GZMK

GZMK
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1MZA, 1MZD
Идентификаторы
Псевдонимы	Gzmk , tryp2, granzyme k
Внешние идентификаторы	Омим : 600784 ; MGI : 1298232 ; Гомологен : 20485 ; GeneCards : GZMK ; OMA : GZMK - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	55,034,570 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	113,362,442 bp
showRNA expression pattern
	Top expressed in
	lymph node; ; granulocyte; ; spleen; ; blood; ; appendix; ; testicle; ; gallbladder; ; trabecular bone; ; epithelium of nasopharynx; ; thymus;
	Top expressed in
	tail of embryo; ; Region II of hippocampus proper; ; submandibular gland; ; supramammillary nucleus; ; medial amygdaloid nucleus; ; CA3 field; ; central amygdaloid nucleus; ; blood; ; gastrula; ; lymph node;
	More reference expression data
	More reference expression data
showGene ontology
Molecular function	peptidase activity; serine-type peptidase activity; hydrolase activity; serine-type endopeptidase activity;
Cellular component	extracellular region;
Biological process	proteolysis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideOrthologs
	3003
	14945
	ENSG00000113088
	ENSMUSG00000042385
	P49863
	O35205
	NM_002104
	NM_008196
	NP_002095
	NP_032222
	Wikidata
View/Edit Human	View/Edit Mouse

Гранзим K (GRK) - это белок , который кодируется GZMK геном на хромосоме 5 у людей. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Гранзимы - это семейство сериновых протеаз, которые играют различные внутриклеточные и внеклеточные роли. GRK обнаруживается в гранулах из природных клеток -киллеров (NK) и цитотоксических Т -лимфоцитов (CTL) и традиционно описывается как цитотоксичный по отношению к целевым иностранным, инфицированным или раковым клеткам. NK -клетки и CTL могут вызывать апоптоз через секреторный путь гранулы, который включает в себя секрецию гранзимов наряду с перфорином в иммунологических синапсах .

Внутриклеточно GRK может расщеплять различные субстраты, такие как белок сборки нуклеосом (NAP), ^{[ 7 ]} HMG2, ^{[ 7 ]} и ape1 ^{[ 8 ]} В комплексе, ассоциированном с ER, наряду с другими мишенями, которые оказывают нисходящие цитотоксические эффекты. По сравнению с исследованиями in vitro цитотоксичность GRK у крыс и людей, исследования мыши in vitro не показывают цитотоксический потенциал в отсутствие перфорина, что делает роль спорного GRK. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} In vitro studies show potential extracellular targets for GrK such as the cleavage and activation of protease activated receptors (PAR)-1^[11]^[12] and PAR-2.^[13] Grk binds lipopolysaccharides (LPS) in vitro separately from GrK's catalytic activity.^[14] Активация PAR и LPS с помощью GRK индуцирует выработку цитокинов в исследованиях in vitro .

GrK is important in bacterial and viral^[15] infection control. GrK-expressing CD8+ T cells may be associated with inflammation and aging.^[16]

