PCGF1

PCGF1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4HPL, 4HPM
Идентификаторы
Псевдонимы	PCGF1 , 2010002K04Rik, NSPC1, RNF3A-2, RNF68, безымянный палец группы поликомбов 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 610231 ; МГИ : 1917087 ; Гомологен : 13090 ; Генные карты : PCGF1 ; OMA : PCGF1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	74,507,695 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	83,057,836 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	oocyte; ; secondary oocyte; ; granulocyte; ; mucosa of transverse colon; ; right lobe of liver; ; right hemisphere of cerebellum; ; pituitary gland; ; body of stomach; ; body of pancreas; ; right uterine tube;
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; zygote; ; primary oocyte; ; adrenal gland; ; genital tubercle; ; bone marrow; ; morula; ; neural layer of retina; ; olfactory bulb; ; pancreas;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein C-terminus binding; protein binding; metal ion binding; promoter-specific chromatin binding;
Cellular component	PcG protein complex; nucleus; nucleoplasm; PRC1 complex;
Biological process	histone H2A monoubiquitination; transcription, DNA-templated; regulation of transcription, DNA-templated; histone H2A-K119 monoubiquitination; negative regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	84759
	69837
	ENSG00000115289
	ENSMUSG00000069678
	Q9BSM1
	Q8R023
	НМ_032673
	НМ_197992
	НП_116062
	НП_932109 ; НП_001390487 ; НП_001390488 ; НП_001390489 ; НП_001390490
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 1 RING-пальца группы Polycomb , PCGF1, также известный как NSPC1 или RNF68, представляет собой домена RING-пальца белок , который у людей кодируется PCGF1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

PCGF1 является компонентом, определяющим неканонический полигребневидный репрессивный комплекс 1.1 (ncPRC1), взаимодействующий с RING1A/B , RYBP , BCOR и KDM2B . ^{[ 7 ]} PCGF1-BCOR собирается через убиквитин-подобный домен RAWUL PCGF1 и рекрутируется на хроматине в сайтах KDM2B . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} В составе PRC1-подобного комплекса PCGF1 регулирует RING1B активность убиквитинлигазы , которая катализирует убиквитинирование Lys119 на гистоне H2A. ^{[ 11 ]} что затем приводит к рекрутированию PRC2 и H3K27me3 для эффективной инициации домена полисоты и опосредования репрессии генов. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000115289 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000069678 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нуньес М., Блан И., Мэйс Дж., Феллоус М., Роберт Б., МакЭлриви К. (апрель 2001 г.). «NSPc1, новый ген Polycomb млекопитающих, экспрессируется в структурах периферической нервной системы, происходящих из нервного гребня» . Механизмы развития . 102 (1–2): 219–22. дои : 10.1016/S0925-4773(01)00288-X . ПМИД 11287196 . S2CID 8344430 .
^ «Ген Энтреза: безымянный палец 1 полисотовой группы PCGF1» .
^ Гао З., Чжан Дж., Бонасио Р., Стрино Ф., Савай А., Паризи Ф. и др. (февраль 2012 г.). «Гомологи PCGF, белки CBX и RYBP определяют функционально различные комплексы семейства PRC1» . Молекулярная клетка . 45 (3): 344–56. doi : 10.1016/j.molcel.2012.01.002 . ПМК 3293217 . ПМИД 22325352 .
^ Вонг С.Дж., Геархарт, М.Д., Тейлор А.Б., Наньес Д.Р., Ха Дж., Робинсон А.К. и др. (октябрь 2016 г.). «Привлечение KDM2B комплекса Polycomb Group, PRC1.1, требует сотрудничества между PCGF1 и BCORL1» . Структура . 24 (10): 1795–1801. дои : 10.1016/j.str.2016.07.011 . ПМК 5088048 . ПМИД 27568929 .
^ Джунко С.Е., Ван Р., Гайпа Дж.К., Тейлор А.Б., Ширф В., Геархарт, доктор медицинских наук и др. (апрель 2013 г.). «Структура белка группы полисот PCGF1 в комплексе с BCOR раскрывает основу селективности связывания гомологов PCGF» . Структура . 21 (4): 665–71. дои : 10.1016/j.str.2013.02.013 . ПМЦ 4003909 . ПМИД 23523425 .
^ Фаркас А.М., Блэкледж Н.П., Садбери И., Лонг Х.К., МакГуран Дж.Ф., Роуз Н.Р. и др. (декабрь 2012 г.). Струл К. (ред.). «KDM2B связывает репрессивный комплекс Polycomb 1 (PRC1) с распознаванием CpG-островков» . электронная жизнь . 1 : е00205. doi : 10.7554/eLife.00205 . ПМЦ 3524939 . ПМИД 23256043 .
^ Тахербхой А.М., Хуанг О.В., Кокран А.Г. (июль 2015 г.). «BMI1-RING1B представляет собой аутоингибированную убиквитинлигазу RING E3» . Природные коммуникации . 6 : 7621. Бибкод : 2015NatCo...6.7621T . дои : 10.1038/ncomms8621 . ПМИД 26151332 .
^ Тамбурри С., Лавароне Е., Фернандес-Перес Д., Конвей Е., Занотти М., Манганаро Д., Пасини Д. (февраль 2020 г.). «Моноубиквитинирование гистона H2AK119 необходимо для репрессии транскрипции, опосредованной Polycomb» . Молекулярная клетка . 77 (4): 840–856.e5. дои : 10.1016/j.molcel.2019.11.021 . ПМЦ 7033561 . ПМИД 31883952 .
^ Фурсова Н.А., Блэкледж Н.П., Накаяма М., Ито С., Косеки Ю., Фаркас А.М. и др. (июнь 2019 г.). «Синергия между вариантными комплексами PRC1 определяет репрессию генов, опосредованную Polycomb» . Молекулярная клетка . 74 (5): 1020–1036.e8. doi : 10.1016/j.molcel.2019.03.024 . ПМК 6561741 . ПМИД 31029541 .
^ Блэкледж Н.П., Фаркас А.М., Кондо Т., Кинг Х.В., Макгуран Дж.Ф., Ханссен Л.Л. и др. (июнь 2014 г.). «Вариант PRC1-комплекс-зависимого убиквитилирования H2A стимулирует рекрутирование PRC2 и образование полисотового домена» . Клетка . 157 (6): 1445–1459. дои : 10.1016/j.cell.2014.05.004 . ПМК 4048464 . ПМИД 24856970 .

