дейнококк

дейнококк
	Тетрада D. radiodurans
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Дейнококкота
Сорт:	дейнококки
Заказ:	Деинококки
Семья:	Дейнококковые ; Брукс и Мюррей, 1981 г.
Род:	дейнококк ; Рейни и др. 1997 год
Типовой вид
	Дейнококк радиодуранс ; Радж и др. 1960 г., бывшие Брукс и Мюррей, 1981 г.
Разновидность
	См. текст.
Синонимы
	Дейнобактерия Ояизу и др. 1987 год ;

Дейнококк (от греческого : δεινος , дейнос , «ужасный, странный» и κοκκος, коккос , «гранулы»). ^{[ 1 ]}) входит в монотипическое семейство Deinococcaceae , и один род ^{[ 2 ]} из трёх в отряде Deinococcales ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} бактериального типа Deinococta, обладающие высокой устойчивостью к вредным воздействиям окружающей среды. Эти бактерии имеют толстые клеточные стенки, что придает им грамположительное окрашивание, но они также имеют вторую мембрану и поэтому по структуре ближе к грамотрицательным бактериям. Дейнококки выживают, когда их ДНК подвергается воздействию высоких доз гамма- и УФ-излучения. В то время как другие бактерии изменяют свою структуру в присутствии радиации, например, образуя эндоспоры, Deinococcus переносят это, не меняя своей клеточной формы и не превращаясь в затвердевшую структуру. Для них также характерно наличие каротиноидного пигмента дейноксантина , который придает им розовый цвет. Обычно их выделяют по этим двум критериям. В августе 2020 года ученые сообщили, что бактерии с Земли, в частности бактерии Deinococcus , выживают в космическом пространстве в течение трех лет , основываясь на исследованиях, проведенных на Международной космической станции . Эти данные подтверждают идею панспермии , гипотезу о том, что Жизнь существует во Вселенной , распределенной различными способами, включая космическую пыль , метеороиды , астероиды , кометы , планетоиды или загрязненные космические корабли . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Молекулярные подписи

Членов Deinococcus можно отличить от всех других бактерий по молекулярным сигнатурам, известным как консервативные сигнатуры (CSI) и белки (CSP). Более раннее исследование Deinococcus выявило девять CSI и 58 CSP, которые были свойственны исключительно представителям этого рода. ^{[ 7 ]} Считается , что некоторые из идентифицированных CSP, такие как белок восстановления повреждений ДНК PprA и одноцепочечный ДНК-связывающий белок DdrB, играют функциональную роль в механизме восстановления ДНК и фенотипе радиорезистентности Deinococcus . ^{[ 7 ]}

В более поздней работе, посвященной белкам репарации ДНК, были идентифицированы еще 22 CSI, специфичные для этого рода, включая вставку из 30 аминокислот в белке UvrA1 , которая, как предполагается, играет роль в устойчивости видов Deinococcus к радиации и окислительное повреждение. ^{[ 8 ]}

Было обнаружено, что ген uvrA1 у Deinococcus образует новую генетическую связь с генами белков dCSP-1 (трансмембранный белок, обнаруженный только у Deinococcus видов ), DsbA и DsbB . Последние два белка играют центральную роль в образовании дисульфидных связей в белках посредством окислительно-восстановительного процесса богатых цистеином мотивов (CXXC). ^{[ 9 ]} Вышеуказанный кластер генов образует новый оперон, уникальный для видов Deinococcus , и предполагается, что закодированные белки будут функционировать вместе, борясь с повреждением ДНК, вызванным реактивными окислительными видами радиации. ^{[ 8 ]}

30 аминокислотных CSI, присутствующих в UvrA1, и еще 5-7 аминокислотных CSI, присутствующих в DsbA, расположены на поверхностных петлях белков. Считается, что открытые на поверхности петли/участки, образованные этими CSI, опосредуют белок-белковые взаимодействия с трансмембранным белком dCSP-1, тем самым облегчая последовательность переносов электронов, что в конечном итоге уменьшает окислительное повреждение. ^{[ 8 ]}

Сравнительная геномика

Хотя все виды рода Deinococcus по определению родственны, они демонстрируют существенные различия в своих геномах . Большинство видов, по-видимому, имеют около 3000 генов, но лишь часть из них является общей для других видов. Например, сравнение трех видов D. radiodurans , D. Deserti и D. geothermalis показывает, что около двух третей каждого генома является общим для всех трех видов, но около трети является специфичным и встречается только у одного из видов. вид (см. рисунок). Как только в такие сравнения будет включено больше геномов, основной геном почти наверняка станет намного меньше. ^{[ 10 ]}

Таксономия

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^{[ 11 ]} и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^{[ 12 ]} По состоянию на август 2011 г. ^[update]Описано 47 видов Deinococcus .

