CCNC (ген)

CCNC
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3RGF, 4F6S, 4F6U, 4F6W, 4F70, 4F7J, 4F7L, 4F7N, 4F7S, 4G6L, 4CRL, 5HBE, 5HBH, 5BNJ, 5HBJ, 5FGK, 5CEI, 5HNB, 5HVY, 5I5Z
Идентификаторы
Псевдонимы	CCNC , CYCC, Cyclin C, HSRB11, SRB11
Внешние идентификаторы	Омим : 123838 ; MGI : 1858199 ; Гомологен : 3803 ; GeneCards : CCNC ; OMA : CCNC - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	99,568,825 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 4 (mouse)
End	21,759,922 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	parotid gland; ; oral cavity; ; corpus epididymis; ; jejunal mucosa; ; islet of Langerhans; ; nasal epithelium; ; mucosa of sigmoid colon; ; skin of thigh; ; caput epididymis; ; amniotic fluid;
	Top expressed in
	spermatid; ; spermatocyte; ; ventricular zone; ; right kidney; ; embryo; ; pineal gland; ; ventral tegmental area; ; medial vestibular nucleus; ; genital tubercle; ; dorsomedial hypothalamic nucleus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; protein serine/threonine kinase activity; cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity;
Cellular component	mediator complex; cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	positive regulation of phosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain; transcription initiation from RNA polymerase II promoter; regulation of transcription, DNA-templated; positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; protein phosphorylation; transcription, DNA-templated; regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity; regulation of transcription by RNA polymerase II; regulation of protein kinase activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	892
	51813
	ENSG00000112237
	Ensmusg00000028252
	P24863
	Q62447
	NM_001013399 ; NM_005190 ; NM_001363537
	NM_001122982 ; NM_001290420 ; NM_001290422 ; NM_016746
	NP_001013417 ; NP_005181 ; NP_001350466
	NP_001116454 ; NP_001277349 ; NP_001277351 ; NP_058026
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Cyclin-C -это белок , который у людей кодируется CCNC геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков циклина . Кодированный белок взаимодействует с циклин-зависимой киназой 8 и индуцирует фосфорилирование карбокси-концевого домена большой субъединицы РНК-полимеразы II . Уровень мРНК для этого гена пика в фазе G1 клеточного цикла. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что CCNC (ген) взаимодействует с альфа -рецептором эстрогена ^{[ 7 ]} и циклин-зависимая киназа 8 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000112237 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000028252 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Lew DJ, Dulic V, Reed Si (октябрь 1991 г.). «Выделение трех новых человеческих циклинов путем спасения функции G1 Cyclin (CLN) у дрожжей». Клетка . 66 (6): 1197–206. doi : 10.1016/0092-8674 (91) 90042-W . PMID 1833066 . S2CID 12166415 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: CCNC Cyclin C" .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Кан, Юн Кюнг; Герма Мохамед; Юань хао-Xing; Редер Роберт Дж (март 2002 г.). «Комплекс коактиватора ловушки/медиатора напрямую взаимодействует с рецепторами эстрогена α и β через субъединицу TRAP220 и непосредственно усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro» . Прокурор Нат. Академический Наука США 99 (5): 2642–7. Bibcode : 2002pnas ... 99.2642K . doi : 10.1073/pnas.261715899 . ISSN 0027-8424 . PMC 122401 . PMID 11867769 .
^ Чжан, y; Иратня Р; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Рейнберг D (май 1997). «Гистон -деацетилазы и SAP18, новый полипептид, являются компонентами комплекса SIN3 человека» . Клетка . 89 (3): 357–64. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80216-0 . ISSN 0092-8674 . PMID 9150135 .
^ Чо, ч; ОРФАНИИ G; Солнце х; Ян XJ; Ogryzko V; Lees E; Накатани y; Рейнберг D (сентябрь 1998). «Комплекс РНК -полимеразы человека II, содержащий факторы, которые модифицируют структуру хроматина» . Мол Клетка. Биол . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128/mcb.18.9.5355 . ISSN 0270-7306 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
^ Ван, г; Cantin GT; Стивенс Дж.Л.; Берк AJ (июль 2001). «Характеристика медиаторных комплексов из ядерного экстракта клеток Hela» . Мол Клетка. Биол . 21 (14): 4604–13. doi : 10.1128/mcb.21.14.4604-4613.2001 . ISSN 0270-7306 . PMC 87123 . PMID 11416138 .
^ Тассан, JP; Jaquenoud m; Леопольд П; Schultz SJ; Нигг EA (сентябрь 1995). «Идентификация человеческой циклин-зависимой киназы 8, предполагаемого партнера протеинкиназы для циклина С» . Прокурор Нат. Академический Наука США 92 (19): 8871–5. Bibcode : 1995pnas ... 92.8871t . doi : 10.1073/pnas.92.19.8871 . ISSN 0027-8424 . PMC 41069 . PMID 7568034 .