Дальнейшее чтение

Валк-Лингбек М.Э., Брюггеман С.В., ван Лохейзен М. (август 2004 г.). «Стволовые клетки и рак: полисотовая связь» . Клетка . 118 (4): 409–18. дои : 10.1016/j.cell.2004.08.005 . ПМИД 15315754 . S2CID 16542938 .
Гун Ю, Юэ Дж, Ву X, Ван X, Вэнь Дж, Лу Л и др. (2007). «NSPc1 представляет собой регулятор роста клеток, который действует как репрессор транскрипции p21Waf1/Cip1 через элемент RARE» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (21): 6158–69. дои : 10.1093/нар/gkl834 . ПМЦ 1693893 . ПМИД 17088287 .
Gearhart MD, Corcoran CM, Wamstad JA, Bardwell VJ (сентябрь 2006 г.). «Группа Polycomb и убиквитинлигазы SCF обнаружены в новом комплексе BCOR, который рекрутируется на мишени BCL6» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (18): 6880–9. дои : 10.1128/MCB.00630-06 . ПМК 1592854 . ПМИД 16943429 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Гун Ю, Ван Х, Лю Дж, Ши Л, Инь Б, Пэн Х и др. (январь 2005 г.). «NSPc1, преимущественно ядерный белок новых членов семейства PcG, обладает активностью репрессии транскрипции, связанной с его сайтом фосфорилирования PKC в S183» . Письма ФЭБС . 579 (1): 115–21. дои : 10.1016/j.febslet.2004.11.056 . ПМИД 15620699 . S2CID 28187618 .
Сугишита Х., Кондо Т., Ито С. и др. (сентябрь 2021 г.). «Вариант PCGF1-PRC1 связывает рекрутирование PRC2 с инактивацией транскрипции, связанной с дифференцировкой, в генах-мишенях» . Нат Коммун . 12 (5341): 5341. Бибкод : 2021NatCo..12.5341S . дои : 10.1038/s41467-021-24894-z . ПМЦ 8429492 . ПМИД 34504070 .

