Clec4a

Clec4a
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	5B1W, 5B1X
Идентификаторы
Псевдонимы	Cllec4a , Clecsf6, Dcirl, DDB27, LLB27, CD367, HDCGC13P, C-типейн домично 4 Мебир
Внешние идентификаторы	Омим : 605306 ; MGI : 1349412 ; Гомологен : 49291 ; GeneCards : Clec4a ; OMA : CLEC4A - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	8,138,607 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 6 (mouse)
End	123,120,958 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	monocyte; ; granulocyte; ; blood; ; appendix; ; testicle; ; spleen; ; bone marrow; ; bone marrow cells; ; upper lobe of left lung; ; right lung;
	Top expressed in
	granulocyte; ; stroma of bone marrow; ; tibiofemoral joint; ; spermatid; ; embryo; ; spleen; ; Paneth cell; ; submandibular gland; ; seminiferous tubule; ; blood;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	transmembrane signaling receptor activity; carbohydrate binding; calcium ion binding; mannose binding; metal ion binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; membrane;
Biological process	cell surface receptor signaling pathway; cell adhesion; stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; adaptive immune response; immune system process; innate immune response; negative regulation of cytokine production; plasmacytoid dendritic cell antigen processing and presentation; negative regulation of tumor necrosis factor production; CD8-positive, alpha-beta T cell activation; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	50856
	26888
	ENSG00000111729
	Ensmusg0000000030148
	Q9Umr7
	Q9QZ15
	NM_016184 ; NM_194447 ; NM_194448 ; NM_194450
	NM_001170332 ; NM_001170333 ; NM_011999
	NP_057268 ; NP_919429 ; NP_919430 ; NP_919432
	NP_001163803 ; NP_001163804 ; NP_036129
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

C-тип Lectin Domain Family 4 Член A -это белок , который у людей кодируется Clec4a геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген кодирует член лектина суперсемейства C-типа C-типа (CTL/CTLD). Члены этого семейства имеют общую белковую складку и имеют разнообразные функции, такие как клеточная адгезия, передача сигналов клеток, оборот гликопротеина и роли в воспалении и иммунном ответе . Кодированный трансмембранной белок типа 2 может играть роль в воспалительном и иммунном ответе.

множественные варианты транскрипта, кодирующие различные изоформы Для этого гена были идентифицированы . Этот ген тесно связан с другими членами суперсемейства CTL/CTLD на хромосоме 12P13 в области комплекса генов естественного убийцы. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000111729 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000030148 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Bates EE, Fournier N, Garcia E, Valladeau J, Durand I, Pin JJ, Zurawski SM, Patel S, Abrams JS, Lebecque S, Garrone P, Saeland S (сентябрь 1999 г.). «APC экспрессируют DCIR, новый поверхностный рецептор лектина C-типа, содержащий ингибирующий мотив иммунорецептора на основе тирозина». J Immunol . 163 (4): 1973–83. doi : 10.4049/jimmunol.163.4.1973 . PMID 10438934 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Clec4a C-тип Lectin Domain Family 4, член A" .

Дальнейшее чтение

Drickamer K (1999). "C-типа, похожие на лектин домены". Карт Мнение Структура Биол . 9 (5): 585–90. doi : 10.1016/s0959-440x (99) 00009-3 . PMID 10508765 .
Huang X, Yuan Z, Chen G, et al. (2001). «Клонирование и характеристика нового ITIM, содержащего лектин-подобный иммунорецептор LLIR, и его два варианта делеции трансмембранной области». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 281 (1): 131–40. doi : 10.1006/bbrc.2001.4322 . PMID 11178971 .
Richard M, Veilleux P, Rouleau M, et al. (2002). «Паттерн экспрессии лектинового Lectin Clecsf6 в нейтрофилах предполагает ключевую роль в контроле воспаления» . J. Leukoc. Биол . 71 (5): 871–80. doi : 10.1189/jlb.71.5.871 . PMID 11994513 . S2CID 36809172 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ebner S, Sharon N, Ben-Tal N (2003). «Эволюционный анализ выявляет коллективные свойства и специфичность в лектиновом и лектино-подобном доменном домене». Белки . 53 (1): 44–55. doi : 10.1002/prot.10440 . PMID 12945048 . S2CID 30955198 .
Richard M, Thibault N, Veilleux P, et al. (2003). «ITIM-несущая CLECSF6 (DCIR) подавляется в нейтрофилах с помощью активирующих нейтрофильных агентов». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 310 (3): 767–73. doi : 10.1016/j.bbrc.2003.09.077 . PMID 14550269 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Richard M, Thibault N, Veilleux P, et al. (2006). «Стимулирующий фактор макрофага гранулоцитов снижает сродство SHP-2 для ITIM CLECSF6 в нейтрофилах: новый механизм действия для SHP-2». Мол Иммунол . 43 (10): 1716–21. doi : 10.1016/j.molimm.2005.10.006 . PMID 16360206 .
Lorentzen JC, Flornes L, Eklöw C, et al. (2007). «Ассоциация артрита с геновым комплексом, кодирующим лектиноподобные рецепторы C-типа». Артрит Рев . 56 (8): 2620–32. doi : 10.1002/art.22813 . PMID 17665455 .

Внешние ссылки

Местоположение генома Human Clec4a и CLEC4A страница сведений генов в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене о хромосоме человека 12 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000111729 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000030148 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10438934-5] Bates EE, Fournier N, Garcia E, Valladeau J, Durand I, Pin JJ, Zurawski SM, Patel S, Abrams JS, Lebecque S, Garrone P, Saeland S (сентябрь 1999 г.). «APC экспрессируют DCIR, новый поверхностный рецептор лектина C-типа, содержащий ингибирующий мотив иммунорецептора на основе тирозина». J Immunol . 163 (4): 1973–83. doi : 10.4049/jimmunol.163.4.1973 . PMID 10438934 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Clec4a C-тип Lectin Domain Family 4, член A" .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]