Теломерный фактор связывания повторов 1
ТЕРФ1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | TERF1 , PIN2, TRBF1, TRF, TRF1, hTRF1-AS, t-TRF1, фактор связывания теломерного повтора 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 600951 ; МГИ : 109634 ; Гомологен : 7570 ; Генные карты : TERF1 ; ОМА : TERF1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Теломерный фактор связывания повторов 1 представляет собой белок , который у человека кодируется TERF1 геном . [5] [6]
Ген
[ редактировать ]Ген TERF1 человека расположен в хромосоме 8 на участках 73 921 097–73 960 357 п.н. Два транскрипта этого гена представляют собой продукты альтернативного сплайсинга. [6] Ген TERF1 также известен как TRF, PIN2 (ингибитор протеиназы 2), TRF1, t-TRF1 и h-TRF1-AS. [7]
Белок
[ редактировать ]Структура белка содержит С-концевой мотив Myb, домен димеризации (гомология TERF) вблизи его N-конца и кислый N-конец.
Субклеточное распределение
[ редактировать ]Клеточное распределение этого ДНК-связывающего белка включает нуклеоплазму , хромосомы , теломерную область, комплекс ядерных теломер , цитоплазму, веретено , ядро , ядрышко и ядерную хромосому.
Функция
[ редактировать ]Ген TERF 1 кодирует специфический для теломер белок, который является компонентом нуклеопротеинового комплекса теломер . Этот белок присутствует в теломерах на протяжении всего клеточного цикла и действует как ингибитор теломеразы , действуя в цис-цис-режиме, ограничивая удлинение отдельных концов хромосом. Известно, что он защищает теломеры млекопитающих от механизмов ДНК, которые используются для восстановления, и в то же время регулирует активность теломеразы. Белок фактора 1, связывающий теломерные повторы, присутствует в теломерах, где отслеживается аспект старения клеток, на протяжении всего типичного процесса клеточного цикла. [7] Прогрессирующая потеря теломерных концов хромосом является важным механизмом определения времени клеточного старения человека. Теломерный фактор повторения 1 (TRF1) представляет собой белок, который связывается на концах теломер.
В конечном итоге белок выполняет функцию ингибитора теломеразы, белкового фермента, который способствует удлинению хромосом путем добавления последовательностей TTAGGG к концам хромосом. Белок действует как цис-регуляторный элемент в процессе ограничения удлинения концов отдельных хромосом, чему способствуют теломераза и последовательности TTAGGG. Структура белка состоит из домена димеризации, расположенного рядом с его аминоконцом, карбоксильного концевого хвоста, который представляет собой свободную карбоксильную группу, завершающую конец белковой цепи, и кислого аминоконца, который представляет собой свободную аминогруппу, которая завершает цепь белка. начало белка.
Биологические процессы
[ редактировать ]Белок также активно участвует в биологических процессах, например, связанных с абсорбцией лекарств, а также в негативной регуляции поддержания теломер посредством процесса полуконсервативной репликации, аналогичного процессу цис-репликации. Кроме того, по мнению Каплана и Кристофера, белок также участвует в биологических процессах положительной регуляции полимеризации микротрубочек и отрицательного контроля процесса репликации ДНК. [8] Этот белок также полезен в биологическом процессе митоза и позитивной регуляции митоза. Он положительно регулирует митотический клеточный цикл. Белок, кодируемый геном TERF 1, также участвует в биологическом процессе деления клеток и негативной регуляции поддержания теломер, осуществляемой ферментом теломеразой.
