Ну мы

Мартф5
Идентификаторы
Псевдонимы	Marchf5 , March-V, Mitol, RNF153, Membrane, связанный с кольцом-CH Pinger 5, 5 марта
Внешние идентификаторы	Омим : 610637 ; MGI : 1915207 ; Гомологен : 9862 ; Genecards : Marchf5 ; OMA : март5 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	92,353,964 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	37,199,550 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	sperm; ; secondary oocyte; ; ganglionic eminence; ; islet of Langerhans; ; cartilage tissue; ; right adrenal gland; ; right adrenal cortex; ; ventricular zone; ; minor salivary glands; ; amniotic fluid;
	Top expressed in
	zygote; ; ventricular zone; ; right kidney; ; muscle of thigh; ; tail of embryo; ; primary visual cortex; ; genital tubercle; ; superior frontal gyrus; ; embryo; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	GTPase binding; zinc ion binding; protein binding; metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity; transferase activity;
Cellular component	integral component of membrane; mitochondrial outer membrane; endoplasmic reticulum membrane; endoplasmic reticulum; membrane; mitochondrion;
Biological process	protein localization to mitochondrion; protein polyubiquitination; regulation of mitochondrial fission; positive regulation of mitochondrial fission; protein ubiquitination; protein autoubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	54708
	69104
	ENSG00000198060
	EMSMUSM0000000023307
	Q9NX47
	Q3KNM2
	NM_017824
	NM_001164336 ; NM_001164337 ; NM_027314 ; NM_001378797 ; NM_001378798
	NP_060294
	NP_001157808 ; NP_001157809 ; NP_081590 ; NP_001365726 ; NP_001365727
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

E3 убиквитин-белковой лигаза March5 , также известный как мембрана, ассоциированная с мембраной безымянным пальцем (C3HC4) 5 , является ферментом , который у людей кодируется марта геном . Он локализован в внешней мембране митохондрий и имеет четыре трансмембранных домена. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Структура

Ген

Ген человека 5 марта , также известный как Mitol или RNF153 , имеет 7 экзонов и расположены в диапазоне хромосом 10Q23.32-Q23.33. ^{[ 6 ]}

Белок

Белок E3-белка E3-белка E3-белка-белка March5, член семейства белков трансмембранного кольца-рингера ^{[ 8 ]} Размер 31 кДа и состоит из 278 аминокислот с N-концевым доменом цинкового пальца в аминокислотной последовательности 6-75 и четырех С-концевых трансмембранных пролета. ^{[ 7 ]} Теоретический ИП этого белка составляет 9,00. ^{[ 9 ]}

Функция

В качестве убиквитиновых лигаз E3 , фермент 5 марта катализирует перенос убиквитина из E2-убиквитина-конъюгирующего фермента в идентифицированный белковый субстрат. Март был сначала идентифицирован как митофузин 2 - и DRP1 -связывающий белок. ^{[ 7 ]} Март 5 способствует убиквитинированию DRP1, а нокдаун 5 марта - РНКи, приводил к ненормальному митохондриальному слиянию. ^{[ 10 ]} Дальнейшие доказательства показывают, что 5 марта специально взаимодействует с митофузином 1 , снижая его уровни во время определенных фаз клеточного цикла . ^{[ 11 ]} Учитывая факты, что март -5 регулирует протеиновый протеостаз DRP1 , митофузина 1 и митофузина 2 , которые являются ключевыми регуляторами митохондриального слияния и деления , март 5 является критическим для регуляции стандартной морфологии митохондрий, а дефицит в ИТ способствует клеточному старению. ^{[ 12 ]}