Филогения

на основе 16S рРНК ДП _08_2023 ^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}

120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}

дейнококк

D. peraridilitoris Rainey et al. 2007 год ^{[ 19 ]}

D. cellulosilyticus Weon et al. 2007 год ^{[ 20 ]}

	Д. Лакус Парк и др. 2018 год

	D. radiophilus (бывший Льюис, 1973) Книги и Мюррей, 1981 ^{[ 21 ]}

	D. piscis Шашидхар и Бандекар, 2009 г. ^{[ 22 ]}

	D. proteolyticus Брукс и Мюррей, 1981 г. ^{[ 23 ]}

D. maricopensis Рейни и да Коста, 2005 г. ^{[ 24 ]}

	D. misasensis Asker et al. 2008 год ^{[ 25 ]}

	D. Roseus Аскер и др. 2008 год ^{[ 25 ]}

D. pimensis Рейни и да Коста, 2005 г. ^{[ 24 ]}

	D. papagonensis Рейни и да Коста, 2005 г. ^{[ 24 ]}

	D. yavapaiensis Рейни и да Коста, 2005 г. ^{[ 24 ]}

Д. Рубер Ким и др. 2017 год ^{[ 26 ]}

D. aquiradiocola Asker et al. 2009 год ^{[ 27 ]}

D. radiomollis Callegan et al. 2008 год ^{[ 28 ]}

	D. Высота Callegan et al. 2008 год ^{[ 28 ]}

	D. закрытие Callegan et al. 2008 год ^{[ 28 ]}

D. sonorensis Рейни и да Коста, 2005 г. ^{[ 24 ]}

D. persicinus Jeon et al. 2016 год ^{[ 26 ]}

D. irradiatisoli Kim et al. 2018 год

D. alpinitundrae Callegan et al. 2008 год ^{[ 28 ]}

	D. Detaillensis Zhang et al. 2021 год

	D. psychrotolerans Tian et al. 2019 год

	Д. Муррайи Феррейра и др. 1997 год ^{[ 29 ]}

	D. terrestris Wang et al. 2020 год

D. несущий Кима и др. 2015 год ^{[ 26 ]}

D.budaensis Mack et al. 2016 год ^{[ 26 ]}

D. phoenicis Vaishampayan, Венкатешваран и Швенднер, 2014 г.

D. geothermalis Ferreira et al. 1997 год ^{[ 29 ]}

	D. aluminii Kim et al. 2018 год

	D. metallilatus Kim et al. 2015

	« Д. Эстуарий » Инь и др. 2022 год

	Д. Этериус Янг и др. 2010 год ^{[ 30 ]}

	D. aerius Yang et al. 2009 год ^{[ 31 ]}

	D. apachensis Рейни и да Коста, 2005 г. ^{[ 24 ]}

D. terrigena Ten et al. 2019 год

	D. enclensis Thorat et al. 2015 год

	D. Рис. Lai et al. Покупка 2006 года. Кемпфер 2009 г. ^{[ 32 ]}

	D. radiodurans (бывший Радж и др., 1960) Брукс и Мюррей, 1981 ^{[ 33 ]}

	D. wolverinesis Wang et al. 2010 год ^{[ 34 ]}

D. xinjiangensis Peng et al. 2009 год ^{[ 35 ]}

D. antarcticus Dong et al. 2015 год ^{[ 26 ]}

	D. Cavernae Zhu et al. 2022 год

	D. Fonticola Makk et al. 2019 год

D. ретикулитермит Chen et al. 2012 год ^{[ 36 ]}

D. Petroleum Xi et al. 2019 год

	D. citri Ahmed et al. 2014 год ^{[ 26 ]}

	D. gobiensis Yuan et al. 2009 год ^{[ 37 ]}

D. Metalli Feng et al. 2015 год

	D. aquatilis Kämpfer et al. 2008 год ^{[ 38 ]}

	D. puniceus Lee et al. 2014 год ^{[ 26 ]}

D. radioresistens Srinivasan et al. 2016 год

	Д. Руфус Ван и др. 2018 год

	D. yunweiensis Zhang et al. 2007 год ^{[ 39 ]}

D. koreensis Baek et al. 2018 год

D. hopiensis Рейни и да Коста, 2005 г. ^{[ 24 ]}

	D. aerolatus Yoo et al. 2010 год ^{[ 40 ]}

	D. aerophilus Yoo et al. 2010 год ^{[ 40 ]}

Д. Хуми Шринивасан и др. 2012 год

	D. swuensis Lee et al. 2015 год

	D. radiopugnans Брукс и Мюррей, 1981 г. ^{[ 41 ]}