References

^ Jump up to: ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000113088 – Ensembl, May 2017
^ Jump up to: ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042385 – Ensembl, May 2017
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ Przetak MM, Yoast S, Schmidt BF (May 1995). "Cloning of cDNA for human granzyme 3". FEBS Letters. 364 (3): 268–271. doi:10.1016/0014-5793(95)00407-Z. PMID 7758581. S2CID 29315976.
^ "Entrez Gene: GZMK granzyme K (granzyme 3; tryptase II)".
^ Jump up to: ^a ^b Zhao T, Zhang H, Guo Y, Zhang Q, Hua G, Lu H, Hou Q, Liu H, Fan Z (March 2007). "Granzyme K cleaves the nucleosome assembly protein SET to induce single-stranded DNA nicks of target cells". Cell Death and Differentiation. 14 (3): 489–499. doi:10.1038/sj.cdd.4402040. PMID 17008916. S2CID 6044972.
^ Guo Y, Chen J, Zhao T, Fan Z (April 2008). "Granzyme K degrades the redox/DNA repair enzyme Ape1 to trigger oxidative stress of target cells leading to cytotoxicity". Molecular Immunology. 45 (8): 2225–2235. doi:10.1016/j.molimm.2007.11.020. PMID 18179823.
^ Susanto O, Trapani JA, Brasacchio D (December 2012). "Controversies in granzyme biology". Tissue Antigens. 80 (6): 477–487. doi:10.1111/tan.12014. PMID 23137319.
^ Bouwman AC, van Daalen KR, Crnko S, ten Broeke T, Bovenschen N (2021). "Intracellular and Extracellular Roles of Granzyme K". Frontiers in Immunology. 12: 677707. doi:10.3389/fimmu.2021.677707. ISSN 1664-3224. PMC 8129556. PMID 34017346.
^ Cooper DM, Pechkovsky DV, Hackett TL, Knight DA, Granville DJ (2011-06-30). "Granzyme K activates protease-activated receptor-1". PLOS ONE. 6 (6): e21484. Bibcode:2011PLoSO...621484C. doi:10.1371/journal.pone.0021484. PMC 3128063. PMID 21760880.
^ Sharma M, Merkulova Y, Raithatha S, Parkinson LG, Shen Y, Cooper D, Granville DJ (May 2016). "Extracellular granzyme K mediates endothelial activation through the cleavage of protease-activated receptor-1". The FEBS Journal. 283 (9): 1734–1747. doi:10.1111/febs.13699. PMID 26936634. S2CID 21180451.
^ Kaiserman D, Zhao P, Rowe CL, Leong A, Barlow N, Joeckel LT, Hitchen C, Stewart SE, Hollenberg MD, Bunnett N, Suhrbier A, Bird PI (2022-07-01). "Granzyme K initiates IL-6 and IL-8 release from epithelial cells by activating protease-activated receptor 2". PLOS ONE. 17 (7): e0270584. Bibcode:2022PLoSO..1770584K. doi:10.1371/journal.pone.0270584. PMC 9321427. PMID 35881628.
^ Wensink AC, Kemp V, Fermie J, García Laorden MI, van der Poll T, Hack CE, Bovenschen N (April 2014). "Granzyme K synergistically potentiates LPS-induced cytokine responses in human monocytes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111 (16): 5974–5979. Bibcode:2014PNAS..111.5974W. doi:10.1073/pnas.1317347111. PMC 4000831. PMID 24711407.
^ Zhong C, Li C, Wang X, Toyoda T, Gao G, Fan Z (May 2012). "Granzyme K inhibits replication of influenza virus through cleaving the nuclear transport complex importin α1/β dimer of infected host cells". Cell Death and Differentiation. 19 (5): 882–890. doi:10.1038/cdd.2011.178. PMC 3321629. PMID 22139131.
^ Mogilenko DA, Shpynov O, Andhey PS, Arthur L, Swain A, Esaulova E, Brioschi S, Shchukina I, Kerndl M, Bambouskova M, Yao Z, Laha A, Zaitsev K, Burdess S, Gillfilan S, Stewart SA, Colonna M, Artyomov MN (January 2021). "Comprehensive Profiling of an Aging Immune System Reveals Clonal GZMK⁺ CD8⁺ T Cells as Conserved Hallmark of Inflammaging". Immunity. 54 (1): 99–115.e12. doi:10.1016/j.immuni.2020.11.005. PMID 33271118. S2CID 227282306.

