СУЗ12

СУЗ12
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5IJ7, 5IJ8, 5HYN
Идентификаторы
Псевдонимы	SUZ12 , CHET9, JJAZ1, SUZ12 2-субъединица полигребенчатого репрессивного комплекса, 2-субъединица полигребенчатого репрессивного комплекса, IMMAS
Внешние идентификаторы	Опустить : 606245 ; МГИ : 1261758 ; Гомологен : 32256 ; Генные карты : SUZ12 ; ОМА : SUZ12 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	32,001,038 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	79,924,949 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	trabecular bone; ; mucosa of paranasal sinus; ; buccal mucosa cell; ; Epithelium of choroid plexus; ; pylorus; ; renal medulla; ; seminal vesicula; ; hair follicle; ; cartilage tissue; ; ventricular zone;
	Top expressed in
	medullary collecting duct; ; zygote; ; secondary oocyte; ; renal corpuscle; ; primary oocyte; ; atrioventricular valve; ; saccule; ; ventricular zone; ; tail of embryo; ; otic placode;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	histone methyltransferase activity; sequence-specific DNA binding; chromatin binding; metal ion binding; methylated histone binding; protein binding; RNA binding; RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding; chromatin DNA binding; promoter-specific chromatin binding; histone methyltransferase activity (H3-K27 specific); RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding;
Cellular component	sex chromatin; ESC/E(Z) complex; nucleoplasm; protein-DNA complex; nucleolus; nucleus; RSC-type complex; nuclear body;
Biological process	negative regulation of cell differentiation; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription, DNA-templated; negative regulation of gene expression, epigenetic; positive regulation of cell population proliferation; histone methylation; histone ubiquitination; regulation of transcription, DNA-templated; histone H3-K27 methylation; negative regulation of G0 to G1 transition; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23512
	52615
	ENSG00000178691
	ENSMUSG00000017548
	Q15022
	Q80U70
	НМ_015355 ; НМ_001321207
	НМ_001163018 ; НМ_199196
	НП_001308136 ; НП_056170
	НП_001156490 ; НП_954666
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок Polycomb SUZ12 — это белок , который у человека кодируется SUZ12 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Функция

Этот ген цинкового пальца был идентифицирован в точках разрыва рекуррентной хромосомной транслокации, обнаруженной при стромальной саркоме эндометрия. Рекомбинация этих точек останова приводит к слиянию этого гена и JAZF1 . Белок, кодируемый этим геном, содержит домен цинкового пальца на С-конце кодирующей области. Конкретная функция этого гена пока не определена. ^{[ 8 ]}

SUZ12, как часть репрессивного комплекса Polycomb 2 ( PRC2 ), может участвовать в подавлении хроматина в сочетании с нкРНК HOTAIR , используя свой домен цинкового пальца для связывания молекулы РНК. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000178691 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017548 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . Исследование ДНК . 2 (4): 167–74, 199–210. CiteSeerX 10.1.1.333.6945 . дои : 10.1093/dnares/2.4.167 . ПМИД 8590280 .
^ Кунц Дж.И., Соренг А.Л., Нуччи М., Куо ФК, Паувелс П., ван Ден Берге Х., Дал Син П., Флетчер Дж.А., Склар Дж. (май 2001 г.). «Частое слияние генов JAZF1 и JJAZ1 в стромальных опухолях эндометрия» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (11): 6348–53. Бибкод : 2001PNAS...98.6348K . дои : 10.1073/pnas.101132598 . ПМК 33471 . ПМИД 11371647 .
^ Росс П.Дж., Рагина Н.П., Родригес Р.М., Ягер А.Е., Сирипаттараправат К., Лопес-Корралес Н., Сибелли Дж.Б. (декабрь 2008 г.). «Экспрессия гена Polycomb и триметилирование гистона H3 лизина 27 изменяются во время предимплантационного развития крупного рогатого скота» . Размножение . 136 (6): 777–85. дои : 10.1530/REP-08-0045 . ПМИД 18784248 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: супрессор SUZ12 гомолога zeste 12 (дрозофила)» .
^ Ринн Дж.Л., Кертес М., Ван Дж.К., Скваццо С.Л., Сюй Икс, Бругманн С.А., Гудноф Л.Х., Хелмс Дж.А., Фарнхэм П.Дж., Сигал Э., Чанг ХИ (июнь 2007 г.). «Функциональное разграничение активных и молчащих доменов хроматина в локусах HOX человека с помощью некодирующих РНК» . Клетка . 129 (7): 1311–23. дои : 10.1016/j.cell.2007.05.022 . ПМК 2084369 . ПМИД 17604720 .