D. marmoris Hirsch et al. 2006 г. ^{[ 42 ]}

	D. saxicola Hirsch et al. 2006 г. ^{[ 42 ]}

	D. frigens Hirsch et al. 2006 г. ^{[ 42 ]}

D. taklimakanensis Liu et al. 2017 год

D. arcticus Wang et al. 2019 год

	« Д. пресноводный » Инь и др. 2022 год

	D. multiflageltus Kim et al. 2018 год

	D. Tree Bae et al. 2022 год

	Д. Берч Бэ и др. 2022 год

D. hohokamensis Рейни и да Коста ^{[ 24 ]}

D. navajonensis Рейни и де Коста ^{[ 24 ]}

	D. Deserti de Groot et al. 2005 г. ^{[ 43 ]}

	D. malanensis Zhu et al. 2017 год

D. указано Suresh et al. 2004 г. ^{[ 44 ]}

Д. цени Им и др. 2008 год ^{[ 45 ]}

D. depolymerans Asker et al. 2011 год ^{[ 46 ]}

D. aquaticus Im et al. 2008 год ^{[ 45 ]}

	D. knuensis Lee et al. 2017 год

	D. seoulensis Lee et al. 2016 год ^{[ 26 ]}

D. radiotolerans Cha et al. 2015 год

D. grandis (Oyaizu et al. 1987) Rainey et al. 1997 год ^{[ 47 ]}^{[ 48 ]}

	D. daejeonensis Srinivasan et al. 2012 год ^{[ 49 ]}

	D. Seedi Lee et al. 2017 год ^{[ 26 ]}

D. hibisci Moya et al. 2018 год

	D. saudiensis Hussain et al. 2016 год ^{[ 26 ]}

	D. soli Cha et al. 2016 нет Чжан и др. 2011 год ^{[ 26 ]}

D. kurensis Akita et al. 2021 год ^{[ 26 ]}

	D. actinosclerus Joo et al. 2016 год ^{[ 26 ]}

	D. arenae Lee et al. 2016 год ^{[ 26 ]}

Дейнококковые

Дейнобактериальная бумага

дейнококк

Дейнококк мисасенсис

	Дейнококк целлюлозолитикус

	Дейнококк розовый

видовая группа 2

дейнококк

Д. пераридилитор

	Д. пименсис

	Д. явапайенсис

Д. марикопенсис

Д. иррадиатизоли

Д. альпинитундрае

	Д. альпинитундрае

	Д. психротолеранс

Д. Рубер

Д. aquiradiocola

	Мистер высота

	Д. закрытие

Д. радиофилус

	Д. рыба

	Д. протеолитикус

Д. hopiensis

Д. финикийский

	Д. геотермалис

	Д. металлилатус

Д. будаенсис

	Д. Мюррей

	Д. террестрис

	" Доктор Эстуарий "

	« D. planocerae » Lin et al. 2017 год

	Мистер воздух

	Д. апахенсис

	Д. акватилис

	Д. пуницеус

Д. фикус

	Д. пустыни

	Д. маланенсис

Д. гобиенсис

D. Fonticola [в т.ч. Д. каверны ]

Д. ретикулитермит

	Д. радиодуранс

	Д. wulumuqiensis

	Д. металлы

	Д. кореенсис

Д. аэрофил

Д. аэролат

	Д. на земле

	Д. радиопугнаны

	мистер мрамор

	Д. фригенс

	г-н Индикус

	D. seoulensis [вкл. Д. кнуенсис ]

Д. Арктикус

	" Мистер Акватикус "

	Д. многожгутиковый

Д. радиотолерантность

D. actinosclerus [в т.ч. Д. арены ; Д. куренсис ]

D. soli [в т.ч. Д. саудиенсис ]

	Д. грандис [в т.ч. Д. даеджоненсис ; « D. xianganensis » Zheng et al. 2014 ]

	Д. осадок

Неопределенные типы сидений:

« D. aquivivus » Kaempferet al. 2008 год
« D. gammatolerans » Шринивасан, Канг и Ким, 2017 г.
« D. guangxiensis » Sun et al. 2009 год
D. hibisci Moya et al. 2018 год
« D. koreense » Ким, Канг и Шринивасан, 2017 г.
D. papagonensis Рейни и да Коста, 2005 г.
« Народный Лорд » Ли, Кудо и Тоноучи 2018
« D. sahariens » Бурауи и др. 2012 год
« D. soli » Чжан и др. 2011 г., нон Ча и др. 2016 год
« D. taeanensis » Lee et al. 2022 год
D. xibeiensis Wang et al. 2010 год ^{[ 34 ]}

