Белок аргининметилтрансфераза 5

ПРМТ5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4GQB, 4X60, 4X61, 4X63, 5EML, 5FA5, 5EMJ, 5EMK, 5EMM, 5C9Z
Идентификаторы
Псевдонимы	PRMT5 , HRMT1L5, IBP72, JBP1, SKB1, SKB1Hs, белок аргининметилтрансфераза 5, HSL7
Внешние идентификаторы	Опустить : 604045 ; МГИ : 1351645 ; Гомологен : 4454 ; Генные карты : PRMT5 ; ОМА : PRMT5 — ортологи
Номер ЕС	2.1.1.321
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	22,929,408 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	54,754,982 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; amniotic fluid; ; ganglionic eminence; ; gonad; ; right uterine tube; ; left ovary; ; right ovary; ; gastrocnemius muscle; ; mucosa of transverse colon; ; islet of Langerhans;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; epiblast; ; yolk sac; ; maxillary prominence; ; mandibular prominence; ; genital tubercle; ; otic vesicle; ; somite; ; primitive streak; ; ventricular zone;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	methyltransferase activity; transferase activity; histone methyltransferase activity (H4-R3 specific); transcription corepressor activity; methyl-CpG binding; core promoter sequence-specific DNA binding; protein binding; protein heterodimerization activity; ribonucleoprotein complex binding; histone-arginine N-methyltransferase activity; protein-arginine N-methyltransferase activity; protein-arginine omega-N symmetric methyltransferase activity; identical protein binding; protein-containing complex binding; E-box binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; Golgi apparatus; nucleoplasm; methylosome; nucleus; histone methyltransferase complex; protein-containing complex;
Biological process	regulation of mitotic nuclear division; positive regulation of oligodendrocyte differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; histone H4-R3 methylation; rhythmic process; DNA-templated transcription, termination; negative regulation of cell differentiation; peptidyl-arginine N-methylation; endothelial cell activation; circadian regulation of gene expression; transcription, DNA-templated; spliceosomal snRNP assembly; liver regeneration; methylation; peptidyl-arginine methylation; regulation of ERK1 and ERK2 cascade; regulation of DNA methylation; cell population proliferation; Golgi ribbon formation; protein methylation; negative regulation of nucleic acid-templated transcription; positive regulation of adenylate cyclase-inhibiting dopamine receptor signaling pathway; regulation of signal transduction by p53 class mediator; peptidyl-arginine methylation, to symmetrical-dimethyl arginine; chromatin organization; histone arginine methylation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10419
	27374
	ENSG00000100462
	ENSMUSG00000023110
	О14744
	Q8CIG8
showНМ_001039619 ; НМ_001282953 ; НМ_001282954 ; НМ_001282955 ; НМ_001282956 ;
	NM_006109
	НМ_013768 ; НМ_001313906 ; НМ_001313907
showНП_001034708 ; NP_001269882 ; НП_001269883 ; НП_001269884 ; НП_001269885 ;
	NP_006100
	НП_001300835 ; НП_001300836 ; НП_038796
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок аргинин-N-метилтрансфераза 5 — это фермент , который у человека кодируется PRMT5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} PRMT5 симметрично диметилирует H2AR3, H4R3, H3R2 и H3R8 in vivo, все из которых связаны с рядом регуляторных событий транскрипции. ^{[ 7 ]}

PRMT5 представляет собой высококонсервативную аргининметилтрансферазу, которая перемещается из цитоплазмы в ядро на эмбриональный день ~E8.5 и во время преимплантационного развития на стадии ~4 клеток. ^{[ 8 ]}

Взаимодействия

Было показано, что белок аргининметилтрансфераза 5 взаимодействует с:

КЛНС1А , ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}
Янус киназа 2 , ^{[ 13 ]}
СНРПД3 , ^{[ 11 ]}
СУПТ5Х , ^{[ 14 ]}
MEP50 , ^{[ 9 ]}
РИОК1 , ^{[ 15 ]}^{[ 12 ]}
COPR5 . ^{[ 12 ]}