Внешние ссылки

человека CCNC Местоположение генома CCNC и страница сведений генов в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Носава Т., Хатано М., Ямамото Х., Кван Т. (1976). «Магнитный круговой дихроизм на обратимой оксигенации диметилмезопорфирина-IX-атопиридинекобальт (II)». Бионорганическая химия . 5 (3): 267–73. doi : 10.1016/s0006-3061 (00) 82025-6 . PMID 1260071 .
Tassan JP, Jaquenoud M, Léopold P, et al. (1995). «Идентификация человеческой циклин-зависимой киназы 8, предполагаемого партнера протеинкиназы для циклина С» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 92 (19): 8871–5. Bibcode : 1995pnas ... 92.8871t . doi : 10.1073/pnas.92.19.8871 . PMC 41069 . PMID 7568034 .
Demetrick DJ, Matsumoto S, Hannon GJ, et al. (1995). «Хромосомное картирование генов для белков клеточного цикла человека Cyclin C (CCNC), циклина E (CCNE), P21 (CDKN1) и KAP (CDKN3)». Цитогенет. Клеточная генера . 69 (3–4): 190–2. doi : 10.1159/000133960 . PMID 7698009 .
Yoshizumi M, Lee WS, Sieh CM, et al. (1995). «Исчезновение циклина коррелирует с постоянным выводом кардиомиоцитов из клеточного цикла в сердцах человека и крыс» . J. Clin. Инвестировать 95 (5): 2275–80. doi : 10.1172/jci117918 . PMC 295840 . PMID 7738192 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Rickert P, Seghezzi W, Shanahan F, et al. (1996). «Циклин C/CDK8 - это новая CTD -киназа, связанная с РНК -полимеразой II». Онкоген . 12 (12): 2631–40. PMID 8700522 .
Li H, Lahti JM, Valentine M, et al. (1997). «Молекулярное клонирование и хромосомная локализация генов циклина C (CCNC) и циклина (CCNE) человека: делеция гена CCNC в опухолях человека». Геномика . 32 (2): 253–9. doi : 10.1006/geno.1996.0112 . PMID 8833152 .
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, et al. (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека TAT взаимодействует с голоуферментом РНК -полимеразы II» . Мол Клетка. Биол . 17 (4): 1817–23. doi : 10.1128/mcb.17.4.1817 . PMC 232028 . PMID 9121429 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Neish AS, Anderson SF, Schlegel BP, et al. (1998). «Факторы, связанные с голоуферментом РНК -полимеразы млекопитающих» . Нуклеиновые кислоты Res . 26 (3): 847–53. doi : 10.1093/nar/26.3.847 . PMC 147327 . PMID 9443979 .
CHO H, Orphanides G, Sun X, et al. (1998). «Комплекс РНК -полимеразы человека II, содержащий факторы, которые модифицируют структуру хроматина» . Мол Клетка. Биол . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128/mcb.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
Sun X, Zhang Y, Cho H, et al. (1998). «NAT, человеческий комплекс, содержащий полипептиды SRB, который функционирует как негативный регулятор активированной транскрипции» . Мол Клетка . 2 (2): 213–22. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80131-8 . PMID 9734358 .
Gu W, Malik S, Ito M, et al. (1999). «Новый человеческий SRB/Med-содержащий кофакторный комплекс, SMCC, участвует в регуляции транскрипции» . Мол Клетка . 3 (1): 97–108. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80178-1 . PMID 10024883 .
Ito M, Yuan CX, Malik S, et al. (1999). «Идентичность между комплексами TRAP и SMCC указывает на новые пути для функции ядерных рецепторов и разнообразных активаторов млекопитающих» . Мол Клетка . 3 (3): 361–70. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80463-3 . PMID 10198638 .
Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, et al. (1999). «Активация лиганд-зависимой транскрипции ядерными рецепторами требует комплекса капель». Природа . 398 (6730): 824–8. Bibcode : 1999natur.398..824r . doi : 10.1038/19783 . PMID 10235266 . S2CID 204992765 .
Ван Г., Кантин Г.Т., Стивенс Дж.Л., Берк А.Дж. (2001). «Характеристика медиаторных комплексов из ядерного экстракта клеток Hela» . Мол Клетка. Биол . 21 (14): 4604–13. doi : 10.1128/mcb.21.14.4604-4613.2001 . PMC 87123 . PMID 11416138 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA, et al. (2003). «Идентификация субъединиц медиатора млекопитающих с сходством с субъединицами медиатора дрожжей SRB5, SRB6, MED11 и ROX3» (PDF) . Дж. Биол. Химический 278 (17): 15123–7. doi : 10.1074/jbc.c300054200 . PMID 12584197 .
Ueberham U, Hessel A, Arendt T (2003). «Экспрессия циклина C участвует в патогенезе болезни Альцгеймера». Нейробиол. Старение . 24 (3): 427–35. doi : 10.1016/s0197-4580 (02) 00132-x . PMID 12600719 . S2CID 12604491 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 6 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000112237 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000028252 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid1833066-5] Lew DJ, Dulic V, Reed Si (октябрь 1991 г.). «Выделение трех новых человеческих циклинов путем спасения функции G1 Cyclin (CLN) у дрожжей». Клетка . 66 (6): 1197–206. doi : 10.1016/0092-8674 (91) 90042-W . PMID 1833066 . S2CID 12166415 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: CCNC Cyclin C" .