Помимо функции ингибитора фермента теломеразы в процессе удлинения концов хромосом, белок выполняет и другие функции. Эти функции включают связывание белка, содействие активности гомодимеризации белка, связывание ДНК и облегчение активности гетеродимеризации белка, а также связывание микротрубочек. Кроме того, белок обладает молекулярной функцией связывания теломерной ДНК и двухцепочечной теломерной ДНК. Белок фактора 1, связывающий теломерные повторы, также используется для связывания хроматина и всей активности изгиба ДНК. [7]
Клиническое значение
[ редактировать ]Уровни белка TERF1 коррелируют с длиной теломер при колоректальном раке. Теломеры защищают хромосому от деградации нуклеазами и сквозного слияния. Прогрессирующая потеря теломерных концов хромосом является важным механизмом определения времени клеточного старения человека. Теломерный фактор повторения 1 (TRF1) представляет собой белок, который связывается на концах теломер.Для измерения концентраций TRF1 и взаимосвязей между длиной теломер, теломеразной активностью и уровнями TRF1 в опухоли и нормальной слизистой оболочке толстой кишки из нормальных и опухолевых образцов пациентов, перенесших операцию по поводу колоректального рака, мы проанализировали концентрацию белка TRF1 и активность теломеразы. . В результате высокие уровни TRF1 наблюдались в 68,7% образцов опухолей, тогда как в большинстве нормальных образцов наблюдались отрицательные или слабые концентрации TRF1. Среди образцов опухолей длина теломер была значимо связана с уровнем белка TRF1. В заключение существует связь между длиной теломер и содержанием белка TRF1 в образцах опухолей, что означает, что TRF1 является важным фактором прогрессирования опухоли и, возможно, диагностическим фактором.
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что белок, кодируемый TERF1, взаимодействует со следующими факторами: SALL1 (Sal-like1- Drosophila, белок), ABL (гомолог онкогена вирусного онкогена мышиного лейкоза Абельсона, белок), MAPRE2 (ассоциированный с микротрубочками белок RP/EB, белок), ATM (мутированная атаксия телеангиэктазии, протеинкиназа) , PINX1 (TERF1-взаимодействующий ингибитор теломеразы 1), TINF2 (TERF1-взаимодействующий ядерный фактор теломеразы), TNKS2 (танкираза, фермент) и NME1 (нуклеозиддифосфаткиназа). В заключение, как упоминалось выше, теломерный фактор связывания повторов 1 белок имеет большую часть своих функций, связанных со связыванием компонентов и регуляцией процессов. [8]
Было показано, что TERF1 взаимодействует с:
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147601 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025925 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Шен М., Хаггблом С., Фогт М., Хантер Т., Лу К.П. (январь 1998 г.). «Характеристика и регуляция клеточного цикла родственных человеческих теломерных белков Pin2 и TRF1 позволяют предположить их роль в митозе» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (25): 13618–23. дои : 10.1073/pnas.94.25.13618 . ПМК 28355 . ПМИД 9391075 .
- ^ Перейти обратно: а б «Ген Энтрез: фактор связывания теломерного повтора TERF1 (взаимодействующий с NIMA) 1» .
- ^ Перейти обратно: а б с Гартон М., Лотон К. (август 2013 г.). «Комплексная модель распознавания теломер человека TRF1» . Журнал молекулярной биологии . 425 (16): 2910–21. дои : 10.1016/j.jmb.2013.05.005 . ПМК 3776228 . ПМИД 23702294 .
- ^ Перейти обратно: а б Каплан CW, Kitts CL (июль 2003 г.). «Разница между наблюдаемой и истинной длиной терминального рестрикционного фрагмента зависит от истинной длины TRF и содержания пуринов» . Журнал микробиологических методов . 54 (1): 121–5. дои : 10.1016/s0167-7012(03)00003-4 . ПМИД 12732430 .
- ^ Перейти обратно: а б Киши С., Чжоу XZ, Зив Ю., Кху С., Хилл Д.Э., Шайло Ю., Лу КП (август 2001 г.). «Теломерный белок Pin2/TRF1 как важная мишень ATM в ответ на двухцепочечные разрывы ДНК» . Ж. Биол. Хим . 276 (31): 29282–91. дои : 10.1074/jbc.M011534200 . ПМИД 11375976 .
- ^ Накамура М., Чжоу XZ, Киши С., Лу КП (март 2002 г.). «Участие теломерного белка Pin2/TRF1 в регуляции митотического веретена» . ФЭБС Летт . 514 (2–3): 193–8. дои : 10.1016/s0014-5793(02)02363-3 . ПМИД 11943150 . S2CID 2579290 .