статья о гене на хромосоме 2 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000115289 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000069678 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid11287196-5] Нуньес М., Блан И., Мэйс Дж., Феллоус М., Роберт Б., МакЭлриви К. (апрель 2001 г.). «NSPc1, новый ген Polycomb млекопитающих, экспрессируется в структурах периферической нервной системы, происходящих из нервного гребня» . Механизмы развития . 102 (1–2): 219–22. дои : 10.1016/S0925-4773(01)00288-X . ПМИД 11287196 . S2CID 8344430 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: безымянный палец 1 полисотовой группы PCGF1» .

[7] Гао З., Чжан Дж., Бонасио Р., Стрино Ф., Савай А., Паризи Ф. и др. (февраль 2012 г.). «Гомологи PCGF, белки CBX и RYBP определяют функционально различные комплексы семейства PRC1» . Молекулярная клетка . 45 (3): 344–56. doi : 10.1016/j.molcel.2012.01.002 . ПМК 3293217 . ПМИД 22325352 .

[8] Вонг С.Дж., Геархарт, М.Д., Тейлор А.Б., Наньес Д.Р., Ха Дж., Робинсон А.К. и др. (октябрь 2016 г.). «Привлечение KDM2B комплекса Polycomb Group, PRC1.1, требует сотрудничества между PCGF1 и BCORL1» . Структура . 24 (10): 1795–1801. дои : 10.1016/j.str.2016.07.011 . ПМК 5088048 . ПМИД 27568929 .

[9] Джунко С.Е., Ван Р., Гайпа Дж.К., Тейлор А.Б., Ширф В., Геархарт, доктор медицинских наук и др. (апрель 2013 г.). «Структура белка группы полисот PCGF1 в комплексе с BCOR раскрывает основу селективности связывания гомологов PCGF» . Структура . 21 (4): 665–71. дои : 10.1016/j.str.2013.02.013 . ПМЦ 4003909 . ПМИД 23523425 .

[10] Фаркас А.М., Блэкледж Н.П., Садбери И., Лонг Х.К., МакГуран Дж.Ф., Роуз Н.Р. и др. (декабрь 2012 г.). Струл К. (ред.). «KDM2B связывает репрессивный комплекс Polycomb 1 (PRC1) с распознаванием CpG-островков» . электронная жизнь . 1 : е00205. doi : 10.7554/eLife.00205 . ПМЦ 3524939 . ПМИД 23256043 .

[11] Тахербхой А.М., Хуанг О.В., Кокран А.Г. (июль 2015 г.). «BMI1-RING1B представляет собой аутоингибированную убиквитинлигазу RING E3» . Природные коммуникации . 6 : 7621. Бибкод : 2015NatCo...6.7621T . дои : 10.1038/ncomms8621 . ПМИД 26151332 .

[12] Тамбурри С., Лавароне Е., Фернандес-Перес Д., Конвей Е., Занотти М., Манганаро Д., Пасини Д. (февраль 2020 г.). «Моноубиквитинирование гистона H2AK119 необходимо для репрессии транскрипции, опосредованной Polycomb» . Молекулярная клетка . 77 (4): 840–856.e5. дои : 10.1016/j.molcel.2019.11.021 . ПМЦ 7033561 . ПМИД 31883952 .

[13] Фурсова Н.А., Блэкледж Н.П., Накаяма М., Ито С., Косеки Ю., Фаркас А.М. и др. (июнь 2019 г.). «Синергия между вариантными комплексами PRC1 определяет репрессию генов, опосредованную Polycomb» . Молекулярная клетка . 74 (5): 1020–1036.e8. doi : 10.1016/j.molcel.2019.03.024 . ПМК 6561741 . ПМИД 31029541 .

[14] Блэкледж Н.П., Фаркас А.М., Кондо Т., Кинг Х.В., Макгуран Дж.Ф., Ханссен Л.Л. и др. (июнь 2014 г.). «Вариант PRC1-комплекс-зависимого убиквитилирования H2A стимулирует рекрутирование PRC2 и образование полисотового домена» . Клетка . 157 (6): 1445–1459. дои : 10.1016/j.cell.2014.05.004 . ПМК 4048464 . ПМИД 24856970 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]