См. также

Ссылки

^ Дейнококк в ЛПСН ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .
^ Брукс Б.В., Мюррей Р.Г.Е. (1981) Номенклатура «Micrococcus radiodurans» и других устойчивых к радиации кокков: Deinococcaceae fam. ноябрь и Deinococcus gen. nov., включая пять видов. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии 31: 353.
^ Экман Дж.В., Раулио М., Буссе Х.Дж., Фьюер Д.П., Салкиноя-Салонен М. (2010) Deinobacteriumcharta gen. ноябрь, сп. nov., чрезвычайно радиационно устойчивая бактерия, образующая биопленку , выделенная на финской бумажной фабрике. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии.
^ Альбукерке Л., Симс С., Нобре М.Ф., Пино Н.М., Баттиста Дж.Р. и др. (2005) Truepera radiovictrix gen. ноябрь, сп. nov., новый радиационно-устойчивый вид и предложение семейства Trueperaceae . ноябрь Письма FEMS по микробиологии 247: 161–169.
^ Стрикленд, Эшли (26 августа 2020 г.). «Согласно новому исследованию, бактерии с Земли могут выжить в космосе и выдержать путешествие на Марс» . Новости CNN . Проверено 26 августа 2020 г.
^ Кавагути, Юко; и др. (26 августа 2020 г.). «Повреждение ДНК и динамика выживания гранул дейнококковых клеток в течение 3 лет воздействия космического пространства» . Границы микробиологии . 11 : 2050. doi : 10.3389/fmicb.2020.02050 . ПМЦ 7479814 . ПМИД 32983036 .
^ Jump up to: ^а ^б Эй, Джонатан; Адеолу, Моболаджи; Хадка, Биджендра; Гупта, Рэдхи С. (октябрь 2016 г.). «Выявление отличительных молекулярных признаков, характерных для типа « Deinococcus–Thermus » и отличающих его основные составляющие группы» . Систематическая и прикладная микробиология . 39 (7): 453–463. дои : 10.1016/j.syapm.2016.07.003 . ISSN 0723-2020 . ПМИД 27506333 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Хасан, министр иностранных дел Назмул; Гупта, Рэдхи С. (08 марта 2018 г.). «Новые особенности последовательностей генов / белков репарации ДНК видов Deinococcus, участвующих в защите от окислительных повреждений» . Гены . 9 (3): 149. doi : 10.3390/genes9030149 . ISSN 2073-4425 . ПМЦ 5867870 . ПМИД 29518000 .
^ Инаба, Кенджи; Ито, Кореаки (апрель 2008 г.). «Строение и механизмы машины образования дисульфидных связей DsbB – DsbA» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1783 (4): 520–529. дои : 10.1016/j.bbamcr.2007.11.006 . ISSN 0167-4889 . ПМИД 18082634 .
^ Jump up to: ^а ^б Грут, Арьян де; Дулермо, Реми; Орте, Филипп; Бланшар, Лоуренс; Герен, Филипп; Фернандес, Бернар; Вашери, Бенуа; Доссат, Кэрол; Жоливе, Эдмонд; Сигуйер, Патрисия; Чендлер, Майкл; Баракат, Мохамед; Дедье, Ален; Барб, Валери; Элен, Тьерри (27 марта 2009 г.). «Альянс протеомики и геномики для раскрытия особенностей сахарской бактерии Deinococcus Deserti» . ПЛОС Генетика . 5 (3): e1000434. дои : 10.1371/journal.pgen.1000434 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 2669436 . ПМИД 19370165 .
^ Ж. П. Эзеби. «Дейнококк» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 июля 2022 г.
^ Сэйерс; и др. «Дейнококкус Термус» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 июля 2022 г.
^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ Рейни Ф.А., Феррейра М., Нобре М.Ф., Рэй К., Багали Д., Эрл А.М., Баттиста-младший, Гомес-Сильва Б., Маккей С.П., да Коста М.С. Deinococcus peraridilitoris sp. ноября, изолированный от прибрежной пустыни. Int J Syst Evol Microbiol. Июль 2007 г.;57(Часть 7):1408-12.
^ Вон ХИ, Ким БАЙ, Шуман П., Сон Дж.А., Чан Дж., Го С.Дж., Квон С.В. Deinococcus cellulosilyticus sp. ноябрь, изолирован от воздуха. Int J Syst Evol Microbiol. 2007, август;57 (Часть 8): 1685-8.
^ Льюис Н.Ф. Радиорезистентный Micrococcus radiophilus sp. ноябрь выделен из облученной бомбейской утки ( Harpodon nehereus ). Курс. наук. (Индия) 1976, т. 42, вып. 14, с. 504
^ Шашидхар Р., Бандекар-младший. Deinococcus piscis sp. nov., радиационно-устойчивая бактерия, выделенная из морской рыбы. Int J Syst Evol Microbiol. 2009 ноя;59(Pt 11):2714-7
^ Кобатаке М., Танабэ С., Хасегава С. Новый радиорезистентный микрококк с красным пигментом, выделенный из фекалий Lama glama , и его использование в качестве микробиологического индикатора радиостерилизации. Сессии CR Soc. Биол. Нить. (1973) 167, 1506–1510.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я Рейни Ф.А., Рэй К., Феррейра М., Гатц Б.З., Нобре М.Ф., Багали Д., Раш Б.А., Парк М.Дж., Эрл А.М., Шэнк Н.С., Смолл А.М., Хенк М.К., Баттиста Дж.Р., Кемпфер П., да Коста М.С. Обширное разнообразие устойчивых к ионизирующему излучению бактерий, выделенных из почвы пустыни Сонора, и описание девяти новых видов рода Deinococcus, полученных из одного образца почвы. Appl Environ Microbiol. Сентябрь 2005 г.;71(9):5225-35. Опечатка в: Appl Environ Microbiol. Ноябрь 2005 г.;71(11):7630.
^ Jump up to: ^а ^б Аскер Д., Авад Т.С., Беппу Т., Уэда К. Deinococcus misasensis и Deinococcusroseus , новые представители рода Deinococcus , выделенные из радиоактивного объекта в Японии. Сист прикладной микробиол. Март 2008 г.;31(1):43-9.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н Парте, АЦ «Дейнококк» . ЛПСН .