Smyth MJ, O'Connor MD, Trapani JA (November 1996). "Granzymes: a variety of serine protease specificities encoded by genetically distinct subfamilies". Journal of Leukocyte Biology. 60 (5): 555–562. doi:10.1002/jlb.60.5.555. PMID 8929545. S2CID 19732623.
Shi L, Kam CM, Powers JC, Aebersold R, Greenberg AH (December 1992). "Purification of three cytotoxic lymphocyte granule serine proteases that induce apoptosis through distinct substrate and target cell interactions". The Journal of Experimental Medicine. 176 (6): 1521–1529. doi:10.1084/jem.176.6.1521. PMC 2119451. PMID 1460416.
Hameed A, Lowrey DM, Lichtenheld M, Podack ER (November 1988). "Characterization of three serine esterases isolated from human IL-2 activated killer cells". Journal of Immunology. 141 (9): 3142–3147. doi:10.4049/jimmunol.141.9.3142. PMID 3262682.
Baker E, Sayers TJ, Sutherland GR, Smyth MJ (1994). "The genes encoding NK cell granule serine proteases, human tryptase-2 (TRYP2) and human granzyme A (HFSP), both map to chromosome 5q11-q12 and define a new locus for cytotoxic lymphocyte granule tryptases". Immunogenetics. 40 (3): 235–237. doi:10.1007/BF00167085. PMID 8039831. S2CID 37615055.
Sayers TJ, Lloyd AR, McVicar DW, O'Connor MD, Kelly JM, Carter CR, Wiltrout TA, Wiltrout RH, Smyth MJ (May 1996). "Cloning and expression of a second human natural killer cell granule tryptase, HNK-Tryp-2/granzyme 3". Journal of Leukocyte Biology. 59 (5): 763–768. doi:10.1002/jlb.59.5.763. PMID 8656064. S2CID 18065724.
Hink-Schauer C, Estébanez-Perpiñá E, Wilharm E, Fuentes-Prior P, Klinkert W, Bode W, Jenne De (декабрь 2002 г.). «Кристаллическая структура 2.2-A человеческого про-гранзима K выявляет жесткий зимоген с необычными признаками» . Журнал биологической химии . 277 (52): 50923–50933. doi : 10.1074/jbc.m207962200 . PMID 12384499 .
Fajardo I, Pejler G (февраль 2003 г.). «Образование активных мономеров из тетрамерной человеческой бета-триптазы» . Биохимический журнал . 369 (Pt 3): 603–610. doi : 10.1042/bj20021418 . PMC 1223112 . PMID 12387726 .
Чжао Т., Чжан Х., Го Ю., Чжан К., Хуа Г, Лу Х, Хоу Q, Лю Х, Фан З. (март 2007 г.). «Гранзим K расщепляет белок сборки нуклеосомы, чтобы индуцировать одноцепочечные ДНК-ники клеток-мишеней». Гибель клеток и дифференциация . 14 (3): 489–499. doi : 10.1038/sj.cdd.4402040 . PMID 17008916 . S2CID 6044972 .
Чжао Т., Чжан Х, Го Ю., Фан З. (апрель 2007 г.). «Гранзим K непосредственно обрабатывает, чтобы высвободить цитохрома C и эндонуклеазы G, ведущий к митохондриям, зависимой от гибели клеток» . Журнал биологической химии . 282 (16): 12104–12111. doi : 10.1074/jbc.m611006200 . PMID 17308307 .
Ручевич М., Фаст Л.Д., Джей Г.Д., Трапальциос Ф.М., Суси А., Сирьяпорн Е., Лим Й.П. (май 2007). «Измененные уровни и молекулярные формы гранзима K в плазме у пациентов с септикой» . Шок 27 (5): 488–493. doi : 10.1097/01.shk.0000246905.24895.e5 . PMID 17438453 . S2CID 525904 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 5 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000113088 – Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042385 – Ensembl, May 2017

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid7758581-5] Przetak MM, Yoast S, Schmidt BF (May 1995). "Cloning of cDNA for human granzyme 3". FEBS Letters. 364 (3): 268–271. doi:10.1016/0014-5793(95)00407-Z. PMID 7758581. S2CID 29315976.

[entrez-6] "Entrez Gene: GZMK granzyme K (granzyme 3; tryptase II)".

