Дейнококк воздушный

Дейнококк воздушный
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Дейнококкота
Сорт:	дейнококки
Заказ:	Деинококки
Семья:	Дейнококковые
Род:	дейнококк
Разновидность:	Мистер воздух
Биномиальное имя
	Дейнококк воздушный ; Ян и др., 2009 г.

Deinococcus aerius — анаэробная бактерия , которую можно встретить в атмосфере над островом Япония. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Жизнь в таких условиях делает эти бактерии очень устойчивыми к высыханию , УФ-С и гамма-излучению . ^{[ 3 ]} было установлено, что эта бактерия является Deinococcus aerius Хотя ранее эта бактерия не была идентифицирована как штамм TR0125, с помощью секвенирования 16S рРНК . ^{[ 4 ]}

Тип грамма, морфология

При выращивании на анаэробном обогащенном агаре колонии D. aerius имели «круглую, выпуклую, блестящую и оранжевую форму». ^{[ 4 ]} Окраска по Граму показала, что эти бактерии являются грамположительными. ^{[ 4 ]} Сканирующая электронная микроскопия показала, что клетки этой бактерии имеют круглую форму и размер примерно 1,0–1,5 микрометра. ^{[ 4 ]} Кроме того, было обнаружено, что они существуют в виде «одиночных клеток или пар, тетрад или кластеров». ^{[ 4 ]}

Метаболизм

Несколько тестов метаболизма показали, что D. aerius не участвует в «активности восстановления нитратов, уреазы , аргинингидролазы и орнитиндекарбоксилазы и не может использовать некоторые источники углерода». ^{[ 3 ]} Однако последующие исследования показали, что эти бактерии способны расти, используя в качестве источников углерода « арабинозу , глюкозамин , орнитин , глутамат , мальтозу , сахарозу, пролин , раффинозу , цистеин , лизин и метионин ». ^{[ 4 ]}

Где он находится

Дейнококк. aerius ранее был изолирован из атмосферы над Японией на высоте от 0,8 до 5,8 км. Для этого пробы пыли отбирались «на мембранных фильтрах с помощью пробоотборника воздуха АСД1». ^{[ 4 ]} Затем образцы инкубировали на анаэробном обогащенном агаре, и штамм TR0125 был идентифицирован как D. aerius. ^{[ 4 ]}

СМИ выросли на

Deinococcus aerius культивировали на агаре mTGE , содержащем говяжий экстракт , триптон , глюкозу и Diphto Bacto агар . ^{[ 4 ]} Анализ роста показал, что эта бактерия лучше всего растет при температуре 25–30 °C и не растет при 4, 10 или 47 °C. ^{[ 4 ]}

Экология

Поскольку об этом организме известно так мало, его взаимодействие с представителями своего рода, а также с другими организмами до сих пор неизвестно.

Разнообразие

С помощью секвенирования 16S рРНК D. aerius удалось поместить на филогенетическое дерево , чтобы определить его родство с другими организмами этого рода. ^{[ 4 ]} Анализ генома показал, что D. aerius имел 92,3% геномное сходство с D. geothermalis и 95,7% геномное сходство с D. apachensi . ^{[ 4 ]}

Геном

полногеномное секвенирование использовали Для определения особенностей генома D. aerius . ^{[ 3 ]} Было обнаружено, что общая длина генома составляла 4 524 446 пар оснований . ^{[ 3 ]} Сюда вошли 4446 белково-кодирующих последовательностей , 52 тРНК оперона и 1 оперон рРНК ». ^{[ 3 ]} Было замечено, что D. aerius не растет так же хорошо, как другие виды Deinococcus , что может быть частично связано с его единственным опероном рРНК. ^{[ 3 ]} Наличие только одного оперона рРНК снизит скорость синтеза белка у этих бактерий, тем самым снижая скорость возможного роста. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Ян, Иньцзе; Ито, Такаши; Ёкобори, Синъити; Итахаси, Сихо; Симада, Харуо; Сато, Кацуя; Оба, Хирофуми; Наруми, Эссе; Ямагиси, Акихико (август 2009 г.). «Deinococcus aerius sp. nov., выделенный из верхних слоев атмосферы» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (8): 1862–1866. дои : 10.1099/ ijs.0.007963-0 ПМИД 19567578 .
^ «Дейнококк воздушный» . www.uniprot.org . ЮниПрот . Проверено 2 мая 2019 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Сато, Кацуя и др. «Проект геномной последовательности радиорезистентной бактерии Deinococcus Aerius TR0125, выделенной из высокой атмосферы над Японией». Объявления о геноме, том. 6, нет. 9, 1 февраля 2018 г., doi:10.1128/genomea.00080-18.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Ян, Ю.; Ито, Т.; Ёкобори, С.-и.; Итахаси, С.; Симада, Х.; Сато, К.; Охба, Х.; Наруми, И.; Ямагиши, А. (30 июня 2009 г.). «Deinococcus aerius sp. nov., выделенный из верхних слоев атмосферы» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (8): 1862–1866. дои : 10.1099/ijs.0.007963-0 . ПМИД 19567578 .

[1] Ян, Иньцзе; Ито, Такаши; Ёкобори, Синъити; Итахаси, Сихо; Симада, Харуо; Сато, Кацуя; Оба, Хирофуми; Наруми, Эссе; Ямагиси, Акихико (август 2009 г.). «Deinococcus aerius sp. nov., выделенный из верхних слоев атмосферы» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (8): 1862–1866. дои : 10.1099/ ijs.0.007963-0 ПМИД 19567578 .

[2] «Дейнококк воздушный» . www.uniprot.org . ЮниПрот . Проверено 2 мая 2019 г.

[:1-3] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Сато, Кацуя и др. «Проект геномной последовательности радиорезистентной бактерии Deinococcus Aerius TR0125, выделенной из высокой атмосферы над Японией». Объявления о геноме, том. 6, нет. 9, 1 февраля 2018 г., doi:10.1128/genomea.00080-18.

[:2-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Ян, Ю.; Ито, Т.; Ёкобори, С.-и.; Итахаси, С.; Симада, Х.; Сато, К.; Охба, Х.; Наруми, И.; Ямагиши, А. (30 июня 2009 г.). «Deinococcus aerius sp. nov., выделенный из верхних слоев атмосферы» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (8): 1862–1866. дои : 10.1099/ijs.0.007963-0 . ПМИД 19567578 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]