Клиническое значение

Учитывая, что как DRP1 , так и MAP1B являются субстратами для митола, считается, что митол играет защитную роль против нитросативного стресса-опосредованного нарушения митохондриальной динамики, такой как морфологическая стабильность и транспорт митохондрий. Поскольку значительно снижение экспрессии митола происходит в ответ на старение в нормальных тканях, митол может контролировать старение, регулируя продукцию АФК в митохондриях. ^{[ 13 ]} С патологической точки зрения, в модели нейрональных клеток доминантно-негативный март 5 предотвращает фрагментацию митохондриального во время нейродегенеративного стресса, индуцированного нейроно-специфическим генеральным генератором кислорода 6-гидроксидопамина, ротенона ингибитора I или амилоида-амилоида, связанного с амилоидом. Март также участвует в удалении белков, связанных со специфическими нейродегенеративными расстройствами, такими как атаксин-3 при болезни Мачадо-Джозефа или MSOD1 при боковом амиотрофическом склерозе, вероятно, поддерживающем митохондриальную функцию. ^{[ 14 ]} Март также был связан с рецепторами, похожими на Toll, (TLR), которые распознают различные молекулярные паттерны, связанные с патогенами , и играют критическую роль в врожденном иммунном ответе . ^{[ 15 ]}

Убиквитин-зависимые пути деградации имеют четкую актуальность рака из-за их интегрального участия в контроле качества белка, регуляции иммунных ответов, трансдукции сигнала и регуляции клеточного цикла. ^{[ 16 ]}

Ошибка имени гена в Excel

Как и другие марш и септин генов, при анализе генетических данных, содержащих ген March5 в Microsoft Excel , необходимо проявлять осторожность. ^{[ 17 ]} Это связано с тем, что автозадачная функция Excel рассматривает мартовский ген как дату и преобразование его в стандартный формат даты. Оригинальный текст не может быть восстановлен в результате преобразования. Исследование 2016 года показало, что до 19,6% всех работ в отдельных журналах, которая будет влиять на ошибку имени гена. ^{[ 18 ]} Проблема может быть предотвращена с помощью имени псевдонима, такого как Marchf5, с приготовлением апострофы (') или предварительной формы ячейки в качестве текста.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000198060 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000023307 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Bartee E, Mansouri M, Hovey Nerenberg BT, Gouveia K, Früh K (февраль 2004 г.). «Понижающая регуляция основной гистосовместимости комплексного класса I класса I -убиквитин лигаз человека, связанных с белками вирусной иммунной уклонения от уклонения от вируса» . Журнал вирусологии . 78 (3): 1109–20. doi : 10.1128/jvi.78.3.1109-1120.2004 . PMC 321412 . PMID 14722266 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: март-5, ассоциированный с мембраной безымянный палец (C3HC4) 5» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Накамура Н., Кимура Ю., Токуда М., Хонда С., Хирозе С. (октябрь 2006 г.). «March-V-это новый белок, связывающий митофузин 2 и DRP1, способный изменять морфологию митохондрий» . Embo сообщает . 7 (10): 1019–22. doi : 10.1038/sj.embor.7400790 . PMC 1618377 . PMID 16936636 .
^ Lehner PJ, Hoer S, Dodd R, Duncan LM (октябрь 2005 г.). «Понижающая регуляция рецепторов клеточной поверхности семейством K3 вирусных и клеточных убиквитина E3 -лигаз». Иммунологические обзоры . 207 : 112–25. doi : 10.1111/j.0105-2896.2005.00314.x . PMID 16181331 . S2CID 25567313 .
^ "Uniprot: Q9NX47 - MARH5_HUMAN" .
^ Yonashiro R, Shido S, Kyo S, Fukuda T, Goto E, Matsuki Y, Ohmura-Hoshino M, а затем K, Hotta H, Yamamura H, Anomme R, Yanagi S (август 2006 г.). «Новая митохондриальная убиквитин -лигаза играет критическую роль в митохондриальной динамике » Embo Journal 25 (15): 3618–2 Doi : 10.1038/ sj.emboj.7601 PMC 1538564 . PMID 16874301
^ Park Yy, Cho H (2012). «Митофузин 1 деградируется в фазе G2/M посредством убиквитилирования к марту» . Клеточная деление . 7 (1): 25. doi : 10.1186/1747-1028-7-25 . PMC 3542011 . PMID 23253261 .
^ Park YY, Lee S, Karbowski M, Neutzner A, Youle RJ, Cho H (февраль 2010 г.). «Потеря марта 5 митохондриальная убиквитин-лигаза E3 индуцирует клеточное старение через динамин, связанный с белком 1 и митофузином 1» . Журнал сотовой науки . 123 (Pt 4): 619–26. doi : 10.1242/jcs.061481 . PMC 2818198 . PMID 20103533 .
^ Нагасима С., Токуяма Т., Йонаширо Р., Инатоме Р., Янаги С (май 2014). «Роли митохондриальной убиквитин -лигазы митол/март в митохондриальной динамике и болезнях» . Журнал биохимии . 155 (5): 273–9. doi : 10.1093/jb/mvu016 . PMID 24616159 .
^ Fang L, Li J, Flammer J, Neutzner A (2013). «Инактивация 5 марта поддерживает митохондриальную функцию во время нейродегенеративного стресса» . Границы в клеточной нейробиологии . 7 : 176. doi : 10.3389/fncel.2013.00176 . PMC 3794199 . PMID 24133412 .
^ Shi HX, Liu X, Wang Q, Tang PP, Liu XY, Shan YF, Wang C (май 2011 г.). «Митохондриальная убиквитин -лигаза March5 способствует передаче сигналов TLR7 путем ослабления действия танка» . PLO -патогены . 7 (5): E1002057. doi : 10.1371/journal.ppat.1002057 . PMC 3098239 . PMID 216255535 .
^ Ван Х, Херр Р.А., Хансен Т (декабрь 2008 г.). «Вирусный и клеточный мартовский убиквитин лигазы и рак» . Семинары по биологии рака . 18 (6): 441–50. doi : 10.1016/j.semcancer.2008.09.002 . PMC 2636702 . PMID 18948196 .
^ Zeeberg BR, Riss J, Kane DW, Bussey KJ, Uchio E, Linehan Wm, et al. (Июнь 2004 г.). «Ошибочные идентификаторы: ошибки имени гена могут быть введены непреднамеренно при использовании Excel в биоинформатике» . BMC Bioinformatics . 5 (1): 80. doi : 10.1186/1471-2105-5-80 . PMC 459209 . PMID 15214961 .
^ Ziemann M, Eren Y, El-Osta A (август 2016 г.). «Ошибки имени генов широко распространены в научной литературе» . Биология генома . 17 (1): 177. doi : 10.1186/s13059-016-1044-7 . PMC 4994289 . PMID 27552985 .

