Пункт III

Nla III типа II, представляет собой фермент рестрикции выделенный из Neisseria Lactamica . ^{[ 1 ]} Являясь частью системы модификации рестрикции , Nla III способен предотвращать интеграцию чужеродной ДНК в геном хозяина, разрезая двухцепочечную ДНК на фрагменты в определенных последовательностях. ^{[ 2 ]} Это приводит к дальнейшей деградации фрагментированной чужеродной ДНК и предотвращает ее заражение генома хозяина. ^{[ 3 ]}

Nla III распознает палиндромную и комплементарную последовательность ДНК CATG/GTAC и разрезает за пределами пар оснований GC. Такая схема резки приводит к образованию липких концов с выступами GTAC на 3-футовом конце . ^{[ 4 ]}

Характеристики

Nla III из N. Lactamica содержит два ключевых компонента: метилазу и эндонуклеазу. ^{[ 5 ]} Метилаза имеет решающее значение для распознавания, а эндонуклеаза используется для разрезания. ^{[ 5 ]} Ген ( Nla IIIR) имеет длину 693 п.н. и создает специфическую эндонуклеазу 5'-CATG-3'. ^{[ 6 ]} Гомологом Nla IIIR является IceA1 Helicobacter pylori . ^{[ 6 ]} У H. pylori существует аналогичный ген метилазы, называемый hpyIM , который находится ниже IceA1 . ^{[ 7 ]} ICEA1 представляет собой эндонуклеазу, которая также распознает последовательность 5'-CATG-3'. ^{[ 6 ]} IceA1 у H. pylori аналогичен таковому NlaIII у N. Lactamica .

Nla III содержит белок ICEA , который включает область от 4 до 225 аминокислот. ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]} H. pylori также содержит тот же белок. ^{[ 9 ]} Инфекция H. pylori часто приводит к желудочно-кишечным заболеваниям, таким как язвенная болезнь, аденокарцинома желудка и лимфома. ^{[ 10 ]} Исследователи предполагают, что белки ICEA служат потенциальными маркерами рака желудка. ^{[ 7 ]}

Изошизомеры

Nla III Изошизомеры распознают и разрезают одну и ту же последовательность узнавания 5'-CATG-3'. ^{[ 11 ]} Эндонуклеазы, разрезающие эту последовательность, включают:

Фаэль
Фатл
Хин1 II
Hsp92 II
ЦвиА II
ЛедА1

Приложения

NlaIII можно использовать во многих различных экспериментальных процедурах. ^{[ 12 ]} такой как:

Серийный анализ экспрессии генов ^{[ 4 ]}
Молекулярное клонирование
Сопоставление сайтов ограничений
Генотипирование
Саузерн-блоттинг
Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ)

Ссылки

^ «nlaIIIR - фермент рестрикции типа 2 NlaIII - Neisseria Lactamica - ген и белок nlaIIIR» . www.uniprot.org . Проверено 5 ноября 2020 г.
^ Ситараман, Рамакришнан (2016). «Роль систем рестрикции-модификации ДНК в биологии Bacillus anthracis» . Границы микробиологии . 7:11 . дои : 10.3389/fmicb.2016.00011 . ISSN 1664-302X . ПМК 4722110 . ПМИД 26834729 .
^ Берг, Джереми М.; Тимочко, Джон Л.; Страйер, Люберт (2002). «Ферменты рестрикции: выполнение высокоспецифичных реакций расщепления ДНК» . Биохимия. 5-е издание .
^ Jump up to: ^а ^б Джек Дж. Пастернак (14 июня 2005 г.). Введение в молекулярную генетику человека: механизмы наследственных заболеваний . Джон Уайли и сыновья. ISBN 978-0-471-71917-5 .
^ Jump up to: ^а ^б Морган, доктор медицинских наук; Лагерь, РР; Уилсон, Г.Г.; Сюй, СЮ (12 декабря 1996 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия системы рестрикции-модификации NlaIII в E. coli» . Джин . 183 (1–2): 215–218. дои : 10.1016/s0378-1119(96)00561-6 . ISSN 0378-1119 . ПМИД 8996109 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Сюй, Цин; Морган, доктор медицинских наук; Робертс, Р.Дж.; Сюй, С.Ю.; ван Доорн, LJ; Донахью, JP; Миллер, Г.Г.; Блазер, Мартин Дж. (1 сентября 2002 г.). «Функциональный анализ IceA1, гена CATG-распознающей эндонуклеазы рестрикции Helicobacter pylori» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (17): 3839–3847. дои : 10.1093/nar/gkf504 . ISSN 0305-1048 . ПМК 137426 . ПМИД 12202769 .
^ Jump up to: ^а ^б Сюй, Кью; Пик, Р.М.; Миллер, Г.Г.; Блазер, MJ (1 ноября 1997 г.). «Геном Helicobacter pylori модифицируется в CATG продуктом hpyIM» . Журнал бактериологии . 179 (21): 6807–6815. дои : 10.1128/jb.179.21.6807-6815.1997 . ISSN 0021-9193 . ПМК 179612 . ПМИД 9352933 .
^ «UniProtKB — Q51083 (T2N3_NEILA)» . ЮниПрот . Проверено 2 декабря 2020 г.
^ Вонг, Бенджамин Чун Юй; Берг, Дуглас Э.; Гарри Чжан, Цзянь Чжун; Хуан, Сяо Ру; , Шиу Кум (2001). «Распространение различных аллелей vacA, cagA и IceA у Helicobacter pylori в Гонконге» . Хеликобактер . 6 (4): 317–324 doi : 10.1046 . ISSN 1523-5378 . PMID 11843964 . / j.1523-5378.2001.00040.x .
^ Кустерс, Йоханнес Г.; Влит, фургон Arnoud HM; Кейперс, Эрнст Дж. (1 июля 2006 г.). «Патогенез инфекции Helicobacter pylori» . Обзоры клинической микробиологии . 19 (3): 449–490. дои : 10.1128/CMR.00054-05 . ISSN 0893-8512 . ПМЦ 1539101 . ПМИД 16847081 .
^ «Искатель ферментов» . Биолаборатории Новой Англии . Проверено 23 октября 2020 г.
^ «Hin1II (NlaIII) (5 ед/мкл)» . Термо Фишер Сайентифик . Проверено 3 ноября 2020 г.

Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] «nlaIIIR - фермент рестрикции типа 2 NlaIII - Neisseria Lactamica - ген и белок nlaIIIR» . www.uniprot.org . Проверено 5 ноября 2020 г.

[:0-2] Ситараман, Рамакришнан (2016). «Роль систем рестрикции-модификации ДНК в биологии Bacillus anthracis» . Границы микробиологии . 7:11 . дои : 10.3389/fmicb.2016.00011 . ISSN 1664-302X . ПМК 4722110 . ПМИД 26834729 .

[3] Берг, Джереми М.; Тимочко, Джон Л.; Страйер, Люберт (2002). «Ферменты рестрикции: выполнение высокоспецифичных реакций расщепления ДНК» . Биохимия. 5-е издание .

[Pasternak2005-4] Jump up to: ^а ^б Джек Дж. Пастернак (14 июня 2005 г.). Введение в молекулярную генетику человека: механизмы наследственных заболеваний . Джон Уайли и сыновья. ISBN 978-0-471-71917-5 .

[ref1-5] Jump up to: ^а ^б Морган, доктор медицинских наук; Лагерь, РР; Уилсон, Г.Г.; Сюй, СЮ (12 декабря 1996 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия системы рестрикции-модификации NlaIII в E. coli» . Джин . 183 (1–2): 215–218. дои : 10.1016/s0378-1119(96)00561-6 . ISSN 0378-1119 . ПМИД 8996109 .

[ref2-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Сюй, Цин; Морган, доктор медицинских наук; Робертс, Р.Дж.; Сюй, С.Ю.; ван Доорн, LJ; Донахью, JP; Миллер, Г.Г.; Блазер, Мартин Дж. (1 сентября 2002 г.). «Функциональный анализ IceA1, гена CATG-распознающей эндонуклеазы рестрикции Helicobacter pylori» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (17): 3839–3847. дои : 10.1093/nar/gkf504 . ISSN 0305-1048 . ПМК 137426 . ПМИД 12202769 .

[ref4-7] Jump up to: ^а ^б Сюй, Кью; Пик, Р.М.; Миллер, Г.Г.; Блазер, MJ (1 ноября 1997 г.). «Геном Helicobacter pylori модифицируется в CATG продуктом hpyIM» . Журнал бактериологии . 179 (21): 6807–6815. дои : 10.1128/jb.179.21.6807-6815.1997 . ISSN 0021-9193 . ПМК 179612 . ПМИД 9352933 .

[8] «UniProtKB — Q51083 (T2N3_NEILA)» . ЮниПрот . Проверено 2 декабря 2020 г.

[ref5-9] Вонг, Бенджамин Чун Юй; Берг, Дуглас Э.; Гарри Чжан, Цзянь Чжун; Хуан, Сяо Ру; , Шиу Кум (2001). «Распространение различных аллелей vacA, cagA и IceA у Helicobacter pylori в Гонконге» . Хеликобактер . 6 (4): 317–324 doi : 10.1046 . ISSN 1523-5378 . PMID 11843964 . / j.1523-5378.2001.00040.x .

[10] Кустерс, Йоханнес Г.; Влит, фургон Arnoud HM; Кейперс, Эрнст Дж. (1 июля 2006 г.). «Патогенез инфекции Helicobacter pylori» . Обзоры клинической микробиологии . 19 (3): 449–490. дои : 10.1128/CMR.00054-05 . ISSN 0893-8512 . ПМЦ 1539101 . ПМИД 16847081 .

[11] «Искатель ферментов» . Биолаборатории Новой Англии . Проверено 23 октября 2020 г.

[12] «Hin1II (NlaIII) (5 ед/мкл)» . Термо Фишер Сайентифик . Проверено 3 ноября 2020 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

v т и Система модификации рестрикции : фермент рестрикции.
Основная концепция	Изошизомер неошизомер изокаудомер
Последовательность распознавания 4bp	TaqВсе Сау 3А Алу И* Флаг III* Дпн II Пункт III HP II
Последовательность распознавания 5bp	Эко РИИ Фок я
Последовательность распознавания 6bp	ааа я Бгл II Pov II* Эко- дом на колесах* Эко РИ Бам Привет Хинд III Xba I Джо я Сумка I Пст я Это я
Последовательность распознавания 8bp	Не я
Списки	А Ba–Bc Бд–Бп Бса – Бсо Бсп–Бсс Бст–Бв компакт-диск ЭФ G-K Л.Н. ИЛИ С ТЗ
* означает, что расщепление приводит к тупым концам