[pmid11867769-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Кан, Юн Кюнг; Герма Мохамед; Юань хао-Xing; Редер Роберт Дж (март 2002 г.). «Комплекс коактиватора ловушки/медиатора напрямую взаимодействует с рецепторами эстрогена α и β через субъединицу TRAP220 и непосредственно усиливает функцию рецептора эстрогена in vitro» . Прокурор Нат. Академический Наука США 99 (5): 2642–7. Bibcode : 2002pnas ... 99.2642K . doi : 10.1073/pnas.261715899 . ISSN 0027-8424 . PMC 122401 . PMID 11867769 .

[pmid9150135-8] Чжан, y; Иратня Р; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Рейнберг D (май 1997). «Гистон -деацетилазы и SAP18, новый полипептид, являются компонентами комплекса SIN3 человека» . Клетка . 89 (3): 357–64. doi : 10.1016/s0092-8674 (00) 80216-0 . ISSN 0092-8674 . PMID 9150135 .

[pmid9710619-9] Чо, ч; ОРФАНИИ G; Солнце х; Ян XJ; Ogryzko V; Lees E; Накатани y; Рейнберг D (сентябрь 1998). «Комплекс РНК -полимеразы человека II, содержащий факторы, которые модифицируют структуру хроматина» . Мол Клетка. Биол . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128/mcb.18.9.5355 . ISSN 0270-7306 . PMC 109120 . PMID 9710619 .

[pmid11416138-10] Ван, г; Cantin GT; Стивенс Дж.Л.; Берк AJ (июль 2001). «Характеристика медиаторных комплексов из ядерного экстракта клеток Hela» . Мол Клетка. Биол . 21 (14): 4604–13. doi : 10.1128/mcb.21.14.4604-4613.2001 . ISSN 0270-7306 . PMC 87123 . PMID 11416138 .

[pmid7568034-11] Тассан, JP; Jaquenoud m; Леопольд П; Schultz SJ; Нигг EA (сентябрь 1995). «Идентификация человеческой циклин-зависимой киназы 8, предполагаемого партнера протеинкиназы для циклина С» . Прокурор Нат. Академический Наука США 92 (19): 8871–5. Bibcode : 1995pnas ... 92.8871t . doi : 10.1073/pnas.92.19.8871 . ISSN 0027-8424 . PMC 41069 . PMID 7568034 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]