Белковый домен YceI

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

YceI
YceI
	Кристаллическая структура полиизопреноидсвязывающего белка TT1927B из Thermus thermophilus hb8.
Идентификаторы
Символ	YceI
Пфам	PF04264
ИнтерПро	ИПР007372
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1uf6 / SCOPe / СУПФАМ
Суперсемейство OPM	101
белок OPM	3hpe
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

В молекулярной биологии белковый Yce-I домен является предполагаемым периплазматическим белком . Эта запись представляет собой липидсвязывающий . белок YceI из Escherichia coli ^{[ 1 ]} и полиизопреноид- связывающий белок TTHA0802 из Thermus thermophilus . ^{[ 2 ]} Его роль заключается в содействии биосинтезу изопреноида живых , важной молекулы, обнаруженной во всех организмах .

Структура

Оба этих белка имеют общий домен с 8-цепочечной укладкой бета-цилиндра . Это напоминает складку липокалина , хотя гомологии последовательностей с липокалинами не существует. В TTHA0802 белок связывает полиизопреноидную цепь внутри поры ствола посредством гидрофобных взаимодействий. ^{[ 2 ]} последовательности Гомологи этой основной структуры присутствуют у широкого круга бактерий и архей .

Кристаллические структуры позволяют предположить, что это семейство белков играет важную роль в изопреноидных хинонов метаболизме , а также в транспорте или хранении. В обоих случаях белок представляет собой гомодимер, причем каждый мономер характеризуется липокалиновой складкой. ^{[ 2 ]}

^ Станчик Л.М., Станчик Д.М., Шмидт Б., Барнхарт Д.М., Йончева Ю.Н., Слончевский Ю.Л. (август 2002 г.). «РН-зависимая экспрессия периплазматических белков и катаболизм аминокислот в Escherichia coli» . Дж. Бактериол . 184 (15): 4246–58. дои : 10.1128/jb.184.15.4246-4258.2002 . ПМЦ 135203 . ПМИД 12107143 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ханда Н., Терада Т., Дой-Катаяма Ю., Хирота Х., Таме Дж.Р., Пак С.Ю., Курамицу С., Ширузу М., Ёкояма С. (апрель 2005 г.). «Кристаллическая структура нового полиизопреноидсвязывающего белка из Thermus thermophilus HB8» . Белковая наука . 14 (4): 1004–10. дои : 10.1110/ps.041183305 . ПМК 2253440 . ПМИД 15741337 .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR007372.