ГпаII

HpaII ( IntEnz : EC 3.1.21.4 ) представляет собой фермент рестрикции, полученный из микроорганизма Haemophilus parainfluenzae . Это фермент рестрикции ДНК , поэтому он способен вырезать ДНК из определенного участка, как показано ниже. ^{[ 1 ]} Он обладает способностью образовывать сцепленные концы , которые весьма полезны при конструировании плазмид .

Последовательность распознавания	Вырезать результаты
5' CCGG 3' GGCC	5' C CGG 3' GGC C

HpaII не разрезает сайты, метилированные метилтрансферазой SssI или метилтрансферазой HpaII. Когда сайты метилированы метилтрансферазой MspI, фермент будет разрезать в 300 раз медленнее, чем неметилированная ДНК, и в 50 раз медленнее, если ДНК гемиметилирована. ^{[ 2 ]} Эта особенность используется для определения клонального происхождения млекопитающих опухоли самок с помощью анализа HUMARA .

Ссылки

^ ИнтерПро : IPR019062
^ Макклелланд, М. , Нельсон, М., Рашке, Э. (1994). Nucleic Acids Research 22, № 17, 3640-3659.

[1] ИнтерПро : IPR019062

[2] Макклелланд, М. , Нельсон, М., Рашке, Э. (1994). Nucleic Acids Research 22, № 17, 3640-3659.

[ 1 ]

[ 2 ]

v т и Система модификации рестрикции : фермент рестрикции.
Основная концепция	Изошизомер неошизомер изокаудомер
Последовательность распознавания 4bp	TaqВсе Сау 3А Алу И* Флаг III* Дпн II Пункт III HP II
Последовательность распознавания 5bp	Эко РИИ Фок я
Последовательность распознавания 6bp	ааа я Бгл II Pov II* Эко- дом на колесах* Эко РИ Бам Привет Хинд III Xba I Джо я Сумка I Пст я Это я
Последовательность распознавания 8bp	Не я
Списки	А Ba–Bc Бд–Бп Бса – Бсо Бсп–Бсс Бст–Бв компакт-диск ЭФ G-K Л.Н. ИЛИ С ТЗ
* означает, что расщепление приводит к тупым концам