- ^ Носака К., Кавахара М., Масуда М., Сатоми Ю., Нишино Х. (февраль 1998 г.). «Ассоциация нуклеозиддифосфаткиназы nm23-H2 с теломерами человека». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 243 (2): 342–8. дои : 10.1006/bbrc.1997.8097 . ПМИД 9480811 .
- ^ Чжоу XZ, Лу КП (ноябрь 2001 г.). «Белок PinX1, взаимодействующий с Pin2/TRF1, является мощным ингибитором теломеразы» . Клетка . 107 (3): 347–59. дои : 10.1016/s0092-8674(01)00538-4 . ПМИД 11701125 . S2CID 6822193 .
- ^ Нетцер С., Ригер Л., Бреро А., Чжан С.Д., Хинцке М., Кольхасе Дж., Боландер С.К. (декабрь 2001 г.). «SALL1, ген, мутировавший при синдроме Таунса-Брокса, кодирует репрессор транскрипции, который взаимодействует с TRF1/PIN2 и локализуется в прицентромерном гетерохроматине» . Хм. Мол. Жене . 10 (26): 3017–24. дои : 10.1093/hmg/10.26.3017 . ПМИД 11751684 .
- ^ Лю Д., Сафари А., О'Коннор М.С., Чан Д.В., Легелер А., Цинь Дж., Сунъян З. (июль 2004 г.). «PTOP взаимодействует с POT1 и регулирует его локализацию на теломерах». Нат. Клеточная Биол . 6 (7): 673–80. дои : 10.1038/ncb1142 . ПМИД 15181449 . S2CID 11543383 .
- ^ Стелцль Ю, Ворм Ю, Лаловски М, Хениг С, Брембек Ф.Х., Гёлер Х, Стродике М, Ценкнер М, Шенхерр А, Кеппен С, Тимм Дж, Минцлафф С, Абрахам С, Бок Н, Китцманн С, Гёдде А, Токсёз Е , Дроге А., Кробич С., Корн Б., Бирчмайер В., Лерах Х., Ванкер Э.Э. (сентябрь 2005 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка . 122 (6): 957–68. дои : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . ПМИД 16169070 . S2CID 8235923 .
- ^ Ким Ш., Каминкер П., Кампизи Дж. (декабрь 1999 г.). «TIN2, новый регулятор длины теломер в клетках человека» . Нат. Жене . 23 (4): 405–12. дои : 10.1038/70508 . ПМК 4940194 . ПМИД 10581025 .
- ^ Перейти обратно: а б Кук Б.Д., Дайнек Дж.Н., Чанг В., Шостак Г., Смит С. (январь 2002 г.). «Роль родственных поли(АДФ-рибоза) полимераз танкиразы 1 и 2 в теломерах человека» . Мол. Клетка. Биол . 22 (1): 332–42. дои : 10.1128/mcb.22.1.332-342.2002 . ПМЦ 134233 . ПМИД 11739745 .
- ^ Чи СЗ, Лодиш HF (декабрь 2000 г.). «Танкираза представляет собой связанный с аппаратом Гольджи митоген-активируемый субстрат протеинкиназы, который взаимодействует с IRAP в везикулах GLUT4» . Ж. Биол. Хим . 275 (49): 38437–44. дои : 10.1074/jbc.M007635200 . ПМИД 10988299 .
- ^ Перейти обратно: а б Сбодио Дж.И., Лодиш Х.Ф., Чи СЗ (февраль 2002 г.). «Танкираза-2 олигомеризуется с танкиразой-1 и связывается как с TRF1 (фактором связывания повторов теломер 1), так и с IRAP (инсулин-зависимая аминопептидаза)» . Биохим. Дж . 361 (Часть 3): 451–9. дои : 10.1042/0264-6021:3610451 . ПМЦ 1222327 . ПМИД 11802774 .