^ Аскер Д., Авад Т.С., Беппу Т., Уеда К. Deinococcus aquiradiocola sp. ноября, выделен из радиоактивного объекта в Японии. Int J Syst Evol Microbiol. Январь 2009 г.;59(Часть 1):144-9.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Каллеган Р.П., Нобре М.Ф., Мактернан П.М., Баттиста-младший, Наварро-Гонсалес Р., Маккей К.П., да Коста М.С., Рейни Ф.А. Описание четырех новых психрофильных, чувствительных к ионизирующему излучению видов Deinococcus из альпийской среды. Int J Syst Evol Microbiol. Май 2008 г.;58(Pt 5):1252-8.
^ Jump up to: ^а ^б Феррейра АС, Нобре МФ, Рейни Ф.А., Силва М.Т., Уэйт Р., Бургхардт Дж., Чунг А.П., да Коста М.С. Deinococcus geothermalis sp. ноябрь и Deinococcus murrayi sp. nov., два чрезвычайно радиационно-устойчивых и слегка теплолюбивых вида из горячих источников. Int J Syst Bacteriol. Октябрь 1997 г.; 47(4): 939-47.
^ Ян Ю, Ито Т, Ёкобори С, Симада Х, Итахаси С, Сато К, Оба Х, Наруми I, Ямагиши А. Deinococcus aetherius sp. ноября, изолирован от стратосферы. Int J Syst Evol Microbiol. 60 апреля 2010 г. (Часть 4): 776-9
^ Ян Ю, Ито Т, Ёкобори С, Итахаши С, Симада Х, Сато К, Оба Х, Наруми I, Ямагиши А. Deinococcus aerius sp. ноябрь, изолирован от верхних слоев атмосферы. Int J Syst Evol Microbiol. 2009 г., 59 г. (Часть 8): 1862-6.
^ Лай В.А., Кемпфер П., Арун А.Б., Шен Ф.Т., Хубер Б., Рекха П.Д., Янг CC. Deinococcus ficus sp. nov., выделенный из ризосферы Ficus religiosa L. Int J Syst Evol Microbiol. 56 апреля 2006 г. (Часть 4): 787–91.
^ Андерсон, AW; Х.К. Нордан, Р.Ф. Каин, Дж. Пэрриш, Д. Дагган (1956). «Исследования радиорезистентного микрококка. I. Выделение, морфология, культуральные особенности и устойчивость к гамма-излучению». Пищевая Технол. 10 (1): 575–577.
^ Jump up to: ^а ^б Ван В., Мао Дж., Чжан З., Тан Ц., Се Ю., Чжу Дж., Чжан Л., Лю З., Ши Ю., Гудфеллоу М. Deinococcus wulumuqiensis sp. nov. и Deinococcus xibeiensis sp. nov., выделенный из радиационно-загрязненной почвы. Int J Syst Evol Microbiol. 2010 сентябрь;60(Часть 9):2006-10
^ Пэн Ф, Чжан Л, Луо X, Дай Дж, Ань Х, Тан Ю, Фанг С. Deinococcus xinjiangensis sp. nov., выделен из пустынной почвы. Int J Syst Evol Microbiol. Апрель 2009 г.;59(Часть 4):709-13.
^ Чен В, Ван Б, Хун Х, Ян Х, Лю SJ. Deinococcus reticulitermitis sp. nov., выделен из кишечника термитов. Int J Syst Evol Microbiol. 2011 18 февраля
^ Юань М., Чжан В., Дай С., Ву Дж., Ван Ю., Тао Т., Чен М., Линь М. Deinococcus gobiensis sp. nov., чрезвычайно устойчивая к радиации бактерия. Int J Syst Evol Microbiol. 2009, июнь;59(Часть 6):1513-7
^ Кемпфер П., Лоддерс Н., Хубер Б., Фальсен Э., Буссе Х.Дж. Deinococcus aquatilis sp. ноябрь, изолирован от воды. Int J Syst Evol Microbiol. 2008 декабрь;58(Pt 12):2803-6.
^ Чжан YQ, Сунь CH, Ли WJ, Ю LY, Чжоу JQ, Чжан YQ, Сюй LH, Цзян CL. Deinococcus yunweiensis sp. nov., бактерия из Китая, устойчивая к гамма- и УФ-излучению. Int J Syst Evol Microbiol. Февраль 2007 г.;57(Часть 2):370-5.
^ Jump up to: ^а ^б Ю Ш, Вон ХИ, Ким С.Дж., Ким Ю.С., Ким БАЙ, Квон С.В. Deinococcus aerolatus sp. ноябрь и Deinococcus aerophilus sp. nov., выделен из проб воздуха. Int J Syst Evol Microbiol. Май 2010 г.;60(Pt 5):1191-5.
^ Дэвис, Н.С., Сильверман, Г.Дж., Маусуроски, Э.Б. Устойчивый к радиации пигментированный кокк, выделенный из ткани пикши. Дж. Бактериол. 1963;86, 294–298.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Хирш П., Галликовски К.А., Зиберт Дж., Пайсл К., Кроппенстедт Р., Шуман П., Штакебрандт Е., Андерсон Р. Deinococcus frigens sp. ноябрь, Deinococcus saxicola sp. nov. и Deinococcus marmoris sp. nov., низкотемпературные, засухоустойчивые и устойчивые к УФ-излучению бактерии из континентальной Антарктиды. Сист прикладной микробиол. Ноябрь 2004 г.;27(6):636-45.
^ де Гроот А, Чапон В, Слуга П, Кристен Р, Со МФ, Зоммер С, Хеулин Т. Deinococcus Deserti sp. nov., устойчивая к гамма-излучению бактерия, выделенная из пустыни Сахара. Int J Syst Evol Microbiol. Ноябрь 2005 г.;55(Pt 6):2441-6.
^ Суреш К., Редди Г.С., Сенгупта С., Шиваджи С. Deinococcus indicus sp. nov., устойчивая к мышьяку бактерия из водоносного горизонта в Западной Бенгалии, Индия. Int J Syst Evol Microbiol. Март 2004 г.;54(Часть 2):457-61.
^ Jump up to: ^а ^б Я В.Т., Юнг Х.М., Тен Л.Н., Ким МК, Бора Н., Гудфеллоу М., Лим С., Юнг Дж., Ли СТ. Deinococcus aquaticus sp. nov., выделенный из пресной воды, и Deinococcus caeni sp. nov., выделен из активного ила. Int J Syst Evol Microbiol. Октябрь 2008 г.;58(Часть 10):2348-53.
^ Аскер Д., Авад Т.С., МакЛэндсборо Л., Беппу Т., Уеда К. Deinococcus depolymerans sp. nov., бактерия, устойчивая к гамма- и УФ-излучению, выделенная из естественно радиоактивного участка. Int J Syst Evol Microbiol. Июнь 2011;61(Часть 6):1448-53
^ Ояизу Х., Стакебрандт Э., Шлейфер К.Х., Людвиг В., Похла Х., Ито Х., Хирата А., Ояизу Ю., Комагата К. Устойчивая к радиации палочковидная бактерия Deinobacter grandis gen. ноябрь, сп. nov., с пептидогликаном, содержащим орнитин. Межд. Дж. Сист. Бактериол., 1987, 37, 62–67.
^ Рейни Ф.А., Нобре М.Ф., Шуман П., Стакебрандт Э., Да Коста М.С. Филогенетическое разнообразие дейнококков, определенное путем сравнения последовательностей 16S рибосомальной ДНК. Межд. Дж. Сист. Бактериол., 1997, 47, 510-514.
^ Шринивасан С., Ким МК, Лим С., Джо М., Ли М. Deinococcus daejeonensis sp. nov., выделен из ила на очистных сооружениях. Int J Syst Evol Microbiol. 2011 15 июля

