Изошизомер

Изошизомеры представляют собой пары ферментов рестрикции, специфичных для одной и той же последовательности узнавания . Например, SphI (CGTAC/G) и BbuI (CGTAC/G) являются изошизомерами друг друга. Первый обнаруженный фермент , распознающий данную последовательность, известен как прототип ; все идентифицированные впоследствии ферменты, распознающие эту последовательность, являются изошизомерами. Изошизомеры выделяют из разных штаммов бактерий и поэтому могут требовать разных условий реакции .

В некоторых случаях только один из пары изошизомеров может распознавать как метилированные , так и неметилированные формы сайтов рестрикции . Напротив, другой фермент рестрикции может распознавать только неметилированную форму сайта рестрикции. Это свойство некоторых изошизомеров позволяет идентифицировать состояние метилирования сайта рестрикции при выделении его из бактериального штамма . Например, ферменты рестрикции HpaII и MspI являются изошизомерами, поскольку они оба распознают последовательность 5'-CCGG-3', когда она неметилирована. Но когда второй C последовательности метилирован, только MspI может распознать его, а HpaII — нет.

Фермент, который распознает одну и ту же последовательность, но разрезает ее по-разному, является неошизомером . Неошизомеры представляют собой особый тип (подмножество) изошизомеров. Например, SmaI (CCC/GGG) и XmaI (C/CCGGG) являются неошизомерами друг друга. Аналогично KpnI (GGTAC/C) и Acc65I (G/GTACC) являются неошизомерами друг друга. Фермент, который распознает несколько иную последовательность, но образует те же концы, называется изокаудомером .

Ссылки

• «Изошизомеры в биолабораториях Новой Англии» .