АПОМ

АПОМ
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2WEW, 2WEX, 2YG2
Идентификаторы
Псевдонимы	APOM , G3a, HSPC336, NG20, апо-М, аполипопротеин М
Внешние идентификаторы	Опустить : 606907 ; МГИ : 1930124 ; Гомологен : 10308 ; GeneCards : APOM ; ОМА : АПОМ – ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p21.33 Start 31,652,416 bp End 31,658,210 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 17 (mouse) Band 17|17 B1 Start 35,347,973 bp End 35,351,026 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right lobe of liver human kidney gonad renal cortex testicle left testis right testis olfactory zone of nasal mucosa gastrocnemius muscle bone marrow Top expressed in yolk sac left lobe of liver right kidney human fetus human kidney proximal tubule primitive streak fetal liver hematopoietic progenitor cell abdominal wall blastocyst More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function lipid transporter activity antioxidant activity phospholipid binding Cellular component discoidal high-density lipoprotein particle integral component of plasma membrane very-low-density lipoprotein particle spherical high-density lipoprotein particle extracellular region low-density lipoprotein particle high-density lipoprotein particle extracellular space Biological process lipoprotein metabolic process lipid transport negative regulation of plasma lipoprotein oxidation response to glucose high-density lipoprotein particle assembly retinoid metabolic process high-density lipoprotein particle remodeling cholesterol efflux cholesterol homeostasis reverse cholesterol transport high-density lipoprotein particle clearance cellular oxidant detoxification Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 55937 55938 Вместе showENSG00000231974 ENSG00000204444 ENSG00000206409 ENSG00000227567 ENSG00000235754 ENSG00000224290 ENSG00000226215 ENSMUSG00000024391 ЮниПрот О95445 Q9Z1R3 RefSeq (мРНК) НМ_001256169 НМ_019101 НМ_018816 RefSeq (белок) НП_001243098 НП_061974 НП_061286 Местоположение (UCSC) Chr 6: 31,65 – 31,66 Мб Чр 17: 35,35 – 35,35 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

АпоМ
Идентификаторы
Символ	АпоМ
Пфам	ПФ11032
Пфам Клан	CL0116
ИнтерПро	ИПР022734
показывать Доступные белковые структуры: Pfam   structures / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum structure summary

Аполипопротеин М — это аполипопротеин , член липокалина семейства белков , который у человека кодируется APOM геном . Обнаружено, что он связан с липопротеинами высокой плотности и в меньшей степени с липопротеинами низкой плотности и триглицеридами , богатыми липопротеинами . Кодируемый белок секретируется через плазматическую мембрану , но остается мембраносвязанным, где он участвует в транспорте липидов . два варианта транскрипта , кодирующие две разные изоформы , но полностью охарактеризован только один из них. Для этого гена обнаружено У него отсутствует внешний амфипатический мотив, и он уникальным образом секретируется в плазму без расщепления терминального сигнального пептида. Средняя молекулярная масса составляет 21253 Да, а моноизотопная молекулярная масса — 21239 Да.