Было показано, что PRMT5 взаимодействует с CLNS1A , RIOK1 и COPR5 через интерфейс, созданный неглубокой бороздкой, расположенной на бочкообразном домене TIM PRMT5, и консенсусной последовательностью GQF[D/E]DA[E/D], расположенной в концевых областях адаптерные белки. ^{[ 12 ]}^{[ 16 ]} Характеристика взаимодействий, происходящих в канавке связывания между PRMT5 и пептидами, полученными из адаптерных белков, привела к разработке ингибиторов белок-белкового взаимодействия (PPI) , модулирующих связывание между PRMT5 и адаптерными белками. ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]} Кроме того, Асберри и его коллеги синтезировали первый в своем классе низкомолекулярный ингибитор ИПП между PRMT5 и MEP50 . ^{[ 19 ]} Ингибиторы ИПП дополняют множество соединений, непосредственно подавляющих ферментативную активность PRMT5. ^{[ 20 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100462 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023110 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гилбрет М., Ян П., Бартоломеуш Г. и др. (январь 1999 г.). «Негативная регуляция митоза у делящихся дрожжей с помощью shk1, взаимодействующего белка skb1 и его человеческого гомолога Skb1Hs» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (25): 14781–6. дои : 10.1073/pnas.95.25.14781 . ПМК 24526 . ПМИД 9843966 .
^ «Ген Энтреза: белок PRMT5 аргининметилтрансфераза 5» .
^ Стопа Н., Кребс Дж. Э., Шехтер Д. (июнь 2015 г.). «Аргининметилтрансфераза PRMT5: множество ролей в развитии, раке и за его пределами» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 72 (11): 2041–59. дои : 10.1007/s00018-015-1847-9 . ПМЦ 4430368 . ПМИД 25662273 .
^ Ким С., Гунесдоган У и др. (ноябрь 2014 г.). «PRMT5 защищает целостность генома во время глобального деметилирования ДНК в первичных зародышевых клетках и преимплантационных эмбрионах» . Молекулярная клетка . 56 (4): 564–579. дои : 10.1016/j.molcel.2014.10.003 . ПМК 4250265 . ПМИД 25457166 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Фризен В.Дж., Вайс А., Паушкин С. и др. (март 2002 г.). «Новый белковый компонент WD-повторов метилосомы связывает белки Sm» . Ж. Биол. Хим . 277 (10): 8243–7. дои : 10.1074/jbc.M109984200 . ПМИД 11756452 .
^ Крапивинский Г., Пу В., Викман К. и др. (май 1998 г.). «pICln связывается с гомологом дрожжевого белка млекопитающих, участвующим в регуляции морфологии клеток» . Ж. Биол. Хим . 273 (18): 10811–4. дои : 10.1074/jbc.273.18.10811 . ПМИД 9556550 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Фризен В.Дж., Паушкин С., Вайс А. и др. (декабрь 2001 г.). «Метилосома, 20S-комплекс, содержащий JBP1 и pICln, продуцирует модифицированные диметиларгинином белки Sm» . Мол. Клетка. Биол . 