Stard13

Stard13
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2H80, 2JW2, 2PSO
Идентификаторы
Псевдонимы	Stard13 , ARHGAP37, DLC2, GT650, LINC00464, Домен переноса липидов, связанный с звездами, содержащий 13
Внешние идентификаторы	Омим : 609866 ; MGI : 2385331 ; Гомологен : 64844 ; GeneCards : Stard13 ; OMA : Stard13 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 13 (human)
End	33,350,630 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	151,157,301 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	sural nerve; ; muscle layer of sigmoid colon; ; epithelium of colon; ; spinal ganglia; ; trigeminal ganglion; ; right lung; ; thyroid gland; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; Achilles tendon;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; lumbar spinal ganglion; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; primary oocyte; ; retinal pigment epithelium; ; sciatic nerve; ; left lung lobe; ; right lung lobe; ; saccule;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	protein binding; lipid binding; GTPase activator activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; lipid droplet; mitochondrial membranes; mitochondrion; membrane;
Biological process	negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis; positive regulation of GTPase activity; endothelial tube lumen extension; regulation of small GTPase mediated signal transduction; endothelial cell migration; signal transduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	90627
	243362
	ENSG00000133121
	Ensmusg00000016128
	Q9y3m8
	Q923Q2
showNM_001243466 ; NM_001243474 ; NM_001243476 ; NM_052851 ; NM_178006 ;
	NM_178007; NM_178008
	NM_001163493 ; NM_146258 ; NM_001359985
showNP_001230395 ; NP_001230403 ; NP_001230405 ; NP_443083 ; NP_821074 ;
	NP_821075
	NP_001156965 ; NP_666370 ; NP_001346914
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Связанный с звездой белок домена липидного домена 13 (Stard13), также известный как удаленный в белке 2 рака печени 2 (DLC-2), является белком , который у людей кодируется Stard13 геном и членом семейства DLC белков. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция и структура

Stard13 служит активирующим Rho GTPase белок (GAP), тип белка, который регулирует членов семейства GTPases Rho . ^{[ 7 ]} Он избирательно активирует RHOA и CDC42 и подавляет рост клеток, ингибируя артиновое стрессовое волокно. ^{[ 7 ]}

Белок состоит из N-концевого стерильного альфа-мотива (SAM) домена, ^{[ 8 ]} Богатый серин домен, домен RHOGAP и на C-конце, связанный с звездой домен липид-трансфер ( Start ).

Распределение тканей и патология

Белок был идентифицирован частично благодаря его дифференциальной экспрессии при раке . Низкий уровень Stard13 наблюдался в менее дифференцированной ткани гепатоцеллюлярной карциномы с более высокой экспрессией RhoA. Небольшое исследование пациента обнаруживает, что отсутствие Stard13 в гепатоцеллюлярных карциномах коррелирует с более высоким уровнем RhoA и более плохим прогнозом , чем пациенты с карциномами, которые были Stard13-позитивными. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000133121 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000016128 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Couch FJ, Rommens JM, Neuhausen SL, Bélanger C, Dumont M, Abel K, Bell R, Berry S, Bogden R, Cannon-Albright L, Farid L, Frye C, Hattier T, Janecki T, Jiang P, Keherer R, Лебланк Дж. Ф., Макартур-Моррисон Дж., Мейни Д., Мики Ю., Пенг Й, Самсон С. Schroeder M, Snyder SC, Simard J (август 1996 г.). «Генерация интегрированной карты транскрипции области BRCA2 на хромосоме 13Q12-Q13» . Геномика . 36 (1): 86–99. doi : 10.1006/Geno.1996.0428 . PMID 8812419 .
^ "Entrez Gene: Stard13 Start Domain, содержащий 13" .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Ching YP, Wong CM, Chan SF, Leung TH, NG DC, Jin Dy, NG IO (март 2003 г.). «Удаленный при раке печени (DLC) 2 кодирует белок RhoGAP с функцией супрессора роста и недостаточно экспрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме» . Журнал биологической химии . 278 (12): 10824–30. doi : 10.1074/jbc.m208310200 . PMID 12531887 .
^ Ли, Хонгян; Фанг, Кинг-Леун; Джин, Донг-Янь; Чунг, Стивен С.М.; Чинг, Ик-Пан; Нг, Ирен Ой-Лин; Ззе, Конг-Ханг; KO, Ben CB; Sun, Hongzhe (2007-06-01). «Структуры раствора, динамика и липид-связывание стерильного альфа-мотиф-домена удаленного при раке печени 2». Белки . 67 (4): 1154–1166. doi : 10.1002/prot.21361 . ISSN 1097-0134 . PMID 17380510 . S2CID 20407564 .
^ Xiaorong L, Wei W, Liyuan Q, Kaiyan Y (2008). «Недоэкспрессия удаленного при раке печени 2 (DLC2) связана с сверхэкспрессией RHOA и плохим прогнозом при гепатоцеллюлярной карциноме» . BMC Рак . 8 : 205. DOI : 10.1186/1471-2407-8-205 . PMC 2496915 . PMID 18651974 .