- ^ Сеймия Х., Смит С. (апрель 2002 г.). «Теломерная поли(АДФ-рибоза) полимераза, танкираза 1, содержит несколько сайтов связывания для фактора связывания теломерного повтора 1 (TRF1) и нового акцептора, белка, связывающего танкиразу массой 182 кДа (TAB182)» . Ж. Биол. Хим . 277 (16): 14116–26. дои : 10.1074/jbc.M112266200 . ПМИД 11854288 .
- ^ Сбодио Джи, Чи СЗ (август 2002 г.). «Идентификация мотива связывания танкиразы, общего для IRAP, TAB182 и TRF1 человека, но не для TRF1 мыши. NuMA содержит этот мотив RXXPDG и является новым партнером танкиразы» . Ж. Биол. Хим . 277 (35): 31887–92. дои : 10.1074/jbc.M203916200 . ПМИД 12080061 .
- ^ Смит С., Гириат И., Шмитт А., де Ланге Т. (ноябрь 1998 г.). «Танкираза, поли(АДФ-рибоза)-полимераза теломер человека». Наука . 282 (5393): 1484–7. CiteSeerX 10.1.1.466.9024 . дои : 10.1126/science.282.5393.1484 . ПМИД 9822378 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Чжун З, Шиуэ Л, Каплан С, де Ланге Т (1992). «Фактор млекопитающих, который связывает теломерные повторы TTAGGG in vitro» . Мол. Клетка. Биол . 12 (11): 4834–43. дои : 10.1128/mcb.12.11.4834 . ПМК 360416 . ПМИД 1406665 .
- Чонг Л., ван Стинсел Б., Брокколи Д., Эрджюмент-Бромаж Х., Ханиш Дж., Темпст П., де Ланге Т. (1995). «Человеческий теломерный белок». Наука . 270 (5242): 1663–7. Бибкод : 1995Sci...270.1663C . дои : 10.1126/science.270.5242.1663 . ПМИД 7502076 . S2CID 25439525 .
- Лу КП, Ханес СД, Хантер Т (1996). «Человеческая пептидил-пролилизомераза, необходимая для регуляции митоза». Природа . 380 (6574): 544–7. Бибкод : 1996Natur.380..544P . дои : 10.1038/380544a0 . ПМИД 8606777 . S2CID 4258406 .
- Билауд Т., Керинг С.Э., Бине-Брассле Э., Анселин К., Поллис А., Гассер С.М., Гилсон Э. (1996). «Телобокс, связанный с Myb мотив связывания теломерной ДНК, обнаруженный в белках дрожжей, растений и человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (7): 1294–303. дои : 10.1093/нар/24.7.1294 . ПМК 145771 . ПМИД 8614633 .
- Брокколи Д., Чонг Л., Ольманн С., Фернальд А.А., Марзилиано Н., ван Стинсел Б., Киплинг Д., Ле Бо М.М., де Ланж Т. (1997). «Сравнение генов человека и мыши, кодирующих теломерный белок TRF1: хромосомная локализация, экспрессия и консервативные белковые домены» . Хм. Мол. Жене . 6 (1): 69–76. дои : 10.1093/hmg/6.1.69 . ПМИД 9002672 .
- Бьянки А., Смит С., Чонг Л., Элиас П., де Ланге Т. (1997). «TRF1 представляет собой димер и изгибает теломерную ДНК» . ЭМБО Дж . 16 (7): 1785–94. дои : 10.1093/emboj/16.7.1785 . ПМЦ 1169781 . ПМИД 9130722 .
- Брокколи Д., Смогожевска А., Чонг Л., де Ланге Т. (1997). «Теломеры человека содержат два различных белка, родственных Myb, TRF1 и TRF2». Нат. Жене . 17 (2): 231–5. дои : 10.1038/ng1097-231 . ПМИД 9326950 . S2CID 41204064 .
- Носака К., Кавахара М., Масуда М., Сатоми Ю., Нишино Х. (1998). «Ассоциация нуклеозиддифосфаткиназы nm23-H2 с теломерами человека». Биохим. Биофиз. Рез. Общий . 243 (2): 342–8. дои : 10.1006/bbrc.1997.8097 . ПМИД 9480811 .