21 (24): 8289–300. дои : 10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001 . ПМК 99994 . ПМИД 11713266 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Кржижановский А., Гаспер Р., Адиху Х. и др. (февраль 2021 г.). «Биохимическое исследование взаимодействия pICln, RioK1 и COPR5 с комплексом PRMT5-MEP50» . ХимБиоХим . 22 (11): 1908–1914. дои : 10.1002/cbic.202100079 . ПМК 8252068 . ПМИД 33624332 .
^ Поллак Б.П., Котенко С.В., Хе В. и др. (октябрь 1999 г.). «Человеческий гомолог дрожжевых белков Skb1 и Hsl7p взаимодействует с Jak-киназами и обладает протеин-метилтрансферазной активностью» . Ж. Биол. Хим . 274 (44): 31531–42. дои : 10.1074/jbc.274.44.31531 . ПМИД 10531356 .
^ Квак Ю.Т., Го Дж., Праджапати С. и др. (апрель 2003 г.). «Метилирование SPT5 регулирует его взаимодействие с РНК-полимеразой II и свойствами элонгации транскрипции» . Мол. Клетка . 11 (4): 1055–66. дои : 10.1016/s1097-2765(03)00101-1 . ПМИД 12718890 .
^ Гудериан Г., Питер С., Визнер Дж. и др. (январь 2011 г.). «RioK1, новый взаимодействующий белок аргининметилтрансфераза 5 (PRMT5), конкурирует с pICln за связывание и модулирует состав комплекса PRMT5 и специфичность субстрата» . J Биол Хим . 286 (3): 1976–86. дои : 10.1074/jbc.M110.148486 . ПМК 3023494 . ПМИД 21081503 .
^ Малвани К.М., Бломкис С., Ачарья Н. и др. (август 2020 г.). «Молекулярные основы рекрутирования субстрата в метилосому PRMT5 (препринт)». bioRxiv 10.1101/2020.08.22.256347 .
^ МакКинни, округ Колумбия, Макмиллан Б.Дж., Ранаган М.Дж. и др. (август 2021 г.). «Открытие первого в своем классе ингибитора взаимодействия PRMT5-субстрат-адаптер» . Журнал медицинской химии . 64 (15): 11148–11168. doi : 10.1021/acs.jmedchem.1c00507 . ПМК 9036822 . ПМИД 34342224 . S2CID 236884799 .
^ Кржижановский А., Эссер Л.М., Уиллом А. и др. (ноябрь 2022 г.). «Разработка макроциклических ингибиторов взаимодействия PRMT5-белок-адаптор» . Дж. Мед. Хим . 65 (22): 15300–15311. doi : 10.1021/acs.jmedchem.2c01273 . ПМК 9706563 . ПМИД 36378254 .
^ Эсберри А.М., Цай X, Дэн X и др. (октябрь 2022 г.). «Открытие и биологическая характеристика ингибиторов белок-белкового взаимодействия PRMT5:MEP50» . Журнал медицинской химии . 65 (20): 13793–13812. doi : 10.1021/acs.jmedchem.2c01000 . ПМЦ 11167723 . ПМИД 36206451 . S2CID 252758808 .
^ Фу С., Чжэн Ц, Чжан Д. и др. (декабрь 2022 г.). «Стратегии медицинской химии, нацеленные на PRMT5 для терапии рака». Европейский журнал медицинской химии . 244 : 114842. doi : 10.1016/j.ejmech.2022.114842 . ПМИД 36274274 . S2CID 252956172 .