[main-1] Дейнококк в ЛПСН ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[2] Брукс Б.В., Мюррей Р.Г.Е. (1981) Номенклатура «Micrococcus radiodurans» и других устойчивых к радиации кокков: Deinococcaceae fam. ноябрь и Deinococcus gen. nov., включая пять видов. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии 31: 353.

[3] Экман Дж.В., Раулио М., Буссе Х.Дж., Фьюер Д.П., Салкиноя-Салонен М. (2010) Deinobacteriumcharta gen. ноябрь, сп. nov., чрезвычайно радиационно устойчивая бактерия, образующая биопленку , выделенная на финской бумажной фабрике. Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии.

[4] Альбукерке Л., Симс С., Нобре М.Ф., Пино Н.М., Баттиста Дж.Р. и др. (2005) Truepera radiovictrix gen. ноябрь, сп. nov., новый радиационно-устойчивый вид и предложение семейства Trueperaceae . ноябрь Письма FEMS по микробиологии 247: 161–169.

[CNN-20200826-5] Стрикленд, Эшли (26 августа 2020 г.). «Согласно новому исследованию, бактерии с Земли могут выжить в космосе и выдержать путешествие на Марс» . Новости CNN . Проверено 26 августа 2020 г.

[FM-20200826-6] Кавагути, Юко; и др. (26 августа 2020 г.). «Повреждение ДНК и динамика выживания гранул дейнококковых клеток в течение 3 лет воздействия космического пространства» . Границы микробиологии . 11 : 2050. doi : 10.3389/fmicb.2020.02050 . ПМЦ 7479814 . ПМИД 32983036 .

[:0-7] Jump up to: ^а ^б Эй, Джонатан; Адеолу, Моболаджи; Хадка, Биджендра; Гупта, Рэдхи С. (октябрь 2016 г.). «Выявление отличительных молекулярных признаков, характерных для типа « Deinococcus–Thermus » и отличающих его основные составляющие группы» . Систематическая и прикладная микробиология . 39 (7): 453–463. дои : 10.1016/j.syapm.2016.07.003 . ISSN 0723-2020 . ПМИД 27506333 .

[:1-8] Jump up to: ^а ^б ^с Хасан, министр иностранных дел Назмул; Гупта, Рэдхи С. (08 марта 2018 г.). «Новые особенности последовательностей генов / белков репарации ДНК видов Deinococcus, участвующих в защите от окислительных повреждений» . Гены . 9 (3): 149. doi : 10.3390/genes9030149 . ISSN 2073-4425 . ПМЦ 5867870 . ПМИД 29518000 .

[9] Инаба, Кенджи; Ито, Кореаки (апрель 2008 г.). «Строение и механизмы машины образования дисульфидных связей DsbB – DsbA» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1783 (4): 520–529. дои : 10.1016/j.bbamcr.2007.11.006 . ISSN 0167-4889 . ПМИД 18082634 .

[:2-10] Jump up to: ^а ^б Грут, Арьян де; Дулермо, Реми; Орте, Филипп; Бланшар, Лоуренс; Герен, Филипп; Фернандес, Бернар; Вашери, Бенуа; Доссат, Кэрол; Жоливе, Эдмонд; Сигуйер, Патрисия; Чендлер, Майкл; Баракат, Мохамед; Дедье, Ален; Барб, Валери; Элен, Тьерри (27 марта 2009 г.). «Альянс протеомики и геномики для раскрытия особенностей сахарской бактерии Deinococcus Deserti» . ПЛОС Генетика . 5 (3): e1000434. дои : 10.1371/journal.pgen.1000434 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 2669436 . ПМИД 19370165 .

[11] Ж. П. Эзеби. «Дейнококк» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 июля 2022 г.

[12] Сэйерс; и др. «Дейнококкус Термус» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 июля 2022 г.

[LTP-13] «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[14] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[15] «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.