Дальнейшее чтение

Бирве А., Сенгупта А.К., Беучл Д., Ларссон Дж., Кеннисон Дж.А., Мюллер Дж. (сентябрь 2001 г.). «Su(z)12, новый ген группы Drosophila Polycomb, консервативный у позвоночных и растений» . Разработка . 128 (17): 3371–9. дои : 10.1242/dev.128.17.3371 . ПМИД 11546753 .
Вайнманн А.С., Бартли С.М., Чжан Т., Чжан М.К., Фарнхэм П.Дж. (октябрь 2001 г.). «Использование иммунопреципитации хроматина для клонирования новых промоторов-мишеней E2F» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (20): 6820–32. дои : 10.1128/MCB.21.20.6820-6832.2001 . ПМК 99859 . ПМИД 11564866 .
Цао Р., Ван Л., Ван Х., Ся Л., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Джонс Р.С., Чжан Ю. (ноябрь 2002 г.). «Роль метилирования лизина 27 гистона H3 в молчании группы Polycomb». Наука . 298 (5595): 1039–43. Бибкод : 2002Sci...298.1039C . дои : 10.1126/science.1076997 . ПМИД 12351676 . S2CID 6265267 .
Кузьмичев А., Нисиока К., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П., Рейнберг Д. (ноябрь 2002 г.). «Активность гистон-метилтрансферазы, связанная с мультибелковым комплексом человека, содержащим усилитель белка Zeste» . Гены и развитие . 16 (22): 2893–905. дои : 10.1101/gad.1035902 . ЧВК 187479 . ПМИД 12435631 .
Петек Э., Дженн Д.Э., Смолле Дж., Биндер Б., Ласингер В., Виндпассингер С., Вагнер К., Кройзель П.М., Керер-Савацки Х. (июль 2003 г.). «Митотическая рекомбинация, опосредованная геном JJAZF1 (KIAA0160), вызывает соматический мозаицизм и новый тип конституциональной микроделеции NF1 у двух детей мозаичной женщины с небольшими проявлениями» . Журнал медицинской генетики . 40 (7): 520–5. дои : 10.1136/jmg.40.7.520 . ПМК 1735521 . ПМИД 12843325 .
Ван Х., Ан В., Цао Р., Ся Л., Эрдьюмент-Бромаж Х., Чаттон Б., Темпст П., Редер Р.Г., Чжан Ю. (август 2003 г.). «mAM способствует превращению с помощью ESET диметила в триметиллизин 9 гистона H3, вызывая репрессию транскрипции» . Молекулярная клетка . 12 (2): 475–87. doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.007 . ПМИД 14536086 .
Хуан Х.И., Ладани М., Сослоу Р.А. (февраль 2004 г.). «Молекулярное обнаружение слияния генов JAZF1-JJAZ1 в стромальных новообразованиях эндометрия с классической и вариантной гистологией: доказательства генетической гетерогенности». Американский журнал хирургической патологии . 28 (2): 224–32. дои : 10.1097/00000478-200402000-00010 . ПМИД 15043312 . S2CID 21043514 .
Цао Р., Чжан И (июль 2004 г.). «SUZ12 необходим как для активности гистон-метилтрансферазы, так и для функции молчания комплекса EED-EZH2» . Молекулярная клетка . 15 (1): 57–67. doi : 10.1016/j.molcel.2004.06.020 . ПМИД 15225548 .
Керер-Савацки Х., Клюве Л., Сандиг С., Кон М., Виммер К., Краммер Ю., Пейрл А., Дженн Д.Е., Хансманн И., Маутнер В.Ф. (сентябрь 2004 г.). «Высокая частота мозаицизма среди больных нейрофиброматозом 1 типа (NF1) с микроделециями, вызванными соматической рекомбинацией гена JJAZ1» . Американский журнал генетики человека . 75 (3): 410–23. дои : 10.1086/423624 . ПМК 1182020 . ПМИД 15257518 .
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж.Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.К., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–5. Бибкод : 2004PNAS..10112130B . дои : 10.1073/pnas.0404720101 . ПМК 514446 . ПМИД 15302935 .
Пасини Д., Бракен А.П., Дженсен М.Р., Лаззерини Денчи Э., Хелин К. (октябрь 2004 г.). «Suz12 необходим для развития мышей и для активности гистон-метилтрансферазы EZH2» . Журнал ЭМБО . 23 (20): 4061–71. дои : 10.1038/sj.emboj.7600402 . ПМК 524339 . ПМИД 15385962 .
Ча ТЛ, Чжоу БП, Ся В, Ву Ю, Ян CC, Чен CT, Пин Б, Отте AP, Хунг MC (октябрь 2005 г.). «Akt-опосредованное фосфорилирование EZH2 подавляет метилирование лизина 27 в гистоне H3». Наука . 310 (5746): 306–10. Бибкод : 2005Sci...310..306C . дои : 10.1126/science.1118947 . ПМИД 16224021 . S2CID 23910845 .
Ли Т.И., Дженнер Р.Г., Бойер Л.А., Гюнтер М.Г., Левин С.С., Кумар Р.М., Шевалье Б., Джонстон С.Э., Коул М.Ф., Исоно К., Косеки Х., Фучики Т., Абэ К., Мюррей Х.Л., Цукер Дж.П., Юань Б., Белл Г.В. , Хербольшаймер Э., Ханнетт Н.М., Сан К., Одом Д.Т., Отте А.П., Волкерт Т.Л., Бартель Д.П., Мелтон Д.А., Гиффорд Д.К., Джениш Р., Янг Р.А. (апрель 2006 г.). «Контроль регуляторов развития с помощью Polycomb в эмбриональных стволовых клетках человека» . Клетка . 125 (2): 301–13. дои : 10.1016/j.cell.2006.02.043 . ПМЦ 3773330 . ПМИД 16630818 .
Фуруно К., Масацугу Т., Сонода М., Сасадзуки Т., Ямамото К. (июль 2006 г.). «Ассоциация группы Polycomb SUZ12 с белком WD-повторения MEP50, который избирательно связывается с гистоном H2A in vitro». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 345 (3): 1051–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.05.014 . ПМИД 16712789 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .
Нуччи М.Р., Харбургер Д., Кунц Дж., Дал Син П., Склар Дж. (январь 2007 г.). «Молекулярный анализ слияния генов JAZF1-JJAZ1 с помощью RT-PCR и флуоресцентной гибридизации in situ в стромальных новообразованиях эндометрия». Американский журнал хирургической патологии . 31 (1): 65–70. дои : 10.1097/01.pas.0000213327.86992.d1 . ПМИД 17197920 . S2CID 36622314 .