- Нисикава Т., Нагадой А., Ёсимура С., Аймото С., Нисимура Ю. (1998). «Структура раствора ДНК-связывающего домена теломерного белка человека hTRF1» . Структура . 6 (8): 1057–65. дои : 10.1016/S0969-2126(98)00106-3 . ПМИД 9739097 .
- Смит С., Гириат И., Шмитт А., де Ланге Т. (1998). «Танкираза, поли(АДФ-рибоза)-полимераза теломер человека». Наука . 282 (5393): 1484–7. CiteSeerX 10.1.1.466.9024 . дои : 10.1126/science.282.5393.1484 . ПМИД 9822378 .
- Ким Ш., Каминкер П., Камписи Дж. (1999). «TIN2, новый регулятор длины теломер в клетках человека» . Нат. Жене . 23 (4): 405–12. дои : 10.1038/70508 . ПМК 4940194 . ПМИД 10581025 .
- Смогожевска А., ван Стинсель Б., Бьянки А., Ольманн С., Шефер М.Р., Шнапп Г., де Ланге Т. (2000). «Контроль длины теломер человека с помощью TRF1 и TRF2» . Мол. Клетка. Биол . 20 (5): 1659–68. дои : 10.1128/MCB.20.5.1659-1668.2000 . ПМЦ 85349 . ПМИД 10669743 .
- Ву Г, Ли В.Х., Чен П.Л. (2000). «NBS1 и TRF1 колокализуются в телах промиелоцитарного лейкоза во время поздних фаз S/G2 в иммортализованных теломеразо-негативных клетках. Участие NBS1 в альтернативном удлинении теломер» . Ж. Биол. Хим . 275 (39): 30618–22. дои : 10.1074/jbc.C000390200 . ПМИД 10913111 .
- Чи СЗ, Лодиш ХФ (2000). «Танкираза представляет собой связанный с аппаратом Гольджи митоген-активируемый субстрат протеинкиназы, который взаимодействует с IRAP в везикулах GLUT4» . Ж. Биол. Хим . 275 (49): 38437–44. дои : 10.1074/jbc.M007635200 . ПМИД 10988299 .
- Киши С., Вульф Г., Накамура М., Лу КП (2001). «Теломерный белок Pin2/TRF1 индуцирует митотический вход и апоптоз в клетках с короткими теломерами и снижается в опухолях молочной железы человека». Онкоген . 20 (12): 1497–508. дои : 10.1038/sj.onc.1204229 . ПМИД 11313893 . S2CID 25285134 .
- Киши С., Чжоу XZ, Зив Ю., Кху С., Хилл Д.Э., Шайло Ю., Лу КП (2001). «Теломерный белок Pin2/TRF1 как важная мишень ATM в ответ на двухцепочечные разрывы ДНК» . Ж. Биол. Хим . 276 (31): 29282–91. дои : 10.1074/jbc.M011534200 . ПМИД 11375976 .
- Фэйролл Л., Чепмен Л., Мосс Х., де Ланж Т., Роудс Д. (2001). «Структура домена димеризации TRFH теломерных белков человека TRF1 и TRF2» . Мол. Клетка . 8 (2): 351–61. дои : 10.1016/S1097-2765(01)00321-5 . ПМИД 11545737 .
- Чжоу XZ, Лу КП (2001). «Белок PinX1, взаимодействующий с Pin2/TRF1, является мощным ингибитором теломеразы» . Клетка . 107 (3): 347–59. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00538-4 . ПМИД 11701125 . S2CID 6822193 .
- Нисикава Т., Окамура Х., Нагадой А., Кениг П., Роудс Д., Нишимура Ю. (2001). «Структура раствора теломерного ДНК-комплекса TRF1 человека» . Структура 9 (12): 1237–51. дои : 10.1016/S0969-2126(01) 00688-8 ПМИД 11738049 .