Бета-дефенсин 1

ДЕФБ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1E4S, 1IJU, 1IJV, 1KJ5, 2NLB, 2NLC, 2NLD, 2NLE, 2NLF, 2NLG, 2NLH, 2NLP, 2NLQ, 2NLS, 2PLZ
Идентификаторы
Псевдонимы	DEFB1 , BD1, DEFB-1, DEFB101, HBD1, дефенсин бета 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 602056 ; МГИ : 1096878 ; Гомологен : 88476 ; Генные карты : DEFB1 ; OMA : DEFB1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 8 (human)
End	6,877,936 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	22,285,201 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	body of pancreas; ; salivary gland; ; skin of abdomen; ; minor salivary glands; ; human kidney; ; skin of leg; ; islet of Langerhans; ; mucosa of esophagus; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; right lobe of liver;
	Top expressed in
	conjunctival fornix; ; right kidney; ; human kidney; ; islet of Langerhans; ; lip; ; cornea; ; esophagus; ; skin of external ear; ; corneal stroma; ; ciliary body;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	CCR6 chemokine receptor binding; protein binding; identical protein binding;
Cellular component	Golgi lumen; extracellular region; extracellular exosome; sperm midpiece; extracellular space; extrinsic component of membrane; microvesicle; membrane;
Biological process	chemotaxis; G protein-coupled receptor signaling pathway; defense response; innate immune response in mucosa; acute inflammatory response; response to bacterium; immune response; response to testosterone; positive regulation of flagellated sperm motility involved in capacitation; defense response to bacterium; calcium-mediated signaling using intracellular calcium source; cAMP-mediated signaling; defense response to Gram-negative bacterium; antimicrobial humoral response; innate immune response; antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide; defense response to Gram-positive bacterium;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1672
	13214
	ENSG00000164825 ; ENSG00000284881
	ENSMUSG00000044748
	P60022
	P56386
	НМ_005218
	НМ_007843
	НП_005209
	НП_031869
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Бета-дефенсин 1 — это белок , который у человека кодируется DEFB1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Дефенсины образуют семейство микробицидных и цитотоксических пептидов, вырабатываемых нейтрофилами . Члены семейства дефенсинов очень похожи по белковой последовательности. Этот ген кодирует дефенсин, бета-1, антимикробный пептид, участвующий в устойчивости эпителиальных поверхностей к микробной колонизации. Этот ген картируется в непосредственной близости от дефенсина, члена семейства дефенсинов, альфа-1 , и участвует в патогенезе муковисцидоза . ^{[ 6 ]} однонуклеотидные полиморфизмы в гене DEFB1 были связаны с концентрацией кинуренина в плазме у с большим депрессивным расстройством пациентов В полногеномном ассоциативном исследовании . ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000284881 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000164825, ENSG00000284881 — Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044748 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Бенш К.В., Райда М., Мегерт Х.Дж., Шульц-Кнаппе П., Форссманн В.Г. (июль 1995 г.). «hBD-1: новый бета-дефенсин из плазмы человека» . Письма ФЭБС . 368 (2): 331–5. дои : 10.1016/0014-5793(95)00687-5 . ПМИД 7628632 . S2CID 84766207 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: дефенсин DEFB1, бета 1» .
^ Лю Д., Рэй Б., Нивин Д.Р., Чжан Дж., Атрея А.П., Бирнака Дж.М. и др. (январь 2018 г.). «Бета-дефенсин 1, арилуглеводородный рецептор и кинуренин плазмы при большом депрессивном расстройстве: геномика, основанная на метаболомике» . Трансляционная психиатрия . 8 (1): 10. дои : 10.1038/s41398-017-0056-8 . ПМК 5802574 . ПМИД 29317604 .

