. (март 2006 г.). «Шанс и необходимость в эволюции минимальных метаболических сетей» . Природа . 440 (7084): 667–670. Бибкод : 2006Natur.440..667P . дои : 10.1038/nature04568 . ISSN   1476-4687 . ПМИД   16572170 . S2CID   4424895 . Проверено 30 марта 2006 г.
  27. ^ Харрисон, Ричард; Папп, Балаж; Пал, Чаба; Оливер, Стивен Г.; Дельнери, Даниэла (13 февраля 2007 г.). «Пластичность генетических взаимодействий в метаболических сетях дрожжей» . Труды Национальной академии наук . 104 (7): 2307–2312. Бибкод : 2007PNAS..104.2307H . дои : 10.1073/pnas.0607153104 . ISSN   0027-8424 . ПМК   1892960 . ПМИД   17284612 .
  28. ^ Саппанос, Балаж; Ковач, Карой; Шамеч, Бела; Хонти, Франтишек; Костанцо, Майкл; Барышникова Анастасия; Гелиус-Дитрих, Габриэль; Лерчер, Мартин Дж.; Джеласити, Марк; Майерс, Чад Л.; Эндрюс, Бренда Дж.; Бун, Чарльз; Оливер, Стивен Г.; Пал, Чаба; Папп, Балаж (июль 2011 г.). «Комплексный подход к характеристике сетей генетических взаимодействий в метаболизме дрожжей» . Природная генетика . 43 (7): 656–662. дои : 10.1038/ng.846 . ISSN   1546-1718 . ПМЦ   3125439 . ПМИД   21623372 .
  29. ^ Нотебарт, Ричард А.; Саппанос, Балаж; Кинцес, Балинт; Пал, Ференц; Дьёркей, Адам; Богос, Балаж; Лазар, Виктория; Спон, Река; Чёрго, Балинт; Вагнер, Аллан; Руппин, Эйтан; Пал, Чаба; Папп, Балаж (12 августа 2014 г.). «Архитектура сетевого уровня и эволюционный потенциал подземного метаболизма» . Труды Национальной академии наук . 111 (32): 11762–11767. Бибкод : 2014PNAS..11111762N . дои : 10.1073/pnas.1406102111 . ISSN   0027-8424 . ПМК   4136603 . ПМИД   25071190 .
  30. ^ Саппанос, Балаж; Фритцемайер, Джонатан; Чёрго, Балинт; Лазар, Виктория; Лу, Сяовэнь; Фекете, Грегори; Балинт, Балаж; Герцег, Роберт; Надь, Иштван; Нотебарт, Ричард А.; Лерчер, Мартин Дж.; Пал, Чаба; Папп, Балаж (20 мая 2016 г.). «Адаптивная эволюция сложных инноваций посредством поэтапного расширения метаболической ниши» . Природные коммуникации . 7 (1): 11607. Бибкод : 2016NatCo...711607S . дои : 10.1038/ncomms11607 . ISSN   2041-1723 . ПМК   5411730 . ПМИД   27197754 .
  31. ^ Лазар, Виктория; Пал Сингх, Гаджиндер; Спон, Река; Надь, Иштван; Хорват, Балаж; Хртян, Моника; Буса-Фекете, Роберт; Богос, Балаж; Бехи, Орсоля; Чёрго, Балинт; Посфаи, Дьердь; Фекете, Грегори; Саппанос, Балаж; Кегль, Балаж; Папп, Балаж; Пал, Чаба (2013). «Бактериальная эволюция гиперчувствительности к антибиотикам» . Молекулярная системная биология . 9 : 700. дои : 10.1038/msb.2013.57 . ПМЦ   3817406 . ПМИД   24169403 .
  32. ^ Бокор, Дора (11 июня 2018 г.). «Направленная эволюция нескольких геномных локусов позволяет прогнозировать устойчивость к антибиотикам» . MTA.hu (на венгерском языке) . Проверено 11 июня 2018 г.
  33. ^ Пал, Чаба; Папп, Балаж; Посфаи, Дьердь (28 мая 2014 г.). «Рассвет эволюционной геномной инженерии» . Обзоры природы Генетика . 15 (7): 504–512. дои : 10.1038/nrg3746 . ISSN   1471-0056 . ПМИД   24866756 . S2CID   6854503 . Проверено 28 мая 2014 г.
  34. ^ Ньергес, Акос; Чёрго, Балинт; Надь, Иштван; Латиновичс, Дора; Шамеч, Бела; Посфаи, Дьёрдь; Пал, Чаба (1 апреля 2014 г.). «Мутанты с условной репарацией ДНК позволяют осуществлять высокоточную геномную инженерию» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (8): е62. дои : 10.1093/нар/gku105 . ISSN   0305-1048 . ПМК   4005651 . ПМИД   24500200 .
  35. ^ Ньергес, Акос; Чёрго, Балинт; Надь, Иштван; Балинт, Балаж; Бихари, Питер; Лазар, Виктория; Апьок, Габор; Уменхоффер, Кинга; Богос, Балаж; Посфаи, Дьердь; Пал, Чаба (11 февраля 2016 г.). «Высокоточный и портативный метод геномной инженерии позволяет сравнивать мутационные эффекты разных видов бактерий» . Труды Национальной академии наук . 113 (9): 2502–2507. Бибкод : 2016PNAS..113.2502N . дои : 10.1073/pnas.1520040113 . ISSN   0027-8424 . ПМЦ   4780621 . ПМИД   26884157 .
  36. ^ «Премия Либена» . Arc.Ask3.Ru . 17 января 2020 г. Проверено 29 января 2020 г.
  37. ^ «Чаба Пал» . stipendien.oeaw.ac.at . Архивировано из оригинала 10 апреля 2019 года . Проверено 17 ноября 2008 г.
  38. ^ «Биолог Чаба Пал выиграл премию Бояи в 2015 году» . Премия Боляи переехала на официальный сайт . Проверено 17 мая 2015 г.
  39. ^ «Боляй-диж – 2015» . National Geographic (на венгерском языке). 18 мая 2015 года . Проверено 18 мая 2015 г.
  40. ^ «Биолог Чаба Пал удостоен премии Бояи в этом году» . www.t-systems.hu . Проверено 18 мая 2015 г.
  41. ^ «Биолог Чаба Пал получил в этом году премию Бояи» . hirado.hu (на венгерском языке) . Проверено 17 мая 2015 г.
  42. ^ «Академические почести Генеральной Ассамблеи» . 3 мая 2021 г.
  43. ^ «Календарь событий» .
  44. ^ «Антибиотики и устойчивые бактерии – основная лекция Чабы Пала (14 марта 2023 г.)» . Ютуб .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 4412e268473cd86f5948ef7bc83d0e5d__1718648160
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/44/5d/4412e268473cd86f5948ef7bc83d0e5d.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Csaba Pal - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)