[:0-7] Jump up to: ^a ^b Zhao T, Zhang H, Guo Y, Zhang Q, Hua G, Lu H, Hou Q, Liu H, Fan Z (March 2007). "Granzyme K cleaves the nucleosome assembly protein SET to induce single-stranded DNA nicks of target cells". Cell Death and Differentiation. 14 (3): 489–499. doi:10.1038/sj.cdd.4402040. PMID 17008916. S2CID 6044972.

[8] Guo Y, Chen J, Zhao T, Fan Z (April 2008). "Granzyme K degrades the redox/DNA repair enzyme Ape1 to trigger oxidative stress of target cells leading to cytotoxicity". Molecular Immunology. 45 (8): 2225–2235. doi:10.1016/j.molimm.2007.11.020. PMID 18179823.

[9] Susanto O, Trapani JA, Brasacchio D (December 2012). "Controversies in granzyme biology". Tissue Antigens. 80 (6): 477–487. doi:10.1111/tan.12014. PMID 23137319.

[10] Bouwman AC, van Daalen KR, Crnko S, ten Broeke T, Bovenschen N (2021). "Intracellular and Extracellular Roles of Granzyme K". Frontiers in Immunology. 12: 677707. doi:10.3389/fimmu.2021.677707. ISSN 1664-3224. PMC 8129556. PMID 34017346.

[11] Cooper DM, Pechkovsky DV, Hackett TL, Knight DA, Granville DJ (2011-06-30). "Granzyme K activates protease-activated receptor-1". PLOS ONE. 6 (6): e21484. Bibcode:2011PLoSO...621484C. doi:10.1371/journal.pone.0021484. PMC 3128063. PMID 21760880.

[12] Sharma M, Merkulova Y, Raithatha S, Parkinson LG, Shen Y, Cooper D, Granville DJ (May 2016). "Extracellular granzyme K mediates endothelial activation through the cleavage of protease-activated receptor-1". The FEBS Journal. 283 (9): 1734–1747. doi:10.1111/febs.13699. PMID 26936634. S2CID 21180451.

[13] Kaiserman D, Zhao P, Rowe CL, Leong A, Barlow N, Joeckel LT, Hitchen C, Stewart SE, Hollenberg MD, Bunnett N, Suhrbier A, Bird PI (2022-07-01). "Granzyme K initiates IL-6 and IL-8 release from epithelial cells by activating protease-activated receptor 2". PLOS ONE. 17 (7): e0270584. Bibcode:2022PLoSO..1770584K. doi:10.1371/journal.pone.0270584. PMC 9321427. PMID 35881628.

[14] Wensink AC, Kemp V, Fermie J, García Laorden MI, van der Poll T, Hack CE, Bovenschen N (April 2014). "Granzyme K synergistically potentiates LPS-induced cytokine responses in human monocytes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111 (16): 5974–5979. Bibcode:2014PNAS..111.5974W. doi:10.1073/pnas.1317347111. PMC 4000831. PMID 24711407.

[15] Zhong C, Li C, Wang X, Toyoda T, Gao G, Fan Z (May 2012). "Granzyme K inhibits replication of influenza virus through cleaving the nuclear transport complex importin α1/β dimer of infected host cells". Cell Death and Differentiation. 19 (5): 882–890. doi:10.1038/cdd.2011.178. PMC 3321629. PMID 22139131.

[16] Mogilenko DA, Shpynov O, Andhey PS, Arthur L, Swain A, Esaulova E, Brioschi S, Shchukina I, Kerndl M, Bambouskova M, Yao Z, Laha A, Zaitsev K, Burdess S, Gillfilan S, Stewart SA, Colonna M, Artyomov MN (January 2021). "Comprehensive Profiling of an Aging Immune System Reveals Clonal GZMK⁺ CD8⁺ T Cells as Conserved Hallmark of Inflammaging". Immunity. 54 (1): 99–115.e12. doi:10.1016/j.immuni.2020.11.005. PMID 33271118. S2CID 227282306.

[1]

[2]

[3]

[4]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

References

Further reading