[about-16] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-17] "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-18] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[19] Рейни Ф.А., Феррейра М., Нобре М.Ф., Рэй К., Багали Д., Эрл А.М., Баттиста-младший, Гомес-Сильва Б., Маккей С.П., да Коста М.С. Deinococcus peraridilitoris sp. ноября, изолированный от прибрежной пустыни. Int J Syst Evol Microbiol. Июль 2007 г.;57(Часть 7):1408-12.

[20] Вон ХИ, Ким БАЙ, Шуман П., Сон Дж.А., Чан Дж., Го С.Дж., Квон С.В. Deinococcus cellulosilyticus sp. ноябрь, изолирован от воздуха. Int J Syst Evol Microbiol. 2007, август;57 (Часть 8): 1685-8.

[21] Льюис Н.Ф. Радиорезистентный Micrococcus radiophilus sp. ноябрь выделен из облученной бомбейской утки ( Harpodon nehereus ). Курс. наук. (Индия) 1976, т. 42, вып. 14, с. 504

[22] Шашидхар Р., Бандекар-младший. Deinococcus piscis sp. nov., радиационно-устойчивая бактерия, выделенная из морской рыбы. Int J Syst Evol Microbiol. 2009 ноя;59(Pt 11):2714-7

[23] Кобатаке М., Танабэ С., Хасегава С. Новый радиорезистентный микрококк с красным пигментом, выделенный из фекалий Lama glama , и его использование в качестве микробиологического индикатора радиостерилизации. Сессии CR Soc. Биол. Нить. (1973) 167, 1506–1510.

[rainey-24] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я Рейни Ф.А., Рэй К., Феррейра М., Гатц Б.З., Нобре М.Ф., Багали Д., Раш Б.А., Парк М.Дж., Эрл А.М., Шэнк Н.С., Смолл А.М., Хенк М.К., Баттиста Дж.Р., Кемпфер П., да Коста М.С. Обширное разнообразие устойчивых к ионизирующему излучению бактерий, выделенных из почвы пустыни Сонора, и описание девяти новых видов рода Deinococcus, полученных из одного образца почвы. Appl Environ Microbiol. Сентябрь 2005 г.;71(9):5225-35. Опечатка в: Appl Environ Microbiol. Ноябрь 2005 г.;71(11):7630.

[asker-25] Jump up to: ^а ^б Аскер Д., Авад Т.С., Беппу Т., Уэда К. Deinococcus misasensis и Deinococcusroseus , новые представители рода Deinococcus , выделенные из радиоактивного объекта в Японии. Сист прикладной микробиол. Март 2008 г.;31(1):43-9.

[Deinococcus-26] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н Парте, АЦ «Дейнококк» . ЛПСН .

[27] Аскер Д., Авад Т.С., Беппу Т., Уеда К. Deinococcus aquiradiocola sp. ноября, выделен из радиоактивного объекта в Японии. Int J Syst Evol Microbiol. Январь 2009 г.;59(Часть 1):144-9.

[callegan-28] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Каллеган Р.П., Нобре М.Ф., Мактернан П.М., Баттиста-младший, Наварро-Гонсалес Р., Маккей К.П., да Коста М.С., Рейни Ф.А. Описание четырех новых психрофильных, чувствительных к ионизирующему излучению видов Deinococcus из альпийской среды. Int J Syst Evol Microbiol. Май 2008 г.;58(Pt 5):1252-8.

[ferreira-29] Jump up to: ^а ^б Феррейра АС, Нобре МФ, Рейни Ф.А., Силва М.Т., Уэйт Р., Бургхардт Дж., Чунг А.П., да Коста М.С. Deinococcus geothermalis sp. ноябрь и Deinococcus murrayi sp. nov., два чрезвычайно радиационно-устойчивых и слегка теплолюбивых вида из горячих источников. Int J Syst Bacteriol. Октябрь 1997 г.; 47(4): 939-47.

[30] Ян Ю, Ито Т, Ёкобори С, Симада Х, Итахаси С, Сато К, Оба Х, Наруми I, Ямагиши А. Deinococcus aetherius sp. ноября, изолирован от стратосферы. Int J Syst Evol Microbiol. 60 апреля 2010 г. (Часть 4): 776-9

[31] Ян Ю, Ито Т, Ёкобори С, Итахаши С, Симада Х, Сато К, Оба Х, Наруми I, Ямагиши А. Deinococcus aerius sp. ноябрь, изолирован от верхних слоев атмосферы. Int J Syst Evol Microbiol. 2009 г., 59 г. (Часть 8): 1862-6.

[32] Лай В.А., Кемпфер П., Арун А.Б., Шен Ф.Т., Хубер Б., Рекха П.Д., Янг CC. Deinococcus ficus sp. nov., выделенный из ризосферы Ficus religiosa L. Int J Syst Evol Microbiol. 56 апреля 2006 г. (Часть 4): 787–91.

[33] Андерсон, AW; Х.К. Нордан, Р.Ф. Каин, Дж. Пэрриш, Д. Дагган (1956). «Исследования радиорезистентного микрококка. I. Выделение, морфология, культуральные особенности и устойчивость к гамма-излучению». Пищевая Технол. 10 (1): 575–577.

