HRK (гены)

HRK
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2L58, 2L5B
Идентификаторы
Псевдонимы	HRK , DP5, Harakiri, Harakiri, BCL2 взаимодействующий белок
Внешние идентификаторы	Омим : 603447 ; MGI : 1201608 ; Гомолоэген : 136405 ; GeneCards : HRK ; OMA : HRK - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	116,881,441 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	118,327,543 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	buccal mucosa cell; ; endothelial cell; ; pancreatic ductal cell; ; gonad; ; testicle; ; Brodmann area 23; ; hippocampus proper; ; prefrontal cortex; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex;
	Top expressed in
	dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; Rostral migratory stream; ; trigeminal ganglion; ; striatum of neuraxis; ; primary visual cortex; ; temporal lobe; ; nucleus accumbens; ; Region I of hippocampus proper; ; dorsal striatum;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; mitochondrion;
Biological process	regulation of apoptotic process; positive regulation of protein homooligomerization; positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria; positive regulation of apoptotic process; apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8739
	12123
	ENSG00000135116
	Ensmusg00000046607
	O00198
	P62816
	NM_003806
	NM_007545
	NP_003797
	NP_031571
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Активатор апоптоза Харакири - это белок , который у людей кодируется HRK геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Активатор апоптоза HRK регулирует апоптоз посредством взаимодействия с белками-репрессором смерти Bcl-2 и Bcl-X (L). В белке HRK отсутствует значительная гомология для других членов семейства BCL2, за исключением 8-аминокислотной области, которая была аналогична мотиву гомологии BCL2 гомологии-3 (BH3) BIK. HRK взаимодействует с BCL2 и BCLXL через домен BH3, но не с белками, связанными с BCL2, BCL2, BAK, BAK или BCLXS. HRK локализуется на мембранах внутриклеточных органеллов в схеме, сходной с ранее сообщенным для BCL2 и BCLXL. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

HRK (ген) было показано, что взаимодействует с:

Bcl2-like 1 , ^{[ 5 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} и
Bcl-2 . ^{[ 5 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000135116 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000046607 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Инохара Н., Дин Л., Чен С., Нуньес Г (май 1997). «Харакири, новый регулятор гибели клеток, кодирует белок, который активирует апоптоз и селективно взаимодействует с белками, способствующими выживанию, Bcl-2 и Bcl-X (L)» . Embo j . 16 (7): 1686–94. doi : 10.1093/emboj/16.7.1686 . PMC 1169772 . PMID 9130713 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: HRK Harakiri, BCL2 взаимодействующий белок (содержит только домен BH3)» .
^ Уитфилд Дж., Харада К., Барделл С., Стаддон Дж. М. (ноябрь 2003 г.). «Высокопроизводительные методы для обнаружения димеризации белков семейства BCL-2». Анальный. Биохимия . 322 (2): 170–8. doi : 10.1016/j.ab.2003.07.014 . PMID 14596824 .
^ Имаидзуми К., Морихара Т., Мори Й, Катайма Т., Цуда М., Фуруяма Т., Ванака А., Такеда М., Тохьяма М (март 1999). «Ген, способствующий гибели клеток DP5, который взаимодействует с семейством BCL2, индуцируется во время апоптоза нейронов после воздействия амилоидного бета-белка» . Дж. Биол. Химический 274 (12): 7975–81. doi : 10.1074/jbc.274.12.7975 . PMID 10075695 .
^ Чен Л., Уиллис С.Н., Вей А., Смит Б.Дж., Флетчер Джи, Хиндс М.Г., Колман П.М., Дэй К.Л., Адамс Дж. М., Хуанг, округ Колумбия (февраль 2005 г.). «Дифференциальное нацеливание белков BCL-2 прозервивации с помощью их лигандов только BH3 позволяет комплементарная апоптотическая функция» . Мол Клетка . 17 (3): 393–403. doi : 10.1016/j.molcel.2004.12.030 . PMID 15694340 .