^{[ мертвая ссылка ]}

Дальнейшее чтение

Karbowski M, Neutzner A, Youle RJ (Jul 2007). «Митохондриальная убиквитин -лигаза E3 March5 требуется для DRP1 -зависимого митохондриального деления» . Журнал клеточной биологии . 178 (1): 71–84. doi : 10.1083/jcb.200611064 . PMC 2064424 . PMID 17606867 .
Накамура Н., Кимура Ю., Токуда М., Хонда С., Хирозе С. (октябрь 2006 г.). «March-V-это новый белок, связывающий митофузин 2 и DRP1, способный изменять морфологию митохондрий» . Embo сообщает . 7 (10): 1019–22. doi : 10.1038/sj.embor.7400790 . PMC 1618377 . PMID 16936636 .
Yonashiro R, Shido S, Kyo S, Fukuda T, Goto E, Matsuki Y, Ohmura-Hoshino M, а затем K, Hotta H, Yamamura H, Anomme R, Yanagi S (август 2006 г.). «Новая митохондриальная убиквитин -лигаза играет критическую роль в митохондриальной динамике » Embo Journal 25 (15): 3618–2 Doi : 10.1038/ sj.emboj.7601 PMC 1538564 . PMID 16874301
Subramanian A, Andronache A, Li YC, Wade M (февраль 2016 г.). «Ингибирование убиквитин-лигазы в марте отменяет MCL1-зависимую сопротивление миметике BH3 через NOXA» . Oncotarget . 7 (13): 15986–6002. doi : 10.18632/oncotarget.7558 . PMC 4941292 . PMID 26910119 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000198060 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000023307 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid14722266-5] Bartee E, Mansouri M, Hovey Nerenberg BT, Gouveia K, Früh K (февраль 2004 г.). «Понижающая регуляция основной гистосовместимости комплексного класса I класса I -убиквитин лигаз человека, связанных с белками вирусной иммунной уклонения от уклонения от вируса» . Журнал вирусологии . 78 (3): 1109–20. doi : 10.1128/jvi.78.3.1109-1120.2004 . PMC 321412 . PMID 14722266 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: март-5, ассоциированный с мембраной безымянный палец (C3HC4) 5» .

