Jump to content

СИБР Зеленый I

(Перенаправлено с SYBR Green )
СИБР Зеленый I
Имена
Название ИЮПАК
N',N' -диметил- N- [4-[(E)-(3-метил -1,3-бензотиазол -2-илиден)метил]-1-фенилхинолин-1-ий-2-ил]- N -пропилпропан-1,3-диамин
Идентификаторы
3D model ( JSmol )
ХЭМБЛ
Характеристики
С 32 Ч 37 Н 4 С +
Молярная масса 509,73   г / моль
Растворимость Обычно поставляется сольватированным в диметилсульфоксиде.
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа).

SYBR Green I ( SG ) — асимметричный цианиновый краситель. [ 1 ] используется в качестве нуклеиновой кислоты красителя в молекулярной биологии . Семейство красителей SYBR производится компанией Molecular Probes Inc. , которая сейчас принадлежит Thermo Fisher Scientific . SYBR Green I связывается с ДНК . Полученный комплекс ДНК-краситель лучше всего поглощает синий свет с длиной волны 497 нанометров ( max = 497 нм) и излучает зеленый свет ( max = 520 нм). Краситель преимущественно связывается с двухцепочечной ДНК, но окрашивает одноцепочечную (оц) ДНК с меньшей эффективностью. SYBR Green также может окрашивать РНК с меньшей эффективностью, чем оцДНК.

Образец спермы сельди, окрашенный SYBR Green, в кювете, освещенной синим светом в эпифлуоресцентном микроскопе . Зеленый SYBR в образце связывается с ДНК спермы и после связывания флуоресцирует, излучая зеленый свет при освещении синим светом.
Спектрограмма SYBR Green I

Использование

[ редактировать ]

SYBR Green находит применение в нескольких областях биохимии и молекулярной биологии . Он используется в качестве красителя для количественного определения двухцепочечной ДНК в некоторых методах количественной ПЦР . [ 2 ] Он также используется для визуализации ДНК при гель-электрофорезе . Более высокие концентрации SYBR Green можно использовать для окрашивания агарозных гелей с целью визуализации присутствующей ДНК. Помимо маркировки чистых нуклеиновых кислот, SYBR Green также можно использовать для маркировки ДНК внутри клеток для проточной цитометрии и флуоресцентной микроскопии . В этих случаях может потребоваться обработка РНКазой для уменьшения фона от РНК в клетках.

Было опубликовано комплексное исследование красителей ДНК на основе тиазола-оранжевого цвета с участием SYBR Safe, SYBR Green, PicoGreen, SYTO-16, SYTO-9 и нового производного TOPHBu. Здесь результаты синтеза этих соединений опубликованы и охарактеризованы спектроскопически для количественной оценки усиления их флуоресценции при связывании с двухцепочечной ДНК. Способность красителей обнаруживать ДНК в низких концентрациях оценивалась с использованием двух новых показателей: абсолютного усиления флуоресценции (AFE) и относительного усиления флуоресценции (RFE). Они были протестированы в экспериментах по qPCR, показавших некоторые важные различия в чувствительности и эффективности qPCR, которые облегчают выбор ДНК-маркеров для аналитических целей. [ 3 ] Это исследование показало, что Sybr Green демонстрирует наибольшее усиление флуоресценции (AFE) и обеспечивает наилучшие характеристики для методов ПЦР. На втором месте оказался TOPHBu, близкий по значениям к Sybr Green.

Безопасность

[ редактировать ]

SYBR Green I продается как замена бромистому этидию , потенциальному мутагену человека , поскольку он более безопасен в работе и не требует сложных проблем утилизации отходов бромида этидия. Однако любая небольшая молекула, способная связывать ДНК с высоким сродством, является возможным канцерогеном , включая SYBR Green.

В исследовании с использованием теста Эймса , который измеряет способность химических веществ вызывать мутации, при анализе в той же концентрации SYBR Green I оказался примерно в 30 раз менее мутагенным, чем бромид этидия. [ 4 ]

Похожие цианиновые красители

[ редактировать ]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Молния H; Бруннер Х; Бернхаген Дж; Вицтум Ф (2004). «Исследования интеркаляции ДНК и поверхностного связывания SYBR Green I, определение ее структуры и методологические последствия» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (12): е103. дои : 10.1093/нар/gnh101 . ПМК   484200 . ПМИД   15249599 .
  2. ^ Маккей И.М.; Арден К.Е.; Ниче А (март 2002 г.). «ПЦР в реальном времени в вирусологии» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (6): 1292–305. дои : 10.1093/нар/30.6.1292 . ПМК   101343 . ПМИД   11884626 .
  3. ^ Домахиди, Вольф; Ковач, Беатрикс; Чери, Левенте; Катона, Грегори; Рожа, Балаж; и др. (19 июня 2024 г.). «Комплексное исследование красителей ДНК на основе тиазола оранжевого цвета» . ХимФотоХим . дои : 10.1002/cptc.202400080 . ISSN   2367-0932 . В эту статью включен текст из этого источника, доступного по лицензии CC BY 4.0 .
  4. ^ Певица В.Л.; Лоулор Т.Э.; Юэ С. (февраль 1999 г.). «Сравнение мутагенности окраски геля нуклеиновой кислоты SYBR Green I и мутагенности бромида этидия в анализе обратной мутации микросом сальмонеллы/млекопитающих (тест Эймса)». Мутационные исследования . 439 (1): 37–47. Бибкод : 1999MRGTE.439...37S . дои : 10.1016/s1383-5718(98)00172-7 . ПМИД   10029672 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 86b21c510c8546d78f7e5a2c4b000163__1722213600
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/86/63/86b21c510c8546d78f7e5a2c4b000163.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
SYBR Green I - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)