Дальнейшее чтение

• Альбертелла М.Р., Джонс Х., Томсон В., Олавесен М.Г., Кэмпбелл Р.Д. (сентябрь 1996 г.). «Локализация восьми дополнительных генов в главном комплексе гистосовместимости человека, включая ген, кодирующий бета-субъединицу казеинкиназы II (CSNK2B)». Геномика . 36 (2): 240–251. дои : 10.1006/geno.1996.0459 . ПМИД   8812450 .
• Сюй Н, Чжан XY, Донг X, Экстрём Ю, Йе Q, Нильссон-Эле П (апрель 2002 г.). «Влияние фактора активации тромбоцитов, фактора некроза опухоли и интерлейкина-1альфа на экспрессию аполипопротеина М в клетках HepG2». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 292 (4): 944–950. дои : 10.1006/bbrc.2002.6755 . ПМИД   11944906 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Гроуз Л.Х., Дерге Дж.Г., Клаузнер Р.Д., Коллинз Ф.С. и др. (декабрь 2002 г.). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Чжан XY, Донг X, Чжэн Л., Луо Г.Х., Лю Ю.Х., Экстрём У. и др. (2003). «Специфическая тканевая экспрессия и клеточная локализация аполипопротеина М человека, определяемая гибридизацией in situ». Акта гистохимика . 105 (1): 67–72. дои : 10.1078/0065-1281-00687 . ПМИД   12666989 .
• Рихтер С., Ши Д.К., Пирсон Э.Р., Вольфрум С., Фаянс С.С., Хаттерсли А.Т., Стоффель М. (декабрь 2003 г.). «Регуляция экспрессии гена аполипопротеина М с помощью гена MODY3 ядерного фактора гепатоцитов-1альфа: гаплонедостаточность связана со снижением уровней аполипопротеина М в сыворотке» . Диабет . 52 (12): 2989–2995. дои : 10.2337/диабет.52.12.2989 . ПМИД   14633861 .
• Се Т., Роуэн Л., Агуадо Б., Ахерн М.Э., Мадан А., Цинь С. и др. (декабрь 2003 г.). «Анализ участка III класса главного комплекса гистосовместимости с высокой плотностью генов и его сравнение с мышами» . Геномные исследования . 13 (12): 2621–2636. дои : 10.1101/гр.1736803 . ПМК   403804 . ПМИД   14656967 .
• Чжан XY, Цзяо GQ, Хуртиг М, Донг X, Чжэн Л, Луо GH и др. (2005). «Характер экспрессии аполипопротеина М во время эмбриогенеза мыши и человека». Акта гистохимика . 106 (2): 123–128. дои : 10.1016/j.acthis.2003.11.004 . ПМИД   15147633 .
• Каббара А., Пайе Н., Коттель Д., Фригард Б., Амуэль П., Ламберт Дж.К. (июнь 2004 г.). «Исключение CYP46 и APOM в качестве генов-кандидатов болезни Альцгеймера во французской популяции». Письма по неврологии . 363 (2): 139–143. дои : 10.1016/j.neulet.2004.03.066 . ПМИД   15172102 . S2CID   27752858 .
• Сюй Н., Нильссон-Эле П., Арен Б. (октябрь 2004 г.). «Корреляция аполипопротеина М с лептином и холестерином у нормальных и тучных людей». Журнал пищевой биохимии . 15 (10): 579–582. doi : 10.1016/j.jnutbio.2004.03.001 . ПМИД   15542348 .
• Луо Г, Хуртиг М, Чжан Х, Нильссон-Эле П, Сюй Н (май 2005 г.). «Лептин ингибирует транскрипцию и секрецию аполипопротеина М в клеточной линии гепатомы человека, клетках HepG2» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Молекулярная и клеточная биология липидов . 1734 (2): 198–202. дои : 10.1016/j.bbalip.2005.02.005 . ПМИД   15904876 .
• Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А., Кэмп Д.Г., Монро М.Э., Мур Р.Дж., Смит Р.Д. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . Журнал исследований протеома . 4 (6): 2070–2080. дои : 10.1021/pr0502065 . ПМК   1850943 . ПМИД   16335952 .
• Ню Н, Чжу Х, Лю Ю, Ду Т, Ван Х, Чен Д и др. (январь 2007 г.). «Однонуклеотидные полиморфизмы в проксимальной промоторной области гена аполипопротеина М (апоМ) определяют предрасположенность к развитию диабета 2 типа у ханьцев». Исследования и обзоры диабета/метаболизма . 23 (1): 21–25. дои : 10.1002/dmrr.641 . ПМИД   16572495 . S2CID   21156244 .
• Кристофферсен С., Нильсен Л.Б., Экслер О., Андерссон А., Йонсен А.Х., Дальбек Б. (август 2006 г.). «Выделение и характеристика аполипопротеин М-содержащих липопротеинов человека» . Журнал исследований липидов . 47 (8): 1833–1843. doi : 10.1194/jlr.M600055-JLR200 . ПМИД   16682745 .
• Карлссон Х., Линдквист Х., Тагессон К., Линдал М. (октябрь 2006 г.). «Характеристика изоформ аполипопротеина М в липопротеинах низкой плотности». Журнал исследований протеома . 5 (10): 2685–2690. дои : 10.1021/pr060180x . ПМИД   17022639 .
• Сюй X, Е Q, Сюй Н, Хэ X, Луо G, Чжан X и др. (ноябрь 2006 г.). «Влияние ишемически-реперфузионного повреждения на экспрессию аполипопротеина М в печени». Процедура трансплантации . 38 (9): 2769–2773. doi : 10.1016/j.transproceed.2006.08.133 . ПМИД   17112825 .
• Анстрем Дж., Фабер К., Экслер О., Дальбек Б. (август 2007 г.). «Гидрофобные лигандсвязывающие свойства аполипопротеина М липокалина человека» . Журнал исследований липидов . 48 (8): 1754–1762. doi : 10.1194/jlr.M700103-JLR200 . ПМИД   17525477 .

Внешние ссылки

• Прикладные исследования по апоМ
• человека APOM Расположение генома APOM и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O95445 (человеческий аполипопротеин M) в PDBe-KB .