Дальнейшее чтение

Ching YP, Wong CM, Chan SF, Leung TH, NG DC, Jin Dy, NG IO (март 2003 г.). «Удаленный при раке печени (DLC) 2 кодирует белок RhoGAP с функцией супрессора роста и недостаточно экспрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме» . Журнал биологической химии . 278 (12): 10824–30. doi : 10.1074/jbc.m208310200 . PMID 12531887 .
Day CL, Puthalakath H, Skea G, Strasser A, Barsukov I, Lian Ly, Huang DC, Hinds MG (февраль 2004 г.). «Локализация световых цепей динеина 1 и 2 и их проапоптотических лигандов» . Биохимический журнал . 377 (Pt 3): 597–605. doi : 10.1042/bj20031251 . PMC 1223895 . PMID 14561217 .
Нагараджа Г.М., Кандпал Р.П. (январь 2004 г.). «Хромосома 13Q12, кодируемая Rho GTPase, активирующий белок подавляет рост клеток карциномы молочной железы, а двухгибридный экран дрожжей показывает его взаимодействие с несколькими белками». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 313 (3): 654–65. doi : 10.1016/j.bbrc.2003.12.001 . PMID 14697242 .
Colland F, Jacq X, Truplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (июль 2004 г.). «Функциональная протеомика картирование сигнального пути человека» . Исследование генома . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Leung TH, Ching YP, Yam JW, Wong CM, Yau To, Jin Dy, NG IO (октябрь 2005 г.). «Удаляется при раке печени 2 (DLC2) подавляет трансформацию клеток посредством ингибирования активности RHOA» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (42): 15207–12. Bibcode : 2005pnas..10215207L . doi : 10.1073/pnas.0504501102 . PMC 1250229 . PMID 16217026 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000133121 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000016128 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8812419-5] Couch FJ, Rommens JM, Neuhausen SL, Bélanger C, Dumont M, Abel K, Bell R, Berry S, Bogden R, Cannon-Albright L, Farid L, Frye C, Hattier T, Janecki T, Jiang P, Keherer R, Лебланк Дж. Ф., Макартур-Моррисон Дж., Мейни Д., Мики Ю., Пенг Й, Самсон С. Schroeder M, Snyder SC, Simard J (август 1996 г.). «Генерация интегрированной карты транскрипции области BRCA2 на хромосоме 13Q12-Q13» . Геномика . 36 (1): 86–99. doi : 10.1006/Geno.1996.0428 . PMID 8812419 .

[entrez-6] "Entrez Gene: Stard13 Start Domain, содержащий 13" .

[pmid12531887-7] Jump up to: ^а ^{беременный} Ching YP, Wong CM, Chan SF, Leung TH, NG DC, Jin Dy, NG IO (март 2003 г.). «Удаленный при раке печени (DLC) 2 кодирует белок RhoGAP с функцией супрессора роста и недостаточно экспрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме» . Журнал биологической химии . 278 (12): 10824–30. doi : 10.1074/jbc.m208310200 . PMID 12531887 .

[8] Ли, Хонгян; Фанг, Кинг-Леун; Джин, Донг-Янь; Чунг, Стивен С.М.; Чинг, Ик-Пан; Нг, Ирен Ой-Лин; Ззе, Конг-Ханг; KO, Ben CB; Sun, Hongzhe (2007-06-01). «Структуры раствора, динамика и липид-связывание стерильного альфа-мотиф-домена удаленного при раке печени 2». Белки . 67 (4): 1154–1166. doi : 10.1002/prot.21361 . ISSN 1097-0134 . PMID 17380510 . S2CID 20407564 .

[9] Xiaorong L, Wei W, Liyuan Q, Kaiyan Y (2008). «Недоэкспрессия удаленного при раке печени 2 (DLC2) связана с сверхэкспрессией RHOA и плохим прогнозом при гепатоцеллюлярной карциноме» . BMC Рак . 8 : 205. DOI : 10.1186/1471-2407-8-205 . PMC 2496915 . PMID 18651974 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]