Дальнейшее чтение

Шварцлер А., Крайенкамп Х.Дж., Рихтер Д. (2000). «Взаимодействие рецептора соматостатина подтипа 1 с человеческим гомологом киназ-связывающего белка Shk1 из дрожжей» . Ж. Биол. Хим . 275 (13): 9557–62. дои : 10.1074/jbc.275.13.9557 . ПМИД 10734105 .
Ро Дж., Чхве С., Сон Ю.Р. и др. (2001). «Prmt5, который образует отдельные гомоолигомеры, является членом семейства протеин-аргинин-метилтрансфераз» . Ж. Биол. Хим . 276 (14): 11393–401. дои : 10.1074/jbc.M008660200 . ПМИД 11152681 .
Брамс Х., Мехеус Л., де Брабандер В. и др. (2001). «Симметричное диметилирование остатков аргинина в сплайсосомном белке Sm B/B' и Sm-подобном белке LSm4 и их взаимодействие с белком SMN» . РНК . 7 (11): 1531–42. дои : 10.1017/S135583820101442X . ПМК 1370196 . ПМИД 11720283 .
Мейстер Г., Эггерт С., Бюлер Д. и др. (2002). «Метилирование белков Sm комплексом, содержащим PRMT5 и предполагаемый фактор сборки U snRNP pICln». Курс. Биол . 11 (24): 1990–4. дои : 10.1016/S0960-9822(01)00592-9 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F501-7 . ПМИД 11747828 . S2CID 14742376 .
Фаббрицио Э., Эль Мессауди С., Полановска Дж. и др. (2003). «Негативная регуляция транскрипции аргининметилтрансферазой II типа PRMT5» . Представитель ЭМБО . 3 (7): 641–5. дои : 10.1093/embo-reports/kvf136 . ПМЦ 1084190 . ПМИД 12101096 .
Цзян Л.К., Вэнь С.Дж., Ван ХИ и др. (2003). «Скрининг белков, которые взаимодействуют с кальпаином, в библиотеке кДНК сердца человека с использованием дрожжевой двухгибридной системы» . Гипертония. Рез . 25 (4): 647–52. дои : 10.1291/hypres.25.647 . ПМИД 12358155 .
Геварт К., Готалс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Нат. Биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Пал С., Юн Р., Датта А. и др. (2003). «Комплекс mSin3A/гистондеацетилаза 2 и PRMT5, содержащий Brg1, участвует в репрессии транскрипции гена-мишени Myc cad» . Мол. Клетка. Биол . 23 (21): 7475–87. дои : 10.1128/MCB.23.21.7475-7487.2003 . ПМК 207647 . ПМИД 14559996 .
Янагида М., Хаяно Т., Ямаути Ю. и др. (2004). «Человеческий фибрилларин образует подкомплекс с p32, связанным с фактором сплайсинга 2, протеинами аргининметилтрансферазами и тубулинами альфа-3 и бета-1, который не зависит от его ассоциации с прерибосомальными рибонуклеопротеиновыми комплексами» . Ж. Биол. Хим . 279 (3): 1607–14. дои : 10.1074/jbc.M305604200 . ПМИД 14583623 .
Джин Дж., Смит Ф.Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3-связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации» . Курс. Биол . 14 (16): 1436–50. Бибкод : 2004CBio...14.1436J . дои : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . ПМИД 15324660 . S2CID 2371325 .
Миранда Т.Б., Хусиал П., Кук Дж.Р. и др. (2004). «Белки D1, D3 и B/B' сплайсосомы Sm асимметрично диметилированы по остаткам аргинина в ядре». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 323 (2): 382–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.08.107 . ПМИД 15369763 .
Пал С., Вишванат С.Н., Эрджумент-Бромейдж Х. и др. (2004). «Человеческий SWI/SNF-ассоциированный PRMT5 метилирует гистон H3 аргинин 8 и отрицательно регулирует экспрессию генов-супрессоров опухолей ST7 и NM23» . Мол. Клетка. Биол . 24 (21): 9630–45. дои : 10.1128/MCB.24.21.9630-9645.2004 . ПМК 522266 . ПМИД 15485929 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000100462 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023110 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9843966-5] Гилбрет М., Ян П., Бартоломеуш Г. и др. (январь 1999 г.). «Негативная регуляция митоза у делящихся дрожжей с помощью shk1, взаимодействующего белка skb1 и его человеческого гомолога Skb1Hs» . Proc Natl Acad Sci США . 95 (25): 14781–6. дои : 10.1073/pnas.95.25.14781 . ПМК 24526 . ПМИД 9843966 .

[entrez-6] «Ген Энтреза: белок PRMT5 аргининметилтрансфераза 5» .

[7] Стопа Н., Кребс Дж. Э., Шехтер Д. (июнь 2015 г.). «Аргининметилтрансфераза PRMT5: множество ролей в развитии, раке и за его пределами» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 72 (11): 2041–59. дои : 10.1007/s00018-015-1847-9 . ПМЦ 4430368 . ПМИД 25662273 .

[8] Ким С., Гунесдоган У и др. (ноябрь 2014 г.). «PRMT5 защищает целостность генома во время глобального деметилирования ДНК в первичных зародышевых клетках и преимплантационных эмбрионах» . Молекулярная клетка . 56 (4): 564–579. дои : 10.1016/j.molcel.2014.10.003 . ПМК 4250265 . ПМИД 25457166 .

[pmid11756452-9] Перейти обратно: ^а ^б Фризен В.Дж., Вайс А., Паушкин С. и др. (март 2002 г.). «Новый белковый компонент WD-повторов метилосомы связывает белки Sm» . Ж. Биол. Хим . 277 (10): 8243–7. дои : 10.1074/jbc.M109984200 . ПМИД 11756452 .

[pmid9556550-10] Крапивинский Г., Пу В., Викман К. и др. (май 1998 г.). «pICln связывается с гомологом дрожжевого белка млекопитающих, участвующим в регуляции морфологии клеток» . Ж. Биол. Хим . 273 (18): 10811–4. дои : 10.1074/jbc.273.18.10811 . ПМИД 9556550 .