[wang-34] Jump up to: ^а ^б Ван В., Мао Дж., Чжан З., Тан Ц., Се Ю., Чжу Дж., Чжан Л., Лю З., Ши Ю., Гудфеллоу М. Deinococcus wulumuqiensis sp. nov. и Deinococcus xibeiensis sp. nov., выделенный из радиационно-загрязненной почвы. Int J Syst Evol Microbiol. 2010 сентябрь;60(Часть 9):2006-10

[35] Пэн Ф, Чжан Л, Луо X, Дай Дж, Ань Х, Тан Ю, Фанг С. Deinococcus xinjiangensis sp. nov., выделен из пустынной почвы. Int J Syst Evol Microbiol. Апрель 2009 г.;59(Часть 4):709-13.

[36] Чен В, Ван Б, Хун Х, Ян Х, Лю SJ. Deinococcus reticulitermitis sp. nov., выделен из кишечника термитов. Int J Syst Evol Microbiol. 2011 18 февраля

[37] Юань М., Чжан В., Дай С., Ву Дж., Ван Ю., Тао Т., Чен М., Линь М. Deinococcus gobiensis sp. nov., чрезвычайно устойчивая к радиации бактерия. Int J Syst Evol Microbiol. 2009, июнь;59(Часть 6):1513-7

[38] Кемпфер П., Лоддерс Н., Хубер Б., Фальсен Э., Буссе Х.Дж. Deinococcus aquatilis sp. ноябрь, изолирован от воды. Int J Syst Evol Microbiol. 2008 декабрь;58(Pt 12):2803-6.

[39] Чжан YQ, Сунь CH, Ли WJ, Ю LY, Чжоу JQ, Чжан YQ, Сюй LH, Цзян CL. Deinococcus yunweiensis sp. nov., бактерия из Китая, устойчивая к гамма- и УФ-излучению. Int J Syst Evol Microbiol. Февраль 2007 г.;57(Часть 2):370-5.

[yoo-40] Jump up to: ^а ^б Ю Ш, Вон ХИ, Ким С.Дж., Ким Ю.С., Ким БАЙ, Квон С.В. Deinococcus aerolatus sp. ноябрь и Deinococcus aerophilus sp. nov., выделен из проб воздуха. Int J Syst Evol Microbiol. Май 2010 г.;60(Pt 5):1191-5.

[41] Дэвис, Н.С., Сильверман, Г.Дж., Маусуроски, Э.Б. Устойчивый к радиации пигментированный кокк, выделенный из ткани пикши. Дж. Бактериол. 1963;86, 294–298.

[hirsch-42] Jump up to: ^а ^б ^с Хирш П., Галликовски К.А., Зиберт Дж., Пайсл К., Кроппенстедт Р., Шуман П., Штакебрандт Е., Андерсон Р. Deinococcus frigens sp. ноябрь, Deinococcus saxicola sp. nov. и Deinococcus marmoris sp. nov., низкотемпературные, засухоустойчивые и устойчивые к УФ-излучению бактерии из континентальной Антарктиды. Сист прикладной микробиол. Ноябрь 2004 г.;27(6):636-45.

[43] де Гроот А, Чапон В, Слуга П, Кристен Р, Со МФ, Зоммер С, Хеулин Т. Deinococcus Deserti sp. nov., устойчивая к гамма-излучению бактерия, выделенная из пустыни Сахара. Int J Syst Evol Microbiol. Ноябрь 2005 г.;55(Pt 6):2441-6.

[44] Суреш К., Редди Г.С., Сенгупта С., Шиваджи С. Deinococcus indicus sp. nov., устойчивая к мышьяку бактерия из водоносного горизонта в Западной Бенгалии, Индия. Int J Syst Evol Microbiol. Март 2004 г.;54(Часть 2):457-61.

[im-45] Jump up to: ^а ^б Я В.Т., Юнг Х.М., Тен Л.Н., Ким МК, Бора Н., Гудфеллоу М., Лим С., Юнг Дж., Ли СТ. Deinococcus aquaticus sp. nov., выделенный из пресной воды, и Deinococcus caeni sp. nov., выделен из активного ила. Int J Syst Evol Microbiol. Октябрь 2008 г.;58(Часть 10):2348-53.

[46] Аскер Д., Авад Т.С., МакЛэндсборо Л., Беппу Т., Уеда К. Deinococcus depolymerans sp. nov., бактерия, устойчивая к гамма- и УФ-излучению, выделенная из естественно радиоактивного участка. Int J Syst Evol Microbiol. Июнь 2011;61(Часть 6):1448-53

[47] Ояизу Х., Стакебрандт Э., Шлейфер К.Х., Людвиг В., Похла Х., Ито Х., Хирата А., Ояизу Ю., Комагата К. Устойчивая к радиации палочковидная бактерия Deinobacter grandis gen. ноябрь, сп. nov., с пептидогликаном, содержащим орнитин. Межд. Дж. Сист. Бактериол., 1987, 37, 62–67.

[48] Рейни Ф.А., Нобре М.Ф., Шуман П., Стакебрандт Э., Да Коста М.С. Филогенетическое разнообразие дейнококков, определенное путем сравнения последовательностей 16S рибосомальной ДНК. Межд. Дж. Сист. Бактериол., 1997, 47, 510-514.

[49] Шринивасан С., Ким МК, Лим С., Джо М., Ли М. Deinococcus daejeonensis sp. nov., выделен из ила на очистных сооружениях. Int J Syst Evol Microbiol. 2011 15 июля

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]