[Nakamura_N_p1-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Накамура Н., Кимура Ю., Токуда М., Хонда С., Хирозе С. (октябрь 2006 г.). «March-V-это новый белок, связывающий митофузин 2 и DRP1, способный изменять морфологию митохондрий» . Embo сообщает . 7 (10): 1019–22. doi : 10.1038/sj.embor.7400790 . PMC 1618377 . PMID 16936636 .

[8] Lehner PJ, Hoer S, Dodd R, Duncan LM (октябрь 2005 г.). «Понижающая регуляция рецепторов клеточной поверхности семейством K3 вирусных и клеточных убиквитина E3 -лигаз». Иммунологические обзоры . 207 : 112–25. doi : 10.1111/j.0105-2896.2005.00314.x . PMID 16181331 . S2CID 25567313 .

[9] "Uniprot: Q9NX47 - MARH5_HUMAN" .

[10] Yonashiro R, Shido S, Kyo S, Fukuda T, Goto E, Matsuki Y, Ohmura-Hoshino M, а затем K, Hotta H, Yamamura H, Anomme R, Yanagi S (август 2006 г.). «Новая митохондриальная убиквитин -лигаза играет критическую роль в митохондриальной динамике » Embo Journal 25 (15): 3618–2 Doi : 10.1038/ sj.emboj.7601 PMC 1538564 . PMID 16874301

[11] Park Yy, Cho H (2012). «Митофузин 1 деградируется в фазе G2/M посредством убиквитилирования к марту» . Клеточная деление . 7 (1): 25. doi : 10.1186/1747-1028-7-25 . PMC 3542011 . PMID 23253261 .

[12] Park YY, Lee S, Karbowski M, Neutzner A, Youle RJ, Cho H (февраль 2010 г.). «Потеря марта 5 митохондриальная убиквитин-лигаза E3 индуцирует клеточное старение через динамин, связанный с белком 1 и митофузином 1» . Журнал сотовой науки . 123 (Pt 4): 619–26. doi : 10.1242/jcs.061481 . PMC 2818198 . PMID 20103533 .

[13] Нагасима С., Токуяма Т., Йонаширо Р., Инатоме Р., Янаги С (май 2014). «Роли митохондриальной убиквитин -лигазы митол/март в митохондриальной динамике и болезнях» . Журнал биохимии . 155 (5): 273–9. doi : 10.1093/jb/mvu016 . PMID 24616159 .

[14] Fang L, Li J, Flammer J, Neutzner A (2013). «Инактивация 5 марта поддерживает митохондриальную функцию во время нейродегенеративного стресса» . Границы в клеточной нейробиологии . 7 : 176. doi : 10.3389/fncel.2013.00176 . PMC 3794199 . PMID 24133412 .

[15] Shi HX, Liu X, Wang Q, Tang PP, Liu XY, Shan YF, Wang C (май 2011 г.). «Митохондриальная убиквитин -лигаза March5 способствует передаче сигналов TLR7 путем ослабления действия танка» . PLO -патогены . 7 (5): E1002057. doi : 10.1371/journal.ppat.1002057 . PMC 3098239 . PMID 216255535 .

[16] Ван Х, Херр Р.А., Хансен Т (декабрь 2008 г.). «Вирусный и клеточный мартовский убиквитин лигазы и рак» . Семинары по биологии рака . 18 (6): 441–50. doi : 10.1016/j.semcancer.2008.09.002 . PMC 2636702 . PMID 18948196 .

[ExcelAteMyDNA-17] Zeeberg BR, Riss J, Kane DW, Bussey KJ, Uchio E, Linehan Wm, et al. (Июнь 2004 г.). «Ошибочные идентификаторы: ошибки имени гена могут быть введены непреднамеренно при использовании Excel в биоинформатике» . BMC Bioinformatics . 5 (1): 80. doi : 10.1186/1471-2105-5-80 . PMC 459209 . PMID 15214961 .

[18] Ziemann M, Eren Y, El-Osta A (август 2016 г.). «Ошибки имени генов широко распространены в научной литературе» . Биология генома . 17 (1): 177. doi : 10.1186/s13059-016-1044-7 . PMC 4994289 . PMID 27552985 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]