[pmid11713266-11] Перейти обратно: ^а ^б Фризен В.Дж., Паушкин С., Вайс А. и др. (декабрь 2001 г.). «Метилосома, 20S-комплекс, содержащий JBP1 и pICln, продуцирует модифицированные диметиларгинином белки Sm» . Мол. Клетка. Биол . 21 (24): 8289–300. дои : 10.1128/MCB.21.24.8289-8300.2001 . ПМК 99994 . ПМИД 11713266 .

[Krzyzanowski_2021-12] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Кржижановский А., Гаспер Р., Адиху Х. и др. (февраль 2021 г.). «Биохимическое исследование взаимодействия pICln, RioK1 и COPR5 с комплексом PRMT5-MEP50» . ХимБиоХим . 22 (11): 1908–1914. дои : 10.1002/cbic.202100079 . ПМК 8252068 . ПМИД 33624332 .

[pmid10531356-13] Поллак Б.П., Котенко С.В., Хе В. и др. (октябрь 1999 г.). «Человеческий гомолог дрожжевых белков Skb1 и Hsl7p взаимодействует с Jak-киназами и обладает протеин-метилтрансферазной активностью» . Ж. Биол. Хим . 274 (44): 31531–42. дои : 10.1074/jbc.274.44.31531 . ПМИД 10531356 .

[pmid12718890-14] Квак Ю.Т., Го Дж., Праджапати С. и др. (апрель 2003 г.). «Метилирование SPT5 регулирует его взаимодействие с РНК-полимеразой II и свойствами элонгации транскрипции» . Мол. Клетка . 11 (4): 1055–66. дои : 10.1016/s1097-2765(03)00101-1 . ПМИД 12718890 .

[pmid21081503-15] Гудериан Г., Питер С., Визнер Дж. и др. (январь 2011 г.). «RioK1, новый взаимодействующий белок аргининметилтрансфераза 5 (PRMT5), конкурирует с pICln за связывание и модулирует состав комплекса PRMT5 и специфичность субстрата» . J Биол Хим . 286 (3): 1976–86. дои : 10.1074/jbc.M110.148486 . ПМК 3023494 . ПМИД 21081503 .

[16] Малвани К.М., Бломкис С., Ачарья Н. и др. (август 2020 г.). «Молекулярные основы рекрутирования субстрата в метилосому PRMT5 (препринт)». bioRxiv 10.1101/2020.08.22.256347 .

[pmid34342224-17] МакКинни, округ Колумбия, Макмиллан Б.Дж., Ранаган М.Дж. и др. (август 2021 г.). «Открытие первого в своем классе ингибитора взаимодействия PRMT5-субстрат-адаптер» . Журнал медицинской химии . 64 (15): 11148–11168. doi : 10.1021/acs.jmedchem.1c00507 . ПМК 9036822 . ПМИД 34342224 . S2CID 236884799 .

[pmid36378254-18] Кржижановский А., Эссер Л.М., Уиллом А. и др. (ноябрь 2022 г.). «Разработка макроциклических ингибиторов взаимодействия PRMT5-белок-адаптор» . Дж. Мед. Хим . 65 (22): 15300–15311. doi : 10.1021/acs.jmedchem.2c01273 . ПМК 9706563 . ПМИД 36378254 .

[pmid36206451-19] Эсберри А.М., Цай X, Дэн X и др. (октябрь 2022 г.). «Открытие и биологическая характеристика ингибиторов белок-белкового взаимодействия PRMT5:MEP50» . Журнал медицинской химии . 65 (20): 13793–13812. doi : 10.1021/acs.jmedchem.2c01000 . ПМЦ 11167723 . ПМИД 36206451 . S2CID 252758808 .

[pmid36274274-20] Фу С., Чжэн Ц, Чжан Д. и др. (декабрь 2022 г.). «Стратегии медицинской химии, нацеленные на PRMT5 для терапии рака». Европейский журнал медицинской химии . 244 : 114842. doi : 10.1016/j.ejmech.2022.114842 . ПМИД 36274274 . S2CID 252956172 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]