Дальнейшее чтение

Ганц Т., Лерер Р.И. (май 1995 г.). «Дефензины». Фармакология и терапия . 66 (2): 191–205. дои : 10.1016/0163-7258(94)00076-F . ПМИД 7667395 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Голдман М.Дж., Андерсон Г.М., Столценберг Э.Д., Кари У.П., Заслофф М., Уилсон Дж.М. (февраль 1997 г.). «Человеческий бета-дефенсин-1 представляет собой чувствительный к соли антибиотик в легких, который инактивируется при муковисцидозе» . Клетка . 88 (4): 553–60. дои : 10.1016/S0092-8674(00)81895-4 . ПМИД 9038346 . S2CID 6614946 .
Маккрей П.Б., Бентли Л. (март 1997 г.). «Эпителий дыхательных путей человека экспрессирует бета-дефенсин». Американский журнал респираторной клеточной и молекулярной биологии . 16 (3): 343–9. дои : 10.1165/ajrcmb.16.3.9070620 . ПМИД 9070620 .
Лю Л., Чжао С., Хэн Х.Х., Ганц Т. (август 1997 г.). «Человеческие бета-дефензин-1 и альфа-дефенсины кодируются соседними генами: два семейства пептидов с разной дисульфидной топологией имеют общее происхождение». Геномика . 43 (3): 316–20. дои : 10.1006/geno.1997.4801 . ПМИД 9268634 .
Валор Э.В., Парк Ч.С., Куэйл А.Дж., Уайлс К.Р., МакКрей П.Б., Ганц Т. (апрель 1998 г.). «Человеческий бета-дефенсин-1: антимикробный пептид урогенитальных тканей» . Журнал клинических исследований . 101 (8): 1633–42. дои : 10.1172/JCI1861 . ПМК 508744 . ПМИД 9541493 .
Шнапп Д., Рид С.Дж., Харрис А. (сентябрь 1998 г.). «Локализация экспрессии бета-дефенсина-1 человека в поджелудочной железе и почках». Журнал патологии . 186 (1): 99–103. doi : 10.1002/(SICI)1096-9896(199809)186:1<99::AID-PATH133>3.0.CO;2-# . ПМИД 9875146 . S2CID 196604843 .
Хирацука Т., Наказато М., Ашитани Дж., Мацукура С. (февраль 1999 г.). «[Исследование человеческого бета-дефенсина-1 и человеческого бета-дефензина-2 в защите слизистой оболочки дыхательных путей]» . Кансенсогаку Дзасси. Журнал Японской ассоциации инфекционных заболеваний . 73 (2): 156–62. дои : 10.11150/kansenshogakuzasshi1970.73.156 . ПМИД 10213993 .
Гропп Р., Фрай М., Вагнер Т.О., Баргон Дж. (апрель 1999 г.). «Эпителиальные дефенсины ослабляют аденовирусную инфекцию: значение генной терапии, опосредованной аденовирусом». Генная терапия человека . 10 (6): 957–64. дои : 10.1089/10430349950018355 . ПМИД 10223729 .
Мэтьюз М., Цзя Х.П., Гутмиллер Дж.М., Лош Г., Грэм С., Джонсон Г.К. и др. (июнь 1999 г.). «Продукция антимикробных пептидов бета-дефензина слизистой оболочкой полости рта и слюнными железами» . Инфекция и иммунитет . 67 (6): 2740–5. дои : 10.1128/IAI.67.6.2740-2745.1999 . ПМК 96577 . ПМИД 10338476 .
Бё Р., Сильвола Дж., Ян Дж., Моенс У., МакКрей П.Б., Стенфорс Л.Е., Сельджфелид Р. (сентябрь 1999 г.). «МРНК бета-дефензина-1 человека транскрибируется в барабанной перепонке и прилегающем эпителии слухового прохода» . Инфекция и иммунитет . 67 (9): 4843–6. дои : 10.1128/IAI.67.9.4843-4846.1999 . ПМК 96817 . ПМИД 10456939 .
Ян Д., Чертов О., Быковская С.Н., Чен К., Буффо М.Дж., Шоган Дж. и др. (октябрь 1999 г.). «Бета-дефензины: связь врожденного и адаптивного иммунитета через дендритный и Т-клеточный CCR6». Наука . 286 (5439): 525–8. дои : 10.1126/science.286.5439.525 . ПМИД 10521347 .
Тунци Ч.Р., Харпер П.А., Бар-Оз Б., Валор Е.В., Семпл Дж.Л., Уотсон-МакДонелл Дж. и др. (июль 2000 г.). «Экспрессия бета-дефенсина в эпителии молочной железы человека» . Педиатрические исследования . 48 (1): 30–5. дои : 10.1203/00006450-200007000-00008 . ПМИД 10879797 .
Сахасрабуде К.С., Кимбалл-младший, Мортон Т.Х., Вайнберг А., Дейл Б.А. (сентябрь 2000 г.). «Экспрессия антимикробного пептида человеческого бета-дефензина 1 в клетках протоков малых слюнных желез и обнаружение в слюне». Журнал стоматологических исследований . 79 (9): 1669–74. дои : 10.1177/00220345000790090601 . ПМИД 11023262 . S2CID 2364914 .
Цзя Х.П., Старнер Т., Акерманн М., Кирби П., Тэк Б.Ф., МакКрей П.Б. (январь 2001 г.). «Обильная экспрессия человеческого бета-дефензина-1 в молоке и эпителии молочной железы». Журнал педиатрии . 138 (1): 109–12. дои : 10.1067/mpd.2001.109375 . ПМИД 11148522 .
Али Р.С., Фальконер А., Икрам М., Биссетт С.Э., Серио Р., Куинн А.Г. (июль 2001 г.). «Экспрессия пептидных антибиотиков бета-дефенсина-1 человека и бета-дефенсина-2 человека в нормальной коже человека» . Журнал исследовательской дерматологии . 117 (1): 106–11. дои : 10.1046/j.0022-202x.2001.01401.x . ПМИД 11442756 .
Каротерс Д.Г., Грэм С.М., Цзя Х.П., Акерманн М.Р., Тэк Б.Ф., МакКрей П.Б. (2001). «Продукция антимикробных пептидов бета-дефенсина слизистой оболочкой верхнечелюстной пазухи». Американский журнал ринологии . 15 (3): 175–9. дои : 10.2500/105065801779954238 . ПМИД 11453504 . S2CID 31583849 .
Гувер Д.М., Чертов О., Лубковски Дж. (октябрь 2001 г.). «Структура человеческого бета-дефенсина-1: новое понимание структурных свойств бета-дефензинов» . Журнал биологической химии . 276 (42): 39021–6. дои : 10.1074/jbc.M103830200 . ПМИД 11486002 .

Эта статья о гене человека й хромосомы незавершена 8 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000284881 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000164825, ENSG00000284881 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000044748 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7628632-5] Бенш К.В., Райда М., Мегерт Х.Дж., Шульц-Кнаппе П., Форссманн В.Г. (июль 1995 г.). «hBD-1: новый бета-дефенсин из плазмы человека» . Письма ФЭБС . 368 (2): 331–5. дои : 10.1016/0014-5793(95)00687-5 . ПМИД 7628632 . S2CID 84766207 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: дефенсин DEFB1, бета 1» .

[7] Лю Д., Рэй Б., Нивин Д.Р., Чжан Дж., Атрея А.П., Бирнака Дж.М. и др. (январь 2018 г.). «Бета-дефенсин 1, арилуглеводородный рецептор и кинуренин плазмы при большом депрессивном расстройстве: геномика, основанная на метаболомике» . Трансляционная психиатрия . 8 (1): 10. дои : 10.1038/s41398-017-0056-8 . ПМК 5802574 . ПМИД 29317604 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]