Внешние ссылки

ФакторБук СУЗ12

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000178691 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017548 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8590280-5] Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1» . Исследование ДНК . 2 (4): 167–74, 199–210. CiteSeerX 10.1.1.333.6945 . дои : 10.1093/dnares/2.4.167 . ПМИД 8590280 .

[pmid11371647-6] Кунц Дж.И., Соренг А.Л., Нуччи М., Куо ФК, Паувелс П., ван Ден Берге Х., Дал Син П., Флетчер Дж.А., Склар Дж. (май 2001 г.). «Частое слияние генов JAZF1 и JJAZ1 в стромальных опухолях эндометрия» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (11): 6348–53. Бибкод : 2001PNAS...98.6348K . дои : 10.1073/pnas.101132598 . ПМК 33471 . ПМИД 11371647 .

[pmid18784248-7] Росс П.Дж., Рагина Н.П., Родригес Р.М., Ягер А.Е., Сирипаттараправат К., Лопес-Корралес Н., Сибелли Дж.Б. (декабрь 2008 г.). «Экспрессия гена Polycomb и триметилирование гистона H3 лизина 27 изменяются во время предимплантационного развития крупного рогатого скота» . Размножение . 136 (6): 777–85. дои : 10.1530/REP-08-0045 . ПМИД 18784248 .

[entrez-8] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: супрессор SUZ12 гомолога zeste 12 (дрозофила)» .

[Rinn-9] Ринн Дж.Л., Кертес М., Ван Дж.К., Скваццо С.Л., Сюй Икс, Бругманн С.А., Гудноф Л.Х., Хелмс Дж.А., Фарнхэм П.Дж., Сигал Э., Чанг ХИ (июнь 2007 г.). «Функциональное разграничение активных и молчащих доменов хроматина в локусах HOX человека с помощью некодирующих РНК» . Клетка . 129 (7): 1311–23. дои : 10.1016/j.cell.2007.05.022 . ПМК 2084369 . ПМИД 17604720 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]