Дальнейшее чтение

Имайзуми К., Морихара Т., Мори Й, Катайма Т., Цуда М., Фуруяма Т., Ванака А., Такеда М., Тохьяма М. (1999). «Ген, способствующий гибели клеток DP5, который взаимодействует с семейством BCL2, индуцируется во время апоптоза нейронов после воздействия амилоидного бета-белка» . Дж. Биол. Химический 274 (12): 7975–81. doi : 10.1074/jbc.274.12.7975 . PMID 10075695 .
Хартли Дж. Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Геном Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Sanz C, Mellstrom B, Link WA, Naranjo JR, Fernandez-Luna JL (2001). «3-зависимая активация мечты интерлейкина участвует в транскрипционном молчании гена апоптотического HRK в гематопоэтических клетках-предшественниках» . Embo j . 20 (9): 2286–92. doi : 10.1093/emboj/20.9.2286 . PMC 125442 . PMID 11331593 .
Bae J, Hsu SY, Leo CP, Zell K, Hsueh AJ (2001). «Недофосфорилированный плохой взаимодействие с разнообразными антиапоптотическими белками семейства BCL-2 для регулирования апоптоза». Апоптоз . 6 (5): 319–30. doi : 10.1023/a: 1011319901057 . PMID 11483855 . S2CID 23119757 .
Wakabayashi T, Kosaka J, Hommura S (2002). «Повышенная регуляция HRK, регулятора гибели клеток, в ганглиозных клетках сетчатки аксотомированной сетчатки крысы». Нейроски. Летал 318 (2): 77–80. doi : 10.1016/s0304-3940 (01) 02487-9 . PMID 11796190 . S2CID 45375137 .
Санз С., Хорита М. Сигнализация и блокада Hamulomica . 87 (9): 903–7. PMID 12217801 .
Jurisicova A, Antenos M, Varmuza S, Tilly JL, Casper RF (2003). «Экспрессия генов, связанных с апоптозом во время преимплантационного развития человека, развития эмбрионов человека: потенциальная роль для продукта гена Харакири и каспазы-3 в фрагментации бластомера» . Мол Гул Воспроизведение 9 (3): 133–41. doi : 10.1093/molehr/gag016 . PMID 12606589 .
Уитфилд Дж., Харада К., Барделл С., Стаддон Дж. М. (2004). «Высокопроизводительные методы для обнаружения димеризации белков семейства BCL-2». Анальный. Биохимия . 322 (2): 170–8. doi : 10.1016/j.ab.2003.07.014 . PMID 14596824 .
Обата Т., Тойота М., Сато А., Сасаки Ю., Оги К, Акино К., Сузуки Х, Мурай М., Кикучи Т., Мита Х, Ито Ф., Исса Дж.П., Токино Т, Имаи К (2004). «Идентификация HRK как мишени эпигенетической инактивации при колоректальном раке и раке желудка». Клин Рак . 9 (17): 6410–8. PMID 14695142 .
Sunayama J, Ando Y, Itoh N, Tomiyama A, Sakurada K, Sugiyama A, Kang D, Tashiro F, Gotoh Y, Kuchino Y, Kitanaka C (2005). «Физическое и функциональное взаимодействие между BH3-белком HRK и митохондриальным пор-образующимся белком p32» . Клеточная гибель отличается . 11 (7): 771–81. doi : 10.1038/sj.cdd.4401418 . PMID 15031724 .
Чен Л., Уиллис С.Н., Вей А., Смит Б.Дж., Флетчер Джи, Хиндс М.Г., Колман П.М., Дэй К.Л., Адамс Дж. М., Хуанг, округ Колумбия (2005). «Дифференциальное нацеливание белков BCL-2 прозервивации с помощью их лигандов только BH3 позволяет комплементарная апоптотическая функция» . Мол Клетка . 17 (3): 393–403. doi : 10.1016/j.molcel.2004.12.030 . PMID 15694340 .
Kuwana T, Bouchier-Hayes L, Chipuk JE, Bonzon C, Sullivan BA, Green DR, Newmeyer DD (2005). «Домены BH3 белков только BH3 по-разному регулируют Bax-опосредованную митохондриальную мембрану промеабилизацию как напрямую, так и косвенно» . Мол Клетка . 17 (4): 525–35. doi : 10.1016/j.molcel.2005.02.003 . PMID 15721256 .
Certo M, Del Gaizo Moore V, Nishino M, Wei G, Korsmeyer S, Armstrong SA, Letai A (2006). «Митохондрии, заполненные сигналами смерти, определяют клеточную зависимость от антиапоптотических членов семейства BCL-2» . Раковая клетка . 9 (5): 351–65. doi : 10.1016/j.ccr.2006.03.027 . PMID 16697956 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 12 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000135116 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000046607 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9130713-5] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Инохара Н., Дин Л., Чен С., Нуньес Г (май 1997). «Харакири, новый регулятор гибели клеток, кодирует белок, который активирует апоптоз и селективно взаимодействует с белками, способствующими выживанию, Bcl-2 и Bcl-X (L)» . Embo j . 16 (7): 1686–94. doi : 10.1093/emboj/16.7.1686 . PMC 1169772 . PMID 9130713 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: HRK Harakiri, BCL2 взаимодействующий белок (содержит только домен BH3)» .

[pmid14596824-7] Уитфилд Дж., Харада К., Барделл С., Стаддон Дж. М. (ноябрь 2003 г.). «Высокопроизводительные методы для обнаружения димеризации белков семейства BCL-2». Анальный. Биохимия . 322 (2): 170–8. doi : 10.1016/j.ab.2003.07.014 . PMID 14596824 .

[pmid10075695-8] Имаидзуми К., Морихара Т., Мори Й, Катайма Т., Цуда М., Фуруяма Т., Ванака А., Такеда М., Тохьяма М (март 1999). «Ген, способствующий гибели клеток DP5, который взаимодействует с семейством BCL2, индуцируется во время апоптоза нейронов после воздействия амилоидного бета-белка» . Дж. Биол. Химический 274 (12): 7975–81. doi : 10.1074/jbc.274.12.7975 . PMID 10075695 .

[pmid15694340-9] Чен Л., Уиллис С.Н., Вей А., Смит Б.Дж., Флетчер Джи, Хиндс М.Г., Колман П.М., Дэй К.Л., Адамс Дж. М., Хуанг, округ Колумбия (февраль 2005 г.). «Дифференциальное нацеливание белков BCL-2 прозервивации с помощью их лигандов только BH3 позволяет комплементарная апоптотическая функция» . Мол Клетка . 17 (3): 393–403. doi : 10.1016/j.molcel.2004.12.030 . PMID 15694340 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]